MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_011901	GAGG	2	8	886262	886269	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21002	NC_011901	CGG	2	6	886306	886311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21003	NC_011901	TCT	2	6	886430	886435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933999
21004	NC_011901	CTG	2	6	886450	886455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933999
21005	NC_011901	GGC	2	6	886467	886472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933999
21006	NC_011901	GGA	2	6	886524	886529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933999
21007	NC_011901	GGCC	2	8	886584	886591	0 %	0 %	50 %	50 %	220933999
21008	NC_011901	GCG	2	6	886676	886681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933999
21009	NC_011901	CAC	2	6	886701	886706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933999
21010	NC_011901	TCCC	2	8	886725	886732	0 %	25 %	0 %	75 %	220933999
21011	NC_011901	AAG	3	9	886747	886755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933999
21012	NC_011901	TGG	2	6	886811	886816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933999
21013	NC_011901	AAC	2	6	886819	886824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933999
21014	NC_011901	ATC	2	6	886825	886830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933999
21015	NC_011901	GTG	2	6	886840	886845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933999
21016	NC_011901	GCAACC	2	12	886859	886870	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220933999
21017	NC_011901	TGG	2	6	886874	886879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933999
21018	NC_011901	CAG	2	6	886888	886893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933999
21019	NC_011901	GCTGGT	2	12	886899	886910	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220933999
21020	NC_011901	GCC	2	6	886914	886919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933999
21021	NC_011901	A	7	7	886940	886946	100 %	0 %	0 %	0 %	220933999
21022	NC_011901	GGA	2	6	886989	886994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933999
21023	NC_011901	GCCA	2	8	887032	887039	25 %	0 %	25 %	50 %	220933999
21024	NC_011901	TGG	2	6	887177	887182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933999
21025	NC_011901	C	7	7	887197	887203	0 %	0 %	0 %	100 %	220933999
21026	NC_011901	GGA	2	6	887259	887264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933999
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21029	NC_011901	TGG	2	6	887426	887431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220934000
21030	NC_011901	CCG	2	6	887504	887509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220934000
21031	NC_011901	GCT	2	6	887529	887534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934000
21032	NC_011901	GCG	2	6	887537	887542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220934000
21033	NC_011901	CGA	2	6	887556	887561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220934000
21034	NC_011901	CGA	2	6	887583	887588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220934000
21035	NC_011901	TCA	2	6	887597	887602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220934000
21036	NC_011901	GGC	2	6	887621	887626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220934000
21037	NC_011901	GGC	2	6	887647	887652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220934000
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21039	NC_011901	CGG	2	6	887673	887678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220934000
21040	NC_011901	CCG	2	6	887732	887737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220934000
21041	NC_011901	TGG	2	6	887837	887842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220934000
21042	NC_011901	CTGG	2	8	887856	887863	0 %	25 %	50 %	25 %	220934000
21043	NC_011901	CTG	2	6	887893	887898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934000
21044	NC_011901	GGA	2	6	887928	887933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220934000
21045	NC_011901	CAT	3	9	887934	887942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220934000
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21049	NC_011901	ACC	2	6	888022	888027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220934000
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21051	NC_011901	GCCA	2	8	888237	888244	25 %	0 %	25 %	50 %	220934001
21052	NC_011901	CCCGAG	2	12	888270	888281	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220934001
21053	NC_011901	TC	3	6	888329	888334	0 %	50 %	0 %	50 %	220934001
21054	NC_011901	CCG	2	6	888418	888423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220934001
21055	NC_011901	CGA	2	6	888434	888439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220934001
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21057	NC_011901	GC	3	6	888512	888517	0 %	0 %	50 %	50 %	220934002
21058	NC_011901	GGT	2	6	888548	888553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220934002
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21060	NC_011901	GGC	2	6	888604	888609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220934002
21061	NC_011901	GCT	2	6	888620	888625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934002
21062	NC_011901	CTG	2	6	888648	888653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934002
21063	NC_011901	GGTGC	2	10	888657	888666	0 %	20 %	60 %	20 %	220934002
21064	NC_011901	GGC	2	6	888698	888703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220934002
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21066	NC_011901	CTG	2	6	888750	888755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934002
21067	NC_011901	CAG	2	6	888777	888782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220934002
21068	NC_011901	GAG	2	6	888876	888881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220934002
21069	NC_011901	TCG	2	6	888898	888903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934002
21070	NC_011901	CTG	2	6	888924	888929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934002
21071	NC_011901	GTCCCT	2	12	888944	888955	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	220934002
21072	NC_011901	ATC	2	6	888996	889001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220934002
21073	NC_011901	CAAGGA	2	12	889028	889039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220934002
21074	NC_011901	TGC	2	6	889216	889221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934002
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21077	NC_011901	CGGCG	2	10	889262	889271	0 %	0 %	60 %	40 %	220934002
21078	NC_011901	GTG	2	6	889272	889277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220934002
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21081	NC_011901	TGG	2	6	889342	889347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220934002
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21083	NC_011901	CAT	2	6	889430	889435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220934002
21084	NC_011901	CGC	2	6	889436	889441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220934002
21085	NC_011901	TTC	2	6	889482	889487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220934002
21086	NC_011901	CACGG	2	10	889534	889543	20 %	0 %	40 %	40 %	220934002
21087	NC_011901	GGA	2	6	889598	889603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21088	NC_011901	A	6	6	889645	889650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21089	NC_011901	T	7	7	889709	889715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21090	NC_011901	GGGTGA	2	12	889803	889814	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	220934003
21091	NC_011901	GGT	2	6	889870	889875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220934003
21092	NC_011901	ACC	2	6	889922	889927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220934003
21093	NC_011901	TGA	2	6	889951	889956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220934003
21094	NC_011901	TCG	2	6	889992	889997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934003
21095	NC_011901	GAT	2	6	890000	890005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220934003
21096	NC_011901	GTCC	2	8	890022	890029	0 %	25 %	25 %	50 %	220934003
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21098	NC_011901	TGG	2	6	890080	890085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220934003
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21100	NC_011901	GC	3	6	890146	890151	0 %	0 %	50 %	50 %	220934003
21101	NC_011901	TCT	2	6	890167	890172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220934003
21102	NC_011901	CCT	2	6	890173	890178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220934003
21103	NC_011901	ATG	2	6	890232	890237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220934003
21104	NC_011901	TCC	2	6	890256	890261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220934003
21105	NC_011901	CGC	2	6	890279	890284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220934003
21106	NC_011901	CAG	2	6	890291	890296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220934003
21107	NC_011901	TGCCGG	2	12	890302	890313	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220934003
21108	NC_011901	CGCC	2	8	890458	890465	0 %	0 %	25 %	75 %	220934003
21109	NC_011901	CTC	2	6	890492	890497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220934003
21110	NC_011901	CGT	2	6	890659	890664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220934003
21111	NC_011901	GTA	2	6	890681	890686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220934003
21112	NC_011901	TCC	2	6	890688	890693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220934003
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21117	NC_011901	GCCG	2	8	890875	890882	0 %	0 %	50 %	50 %	220934003
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21119	NC_011901	GC	3	6	891002	891007	0 %	0 %	50 %	50 %	220934003
21120	NC_011901	CTT	2	6	891023	891028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220934003
21121	NC_011901	CTC	2	6	891041	891046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220934003
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21152	NC_011901	TGG	2	6	892626	892631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220934006
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21479	NC_011901	CGC	2	6	905978	905983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220934020
21480	NC_011901	CAC	2	6	905991	905996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220934020
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