MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_011959	GCGT	2	8	331002	331009	0 %	25 %	50 %	25 %	221632357
7502	NC_011959	GCG	2	6	331020	331025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632357
7503	NC_011959	ACC	2	6	331048	331053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632357
7504	NC_011959	GCA	2	6	331066	331071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632357
7505	NC_011959	GAG	2	6	331078	331083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632357
7506	NC_011959	CCG	2	6	331195	331200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632357
7507	NC_011959	ATC	2	6	331324	331329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632357
7508	NC_011959	TCAG	3	12	331385	331396	25 %	25 %	25 %	25 %	221632357
7509	NC_011959	GCC	2	6	331426	331431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632357
7510	NC_011959	GCCA	2	8	331449	331456	25 %	0 %	25 %	50 %	221632357
7511	NC_011959	GAG	2	6	331507	331512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632357
7512	NC_011959	TCGGT	2	10	331523	331532	0 %	40 %	40 %	20 %	221632357
7513	NC_011959	GC	3	6	331572	331577	0 %	0 %	50 %	50 %	221632357
7514	NC_011959	CG	3	6	331586	331591	0 %	0 %	50 %	50 %	221632357
7515	NC_011959	GCT	2	6	331605	331610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632357
7516	NC_011959	CTC	2	6	331658	331663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7517	NC_011959	CCT	2	6	331671	331676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7518	NC_011959	CGA	2	6	331708	331713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_011959	CCT	2	6	331761	331766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7520	NC_011959	CGA	2	6	331784	331789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_011959	G	6	6	331820	331825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_011959	CAC	2	6	331834	331839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7523	NC_011959	GTC	2	6	331930	331935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_011959	AGGG	3	12	331984	331995	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_011959	GAA	2	6	332013	332018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_011959	GAC	2	6	332025	332030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_011959	GC	3	6	332036	332041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7528	NC_011959	GTAC	2	8	332053	332060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7529	NC_011959	CA	3	6	332118	332123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7530	NC_011959	GAG	2	6	332194	332199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_011959	TGC	2	6	332203	332208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_011959	GCT	2	6	332216	332221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_011959	GATGA	2	10	332242	332251	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_011959	GCGA	2	8	332258	332265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7535	NC_011959	GGGC	2	8	332274	332281	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7536	NC_011959	TGC	2	6	332288	332293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_011959	TCCC	2	8	332410	332417	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7538	NC_011959	GCA	2	6	332510	332515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_011959	CGT	2	6	332654	332659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_011959	CGAG	2	8	332675	332682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7541	NC_011959	TGC	2	6	332710	332715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632358
7542	NC_011959	GCT	2	6	332732	332737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632358
7543	NC_011959	GC	3	6	332780	332785	0 %	0 %	50 %	50 %	221632358
7544	NC_011959	CG	3	6	332789	332794	0 %	0 %	50 %	50 %	221632358
7545	NC_011959	AGC	2	6	332813	332818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632358
7546	NC_011959	AGAA	2	8	332921	332928	75 %	0 %	25 %	0 %	221632358
7547	NC_011959	CGAG	2	8	333057	333064	25 %	0 %	50 %	25 %	221632358
7548	NC_011959	ACG	3	9	333068	333076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632358
7549	NC_011959	AGCGG	2	10	333116	333125	20 %	0 %	60 %	20 %	221632358
7550	NC_011959	CA	3	6	333275	333280	50 %	0 %	0 %	50 %	221632359
7551	NC_011959	CTC	2	6	333310	333315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632359
7552	NC_011959	CG	3	6	333327	333332	0 %	0 %	50 %	50 %	221632359
7553	NC_011959	GGCCG	2	10	333367	333376	0 %	0 %	60 %	40 %	221632359
7554	NC_011959	TTCG	2	8	333382	333389	0 %	50 %	25 %	25 %	221632359
7555	NC_011959	ACA	2	6	333415	333420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632359
7556	NC_011959	TCG	2	6	333446	333451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632359
7557	NC_011959	AG	3	6	333453	333458	50 %	0 %	50 %	0 %	221632359
7558	NC_011959	CTC	2	6	333463	333468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632359
7559	NC_011959	GGT	2	6	333494	333499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632359
7560	NC_011959	CTC	2	6	333502	333507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632359
7561	NC_011959	TGA	2	6	333510	333515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632359
7562	NC_011959	GAA	2	6	333544	333549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632359
7563	NC_011959	ACG	2	6	333563	333568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632359
7564	NC_011959	GAT	2	6	333577	333582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632359
7565	NC_011959	TGA	2	6	333630	333635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632359
7566	NC_011959	GC	3	6	333699	333704	0 %	0 %	50 %	50 %	221632359
7567	NC_011959	GCG	2	6	333709	333714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632359
7568	NC_011959	TCGACC	2	12	333782	333793	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221632359
7569	NC_011959	GTA	2	6	333805	333810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632359
7570	NC_011959	TGA	2	6	333898	333903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632360
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7572	NC_011959	AGC	2	6	334040	334045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7573	NC_011959	GTC	2	6	334121	334126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7574	NC_011959	CTG	2	6	334169	334174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7575	NC_011959	TCA	2	6	334219	334224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632360
7576	NC_011959	CGT	2	6	334270	334275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7577	NC_011959	TGGA	2	8	334331	334338	25 %	25 %	50 %	0 %	221632360
7578	NC_011959	GAC	2	6	334391	334396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7579	NC_011959	CGA	2	6	334402	334407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7580	NC_011959	CA	3	6	334445	334450	50 %	0 %	0 %	50 %	221632360
7581	NC_011959	CGCC	2	8	334459	334466	0 %	0 %	25 %	75 %	221632360
7582	NC_011959	ATCG	2	8	334499	334506	25 %	25 %	25 %	25 %	221632360
7583	NC_011959	C	7	7	334535	334541	0 %	0 %	0 %	100 %	221632360
7584	NC_011959	CAC	2	6	334699	334704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632360
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7587	NC_011959	GAG	2	6	334847	334852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632360
7588	NC_011959	CGA	2	6	335062	335067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7589	NC_011959	CGT	2	6	335083	335088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7590	NC_011959	CAT	2	6	335108	335113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632360
7591	NC_011959	TCG	2	6	335118	335123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7592	NC_011959	AAG	2	6	335124	335129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632360
7593	NC_011959	ACC	2	6	335243	335248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632360
7594	NC_011959	GATC	2	8	335260	335267	25 %	25 %	25 %	25 %	221632360
7595	NC_011959	GAT	2	6	335315	335320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632360
7596	NC_011959	CGA	2	6	335365	335370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7597	NC_011959	CGC	2	6	335377	335382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632360
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7599	NC_011959	GCG	2	6	335442	335447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632360
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7601	NC_011959	GCGA	2	8	335473	335480	25 %	0 %	50 %	25 %	221632360
7602	NC_011959	GAC	2	6	335498	335503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632360
7603	NC_011959	TGCC	2	8	335518	335525	0 %	25 %	25 %	50 %	221632360
7604	NC_011959	GCG	2	6	335532	335537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632360
7605	NC_011959	CGA	2	6	335563	335568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632360
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7607	NC_011959	CGA	2	6	335617	335622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632361
7608	NC_011959	CGATCG	2	12	335650	335661	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632361
7609	NC_011959	CGGA	2	8	335729	335736	25 %	0 %	50 %	25 %	221632361
7610	NC_011959	ATC	2	6	335741	335746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632361
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7612	NC_011959	TCG	2	6	335862	335867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632361
7613	NC_011959	ACG	2	6	335877	335882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632361
7614	NC_011959	ACG	2	6	335892	335897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632361
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7617	NC_011959	CG	3	6	336050	336055	0 %	0 %	50 %	50 %	221632362
7618	NC_011959	ATC	2	6	336057	336062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632362
7619	NC_011959	AGA	2	6	336112	336117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632362
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7623	NC_011959	GAT	2	6	336209	336214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632362
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7753	NC_011959	GAG	2	6	342034	342039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7869	NC_011959	ATCG	2	8	346984	346991	25 %	25 %	25 %	25 %	221632371
7870	NC_011959	CG	3	6	346990	346995	0 %	0 %	50 %	50 %	221632371
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7989	NC_011959	GGA	2	6	352634	352639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632378
7990	NC_011959	GGT	2	6	352661	352666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632378
7991	NC_011959	CGT	2	6	352679	352684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632378
7992	NC_011959	TCG	3	9	352717	352725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632378
7993	NC_011959	CTGC	2	8	352754	352761	0 %	25 %	25 %	50 %	221632378
7994	NC_011959	GCGA	2	8	352794	352801	25 %	0 %	50 %	25 %	221632378
7995	NC_011959	TGG	2	6	352814	352819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632378
7996	NC_011959	TGAG	2	8	352897	352904	25 %	25 %	50 %	0 %	221632378
7997	NC_011959	CTCGA	2	10	352918	352927	20 %	20 %	20 %	40 %	221632378
7998	NC_011959	CGG	2	6	352934	352939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632378
7999	NC_011959	GCG	2	6	353022	353027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632379
8000	NC_011959	GC	3	6	353054	353059	0 %	0 %	50 %	50 %	221632379

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