MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011959	CTCGC	2	10	399769	399778	0 %	20 %	20 %	60 %	221632427
9002	NC_011959	ATC	2	6	399823	399828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632427
9003	NC_011959	TCA	2	6	399923	399928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632427
9004	NC_011959	GGC	2	6	399998	400003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632427
9005	NC_011959	GAA	2	6	400029	400034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632427
9006	NC_011959	AGG	2	6	400079	400084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632427
9007	NC_011959	GAC	2	6	400093	400098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632428
9008	NC_011959	CG	3	6	400186	400191	0 %	0 %	50 %	50 %	221632428
9009	NC_011959	CGGG	2	8	400203	400210	0 %	0 %	75 %	25 %	221632428
9010	NC_011959	GGCCG	2	10	400237	400246	0 %	0 %	60 %	40 %	221632428
9011	NC_011959	TCG	2	6	400311	400316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632428
9012	NC_011959	GTC	2	6	400424	400429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632428
9013	NC_011959	ACC	2	6	400514	400519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632428
9014	NC_011959	CAG	2	6	400539	400544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632428
9015	NC_011959	GGT	2	6	400591	400596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632428
9016	NC_011959	G	6	6	400604	400609	0 %	0 %	100 %	0 %	221632428
9017	NC_011959	CGC	3	9	400624	400632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632428
9018	NC_011959	CGG	2	6	400671	400676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632428
9019	NC_011959	TCG	2	6	400677	400682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632428
9020	NC_011959	GGA	2	6	400687	400692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632428
9021	NC_011959	GGT	2	6	400723	400728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632428
9022	NC_011959	CTG	2	6	400820	400825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632429
9023	NC_011959	TGC	2	6	400830	400835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632429
9024	NC_011959	TCG	2	6	400924	400929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632429
9025	NC_011959	GTC	2	6	400934	400939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632429
9026	NC_011959	TCC	2	6	401026	401031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632429
9027	NC_011959	GC	3	6	401037	401042	0 %	0 %	50 %	50 %	221632429
9028	NC_011959	CCT	2	6	401047	401052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632429
9029	NC_011959	GCT	2	6	401073	401078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632429
9030	NC_011959	CAG	2	6	401094	401099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632429
9031	NC_011959	GGC	2	6	401176	401181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632429
9032	NC_011959	GC	3	6	401286	401291	0 %	0 %	50 %	50 %	221632429
9033	NC_011959	GGC	2	6	401320	401325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632429
9034	NC_011959	AGC	2	6	401359	401364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632429
9035	NC_011959	GC	3	6	401432	401437	0 %	0 %	50 %	50 %	221632430
9036	NC_011959	TCC	2	6	401453	401458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632430
9037	NC_011959	TCG	2	6	401483	401488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632430
9038	NC_011959	CG	3	6	401516	401521	0 %	0 %	50 %	50 %	221632430
9039	NC_011959	GGT	2	6	401565	401570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632430
9040	NC_011959	TCG	2	6	401576	401581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632430
9041	NC_011959	GGC	2	6	401584	401589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632430
9042	NC_011959	AAC	2	6	401596	401601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_011959	TC	3	6	401652	401657	0 %	50 %	0 %	50 %	221632431
9044	NC_011959	TCG	2	6	401710	401715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632431
9045	NC_011959	CTT	3	9	401729	401737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632431
9046	NC_011959	CCG	2	6	401779	401784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632431
9047	NC_011959	GCGA	2	8	401895	401902	25 %	0 %	50 %	25 %	221632431
9048	NC_011959	CGG	2	6	401928	401933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632431
9049	NC_011959	TGA	2	6	401973	401978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632431
9050	NC_011959	CTG	2	6	401979	401984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632431
9051	NC_011959	TCC	2	6	402019	402024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632432
9052	NC_011959	GAGCC	2	10	402097	402106	20 %	0 %	40 %	40 %	221632432
9053	NC_011959	ACC	2	6	402110	402115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632432
9054	NC_011959	GA	3	6	402131	402136	50 %	0 %	50 %	0 %	221632432
9055	NC_011959	GGA	3	9	402177	402185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632432
9056	NC_011959	ACG	2	6	402197	402202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632432
9057	NC_011959	TGC	2	6	402268	402273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632432
9058	NC_011959	ACG	2	6	402296	402301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632432
9059	NC_011959	GGTG	2	8	402312	402319	0 %	25 %	75 %	0 %	221632432
9060	NC_011959	CG	3	6	402397	402402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9061	NC_011959	TTCCT	2	10	402404	402413	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9062	NC_011959	TCG	2	6	402427	402432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_011959	GAG	2	6	402458	402463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_011959	GAA	2	6	402540	402545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632433
9065	NC_011959	TCG	2	6	402593	402598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9066	NC_011959	CGA	2	6	402639	402644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9067	NC_011959	GC	3	6	402651	402656	0 %	0 %	50 %	50 %	221632433
9068	NC_011959	GACG	2	8	402660	402667	25 %	0 %	50 %	25 %	221632433
9069	NC_011959	CGA	2	6	402702	402707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9070	NC_011959	GGC	2	6	402741	402746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632433
9071	NC_011959	CGC	2	6	402748	402753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632433
9072	NC_011959	CGG	2	6	402936	402941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632433
9073	NC_011959	TCGG	2	8	402979	402986	0 %	25 %	50 %	25 %	221632433
9074	NC_011959	TCA	2	6	402989	402994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632433
9075	NC_011959	TAC	2	6	403198	403203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632433
9076	NC_011959	TCG	2	6	403208	403213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9077	NC_011959	ACA	2	6	403223	403228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632433
9078	NC_011959	CGA	2	6	403236	403241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9079	NC_011959	TCA	2	6	403256	403261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632433
9080	NC_011959	GC	3	6	403273	403278	0 %	0 %	50 %	50 %	221632433
9081	NC_011959	CTA	2	6	403293	403298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632433
9082	NC_011959	GCG	2	6	403326	403331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632433
9083	NC_011959	ACG	2	6	403439	403444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9084	NC_011959	TCA	2	6	403541	403546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632433
9085	NC_011959	TCG	2	6	403547	403552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9086	NC_011959	ATG	2	6	403570	403575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632433
9087	NC_011959	GCC	2	6	403580	403585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632433
9088	NC_011959	AGG	2	6	403622	403627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632433
9089	NC_011959	CGA	2	6	403661	403666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9090	NC_011959	ACT	2	6	403679	403684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632433
9091	NC_011959	CGG	2	6	403721	403726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632433
9092	NC_011959	CCGAGG	2	12	403730	403741	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221632433
9093	NC_011959	GGT	2	6	403767	403772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632433
9094	NC_011959	GAT	2	6	403794	403799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632433
9095	NC_011959	GTG	2	6	403855	403860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632433
9096	NC_011959	GAG	2	6	403870	403875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632433
9097	NC_011959	TCGG	2	8	403886	403893	0 %	25 %	50 %	25 %	221632433
9098	NC_011959	TCGA	2	8	403915	403922	25 %	25 %	25 %	25 %	221632433
9099	NC_011959	TCG	2	6	404012	404017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9100	NC_011959	CGA	2	6	404051	404056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9101	NC_011959	ACG	2	6	404148	404153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9102	NC_011959	GAC	2	6	404293	404298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
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9104	NC_011959	AGA	3	9	404348	404356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632433
9105	NC_011959	TCG	2	6	404390	404395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9106	NC_011959	TCA	2	6	404408	404413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632433
9107	NC_011959	AGC	2	6	404417	404422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9108	NC_011959	CCG	2	6	404442	404447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632433
9109	NC_011959	GCG	2	6	404496	404501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632433
9110	NC_011959	CGG	2	6	404537	404542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632433
9111	NC_011959	TCC	2	6	404564	404569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632433
9112	NC_011959	CGC	2	6	404609	404614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632433
9113	NC_011959	GAA	2	6	404623	404628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632433
9114	NC_011959	GAAC	2	8	404637	404644	50 %	0 %	25 %	25 %	221632433
9115	NC_011959	GTG	2	6	404842	404847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632433
9116	NC_011959	CAG	2	6	404875	404880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9117	NC_011959	ACG	2	6	404900	404905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632433
9118	NC_011959	ACCGA	2	10	404973	404982	40 %	0 %	20 %	40 %	221632433
9119	NC_011959	GGT	2	6	404983	404988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632433
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9121	NC_011959	GAA	2	6	405057	405062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632433
9122	NC_011959	TGC	2	6	405073	405078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632433
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9230	NC_011959	CGTT	2	8	410823	410830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9231	NC_011959	GAGC	2	8	410834	410841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9232	NC_011959	GC	3	6	410894	410899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9233	NC_011959	CGA	2	6	410996	411001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632440
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9241	NC_011959	TCGC	2	8	411528	411535	0 %	25 %	25 %	50 %	221632440
9242	NC_011959	GCCA	2	8	411581	411588	25 %	0 %	25 %	50 %	221632440
9243	NC_011959	CGAT	2	8	411638	411645	25 %	25 %	25 %	25 %	221632440
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9490	NC_011959	CGC	2	6	423104	423109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632453
9491	NC_011959	CCGA	2	8	423294	423301	25 %	0 %	25 %	50 %	221632453
9492	NC_011959	CAT	2	6	423353	423358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632453
9493	NC_011959	CG	3	6	423412	423417	0 %	0 %	50 %	50 %	221632453
9494	NC_011959	CCG	2	6	423428	423433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632453
9495	NC_011959	GGTGC	2	10	423480	423489	0 %	20 %	60 %	20 %	221632453
9496	NC_011959	CTA	2	6	423575	423580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632453
9497	NC_011959	CAT	2	6	423641	423646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632453
9498	NC_011959	CGT	2	6	423653	423658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632453
9499	NC_011959	GGC	2	6	423704	423709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632453
9500	NC_011959	GGA	2	6	423713	423718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632453

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