MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011959	GTC	2	6	514893	514898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632542
11502	NC_011959	GCT	2	6	514899	514904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632542
11503	NC_011959	CGA	2	6	514929	514934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632542
11504	NC_011959	GAT	2	6	514959	514964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632542
11505	NC_011959	CAG	2	6	515014	515019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632542
11506	NC_011959	CGA	2	6	515043	515048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632542
11507	NC_011959	TCC	2	6	515059	515064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632542
11508	NC_011959	TTG	2	6	515098	515103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632542
11509	NC_011959	GC	3	6	515214	515219	0 %	0 %	50 %	50 %	221632542
11510	NC_011959	GCA	2	6	515241	515246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632542
11511	NC_011959	AGG	2	6	515292	515297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632542
11512	NC_011959	GCC	2	6	515354	515359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632542
11513	NC_011959	TAA	2	6	515377	515382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221632542
11514	NC_011959	CGC	2	6	515404	515409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632542
11515	NC_011959	AGT	2	6	515528	515533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_011959	TCTCC	2	10	515589	515598	0 %	40 %	0 %	60 %	221632543
11517	NC_011959	CGG	2	6	515611	515616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632543
11518	NC_011959	TCG	2	6	515651	515656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632543
11519	NC_011959	TCG	2	6	515711	515716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632543
11520	NC_011959	CGG	2	6	515800	515805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632543
11521	NC_011959	GC	3	6	515870	515875	0 %	0 %	50 %	50 %	221632543
11522	NC_011959	CCG	2	6	515882	515887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632543
11523	NC_011959	CGC	2	6	515940	515945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632543
11524	NC_011959	CGC	2	6	516004	516009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632543
11525	NC_011959	GC	3	6	516030	516035	0 %	0 %	50 %	50 %	221632543
11526	NC_011959	GGGA	2	8	516083	516090	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_011959	CG	3	6	516119	516124	0 %	0 %	50 %	50 %	221632544
11528	NC_011959	GCGG	2	8	516183	516190	0 %	0 %	75 %	25 %	221632544
11529	NC_011959	GTC	2	6	516316	516321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632544
11530	NC_011959	GC	3	6	516325	516330	0 %	0 %	50 %	50 %	221632544
11531	NC_011959	GCGA	2	8	516385	516392	25 %	0 %	50 %	25 %	221632544
11532	NC_011959	CTC	2	6	516418	516423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632544
11533	NC_011959	CGA	2	6	516444	516449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632544
11534	NC_011959	AAG	3	9	516526	516534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632544
11535	NC_011959	TGC	2	6	516552	516557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632544
11536	NC_011959	GCA	3	9	516586	516594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632544
11537	NC_011959	GCG	2	6	516675	516680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632544
11538	NC_011959	AGC	2	6	516788	516793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_011959	TTG	2	6	516948	516953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632545
11540	NC_011959	CTT	2	6	516958	516963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632545
11541	NC_011959	GCT	2	6	516987	516992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632545
11542	NC_011959	ATG	2	6	517011	517016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632545
11543	NC_011959	GCTC	2	8	517174	517181	0 %	25 %	25 %	50 %	221632545
11544	NC_011959	CGA	2	6	517228	517233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632545
11545	NC_011959	GTT	2	6	517244	517249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632545
11546	NC_011959	CTGG	2	8	517250	517257	0 %	25 %	50 %	25 %	221632545
11547	NC_011959	GAG	2	6	517286	517291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632545
11548	NC_011959	GGC	2	6	517358	517363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632545
11549	NC_011959	ACC	2	6	517395	517400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632545
11550	NC_011959	CTT	2	6	517432	517437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632545
11551	NC_011959	TGA	2	6	517576	517581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632545
11552	NC_011959	AGT	2	6	517585	517590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632545
11553	NC_011959	GAG	2	6	517601	517606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632545
11554	NC_011959	ATG	2	6	517620	517625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632545
11555	NC_011959	CGT	2	6	517654	517659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632545
11556	NC_011959	TGC	2	6	517816	517821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632545
11557	NC_011959	CG	3	6	517852	517857	0 %	0 %	50 %	50 %	221632545
11558	NC_011959	GTCGGC	2	12	517881	517892	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632545
11559	NC_011959	GCAG	2	8	517904	517911	25 %	0 %	50 %	25 %	221632545
11560	NC_011959	CGAA	2	8	517930	517937	50 %	0 %	25 %	25 %	221632545
11561	NC_011959	CGC	2	6	517959	517964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632545
11562	NC_011959	CTG	2	6	517991	517996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632545
11563	NC_011959	TCC	2	6	518043	518048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11564	NC_011959	CGAC	2	8	518060	518067	25 %	0 %	25 %	50 %	221632546
11565	NC_011959	AGC	2	6	518112	518117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632546
11566	NC_011959	CGC	2	6	518157	518162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632546
11567	NC_011959	CGT	2	6	518189	518194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632546
11568	NC_011959	GAA	2	6	518213	518218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632546
11569	NC_011959	TGA	2	6	518221	518226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
11570	NC_011959	GTC	2	6	518231	518236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632546
11571	NC_011959	CAA	2	6	518255	518260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632546
11572	NC_011959	GAT	2	6	518270	518275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
11573	NC_011959	GAG	2	6	518285	518290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632546
11574	NC_011959	GC	3	6	518382	518387	0 %	0 %	50 %	50 %	221632546
11575	NC_011959	ACG	2	6	518388	518393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632546
11576	NC_011959	CGA	2	6	518398	518403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632546
11577	NC_011959	GATCGT	2	12	518429	518440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632546
11578	NC_011959	CTTGAG	2	12	518453	518464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632546
11579	NC_011959	GAA	2	6	518468	518473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632546
11580	NC_011959	CCAG	2	8	518479	518486	25 %	0 %	25 %	50 %	221632546
11581	NC_011959	GAA	2	6	518501	518506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632546
11582	NC_011959	CAG	2	6	518510	518515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632546
11583	NC_011959	GAT	2	6	518543	518548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
11584	NC_011959	GC	3	6	518611	518616	0 %	0 %	50 %	50 %	221632546
11585	NC_011959	TCG	2	6	518644	518649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632546
11586	NC_011959	GCG	2	6	518679	518684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632546
11587	NC_011959	GC	3	6	518711	518716	0 %	0 %	50 %	50 %	221632546
11588	NC_011959	GAT	2	6	518789	518794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
11589	NC_011959	ATTGAG	2	12	518828	518839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
11590	NC_011959	GAAA	2	8	518852	518859	75 %	0 %	25 %	0 %	221632546
11591	NC_011959	TCG	3	9	518878	518886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632546
11592	NC_011959	CCG	2	6	518917	518922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632547
11593	NC_011959	ACGA	2	8	518978	518985	50 %	0 %	25 %	25 %	221632547
11594	NC_011959	CTG	2	6	519025	519030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632547
11595	NC_011959	GCC	2	6	519061	519066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632547
11596	NC_011959	AGA	2	6	519168	519173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632547
11597	NC_011959	TCGA	2	8	519233	519240	25 %	25 %	25 %	25 %	221632547
11598	NC_011959	ACG	2	6	519293	519298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632547
11599	NC_011959	AG	5	10	519317	519326	50 %	0 %	50 %	0 %	221632547
11600	NC_011959	CGAT	2	8	519329	519336	25 %	25 %	25 %	25 %	221632547
11601	NC_011959	GTT	2	6	519358	519363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632547
11602	NC_011959	GC	3	6	519377	519382	0 %	0 %	50 %	50 %	221632547
11603	NC_011959	ATG	2	6	519392	519397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632547
11604	NC_011959	AGGACG	2	12	519437	519448	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221632547
11605	NC_011959	GCG	2	6	519466	519471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632547
11606	NC_011959	CGAAGG	2	12	519489	519500	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221632547
11607	NC_011959	GTG	2	6	519527	519532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632547
11608	NC_011959	GC	3	6	519589	519594	0 %	0 %	50 %	50 %	221632547
11609	NC_011959	GCGA	2	8	519643	519650	25 %	0 %	50 %	25 %	221632547
11610	NC_011959	AAG	2	6	519683	519688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632547
11611	NC_011959	AGG	2	6	519692	519697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632547
11612	NC_011959	AG	3	6	519726	519731	50 %	0 %	50 %	0 %	221632547
11613	NC_011959	GC	3	6	519767	519772	0 %	0 %	50 %	50 %	221632547
11614	NC_011959	TCG	2	6	519960	519965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632548
11615	NC_011959	GAC	2	6	519982	519987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632548
11616	NC_011959	CTT	2	6	520017	520022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632548
11617	NC_011959	ATTCG	2	10	520219	520228	20 %	40 %	20 %	20 %	221632548
11618	NC_011959	CGA	2	6	520242	520247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632548
11619	NC_011959	TCA	2	6	520311	520316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632548
11620	NC_011959	CTT	3	9	520344	520352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632548
11621	NC_011959	CGTG	2	8	520356	520363	0 %	25 %	50 %	25 %	221632548
11622	NC_011959	TGT	3	9	520514	520522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632548
11623	NC_011959	CTC	2	6	520549	520554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632548
11624	NC_011959	TCG	2	6	520607	520612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632548
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11628	NC_011959	CGAT	2	8	521065	521072	25 %	25 %	25 %	25 %	221632549
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11738	NC_011959	GCCG	2	8	525753	525760	0 %	0 %	50 %	50 %	221632552
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11741	NC_011959	TGCG	2	8	525964	525971	0 %	25 %	50 %	25 %	221632552
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11743	NC_011959	CGA	2	6	526095	526100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632552
11744	NC_011959	GAT	2	6	526105	526110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632552
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11749	NC_011959	CGAGC	2	10	526357	526366	20 %	0 %	40 %	40 %	221632552
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11777	NC_011959	TCGT	2	8	527387	527394	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11778	NC_011959	CG	3	6	527471	527476	0 %	0 %	50 %	50 %	221632554
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11889	NC_011959	CGG	2	6	533306	533311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11981	NC_011959	TGG	2	6	537178	537183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632568
11982	NC_011959	GAA	2	6	537268	537273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632568
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