MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011959	CG	3	6	492171	492176	0 %	0 %	50 %	50 %	221632521
11002	NC_011959	ATC	2	6	492197	492202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632521
11003	NC_011959	GAA	2	6	492306	492311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632521
11004	NC_011959	ATCG	2	8	492331	492338	25 %	25 %	25 %	25 %	221632521
11005	NC_011959	TCG	2	6	492355	492360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632521
11006	NC_011959	AGC	2	6	492365	492370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632521
11007	NC_011959	GCG	2	6	492376	492381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632521
11008	NC_011959	CGA	2	6	492408	492413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632521
11009	NC_011959	CCTC	2	8	492494	492501	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11010	NC_011959	CAC	2	6	492514	492519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_011959	GAA	2	6	492540	492545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_011959	CTT	2	6	492606	492611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632522
11013	NC_011959	CTC	2	6	492619	492624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632522
11014	NC_011959	CGT	2	6	492651	492656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632522
11015	NC_011959	AGG	2	6	492668	492673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632522
11016	NC_011959	GAA	2	6	492694	492699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632522
11017	NC_011959	CGCT	2	8	492763	492770	0 %	25 %	25 %	50 %	221632522
11018	NC_011959	TGC	2	6	492778	492783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632522
11019	NC_011959	TGC	2	6	492829	492834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632522
11020	NC_011959	TGA	2	6	492840	492845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632522
11021	NC_011959	TCGGGT	2	12	492888	492899	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	221632522
11022	NC_011959	TGAA	2	8	492912	492919	50 %	25 %	25 %	0 %	221632522
11023	NC_011959	CGA	2	6	492972	492977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632522
11024	NC_011959	CAC	2	6	493016	493021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632522
11025	NC_011959	CGCTT	2	10	493085	493094	0 %	40 %	20 %	40 %	221632522
11026	NC_011959	GTGC	2	8	493124	493131	0 %	25 %	50 %	25 %	221632522
11027	NC_011959	GAT	2	6	493132	493137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632522
11028	NC_011959	CAT	2	6	493177	493182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632522
11029	NC_011959	GC	3	6	493272	493277	0 %	0 %	50 %	50 %	221632522
11030	NC_011959	GGT	2	6	493306	493311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632522
11031	NC_011959	CGA	2	6	493356	493361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632522
11032	NC_011959	CGA	2	6	493446	493451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632522
11033	NC_011959	GCG	2	6	493453	493458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632522
11034	NC_011959	GCA	2	6	493460	493465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632522
11035	NC_011959	CGT	2	6	493501	493506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632522
11036	NC_011959	GAG	2	6	493630	493635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632522
11037	NC_011959	GTTC	2	8	493716	493723	0 %	50 %	25 %	25 %	221632522
11038	NC_011959	CTGA	2	8	493781	493788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11039	NC_011959	TGG	2	6	493840	493845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_011959	CG	3	6	493875	493880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11041	NC_011959	TAC	2	6	493892	493897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_011959	GAG	2	6	493903	493908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_011959	TGA	2	6	493921	493926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_011959	GGT	2	6	493927	493932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_011959	TCG	2	6	493997	494002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_011959	CGA	3	9	494005	494013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_011959	TGA	2	6	494073	494078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_011959	AGG	2	6	494086	494091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_011959	TGC	2	6	494164	494169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632523
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11052	NC_011959	TCT	2	6	494323	494328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632523
11053	NC_011959	GGC	2	6	494341	494346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632523
11054	NC_011959	CAC	2	6	494398	494403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632523
11055	NC_011959	CTCG	2	8	494470	494477	0 %	25 %	25 %	50 %	221632523
11056	NC_011959	CCA	2	6	494500	494505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632523
11057	NC_011959	TTG	2	6	494510	494515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632523
11058	NC_011959	CTCG	2	8	494627	494634	0 %	25 %	25 %	50 %	221632523
11059	NC_011959	TCA	2	6	494638	494643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632523
11060	NC_011959	TCGGG	2	10	494691	494700	0 %	20 %	60 %	20 %	221632523
11061	NC_011959	CG	3	6	494703	494708	0 %	0 %	50 %	50 %	221632523
11062	NC_011959	C	6	6	494745	494750	0 %	0 %	0 %	100 %	221632523
11063	NC_011959	GCA	2	6	494769	494774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632523
11064	NC_011959	CAAG	2	8	494785	494792	50 %	0 %	25 %	25 %	221632523
11065	NC_011959	CG	3	6	494826	494831	0 %	0 %	50 %	50 %	221632523
11066	NC_011959	GGC	2	6	494859	494864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632523
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11069	NC_011959	TCT	2	6	494968	494973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632523
11070	NC_011959	GCG	2	6	495019	495024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632524
11071	NC_011959	CCT	2	6	495109	495114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632524
11072	NC_011959	AGC	2	6	495135	495140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632524
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11077	NC_011959	TCG	2	6	495315	495320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632524
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11082	NC_011959	GCT	2	6	495601	495606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632524
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11088	NC_011959	TGG	2	6	495782	495787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632524
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11093	NC_011959	TCG	2	6	496086	496091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632525
11094	NC_011959	GA	3	6	496100	496105	50 %	0 %	50 %	0 %	221632525
11095	NC_011959	TCG	2	6	496169	496174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11098	NC_011959	GAC	2	6	496327	496332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_011959	TCG	2	6	496402	496407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_011959	CTC	2	6	496509	496514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11101	NC_011959	CTT	2	6	496562	496567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_011959	AAG	2	6	496570	496575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_011959	GGCT	2	8	496667	496674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11104	NC_011959	CAT	2	6	496700	496705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_011959	ATG	2	6	496842	496847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_011959	TCG	2	6	496993	496998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_011959	TGG	2	6	497002	497007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_011959	CG	3	6	497015	497020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11109	NC_011959	GAGC	2	8	497065	497072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11110	NC_011959	GTGC	2	8	497073	497080	0 %	25 %	50 %	25 %	221632526
11111	NC_011959	GCT	2	6	497131	497136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632526
11112	NC_011959	CGC	2	6	497158	497163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632526
11113	NC_011959	GAGC	2	8	497176	497183	25 %	0 %	50 %	25 %	221632526
11114	NC_011959	CCG	2	6	497399	497404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632526
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11122	NC_011959	CTCC	2	8	497669	497676	0 %	25 %	0 %	75 %	221632526
11123	NC_011959	GCG	2	6	497677	497682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632526
11124	NC_011959	TCG	2	6	497714	497719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632526
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11147	NC_011959	CGG	2	6	498667	498672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11154	NC_011959	GAA	2	6	499109	499114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632527
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11232	NC_011959	CG	3	6	503011	503016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11244	NC_011959	TCG	2	6	503609	503614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632531
11245	NC_011959	GCG	2	6	503626	503631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632531
11246	NC_011959	GGC	2	6	503657	503662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632531
11247	NC_011959	ATC	2	6	503695	503700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632531
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11253	NC_011959	CGGA	2	8	503911	503918	25 %	0 %	50 %	25 %	221632531
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11255	NC_011959	TCG	2	6	503939	503944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632531
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11259	NC_011959	ACGT	2	8	504154	504161	25 %	25 %	25 %	25 %	221632531
11260	NC_011959	CGA	2	6	504261	504266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632531
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11263	NC_011959	GTC	2	6	504469	504474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632531
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11267	NC_011959	AG	3	6	504702	504707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11268	NC_011959	GAG	2	6	504721	504726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11271	NC_011959	TCGA	2	8	504885	504892	25 %	25 %	25 %	25 %	221632532
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11287	NC_011959	CA	3	6	505583	505588	50 %	0 %	0 %	50 %	221632532
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11326	NC_011959	CGA	2	6	507108	507113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632533
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11331	NC_011959	CGA	2	6	507291	507296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632533
11332	NC_011959	CGG	2	6	507305	507310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632533
11333	NC_011959	GATC	2	8	507342	507349	25 %	25 %	25 %	25 %	221632533
11334	NC_011959	GATC	2	8	507387	507394	25 %	25 %	25 %	25 %	221632533
11335	NC_011959	AGTG	2	8	507397	507404	25 %	25 %	50 %	0 %	221632533
11336	NC_011959	CAG	2	6	507441	507446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632533
11337	NC_011959	CT	3	6	507494	507499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11338	NC_011959	ACG	2	6	507535	507540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11339	NC_011959	GTC	2	6	507652	507657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632534
11340	NC_011959	GCTC	2	8	507690	507697	0 %	25 %	25 %	50 %	221632534
11341	NC_011959	GAG	2	6	507712	507717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632534
11342	NC_011959	GC	3	6	507769	507774	0 %	0 %	50 %	50 %	221632534
11343	NC_011959	AC	3	6	507782	507787	50 %	0 %	0 %	50 %	221632534
11344	NC_011959	GC	3	6	507819	507824	0 %	0 %	50 %	50 %	221632534
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11347	NC_011959	CCGG	2	8	508002	508009	0 %	0 %	50 %	50 %	221632534
11348	NC_011959	TGC	2	6	508116	508121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632534
11349	NC_011959	GAT	2	6	508231	508236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632534
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11351	NC_011959	GCGT	2	8	508317	508324	0 %	25 %	50 %	25 %	221632534
11352	NC_011959	ACG	2	6	508333	508338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632534
11353	NC_011959	CG	3	6	508337	508342	0 %	0 %	50 %	50 %	221632534
11354	NC_011959	TC	3	6	508368	508373	0 %	50 %	0 %	50 %	221632534
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11358	NC_011959	GAC	2	6	508644	508649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632535
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11360	NC_011959	GAT	2	6	508689	508694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632535
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11362	NC_011959	GGA	2	6	508847	508852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632535
11363	NC_011959	TCGC	2	8	508933	508940	0 %	25 %	25 %	50 %	221632535
11364	NC_011959	TCG	2	6	509080	509085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632535
11365	NC_011959	GC	3	6	509100	509105	0 %	0 %	50 %	50 %	221632535
11366	NC_011959	TCC	2	6	509113	509118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632535
11367	NC_011959	GCT	2	6	509170	509175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632535
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11373	NC_011959	TCC	2	6	509392	509397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632535
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11375	NC_011959	GCT	2	6	509491	509496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632535
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11393	NC_011959	CGGCG	2	10	510050	510059	0 %	0 %	60 %	40 %	221632535
11394	NC_011959	GAG	2	6	510084	510089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632535
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11399	NC_011959	TCGA	2	8	510258	510265	25 %	25 %	25 %	25 %	221632535
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11413	NC_011959	CTC	2	6	510765	510770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632536
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11416	NC_011959	CGAG	2	8	510874	510881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11417	NC_011959	ACCA	2	8	510986	510993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11418	NC_011959	TCA	2	6	511005	511010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11470	NC_011959	GC	3	6	513644	513649	0 %	0 %	50 %	50 %	221632540
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11477	NC_011959	AGA	2	6	513958	513963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11478	NC_011959	GTG	2	6	513967	513972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632541
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11482	NC_011959	TCG	2	6	514046	514051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632541
11483	NC_011959	GTG	2	6	514138	514143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632541
11484	NC_011959	AT	3	6	514191	514196	50 %	50 %	0 %	0 %	221632541
11485	NC_011959	GAC	2	6	514252	514257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632541
11486	NC_011959	G	6	6	514335	514340	0 %	0 %	100 %	0 %	221632541
11487	NC_011959	GGTG	2	8	514349	514356	0 %	25 %	75 %	0 %	221632541
11488	NC_011959	GCT	2	6	514402	514407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632541
11489	NC_011959	TCG	2	6	514442	514447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632541
11490	NC_011959	CGT	2	6	514491	514496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632541
11491	NC_011959	GCG	2	6	514506	514511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632541
11492	NC_011959	GAG	2	6	514531	514536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632541
11493	NC_011959	GTGC	2	8	514537	514544	0 %	25 %	50 %	25 %	221632541
11494	NC_011959	GCTGG	2	10	514645	514654	0 %	20 %	60 %	20 %	221632541
11495	NC_011959	ACC	2	6	514669	514674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632541
11496	NC_011959	GTGC	2	8	514708	514715	0 %	25 %	50 %	25 %	221632541
11497	NC_011959	CGCTG	2	10	514722	514731	0 %	20 %	40 %	40 %	221632541
11498	NC_011959	CGA	2	6	514800	514805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632541
11499	NC_011959	GACG	2	8	514837	514844	25 %	0 %	50 %	25 %	221632541
11500	NC_011959	ATG	2	6	514851	514856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632541

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