MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_011959	GCG	2	6	423720	423725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632453
9502	NC_011959	CAG	2	6	423795	423800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9503	NC_011959	GCGG	2	8	423855	423862	0 %	0 %	75 %	25 %	221632453
9504	NC_011959	TG	3	6	423870	423875	0 %	50 %	50 %	0 %	221632453
9505	NC_011959	CGA	2	6	423944	423949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9506	NC_011959	TCC	2	6	423950	423955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632453
9507	NC_011959	CGT	2	6	423970	423975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9508	NC_011959	GCA	2	6	424028	424033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9509	NC_011959	CGC	2	6	424058	424063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632453
9510	NC_011959	GCT	2	6	424071	424076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9511	NC_011959	TCG	2	6	424132	424137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9512	NC_011959	GAT	2	6	424139	424144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632453
9513	NC_011959	AGTGC	2	10	424152	424161	20 %	20 %	40 %	20 %	221632453
9514	NC_011959	ACG	2	6	424195	424200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9515	NC_011959	AACG	2	8	424204	424211	50 %	0 %	25 %	25 %	221632453
9516	NC_011959	CGCT	2	8	424213	424220	0 %	25 %	25 %	50 %	221632453
9517	NC_011959	CGG	2	6	424263	424268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632453
9518	NC_011959	GTC	2	6	424308	424313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9519	NC_011959	TGG	2	6	424321	424326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632453
9520	NC_011959	GAA	2	6	424346	424351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632453
9521	NC_011959	GAC	2	6	424395	424400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9522	NC_011959	CGCTG	2	10	424403	424412	0 %	20 %	40 %	40 %	221632453
9523	NC_011959	CGT	2	6	424428	424433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9524	NC_011959	TCG	2	6	424436	424441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9525	NC_011959	CG	3	6	424440	424445	0 %	0 %	50 %	50 %	221632453
9526	NC_011959	TGG	2	6	424502	424507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632453
9527	NC_011959	GCG	2	6	424524	424529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632453
9528	NC_011959	CG	3	6	424528	424533	0 %	0 %	50 %	50 %	221632453
9529	NC_011959	GCA	2	6	424569	424574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9530	NC_011959	TGC	2	6	424627	424632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9531	NC_011959	CG	3	6	424633	424638	0 %	0 %	50 %	50 %	221632453
9532	NC_011959	CCG	2	6	424712	424717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632453
9533	NC_011959	CGA	2	6	424726	424731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9534	NC_011959	CGCT	2	8	424734	424741	0 %	25 %	25 %	50 %	221632453
9535	NC_011959	CGG	2	6	424770	424775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632453
9536	NC_011959	GCT	2	6	424784	424789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9537	NC_011959	GAG	2	6	424833	424838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632453
9538	NC_011959	CGC	2	6	424841	424846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632453
9539	NC_011959	AAG	2	6	424884	424889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632453
9540	NC_011959	GGT	2	6	424979	424984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632454
9541	NC_011959	CCGA	2	8	424997	425004	25 %	0 %	25 %	50 %	221632454
9542	NC_011959	GTC	2	6	425027	425032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632454
9543	NC_011959	GGC	2	6	425073	425078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632454
9544	NC_011959	GCT	2	6	425161	425166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632454
9545	NC_011959	CCAGC	2	10	425207	425216	20 %	0 %	20 %	60 %	221632454
9546	NC_011959	ATC	2	6	425294	425299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632454
9547	NC_011959	GGT	2	6	425309	425314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632454
9548	NC_011959	ACG	2	6	425324	425329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632454
9549	NC_011959	TGG	2	6	425416	425421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632454
9550	NC_011959	GGT	2	6	425432	425437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632454
9551	NC_011959	CGT	2	6	425449	425454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632454
9552	NC_011959	TCG	2	6	425475	425480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632454
9553	NC_011959	TGC	2	6	425481	425486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632454
9554	NC_011959	GAG	2	6	425516	425521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632454
9555	NC_011959	TTC	2	6	425523	425528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632454
9556	NC_011959	GAGGG	2	10	425616	425625	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9557	NC_011959	ATGG	2	8	425627	425634	25 %	25 %	50 %	0 %	221632455
9558	NC_011959	CTC	2	6	425649	425654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632455
9559	NC_011959	GCA	2	6	425702	425707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632455
9560	NC_011959	GGC	2	6	425796	425801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632455
9561	NC_011959	GCA	3	9	425808	425816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632455
9562	NC_011959	CTC	2	6	425887	425892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632455
9563	NC_011959	GTT	2	6	425902	425907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632455
9564	NC_011959	TCG	2	6	425970	425975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632455
9565	NC_011959	GGC	2	6	426001	426006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632455
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9567	NC_011959	GTC	2	6	426072	426077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632455
9568	NC_011959	CTT	2	6	426132	426137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632455
9569	NC_011959	GCG	2	6	426147	426152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632455
9570	NC_011959	GGA	2	6	426242	426247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632455
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9572	NC_011959	GTC	4	12	426438	426449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632455
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9574	NC_011959	TGG	2	6	426581	426586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632455
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9577	NC_011959	GAGC	2	8	426678	426685	25 %	0 %	50 %	25 %	221632455
9578	NC_011959	GCG	2	6	426690	426695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632455
9579	NC_011959	TGC	2	6	426740	426745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632455
9580	NC_011959	TGG	2	6	426820	426825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632455
9581	NC_011959	CGCGA	2	10	426913	426922	20 %	0 %	40 %	40 %	221632456
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9584	NC_011959	GCC	2	6	426991	426996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632456
9585	NC_011959	GGTC	2	8	426997	427004	0 %	25 %	50 %	25 %	221632456
9586	NC_011959	GCGA	2	8	427114	427121	25 %	0 %	50 %	25 %	221632456
9587	NC_011959	TCG	2	6	427239	427244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632456
9588	NC_011959	TCA	2	6	427269	427274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632456
9589	NC_011959	TCGC	2	8	427293	427300	0 %	25 %	25 %	50 %	221632456
9590	NC_011959	GCT	2	6	427357	427362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632456
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9593	NC_011959	ATT	2	6	427563	427568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221632456
9594	NC_011959	CTGG	2	8	427578	427585	0 %	25 %	50 %	25 %	221632456
9595	NC_011959	TCC	2	6	427599	427604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632456
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9597	NC_011959	CAT	2	6	427687	427692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632456
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9602	NC_011959	CTCG	2	8	427845	427852	0 %	25 %	25 %	50 %	221632457
9603	NC_011959	GCGA	2	8	427873	427880	25 %	0 %	50 %	25 %	221632457
9604	NC_011959	CGCT	2	8	428179	428186	0 %	25 %	25 %	50 %	221632458
9605	NC_011959	ACA	2	6	428245	428250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632458
9606	NC_011959	AC	3	6	428271	428276	50 %	0 %	0 %	50 %	221632458
9607	NC_011959	CGG	2	6	428300	428305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632458
9608	NC_011959	CGG	2	6	428329	428334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632458
9609	NC_011959	GCA	2	6	428364	428369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632458
9610	NC_011959	CGA	2	6	428394	428399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632458
9611	NC_011959	GCA	2	6	428421	428426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632458
9612	NC_011959	GTT	2	6	428433	428438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632458
9613	NC_011959	CGA	2	6	428477	428482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632458
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9617	NC_011959	TGGGT	2	10	428607	428616	0 %	40 %	60 %	0 %	221632458
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