MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 45102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011959	GTT	2	6	308850	308855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632334
7002	NC_011959	GTG	2	6	308891	308896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632334
7003	NC_011959	CGAG	2	8	308909	308916	25 %	0 %	50 %	25 %	221632334
7004	NC_011959	GCGG	2	8	308945	308952	0 %	0 %	75 %	25 %	221632334
7005	NC_011959	AGC	2	6	308972	308977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632334
7006	NC_011959	TCG	2	6	309042	309047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632334
7007	NC_011959	GCT	2	6	309115	309120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632334
7008	NC_011959	GTC	2	6	309140	309145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632334
7009	NC_011959	GAG	2	6	309146	309151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632334
7010	NC_011959	AGGG	2	8	309207	309214	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_011959	GCG	2	6	309241	309246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632335
7012	NC_011959	GCGT	2	8	309374	309381	0 %	25 %	50 %	25 %	221632335
7013	NC_011959	GGA	2	6	309424	309429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632335
7014	NC_011959	AGC	2	6	309456	309461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7015	NC_011959	ATG	2	6	309542	309547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632335
7016	NC_011959	GGC	2	6	309595	309600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632335
7017	NC_011959	CCG	2	6	309637	309642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632335
7018	NC_011959	CGA	2	6	309706	309711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7019	NC_011959	AAC	2	6	309881	309886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632335
7020	NC_011959	CGG	2	6	309887	309892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632335
7021	NC_011959	CGAT	2	8	309894	309901	25 %	25 %	25 %	25 %	221632335
7022	NC_011959	CGG	2	6	309939	309944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632335
7023	NC_011959	GCT	2	6	310129	310134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7024	NC_011959	GTG	2	6	310137	310142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632335
7025	NC_011959	AGC	2	6	310273	310278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7026	NC_011959	GATC	2	8	310315	310322	25 %	25 %	25 %	25 %	221632335
7027	NC_011959	ACC	2	6	310353	310358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632335
7028	NC_011959	GCT	2	6	310366	310371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7029	NC_011959	CGT	2	6	310389	310394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7030	NC_011959	GTG	2	6	310454	310459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632335
7031	NC_011959	TGC	2	6	310600	310605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7032	NC_011959	GGT	2	6	310606	310611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632335
7033	NC_011959	GC	3	6	310613	310618	0 %	0 %	50 %	50 %	221632335
7034	NC_011959	CGG	2	6	310632	310637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632335
7035	NC_011959	TCG	2	6	310638	310643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7036	NC_011959	ACGA	2	8	310668	310675	50 %	0 %	25 %	25 %	221632335
7037	NC_011959	CGT	3	9	310696	310704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7038	NC_011959	CCG	2	6	310705	310710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632335
7039	NC_011959	CGAT	2	8	310725	310732	25 %	25 %	25 %	25 %	221632335
7040	NC_011959	CCG	2	6	310775	310780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632335
7041	NC_011959	CCG	2	6	310828	310833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632335
7042	NC_011959	TTC	2	6	310931	310936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632335
7043	NC_011959	GAT	2	6	310966	310971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632335
7044	NC_011959	GCG	2	6	310993	310998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632335
7045	NC_011959	GAG	2	6	311126	311131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632335
7046	NC_011959	GTC	2	6	311235	311240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632335
7047	NC_011959	CG	3	6	311279	311284	0 %	0 %	50 %	50 %	221632335
7048	NC_011959	ATC	2	6	311390	311395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632335
7049	NC_011959	GA	3	6	311433	311438	50 %	0 %	50 %	0 %	221632335
7050	NC_011959	GAT	2	6	311458	311463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632335
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7052	NC_011959	CG	3	6	311565	311570	0 %	0 %	50 %	50 %	221632335
7053	NC_011959	ATG	2	6	311571	311576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632335
7054	NC_011959	CTTC	2	8	311584	311591	0 %	50 %	0 %	50 %	221632335
7055	NC_011959	CTA	2	6	311593	311598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632335
7056	NC_011959	GTCG	2	8	311654	311661	0 %	25 %	50 %	25 %	221632335
7057	NC_011959	GGC	2	6	311684	311689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632335
7058	NC_011959	CG	3	6	311815	311820	0 %	0 %	50 %	50 %	221632335
7059	NC_011959	GCG	2	6	311837	311842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632335
7060	NC_011959	TCGTC	2	10	311883	311892	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7061	NC_011959	TC	3	6	311940	311945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_011959	GAG	2	6	311949	311954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_011959	CGC	2	6	311977	311982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_011959	GGT	2	6	311983	311988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_011959	CGT	2	6	312083	312088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_011959	GGAG	2	8	312092	312099	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_011959	TCA	2	6	312133	312138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632336
7068	NC_011959	AAG	2	6	312212	312217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632336
7069	NC_011959	ATC	2	6	312246	312251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632336
7070	NC_011959	GCC	2	6	312316	312321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632336
7071	NC_011959	CGCA	2	8	312346	312353	25 %	0 %	25 %	50 %	221632336
7072	NC_011959	GCG	2	6	312377	312382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632336
7073	NC_011959	GTG	2	6	312388	312393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632336
7074	NC_011959	CAG	2	6	312407	312412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632336
7075	NC_011959	GGC	2	6	312450	312455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632336
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7077	NC_011959	TCG	2	6	312498	312503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632336
7078	NC_011959	TGG	2	6	312508	312513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632336
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7080	NC_011959	CGC	2	6	312528	312533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632336
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7082	NC_011959	GCTC	2	8	312600	312607	0 %	25 %	25 %	50 %	221632336
7083	NC_011959	GT	3	6	312621	312626	0 %	50 %	50 %	0 %	221632336
7084	NC_011959	GAA	2	6	312659	312664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632336
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7086	NC_011959	CT	3	6	312684	312689	0 %	50 %	0 %	50 %	221632336
7087	NC_011959	GGT	2	6	312704	312709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632336
7088	NC_011959	GGT	2	6	312770	312775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632336
7089	NC_011959	CCA	2	6	312778	312783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632336
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7091	NC_011959	GGCGT	2	10	312820	312829	0 %	20 %	60 %	20 %	221632336
7092	NC_011959	AGG	2	6	312910	312915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632336
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7094	NC_011959	CCG	2	6	312998	313003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632336
7095	NC_011959	CGG	2	6	313016	313021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632336
7096	NC_011959	GAGG	2	8	313068	313075	25 %	0 %	75 %	0 %	221632336
7097	NC_011959	AGCG	2	8	313090	313097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7098	NC_011959	GCTC	2	8	313115	313122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7099	NC_011959	CCA	2	6	313204	313209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632337
7100	NC_011959	CGG	2	6	313229	313234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632337
7101	NC_011959	ACCA	2	8	313361	313368	50 %	0 %	0 %	50 %	221632337
7102	NC_011959	CTG	2	6	313423	313428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632337
7103	NC_011959	CGGT	2	8	313470	313477	0 %	25 %	50 %	25 %	221632337
7104	NC_011959	CAC	2	6	313479	313484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632337
7105	NC_011959	ATGGT	2	10	313514	313523	20 %	40 %	40 %	0 %	221632337
7106	NC_011959	GTT	2	6	313540	313545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632337
7107	NC_011959	GCG	2	6	313585	313590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632337
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7109	NC_011959	TGA	2	6	313682	313687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632337
7110	NC_011959	GC	3	6	313699	313704	0 %	0 %	50 %	50 %	221632337
7111	NC_011959	CGT	2	6	313725	313730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632337
7112	NC_011959	CCCT	2	8	313770	313777	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7113	NC_011959	CGAC	2	8	313787	313794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7114	NC_011959	TC	3	6	313887	313892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7115	NC_011959	GCG	2	6	313964	313969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_011959	CGT	2	6	313970	313975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_011959	TCGA	2	8	314028	314035	25 %	25 %	25 %	25 %	221632338
7118	NC_011959	CG	3	6	314038	314043	0 %	0 %	50 %	50 %	221632338
7119	NC_011959	GCG	2	6	314060	314065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632338
7120	NC_011959	CCA	2	6	314094	314099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632338
7121	NC_011959	GGCC	2	8	314133	314140	0 %	0 %	50 %	50 %	221632338
7122	NC_011959	CAG	2	6	314164	314169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
7123	NC_011959	CAGC	2	8	314185	314192	25 %	0 %	25 %	50 %	221632338
7124	NC_011959	TCGC	2	8	314193	314200	0 %	25 %	25 %	50 %	221632338
7125	NC_011959	GCG	2	6	314217	314222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632338
7126	NC_011959	CTC	2	6	314269	314274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632338
7127	NC_011959	CTT	2	6	314302	314307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632338
7128	NC_011959	GGC	2	6	314320	314325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632338
7129	NC_011959	CAG	2	6	314336	314341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
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7138	NC_011959	GAC	2	6	314596	314601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
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7140	NC_011959	GTC	2	6	314677	314682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632338
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7234	NC_011959	TCGGCC	2	12	318619	318630	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221632342
7235	NC_011959	TGGC	2	8	318663	318670	0 %	25 %	50 %	25 %	221632342
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7242	NC_011959	GC	3	6	319113	319118	0 %	0 %	50 %	50 %	221632342
7243	NC_011959	CTG	2	6	319149	319154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632342
7244	NC_011959	AGT	2	6	319199	319204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632343
7245	NC_011959	GATC	2	8	319206	319213	25 %	25 %	25 %	25 %	221632343
7246	NC_011959	GAT	2	6	319216	319221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632343
7247	NC_011959	GAC	2	6	319237	319242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632343
7248	NC_011959	GTGA	2	8	319478	319485	25 %	25 %	50 %	0 %	221632343
7249	NC_011959	GAC	2	6	319523	319528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632343
7250	NC_011959	TCG	2	6	319533	319538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632343
7251	NC_011959	GTC	2	6	319544	319549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632343
7252	NC_011959	GT	4	8	319574	319581	0 %	50 %	50 %	0 %	221632343
7253	NC_011959	CGAG	2	8	319705	319712	25 %	0 %	50 %	25 %	221632343
7254	NC_011959	TCG	2	6	319731	319736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632343
7255	NC_011959	TCG	2	6	319785	319790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632343
7256	NC_011959	CGT	2	6	319855	319860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632343
7257	NC_011959	CGAC	2	8	319870	319877	25 %	0 %	25 %	50 %	221632343
7258	NC_011959	GAG	2	6	319883	319888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632343
7259	NC_011959	CGAT	2	8	319974	319981	25 %	25 %	25 %	25 %	221632343
7260	NC_011959	GCC	2	6	319991	319996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632343
7261	NC_011959	CCGG	2	8	320019	320026	0 %	0 %	50 %	50 %	221632343
7262	NC_011959	ACG	3	9	320064	320072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632343
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7265	NC_011959	GCT	2	6	320153	320158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632343
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7268	NC_011959	CGA	2	6	320322	320327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632343
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7270	NC_011959	TGC	2	6	320391	320396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632344
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7272	NC_011959	C	6	6	320422	320427	0 %	0 %	0 %	100 %	221632344
7273	NC_011959	GGA	2	6	320428	320433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632344
7274	NC_011959	GCTG	2	8	320434	320441	0 %	25 %	50 %	25 %	221632344
7275	NC_011959	GC	3	6	320454	320459	0 %	0 %	50 %	50 %	221632344
7276	NC_011959	GTC	2	6	320495	320500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632344
7277	NC_011959	TCG	2	6	320535	320540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632344
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7280	NC_011959	AGCG	2	8	320659	320666	25 %	0 %	50 %	25 %	221632344
7281	NC_011959	TCG	2	6	320724	320729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632344
7282	NC_011959	GTC	2	6	320732	320737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632344
7283	NC_011959	GCT	2	6	320758	320763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632344
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7291	NC_011959	TGG	2	6	321144	321149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632344
7292	NC_011959	TGA	2	6	321198	321203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632344
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7294	NC_011959	CGA	2	6	321288	321293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632344
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7296	NC_011959	TCG	2	6	321408	321413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632344
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7299	NC_011959	GAC	2	6	321720	321725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7304	NC_011959	TGA	2	6	321883	321888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632345
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7326	NC_011959	TCG	2	6	322723	322728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7332	NC_011959	GTG	2	6	323276	323281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632346
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7353	NC_011959	CGGG	2	8	324187	324194	0 %	0 %	75 %	25 %	221632347
7354	NC_011959	TTC	2	6	324211	324216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632347
7355	NC_011959	TCG	2	6	324233	324238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632347
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7359	NC_011959	GCTG	2	8	324371	324378	0 %	25 %	50 %	25 %	221632347
7360	NC_011959	CGATC	2	10	324390	324399	20 %	20 %	20 %	40 %	221632347
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7363	NC_011959	GGAG	2	8	324531	324538	25 %	0 %	75 %	0 %	221632347
7364	NC_011959	GC	3	6	324709	324714	0 %	0 %	50 %	50 %	221632347
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7478	NC_011959	GA	3	6	329567	329572	50 %	0 %	50 %	0 %	221632355
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7486	NC_011959	GA	3	6	330133	330138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7487	NC_011959	ACAG	2	8	330173	330180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7488	NC_011959	GGC	2	6	330248	330253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7489	NC_011959	GAG	2	6	330432	330437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7490	NC_011959	GGCC	2	8	330472	330479	0 %	0 %	50 %	50 %	221632357
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7492	NC_011959	CGGAG	2	10	330603	330612	20 %	0 %	60 %	20 %	221632357
7493	NC_011959	GCT	2	6	330633	330638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632357
7494	NC_011959	CTA	2	6	330660	330665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632357
7495	NC_011959	GTT	2	6	330675	330680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632357
7496	NC_011959	G	6	6	330815	330820	0 %	0 %	100 %	0 %	221632357
7497	NC_011959	GCA	3	9	330850	330858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632357
7498	NC_011959	GTC	2	6	330907	330912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632357
7499	NC_011959	AAC	2	6	330932	330937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632357
7500	NC_011959	CGG	2	6	330989	330994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632357

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