MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011959	TGC	2	6	376423	376428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632399
8502	NC_011959	ACG	2	6	376492	376497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632399
8503	NC_011959	GAG	2	6	376533	376538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632399
8504	NC_011959	TCC	2	6	376561	376566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632399
8505	NC_011959	TGC	2	6	376626	376631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632399
8506	NC_011959	TAA	2	6	376646	376651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221632399
8507	NC_011959	CGT	2	6	376685	376690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632399
8508	NC_011959	TGG	2	6	376696	376701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632399
8509	NC_011959	GAT	2	6	376728	376733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632399
8510	NC_011959	GAG	2	6	376749	376754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632399
8511	NC_011959	CG	4	8	376757	376764	0 %	0 %	50 %	50 %	221632399
8512	NC_011959	TGC	2	6	376801	376806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632399
8513	NC_011959	CGCT	2	8	376809	376816	0 %	25 %	25 %	50 %	221632399
8514	NC_011959	TCC	2	6	376832	376837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632400
8515	NC_011959	GTC	2	6	376844	376849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632400
8516	NC_011959	TCG	2	6	376898	376903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632400
8517	NC_011959	TAGC	2	8	376938	376945	25 %	25 %	25 %	25 %	221632400
8518	NC_011959	TGCC	2	8	377015	377022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8519	NC_011959	ACTTC	2	10	377110	377119	20 %	40 %	0 %	40 %	221632401
8520	NC_011959	GTGAAG	2	12	377199	377210	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	221632401
8521	NC_011959	CGA	2	6	377230	377235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632401
8522	NC_011959	GAA	2	6	377238	377243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632401
8523	NC_011959	GTC	2	6	377244	377249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632401
8524	NC_011959	TGC	2	6	377277	377282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632401
8525	NC_011959	GTCACG	2	12	377304	377315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632401
8526	NC_011959	CCG	2	6	377388	377393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632401
8527	NC_011959	CCA	2	6	377412	377417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632401
8528	NC_011959	CCA	3	9	377421	377429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632401
8529	NC_011959	CGCGT	2	10	377497	377506	0 %	20 %	40 %	40 %	221632401
8530	NC_011959	CCT	2	6	377542	377547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632401
8531	NC_011959	CAA	2	6	377567	377572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632401
8532	NC_011959	AG	3	6	377633	377638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_011959	GGT	2	6	377730	377735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632402
8534	NC_011959	TGC	2	6	377841	377846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632402
8535	NC_011959	CG	3	6	377855	377860	0 %	0 %	50 %	50 %	221632402
8536	NC_011959	GAC	2	6	377862	377867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632402
8537	NC_011959	GAC	3	9	377916	377924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632402
8538	NC_011959	GAG	2	6	377943	377948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632402
8539	NC_011959	TCG	2	6	377962	377967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632402
8540	NC_011959	TGG	2	6	378002	378007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632402
8541	NC_011959	CTGC	2	8	378032	378039	0 %	25 %	25 %	50 %	221632402
8542	NC_011959	GC	3	6	378061	378066	0 %	0 %	50 %	50 %	221632402
8543	NC_011959	CGAC	2	8	378071	378078	25 %	0 %	25 %	50 %	221632402
8544	NC_011959	AGG	2	6	378110	378115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632402
8545	NC_011959	TGAT	2	8	378130	378137	25 %	50 %	25 %	0 %	221632402
8546	NC_011959	GC	3	6	378162	378167	0 %	0 %	50 %	50 %	221632402
8547	NC_011959	TCG	2	6	378241	378246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632402
8548	NC_011959	TCC	2	6	378253	378258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632402
8549	NC_011959	TGA	2	6	378326	378331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632402
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8551	NC_011959	TGGG	2	8	378419	378426	0 %	25 %	75 %	0 %	221632403
8552	NC_011959	GTCG	2	8	378466	378473	0 %	25 %	50 %	25 %	221632403
8553	NC_011959	GGT	2	6	378501	378506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632403
8554	NC_011959	TGGC	2	8	378578	378585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8555	NC_011959	CGA	2	6	378602	378607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_011959	CCAG	2	8	378608	378615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8557	NC_011959	GA	3	6	378631	378636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_011959	GTC	2	6	378650	378655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_011959	TCA	2	6	378694	378699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632404
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8561	NC_011959	CCT	2	6	378781	378786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632404
8562	NC_011959	CGTC	2	8	378844	378851	0 %	25 %	25 %	50 %	221632404
8563	NC_011959	TCC	2	6	378858	378863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632404
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8565	NC_011959	CAT	2	6	378955	378960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632404
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8569	NC_011959	GTC	2	6	379025	379030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632404
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8572	NC_011959	CCT	2	6	379203	379208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632405
8573	NC_011959	CGC	2	6	379246	379251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632405
8574	NC_011959	CTGA	2	8	379255	379262	25 %	25 %	25 %	25 %	221632405
8575	NC_011959	CGGTC	2	10	379370	379379	0 %	20 %	40 %	40 %	221632405
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8579	NC_011959	GTC	2	6	379569	379574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632406
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8582	NC_011959	CGG	2	6	379654	379659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632406
8583	NC_011959	TGA	2	6	379696	379701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632406
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8588	NC_011959	GCTC	2	8	379785	379792	0 %	25 %	25 %	50 %	221632406
8589	NC_011959	GTCG	2	8	379919	379926	0 %	25 %	50 %	25 %	221632406
8590	NC_011959	GCCACC	2	12	379943	379954	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221632406
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8592	NC_011959	ACGA	2	8	380141	380148	50 %	0 %	25 %	25 %	221632406
8593	NC_011959	GGGAT	2	10	380154	380163	20 %	20 %	60 %	0 %	221632406
8594	NC_011959	CTC	2	6	380231	380236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632406
8595	NC_011959	GCCG	2	8	380254	380261	0 %	0 %	50 %	50 %	221632406
8596	NC_011959	TCG	2	6	380265	380270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632406
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8601	NC_011959	ACG	3	9	380358	380366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632406
8602	NC_011959	CTGG	2	8	380371	380378	0 %	25 %	50 %	25 %	221632406
8603	NC_011959	GGT	2	6	380384	380389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632406
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8605	NC_011959	CGT	2	6	380423	380428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632406
8606	NC_011959	GAC	2	6	380441	380446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632406
8607	NC_011959	GC	3	6	380452	380457	0 %	0 %	50 %	50 %	221632406
8608	NC_011959	GC	3	6	380474	380479	0 %	0 %	50 %	50 %	221632406
8609	NC_011959	GC	4	8	380487	380494	0 %	0 %	50 %	50 %	221632406
8610	NC_011959	CCT	2	6	380515	380520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632406
8611	NC_011959	AGCG	2	8	380576	380583	25 %	0 %	50 %	25 %	221632406
8612	NC_011959	CGCT	2	8	380593	380600	0 %	25 %	25 %	50 %	221632406
8613	NC_011959	GCC	2	6	380645	380650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632406
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8622	NC_011959	TGA	2	6	381372	381377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632407
8623	NC_011959	CGA	2	6	381381	381386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632407
8624	NC_011959	CTC	2	6	381406	381411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632407
8625	NC_011959	ACG	2	6	381443	381448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632407
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8632	NC_011959	GAC	2	6	381697	381702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632407
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8635	NC_011959	GATC	2	8	381870	381877	25 %	25 %	25 %	25 %	221632407
8636	NC_011959	TCG	2	6	381911	381916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632407
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8641	NC_011959	GCG	2	6	382087	382092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8642	NC_011959	AGA	2	6	382270	382275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632408
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8644	NC_011959	GGTA	2	8	382351	382358	25 %	25 %	50 %	0 %	221632408
8645	NC_011959	TCG	2	6	382374	382379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632408
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8652	NC_011959	CCAC	2	8	382657	382664	25 %	0 %	0 %	75 %	221632408
8653	NC_011959	TGG	2	6	382669	382674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632408
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8686	NC_011959	TCT	2	6	384573	384578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632410
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8688	NC_011959	CGGT	2	8	384606	384613	0 %	25 %	50 %	25 %	221632410
8689	NC_011959	CGA	2	6	384624	384629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632410
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8693	NC_011959	TCG	2	6	385024	385029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632411
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8697	NC_011959	CGA	2	6	385136	385141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632411
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8731	NC_011959	CTC	2	6	386559	386564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632414
8732	NC_011959	GAGC	2	8	386642	386649	25 %	0 %	50 %	25 %	221632414
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8735	NC_011959	CTG	3	9	386940	386948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632414
8736	NC_011959	GAGCGC	2	12	387003	387014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221632414
8737	NC_011959	GCGT	2	8	387037	387044	0 %	25 %	50 %	25 %	221632414
8738	NC_011959	GCA	3	9	387082	387090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632414
8739	NC_011959	GAC	2	6	387120	387125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632414
8740	NC_011959	TGG	2	6	387188	387193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632414
8741	NC_011959	TCCC	2	8	387197	387204	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8742	NC_011959	CGA	2	6	387272	387277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632415
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8744	NC_011959	TCC	2	6	387307	387312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632415
8745	NC_011959	GATC	2	8	387314	387321	25 %	25 %	25 %	25 %	221632415
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8792	NC_011959	GCGAT	2	10	389329	389338	20 %	20 %	40 %	20 %	221632416
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8852	NC_011959	GCGA	2	8	392274	392281	25 %	0 %	50 %	25 %	221632419
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