MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011959	GCG	2	6	22176	22181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632056
502	NC_011959	GCT	2	6	22205	22210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632056
503	NC_011959	GAC	2	6	22258	22263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632056
504	NC_011959	TCA	2	6	22275	22280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632056
505	NC_011959	ATG	2	6	22365	22370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632056
506	NC_011959	CGTG	2	8	22399	22406	0 %	25 %	50 %	25 %	221632056
507	NC_011959	GCC	2	6	22522	22527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632056
508	NC_011959	TCGAG	2	10	22573	22582	20 %	20 %	40 %	20 %	221632056
509	NC_011959	GAG	2	6	22601	22606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632056
510	NC_011959	TCG	2	6	22617	22622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632056
511	NC_011959	TCG	3	9	22653	22661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632056
512	NC_011959	TGCA	2	8	22734	22741	25 %	25 %	25 %	25 %	221632056
513	NC_011959	TCGCG	2	10	22759	22768	0 %	20 %	40 %	40 %	221632056
514	NC_011959	CG	4	8	22765	22772	0 %	0 %	50 %	50 %	221632056
515	NC_011959	CGC	2	6	22786	22791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632056
516	NC_011959	G	6	6	22797	22802	0 %	0 %	100 %	0 %	221632056
517	NC_011959	TCG	2	6	22827	22832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632056
518	NC_011959	GTC	2	6	22841	22846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632056
519	NC_011959	CGA	2	6	22900	22905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632056
520	NC_011959	TCT	2	6	22906	22911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632056
521	NC_011959	CGC	2	6	22953	22958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632056
522	NC_011959	TAC	2	6	22997	23002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632056
523	NC_011959	GGA	2	6	23035	23040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632056
524	NC_011959	GAC	2	6	23116	23121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632056
525	NC_011959	GAC	2	6	23130	23135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632056
526	NC_011959	CG	3	6	23162	23167	0 %	0 %	50 %	50 %	221632056
527	NC_011959	AGG	2	6	23265	23270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632056
528	NC_011959	CTTG	2	8	23302	23309	0 %	50 %	25 %	25 %	221632056
529	NC_011959	TCG	2	6	23397	23402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632056
530	NC_011959	TCCT	2	8	23433	23440	0 %	50 %	0 %	50 %	221632056
531	NC_011959	CTG	2	6	23608	23613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632057
532	NC_011959	TGC	2	6	23675	23680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632057
533	NC_011959	CGT	2	6	23683	23688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632057
534	NC_011959	CCG	2	6	23690	23695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632057
535	NC_011959	CGA	2	6	23700	23705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632057
536	NC_011959	CGC	2	6	23741	23746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632057
537	NC_011959	CTA	2	6	23778	23783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632057
538	NC_011959	GCGTC	2	10	23844	23853	0 %	20 %	40 %	40 %	221632057
539	NC_011959	CAACCA	2	12	23929	23940	50 %	0 %	0 %	50 %	221632057
540	NC_011959	CGC	2	6	23958	23963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632057
541	NC_011959	CTG	2	6	23991	23996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632057
542	NC_011959	GAG	2	6	24004	24009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632057
543	NC_011959	CTG	2	6	24017	24022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632057
544	NC_011959	CAC	2	6	24026	24031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632057
545	NC_011959	CGCAG	2	10	24043	24052	20 %	0 %	40 %	40 %	221632057
546	NC_011959	T	6	6	24091	24096	0 %	100 %	0 %	0 %	221632058
547	NC_011959	CTCG	2	8	24108	24115	0 %	25 %	25 %	50 %	221632058
548	NC_011959	TCA	2	6	24116	24121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632058
549	NC_011959	GAA	2	6	24144	24149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632058
550	NC_011959	CTT	2	6	24158	24163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632058
551	NC_011959	CTT	2	6	24260	24265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632058
552	NC_011959	CG	3	6	24301	24306	0 %	0 %	50 %	50 %	221632058
553	NC_011959	TC	3	6	24311	24316	0 %	50 %	0 %	50 %	221632058
554	NC_011959	TCC	2	6	24331	24336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632058
555	NC_011959	TCC	2	6	24424	24429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632058
556	NC_011959	CCG	2	6	24437	24442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632058
557	NC_011959	GCAG	2	8	24458	24465	25 %	0 %	50 %	25 %	221632058
558	NC_011959	ATC	2	6	24474	24479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632058
559	NC_011959	GAG	2	6	24501	24506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632058
560	NC_011959	CCG	2	6	24517	24522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632058
561	NC_011959	CTA	2	6	24557	24562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632058
562	NC_011959	GCCA	2	8	24572	24579	25 %	0 %	25 %	50 %	221632058
563	NC_011959	CGA	2	6	24629	24634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632058
564	NC_011959	GCTC	2	8	24683	24690	0 %	25 %	25 %	50 %	221632058
565	NC_011959	AC	3	6	24702	24707	50 %	0 %	0 %	50 %	221632058
566	NC_011959	ACGAA	2	10	24733	24742	60 %	0 %	20 %	20 %	221632058
567	NC_011959	CGA	2	6	24881	24886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632058
568	NC_011959	GTC	2	6	24903	24908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632058
569	NC_011959	GAC	2	6	24977	24982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632058
570	NC_011959	TCG	2	6	25136	25141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632059
571	NC_011959	ACG	2	6	25145	25150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632059
572	NC_011959	CG	3	6	25167	25172	0 %	0 %	50 %	50 %	221632059
573	NC_011959	GCC	2	6	25187	25192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632059
574	NC_011959	ACTC	2	8	25233	25240	25 %	25 %	0 %	50 %	221632059
575	NC_011959	CCG	2	6	25251	25256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632059
576	NC_011959	GCA	2	6	25260	25265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632059
577	NC_011959	ATCG	2	8	25282	25289	25 %	25 %	25 %	25 %	221632059
578	NC_011959	AACC	2	8	25366	25373	50 %	0 %	0 %	50 %	221632059
579	NC_011959	CTCCGC	2	12	25398	25409	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	221632060
580	NC_011959	GGC	2	6	25425	25430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
581	NC_011959	CCA	2	6	25478	25483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632060
582	NC_011959	CGG	2	6	25503	25508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
583	NC_011959	ACC	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632060
584	NC_011959	CGA	2	6	25520	25525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632060
585	NC_011959	CGC	2	6	25530	25535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
586	NC_011959	CAGCG	2	10	25551	25560	20 %	0 %	40 %	40 %	221632060
587	NC_011959	CGGA	2	8	25581	25588	25 %	0 %	50 %	25 %	221632060
588	NC_011959	TGA	3	9	25592	25600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632060
589	NC_011959	CGC	2	6	25617	25622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
590	NC_011959	GAT	2	6	25674	25679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632060
591	NC_011959	CCA	2	6	25727	25732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632060
592	NC_011959	CCG	2	6	25735	25740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
593	NC_011959	CGC	2	6	25745	25750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
594	NC_011959	CGT	2	6	25760	25765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632060
595	NC_011959	CGT	2	6	25781	25786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632060
596	NC_011959	CGG	2	6	25805	25810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
597	NC_011959	AAC	2	6	25843	25848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632060
598	NC_011959	GGC	2	6	25881	25886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
599	NC_011959	CGC	2	6	25923	25928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
600	NC_011959	CGC	2	6	25935	25940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
601	NC_011959	CAC	2	6	25950	25955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632060
602	NC_011959	CCG	2	6	26000	26005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
603	NC_011959	GCC	2	6	26028	26033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
604	NC_011959	GAT	2	6	26079	26084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632060
605	NC_011959	TCG	2	6	26117	26122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632060
606	NC_011959	TCG	2	6	26204	26209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632060
607	NC_011959	GGC	2	6	26244	26249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
608	NC_011959	GGT	2	6	26289	26294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632060
609	NC_011959	CGA	2	6	26324	26329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632060
610	NC_011959	GCG	2	6	26369	26374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
611	NC_011959	GAT	2	6	26397	26402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632060
612	NC_011959	TCC	2	6	26461	26466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_011959	TCG	2	6	26471	26476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011959	GAT	2	6	26482	26487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011959	GC	3	6	26499	26504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_011959	CGC	2	6	26533	26538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_011959	ACCAG	2	10	26543	26552	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
618	NC_011959	GCTC	2	8	26585	26592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
619	NC_011959	GCG	2	6	26603	26608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_011959	GAG	2	6	26673	26678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011959	GC	3	6	26704	26709	0 %	0 %	50 %	50 %	221632061
622	NC_011959	TCGT	2	8	26746	26753	0 %	50 %	25 %	25 %	221632061
623	NC_011959	GAT	2	6	26778	26783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632061
624	NC_011959	GGCA	2	8	26818	26825	25 %	0 %	50 %	25 %	221632061
625	NC_011959	GC	3	6	26884	26889	0 %	0 %	50 %	50 %	221632061
626	NC_011959	GTG	2	6	26891	26896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632061
627	NC_011959	CGA	3	9	26912	26920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632061
628	NC_011959	GCG	2	6	26961	26966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632061
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1000	NC_011959	TGCAG	2	10	44716	44725	20 %	20 %	40 %	20 %	221632074

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