MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011901	CGGT	2	8	632785	632792	0 %	25 %	50 %	25 %	220933783
15002	NC_011901	GATGAC	2	12	632793	632804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220933783
15003	NC_011901	CTGATC	2	12	632820	632831	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220933783
15004	NC_011901	GGCCC	2	10	632918	632927	0 %	0 %	40 %	60 %	220933783
15005	NC_011901	GCGG	2	8	632934	632941	0 %	0 %	75 %	25 %	220933783
15006	NC_011901	TCC	2	6	633025	633030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933783
15007	NC_011901	TCC	2	6	633034	633039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933783
15008	NC_011901	CCAG	2	8	633071	633078	25 %	0 %	25 %	50 %	220933783
15009	NC_011901	CG	3	6	633083	633088	0 %	0 %	50 %	50 %	220933783
15010	NC_011901	CGTAG	2	10	633114	633123	20 %	20 %	40 %	20 %	220933783
15011	NC_011901	GAA	2	6	633180	633185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933783
15012	NC_011901	TGG	2	6	633206	633211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933783
15013	NC_011901	GC	3	6	633253	633258	0 %	0 %	50 %	50 %	220933783
15014	NC_011901	CAG	2	6	633270	633275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933783
15015	NC_011901	GGGC	2	8	633306	633313	0 %	0 %	75 %	25 %	220933783
15016	NC_011901	CTT	2	6	633318	633323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933783
15017	NC_011901	CCT	2	6	633461	633466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933783
15018	NC_011901	CAC	2	6	633468	633473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933783
15019	NC_011901	GCA	2	6	633581	633586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933783
15020	NC_011901	CG	3	6	633621	633626	0 %	0 %	50 %	50 %	220933783
15021	NC_011901	GCA	2	6	633629	633634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933783
15022	NC_011901	TCC	2	6	633640	633645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933783
15023	NC_011901	TCC	2	6	633718	633723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933783
15024	NC_011901	CTTCC	2	10	633759	633768	0 %	40 %	0 %	60 %	220933783
15025	NC_011901	AGCC	2	8	633769	633776	25 %	0 %	25 %	50 %	220933783
15026	NC_011901	CCA	2	6	633782	633787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933783
15027	NC_011901	CTG	2	6	633804	633809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933783
15028	NC_011901	GGC	2	6	633855	633860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933784
15029	NC_011901	CTT	2	6	633869	633874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933784
15030	NC_011901	GCCA	2	8	633896	633903	25 %	0 %	25 %	50 %	220933784
15031	NC_011901	GC	3	6	633973	633978	0 %	0 %	50 %	50 %	220933784
15032	NC_011901	AAG	2	6	633993	633998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933784
15033	NC_011901	GAA	2	6	634031	634036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933784
15034	NC_011901	CAT	2	6	634041	634046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933784
15035	NC_011901	GCG	2	6	634055	634060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933784
15036	NC_011901	AGC	2	6	634135	634140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933784
15037	NC_011901	CAA	2	6	634238	634243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933784
15038	NC_011901	GAA	2	6	634271	634276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933784
15039	NC_011901	GAC	2	6	634287	634292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933784
15040	NC_011901	CAC	2	6	634418	634423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933784
15041	NC_011901	CCA	2	6	634456	634461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933784
15042	NC_011901	AGC	2	6	634612	634617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933784
15043	NC_011901	GCT	3	9	634628	634636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933784
15044	NC_011901	GGC	2	6	634680	634685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933784
15045	NC_011901	CCTG	2	8	634690	634697	0 %	25 %	25 %	50 %	220933784
15046	NC_011901	G	6	6	634708	634713	0 %	0 %	100 %	0 %	220933784
15047	NC_011901	CTG	2	6	634742	634747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933784
15048	NC_011901	TTG	2	6	634768	634773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933784
15049	NC_011901	TGA	2	6	634802	634807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933784
15050	NC_011901	AGT	2	6	634817	634822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933784
15051	NC_011901	GC	3	6	634854	634859	0 %	0 %	50 %	50 %	220933784
15052	NC_011901	ACC	2	6	635025	635030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933784
15053	NC_011901	CAA	2	6	635061	635066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933784
15054	NC_011901	TCTG	2	8	635067	635074	0 %	50 %	25 %	25 %	220933784
15055	NC_011901	GCA	2	6	635096	635101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933784
15056	NC_011901	CGG	2	6	635163	635168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933784
15057	NC_011901	CAGC	2	8	635236	635243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15058	NC_011901	TCC	2	6	635289	635294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15059	NC_011901	CGG	2	6	635303	635308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_011901	CGA	2	6	635350	635355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_011901	TCCT	2	8	635379	635386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15062	NC_011901	CG	3	6	635426	635431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15063	NC_011901	CGG	2	6	635504	635509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933785
15064	NC_011901	CG	3	6	635567	635572	0 %	0 %	50 %	50 %	220933785
15065	NC_011901	GTC	2	6	635595	635600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933785
15066	NC_011901	AT	3	6	635616	635621	50 %	50 %	0 %	0 %	220933785
15067	NC_011901	CGT	2	6	635714	635719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933785
15068	NC_011901	GC	3	6	635740	635745	0 %	0 %	50 %	50 %	220933785
15069	NC_011901	CAG	2	6	635763	635768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933785
15070	NC_011901	GGCC	2	8	635780	635787	0 %	0 %	50 %	50 %	220933785
15071	NC_011901	GGC	2	6	635823	635828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933785
15072	NC_011901	CCG	3	9	635849	635857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933785
15073	NC_011901	AGC	3	9	635887	635895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933785
15074	NC_011901	TCG	2	6	635899	635904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933785
15075	NC_011901	CTG	2	6	635946	635951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933785
15076	NC_011901	TCG	2	6	635962	635967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933785
15077	NC_011901	CCG	2	6	635980	635985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933785
15078	NC_011901	CAG	2	6	635994	635999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933785
15079	NC_011901	CTG	2	6	636030	636035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933785
15080	NC_011901	TG	3	6	636034	636039	0 %	50 %	50 %	0 %	220933785
15081	NC_011901	GGT	2	6	636077	636082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933785
15082	NC_011901	TGA	2	6	636116	636121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933785
15083	NC_011901	TGG	2	6	636131	636136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933785
15084	NC_011901	GAT	2	6	636150	636155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933785
15085	NC_011901	CCG	2	6	636199	636204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933785
15086	NC_011901	TCA	2	6	636432	636437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933786
15087	NC_011901	TTTCCA	2	12	636514	636525	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	220933786
15088	NC_011901	TTG	2	6	636600	636605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933786
15089	NC_011901	CCG	2	6	636744	636749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933786
15090	NC_011901	AGA	2	6	636802	636807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933786
15091	NC_011901	ATC	2	6	636815	636820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933786
15092	NC_011901	TTC	2	6	636882	636887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933787
15093	NC_011901	AAT	2	6	637062	637067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220933787
15094	NC_011901	GTC	2	6	637068	637073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933787
15095	NC_011901	CTC	2	6	637230	637235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933787
15096	NC_011901	TTG	2	6	637267	637272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933787
15097	NC_011901	GGC	2	6	637359	637364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933787
15098	NC_011901	TGAT	2	8	637387	637394	25 %	50 %	25 %	0 %	220933787
15099	NC_011901	TCC	2	6	637407	637412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933787
15100	NC_011901	CATCA	2	10	637425	637434	40 %	20 %	0 %	40 %	220933787
15101	NC_011901	CGCT	2	8	637474	637481	0 %	25 %	25 %	50 %	220933787
15102	NC_011901	GAG	2	6	637506	637511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933787
15103	NC_011901	T	6	6	637588	637593	0 %	100 %	0 %	0 %	220933787
15104	NC_011901	TTC	2	6	637624	637629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933787
15105	NC_011901	CTC	2	6	637635	637640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933787
15106	NC_011901	TCA	2	6	637675	637680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933787
15107	NC_011901	TTG	2	6	637792	637797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933787
15108	NC_011901	CCT	2	6	637857	637862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933788
15109	NC_011901	GCA	2	6	637863	637868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933788
15110	NC_011901	TCC	2	6	637913	637918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933788
15111	NC_011901	GCG	2	6	637926	637931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933788
15112	NC_011901	GTAC	2	8	637932	637939	25 %	25 %	25 %	25 %	220933788
15113	NC_011901	CGA	2	6	637974	637979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933788
15114	NC_011901	CTT	2	6	638005	638010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933788
15115	NC_011901	TCG	2	6	638015	638020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933788
15116	NC_011901	GTC	2	6	638158	638163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933788
15117	NC_011901	GCA	2	6	638184	638189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933788
15118	NC_011901	GGCCGG	2	12	638197	638208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933788
15119	NC_011901	CTT	2	6	638242	638247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933788
15120	NC_011901	TGC	2	6	638253	638258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933788
15121	NC_011901	TCC	2	6	638273	638278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933788
15122	NC_011901	GGC	2	6	638356	638361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933788
15123	NC_011901	GTG	2	6	638438	638443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933788
15124	NC_011901	GGTCTC	2	12	638458	638469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933788
15125	NC_011901	TGA	2	6	638577	638582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933788
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15132	NC_011901	CTG	2	6	638983	638988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933788
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15152	NC_011901	GATC	2	8	639818	639825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15153	NC_011901	TCTA	2	8	639826	639833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15154	NC_011901	GTC	2	6	639850	639855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933789
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15157	NC_011901	CCAG	2	8	639923	639930	25 %	0 %	25 %	50 %	220933789
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15363	NC_011901	ATG	2	6	648408	648413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933797
15364	NC_011901	GTG	2	6	648416	648421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933797
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15372	NC_011901	AACG	2	8	648975	648982	50 %	0 %	25 %	25 %	220933798
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15399	NC_011901	TAAT	2	8	650086	650093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15400	NC_011901	CGC	2	6	650108	650113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933799
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15482	NC_011901	GCA	2	6	654637	654642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933801
15483	NC_011901	GTA	2	6	654686	654691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933801
15484	NC_011901	CCA	2	6	654706	654711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933801
15485	NC_011901	TCT	2	6	654766	654771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933801
15486	NC_011901	GCG	2	6	654863	654868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15487	NC_011901	AGA	2	6	654881	654886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15488	NC_011901	CGA	2	6	655021	655026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15489	NC_011901	TCCG	2	8	655086	655093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15490	NC_011901	GTCTT	2	10	655177	655186	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15491	NC_011901	A	7	7	655195	655201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15492	NC_011901	GAC	2	6	655265	655270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15493	NC_011901	T	7	7	655279	655285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15494	NC_011901	C	6	6	655309	655314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15495	NC_011901	ATT	2	6	655328	655333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15496	NC_011901	TTGA	2	8	655374	655381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15497	NC_011901	TTGT	2	8	655527	655534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_011901	C	10	10	655558	655567	0 %	0 %	0 %	100 %	220933802
15499	NC_011901	TCA	2	6	655660	655665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933802
15500	NC_011901	AGA	2	6	655705	655710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933802

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