MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011959	G	6	6	560562	560567	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_011959	ACC	2	6	560573	560578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12503	NC_011959	GCT	2	6	560594	560599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_011959	CGAGTC	2	12	560705	560716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_011959	AGC	2	6	560864	560869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_011959	CGT	2	6	560872	560877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_011959	TCG	2	6	560882	560887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_011959	GCG	2	6	560889	560894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_011959	GCG	2	6	560935	560940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_011959	CGG	2	6	560948	560953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_011959	TCG	2	6	561062	561067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12512	NC_011959	CG	3	6	561117	561122	0 %	0 %	50 %	50 %	221632589
12513	NC_011959	CTC	2	6	561133	561138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632589
12514	NC_011959	CGA	2	6	561141	561146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12515	NC_011959	TGA	2	6	561252	561257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632589
12516	NC_011959	CGA	2	6	561288	561293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12517	NC_011959	TCG	2	6	561308	561313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12518	NC_011959	CTG	2	6	561371	561376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12519	NC_011959	GCGG	2	8	561377	561384	0 %	0 %	75 %	25 %	221632589
12520	NC_011959	CTA	2	6	561477	561482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632589
12521	NC_011959	GTC	2	6	561490	561495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12522	NC_011959	GCCC	2	8	561548	561555	0 %	0 %	25 %	75 %	221632589
12523	NC_011959	GC	3	6	561600	561605	0 %	0 %	50 %	50 %	221632589
12524	NC_011959	CCG	2	6	561608	561613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632589
12525	NC_011959	AGG	2	6	561617	561622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632589
12526	NC_011959	CG	3	6	561627	561632	0 %	0 %	50 %	50 %	221632589
12527	NC_011959	TCG	2	6	561638	561643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12528	NC_011959	AGG	2	6	561644	561649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632589
12529	NC_011959	GAT	2	6	561673	561678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632589
12530	NC_011959	GCTT	2	8	561686	561693	0 %	50 %	25 %	25 %	221632589
12531	NC_011959	CAT	2	6	561696	561701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632589
12532	NC_011959	CGA	2	6	561708	561713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12533	NC_011959	GGT	2	6	561763	561768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632589
12534	NC_011959	GGC	2	6	561818	561823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632589
12535	NC_011959	TTGG	2	8	561830	561837	0 %	50 %	50 %	0 %	221632589
12536	NC_011959	TCC	2	6	561842	561847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632589
12537	NC_011959	TCG	2	6	561851	561856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12538	NC_011959	TTC	2	6	561878	561883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632589
12539	NC_011959	GAA	2	6	561904	561909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632589
12540	NC_011959	TGG	2	6	561951	561956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632589
12541	NC_011959	GTC	2	6	561973	561978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12542	NC_011959	T	6	6	562026	562031	0 %	100 %	0 %	0 %	221632589
12543	NC_011959	GTT	2	6	562075	562080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632589
12544	NC_011959	TGCG	2	8	562100	562107	0 %	25 %	50 %	25 %	221632589
12545	NC_011959	TCT	2	6	562157	562162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632589
12546	NC_011959	CTC	2	6	562204	562209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632589
12547	NC_011959	GATC	2	8	562224	562231	25 %	25 %	25 %	25 %	221632589
12548	NC_011959	CGG	2	6	562232	562237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632589
12549	NC_011959	GTC	2	6	562242	562247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12550	NC_011959	TCG	2	6	562265	562270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632589
12551	NC_011959	TCGC	2	8	562301	562308	0 %	25 %	25 %	50 %	221632589
12552	NC_011959	ATC	2	6	562309	562314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632589
12553	NC_011959	GGT	2	6	562407	562412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632590
12554	NC_011959	TCG	2	6	562416	562421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632590
12555	NC_011959	TCG	2	6	562467	562472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632590
12556	NC_011959	GTC	2	6	562473	562478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632590
12557	NC_011959	TCG	2	6	562491	562496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632590
12558	NC_011959	ACG	2	6	562511	562516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632590
12559	NC_011959	GCG	2	6	562532	562537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632590
12560	NC_011959	AGC	2	6	562612	562617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632590
12561	NC_011959	GATC	2	8	562684	562691	25 %	25 %	25 %	25 %	221632590
12562	NC_011959	GCT	2	6	562712	562717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632590
12563	NC_011959	TGC	2	6	562768	562773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632590
12564	NC_011959	CGAG	2	8	562774	562781	25 %	0 %	50 %	25 %	221632590
12565	NC_011959	GTC	2	6	562787	562792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632590
12566	NC_011959	CAT	2	6	562868	562873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632590
12567	NC_011959	CTGG	2	8	562876	562883	0 %	25 %	50 %	25 %	221632590
12568	NC_011959	GC	3	6	562935	562940	0 %	0 %	50 %	50 %	221632590
12569	NC_011959	GGAT	2	8	563117	563124	25 %	25 %	50 %	0 %	221632590
12570	NC_011959	GACG	2	8	563185	563192	25 %	0 %	50 %	25 %	221632590
12571	NC_011959	GC	3	6	563345	563350	0 %	0 %	50 %	50 %	221632591
12572	NC_011959	CGT	2	6	563351	563356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632591
12573	NC_011959	ACG	2	6	563361	563366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632591
12574	NC_011959	GTG	2	6	563435	563440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632591
12575	NC_011959	GCAGTC	2	12	563476	563487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632591
12576	NC_011959	GTT	2	6	563574	563579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632591
12577	NC_011959	GTT	2	6	563584	563589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632591
12578	NC_011959	GCG	2	6	563650	563655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632591
12579	NC_011959	CG	3	6	563699	563704	0 %	0 %	50 %	50 %	221632591
12580	NC_011959	TC	3	6	563712	563717	0 %	50 %	0 %	50 %	221632591
12581	NC_011959	CAGC	2	8	563723	563730	25 %	0 %	25 %	50 %	221632591
12582	NC_011959	TCGGC	2	10	563844	563853	0 %	20 %	40 %	40 %	221632591
12583	NC_011959	GCT	2	6	563859	563864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632591
12584	NC_011959	GGAGCC	2	12	563916	563927	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221632591
12585	NC_011959	CTCTC	2	10	564059	564068	0 %	40 %	0 %	60 %	221632591
12586	NC_011959	CCG	2	6	564100	564105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632591
12587	NC_011959	GCT	2	6	564235	564240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632591
12588	NC_011959	ACC	2	6	564253	564258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632591
12589	NC_011959	GTC	3	9	564277	564285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632591
12590	NC_011959	TCG	2	6	564305	564310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632591
12591	NC_011959	ACG	2	6	564313	564318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632591
12592	NC_011959	GCG	2	6	564325	564330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632591
12593	NC_011959	CTCCG	2	10	564342	564351	0 %	20 %	20 %	60 %	221632591
12594	NC_011959	GC	3	6	564355	564360	0 %	0 %	50 %	50 %	221632591
12595	NC_011959	CTGG	2	8	564402	564409	0 %	25 %	50 %	25 %	221632591
12596	NC_011959	GCA	2	6	564490	564495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632591
12597	NC_011959	TTG	2	6	564496	564501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632591
12598	NC_011959	CCT	2	6	564536	564541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632591
12599	NC_011959	CGCTC	2	10	564571	564580	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12600	NC_011959	AGC	2	6	564623	564628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632592
12601	NC_011959	CG	3	6	564641	564646	0 %	0 %	50 %	50 %	221632592
12602	NC_011959	GTCG	3	12	564647	564658	0 %	25 %	50 %	25 %	221632592
12603	NC_011959	CTC	2	6	564713	564718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632592
12604	NC_011959	GGT	2	6	564719	564724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632592
12605	NC_011959	CG	3	6	564799	564804	0 %	0 %	50 %	50 %	221632593
12606	NC_011959	CGAC	2	8	564809	564816	25 %	0 %	25 %	50 %	221632593
12607	NC_011959	AGC	2	6	564963	564968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632593
12608	NC_011959	GATC	2	8	564989	564996	25 %	25 %	25 %	25 %	221632593
12609	NC_011959	TCGT	2	8	565233	565240	0 %	50 %	25 %	25 %	221632593
12610	NC_011959	GTT	2	6	565262	565267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632593
12611	NC_011959	CG	5	10	565346	565355	0 %	0 %	50 %	50 %	221632593
12612	NC_011959	AGC	2	6	565356	565361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632593
12613	NC_011959	CGC	2	6	565421	565426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632593
12614	NC_011959	GCT	2	6	565436	565441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632593
12615	NC_011959	CGA	2	6	565442	565447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632593
12616	NC_011959	GCC	2	6	565471	565476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632593
12617	NC_011959	CAC	2	6	565484	565489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632593
12618	NC_011959	AATCC	2	10	565512	565521	40 %	20 %	0 %	40 %	221632593
12619	NC_011959	TCGC	2	8	565555	565562	0 %	25 %	25 %	50 %	221632593
12620	NC_011959	TGT	2	6	565643	565648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632593
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12981	NC_011959	CGA	2	6	582223	582228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632607
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12983	NC_011959	ACG	2	6	582273	582278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632607
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