MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_011959	GC	3	6	353135	353140	0 %	0 %	50 %	50 %	221632379
8003	NC_011959	GGC	2	6	353143	353148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632379
8004	NC_011959	CGT	2	6	353212	353217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632379
8005	NC_011959	GCGG	2	8	353302	353309	0 %	0 %	75 %	25 %	221632379
8006	NC_011959	GC	3	6	353330	353335	0 %	0 %	50 %	50 %	221632379
8007	NC_011959	TCC	2	6	353376	353381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632379
8008	NC_011959	CGG	2	6	353389	353394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632379
8009	NC_011959	CCTC	2	8	353429	353436	0 %	25 %	0 %	75 %	221632379
8010	NC_011959	TTC	2	6	353447	353452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632379
8011	NC_011959	CTG	2	6	353489	353494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632379
8012	NC_011959	GGTCGA	2	12	353515	353526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221632379
8013	NC_011959	GTG	2	6	353540	353545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632379
8014	NC_011959	GC	3	6	353549	353554	0 %	0 %	50 %	50 %	221632379
8015	NC_011959	CGAT	2	8	353613	353620	25 %	25 %	25 %	25 %	221632379
8016	NC_011959	CGA	2	6	353747	353752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632379
8017	NC_011959	GTG	2	6	353756	353761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632379
8018	NC_011959	AGC	2	6	353764	353769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632379
8019	NC_011959	GC	3	6	353851	353856	0 %	0 %	50 %	50 %	221632379
8020	NC_011959	GCT	2	6	353905	353910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_011959	CGA	2	6	353975	353980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632380
8022	NC_011959	GACCC	2	10	354105	354114	20 %	0 %	20 %	60 %	221632380
8023	NC_011959	CGC	2	6	354249	354254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632380
8024	NC_011959	TGG	2	6	354359	354364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632380
8025	NC_011959	GCT	2	6	354369	354374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632380
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8027	NC_011959	GA	3	6	354445	354450	50 %	0 %	50 %	0 %	221632380
8028	NC_011959	GAC	2	6	354525	354530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632380
8029	NC_011959	TGC	2	6	354542	354547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632380
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8031	NC_011959	GCT	2	6	354653	354658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632380
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8034	NC_011959	AAT	2	6	354760	354765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221632380
8035	NC_011959	ACTC	2	8	354773	354780	25 %	25 %	0 %	50 %	221632380
8036	NC_011959	GCTC	2	8	354799	354806	0 %	25 %	25 %	50 %	221632381
8037	NC_011959	CTG	2	6	354820	354825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632381
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8042	NC_011959	CCA	2	6	354928	354933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632381
8043	NC_011959	CGA	2	6	354972	354977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632381
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8045	NC_011959	GCC	2	6	355094	355099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632381
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8050	NC_011959	AGGGC	2	10	355313	355322	20 %	0 %	60 %	20 %	221632381
8051	NC_011959	CAGGG	2	10	355366	355375	20 %	0 %	60 %	20 %	221632381
8052	NC_011959	CG	3	6	355389	355394	0 %	0 %	50 %	50 %	221632381
8053	NC_011959	CGAA	2	8	355445	355452	50 %	0 %	25 %	25 %	221632381
8054	NC_011959	GAC	2	6	355453	355458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632381
8055	NC_011959	GCC	2	6	355597	355602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_011959	CG	3	6	355604	355609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8057	NC_011959	TCG	2	6	355623	355628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_011959	CCA	2	6	355630	355635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8059	NC_011959	TGC	2	6	355670	355675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_011959	TCGA	2	8	355679	355686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8061	NC_011959	GA	3	6	355710	355715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_011959	GGAG	2	8	355746	355753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_011959	CCAG	2	8	355775	355782	25 %	0 %	25 %	50 %	221632382
8064	NC_011959	TCG	2	6	355795	355800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632382
8065	NC_011959	GCA	2	6	355878	355883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632382
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8070	NC_011959	CCGG	2	8	356024	356031	0 %	0 %	50 %	50 %	221632382
8071	NC_011959	TGG	2	6	356182	356187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632382
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8081	NC_011959	CT	3	6	356688	356693	0 %	50 %	0 %	50 %	221632382
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8087	NC_011959	GAACG	2	10	356907	356916	40 %	0 %	40 %	20 %	221632382
8088	NC_011959	TCG	2	6	356947	356952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632382
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8090	NC_011959	TCT	2	6	357004	357009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632382
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8092	NC_011959	CCT	2	6	357077	357082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632382
8093	NC_011959	AGCCG	2	10	357107	357116	20 %	0 %	40 %	40 %	221632382
8094	NC_011959	ACGG	2	8	357136	357143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8095	NC_011959	ACG	2	6	357153	357158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8100	NC_011959	GGC	2	6	357218	357223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632383
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8102	NC_011959	TCAA	2	8	357268	357275	50 %	25 %	0 %	25 %	221632383
8103	NC_011959	CG	3	6	357295	357300	0 %	0 %	50 %	50 %	221632383
8104	NC_011959	TGGT	2	8	357438	357445	0 %	50 %	50 %	0 %	221632383
8105	NC_011959	CCGGTG	2	12	357471	357482	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632383
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8107	NC_011959	GGA	2	6	357515	357520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632383
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8110	NC_011959	CG	3	6	357723	357728	0 %	0 %	50 %	50 %	221632383
8111	NC_011959	CGC	2	6	357787	357792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632383
8112	NC_011959	CCG	2	6	357837	357842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632383
8113	NC_011959	GAG	2	6	357871	357876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632383
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8118	NC_011959	GGA	2	6	357914	357919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632383
8119	NC_011959	AGG	2	6	357943	357948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632383
8120	NC_011959	TCG	2	6	357952	357957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632383
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8123	NC_011959	CGA	2	6	358031	358036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632383
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8233	NC_011959	GGGT	2	8	363954	363961	0 %	25 %	75 %	0 %	221632390
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8241	NC_011959	ATG	2	6	364303	364308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8246	NC_011959	CG	3	6	364501	364506	0 %	0 %	50 %	50 %	221632391
8247	NC_011959	ACCGG	2	10	364541	364550	20 %	0 %	40 %	40 %	221632391
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8355	NC_011959	CTG	2	6	369634	369639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632395
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8491	NC_011959	CGC	2	6	376021	376026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632399
8492	NC_011959	CTTCTG	2	12	376037	376048	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	221632399
8493	NC_011959	CGA	2	6	376106	376111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632399
8494	NC_011959	CAG	2	6	376122	376127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632399
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8499	NC_011959	GC	3	6	376397	376402	0 %	0 %	50 %	50 %	221632399
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