MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011901	CGG	2	6	589570	589575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933744
14002	NC_011901	CGC	2	6	589630	589635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933744
14003	NC_011901	ACC	2	6	589671	589676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933744
14004	NC_011901	CAGGTC	2	12	589691	589702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933744
14005	NC_011901	TGC	2	6	589704	589709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933744
14006	NC_011901	GCAG	2	8	589741	589748	25 %	0 %	50 %	25 %	220933744
14007	NC_011901	TGC	2	6	589798	589803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933744
14008	NC_011901	CGG	2	6	589816	589821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933744
14009	NC_011901	GTT	2	6	589961	589966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933744
14010	NC_011901	CCG	2	6	590017	590022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933744
14011	NC_011901	GTC	2	6	590045	590050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933744
14012	NC_011901	CGC	2	6	590056	590061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933744
14013	NC_011901	GGCG	2	8	590113	590120	0 %	0 %	75 %	25 %	220933744
14014	NC_011901	GCC	2	6	590162	590167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933744
14015	NC_011901	GCA	2	6	590182	590187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933744
14016	NC_011901	GGCC	2	8	590206	590213	0 %	0 %	50 %	50 %	220933744
14017	NC_011901	GCA	3	9	590227	590235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933744
14018	NC_011901	GCC	2	6	590288	590293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933744
14019	NC_011901	CAG	2	6	590294	590299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933744
14020	NC_011901	GGT	2	6	590344	590349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933744
14021	NC_011901	CTGT	2	8	590382	590389	0 %	50 %	25 %	25 %	220933745
14022	NC_011901	GCGCC	2	10	590485	590494	0 %	0 %	40 %	60 %	220933745
14023	NC_011901	GTC	2	6	590557	590562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933745
14024	NC_011901	CCAGGC	2	12	590568	590579	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220933745
14025	NC_011901	GCA	2	6	590604	590609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933745
14026	NC_011901	TCC	2	6	590612	590617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933745
14027	NC_011901	CGG	2	6	590649	590654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933745
14028	NC_011901	GCC	2	6	590687	590692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933745
14029	NC_011901	CGC	2	6	590739	590744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933745
14030	NC_011901	GGT	2	6	590749	590754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933745
14031	NC_011901	TCC	2	6	590762	590767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933745
14032	NC_011901	AGA	2	6	590778	590783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933745
14033	NC_011901	GGC	2	6	590785	590790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933745
14034	NC_011901	CAC	2	6	590827	590832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933745
14035	NC_011901	GCGG	2	8	590853	590860	0 %	0 %	75 %	25 %	220933745
14036	NC_011901	GTC	2	6	590866	590871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933745
14037	NC_011901	TCG	2	6	590948	590953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933745
14038	NC_011901	GCA	3	9	590964	590972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933745
14039	NC_011901	GCC	2	6	591079	591084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933745
14040	NC_011901	CCA	2	6	591171	591176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933745
14041	NC_011901	GC	3	6	591180	591185	0 %	0 %	50 %	50 %	220933745
14042	NC_011901	AGG	2	6	591252	591257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933745
14043	NC_011901	TGG	2	6	591258	591263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933745
14044	NC_011901	CGT	2	6	591279	591284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933745
14045	NC_011901	GTG	2	6	591292	591297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933745
14046	NC_011901	GAC	2	6	591333	591338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933745
14047	NC_011901	CAC	2	6	591352	591357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933745
14048	NC_011901	TCG	2	6	591647	591652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933745
14049	NC_011901	CCA	2	6	591660	591665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933745
14050	NC_011901	CGG	2	6	591717	591722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933745
14051	NC_011901	GCCT	2	8	591823	591830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14052	NC_011901	GGT	2	6	591848	591853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_011901	GTC	3	9	591867	591875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933746
14054	NC_011901	TCG	2	6	591880	591885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933746
14055	NC_011901	GTG	2	6	591942	591947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933746
14056	NC_011901	CAG	2	6	591960	591965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933746
14057	NC_011901	CAG	2	6	591981	591986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933746
14058	NC_011901	GTC	2	6	592008	592013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933746
14059	NC_011901	TGC	3	9	592202	592210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933746
14060	NC_011901	GC	3	6	592255	592260	0 %	0 %	50 %	50 %	220933746
14061	NC_011901	CGAAGG	2	12	592283	592294	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220933746
14062	NC_011901	A	7	7	592360	592366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_011901	TCA	2	6	592435	592440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933747
14064	NC_011901	GCT	2	6	592445	592450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933747
14065	NC_011901	GAA	2	6	592463	592468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933747
14066	NC_011901	AGGACG	2	12	592594	592605	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220933747
14067	NC_011901	CAT	2	6	592628	592633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933747
14068	NC_011901	GCC	2	6	592737	592742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933747
14069	NC_011901	CGA	2	6	592781	592786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933747
14070	NC_011901	TGG	2	6	592807	592812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933747
14071	NC_011901	GCC	2	6	592879	592884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933747
14072	NC_011901	CAG	2	6	592899	592904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933747
14073	NC_011901	GCT	2	6	592916	592921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933747
14074	NC_011901	AACG	2	8	592926	592933	50 %	0 %	25 %	25 %	220933747
14075	NC_011901	GAG	2	6	593041	593046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933748
14076	NC_011901	AGC	2	6	593081	593086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933748
14077	NC_011901	CGC	2	6	593156	593161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933748
14078	NC_011901	GCGCA	2	10	593181	593190	20 %	0 %	40 %	40 %	220933748
14079	NC_011901	GCC	3	9	593212	593220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933748
14080	NC_011901	GGT	2	6	593223	593228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933748
14081	NC_011901	GAT	2	6	593229	593234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933748
14082	NC_011901	CGC	2	6	593285	593290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933748
14083	NC_011901	CGTG	2	8	593295	593302	0 %	25 %	50 %	25 %	220933748
14084	NC_011901	CAGC	2	8	593319	593326	25 %	0 %	25 %	50 %	220933748
14085	NC_011901	CTG	2	6	593362	593367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933748
14086	NC_011901	CGG	2	6	593378	593383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933748
14087	NC_011901	CGA	2	6	593409	593414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933748
14088	NC_011901	GCC	2	6	593434	593439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933748
14089	NC_011901	AGC	2	6	593441	593446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933748
14090	NC_011901	GGT	2	6	593469	593474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933748
14091	NC_011901	CTG	2	6	593497	593502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933748
14092	NC_011901	GCCT	2	8	593578	593585	0 %	25 %	25 %	50 %	220933748
14093	NC_011901	CTG	2	6	593632	593637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933748
14094	NC_011901	TGGCG	2	10	593661	593670	0 %	20 %	60 %	20 %	220933748
14095	NC_011901	AACCAT	2	12	593757	593768	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_011901	GCC	2	6	593829	593834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933749
14097	NC_011901	TGA	2	6	593836	593841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933749
14098	NC_011901	GGT	2	6	593888	593893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933749
14099	NC_011901	CGG	2	6	593906	593911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933749
14100	NC_011901	CAG	2	6	593919	593924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933749
14101	NC_011901	ACA	2	6	593977	593982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933749
14102	NC_011901	GGT	2	6	593993	593998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933749
14103	NC_011901	CTG	2	6	594021	594026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933749
14104	NC_011901	GC	3	6	594053	594058	0 %	0 %	50 %	50 %	220933749
14105	NC_011901	CAA	2	6	594104	594109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933749
14106	NC_011901	TCG	2	6	594115	594120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933749
14107	NC_011901	ACG	2	6	594151	594156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933749
14108	NC_011901	CCG	2	6	594163	594168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933749
14109	NC_011901	GCG	2	6	594181	594186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933749
14110	NC_011901	TCC	2	6	594255	594260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_011901	T	7	7	594294	594300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_011901	GGGC	2	8	594311	594318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14113	NC_011901	CCAG	2	8	594424	594431	25 %	0 %	25 %	50 %	220933750
14114	NC_011901	CGC	2	6	594448	594453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933750
14115	NC_011901	GGC	2	6	594473	594478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933750
14116	NC_011901	GC	3	6	594477	594482	0 %	0 %	50 %	50 %	220933750
14117	NC_011901	GTCT	2	8	594565	594572	0 %	50 %	25 %	25 %	220933750
14118	NC_011901	CCA	2	6	594640	594645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933750
14119	NC_011901	GAT	2	6	594694	594699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933750
14120	NC_011901	CAG	2	6	594743	594748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933750
14121	NC_011901	GCG	2	6	594758	594763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933750
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14240	NC_011901	TGG	2	6	600586	600591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933754
14241	NC_011901	GCC	2	6	600837	600842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933755
14242	NC_011901	G	6	6	600847	600852	0 %	0 %	100 %	0 %	220933755
14243	NC_011901	GTC	2	6	600871	600876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933755
14244	NC_011901	GCAG	2	8	600894	600901	25 %	0 %	50 %	25 %	220933755
14245	NC_011901	TGG	2	6	600953	600958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933755
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14253	NC_011901	TCG	2	6	601280	601285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933755
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14256	NC_011901	CAC	2	6	601519	601524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933755
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14258	NC_011901	GGC	2	6	601624	601629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14260	NC_011901	GGCCC	2	10	601712	601721	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14261	NC_011901	AAG	2	6	601728	601733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933756
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14270	NC_011901	GCG	2	6	602119	602124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933756
14271	NC_011901	G	6	6	602152	602157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14272	NC_011901	TCT	2	6	602231	602236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14273	NC_011901	CT	3	6	602339	602344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14274	NC_011901	GCAGGG	2	12	602497	602508	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220933757
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14332	NC_011901	GA	3	6	604997	605002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14333	NC_011901	CCGCC	2	10	605104	605113	0 %	0 %	20 %	80 %	220933759
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14340	NC_011901	CGC	2	6	605428	605433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933759
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14344	NC_011901	ACCTGG	2	12	605643	605654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933759
14345	NC_011901	CCA	3	9	605688	605696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933759
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14347	NC_011901	GGC	2	6	605717	605722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933759
14348	NC_011901	CGG	2	6	605748	605753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933759
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14350	NC_011901	TGG	2	6	605805	605810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933759
14351	NC_011901	GAG	2	6	605825	605830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933759
14352	NC_011901	AAG	2	6	605831	605836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933759
14353	NC_011901	AGG	2	6	605856	605861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933759
14354	NC_011901	GCTC	2	8	605907	605914	0 %	25 %	25 %	50 %	220933759
14355	NC_011901	GAC	2	6	605921	605926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933759
14356	NC_011901	GC	3	6	605929	605934	0 %	0 %	50 %	50 %	220933759
14357	NC_011901	CGG	2	6	605947	605952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933759
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14359	NC_011901	CCCTG	2	10	606195	606204	0 %	20 %	20 %	60 %	220933759
14360	NC_011901	AGC	2	6	606221	606226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14462	NC_011901	AGT	2	6	610865	610870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14465	NC_011901	CCCA	2	8	611035	611042	25 %	0 %	0 %	75 %	220933764
14466	NC_011901	GCCAG	2	10	611179	611188	20 %	0 %	40 %	40 %	220933764
14467	NC_011901	GCGGG	2	10	611196	611205	0 %	0 %	80 %	20 %	220933764
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14478	NC_011901	GCCA	2	8	611845	611852	25 %	0 %	25 %	50 %	220933764
14479	NC_011901	AAC	2	6	611884	611889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933764
14480	NC_011901	CGTG	2	8	611904	611911	0 %	25 %	50 %	25 %	220933764
14481	NC_011901	TCC	2	6	611938	611943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14482	NC_011901	GTG	2	6	611944	611949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14483	NC_011901	CCG	2	6	612003	612008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14484	NC_011901	GA	3	6	612023	612028	50 %	0 %	50 %	0 %	220933765
14485	NC_011901	GCCC	2	8	612039	612046	0 %	0 %	25 %	75 %	220933765
14486	NC_011901	CGG	2	6	612059	612064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933765
14487	NC_011901	GCTG	2	8	612084	612091	0 %	25 %	50 %	25 %	220933765
14488	NC_011901	GGT	2	6	612093	612098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933765
14489	NC_011901	CTGATG	2	12	612136	612147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220933765
14490	NC_011901	TGC	2	6	612149	612154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933765
14491	NC_011901	GTG	2	6	612169	612174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933765
14492	NC_011901	CTG	2	6	612180	612185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933765
14493	NC_011901	CCG	3	9	612188	612196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933765
14494	NC_011901	TGG	2	6	612224	612229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933765
14495	NC_011901	GCC	2	6	612262	612267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933765
14496	NC_011901	CTG	2	6	612288	612293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933765
14497	NC_011901	ATC	2	6	612358	612363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933765
14498	NC_011901	CTG	2	6	612384	612389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933765
14499	NC_011901	GCGAG	2	10	612395	612404	20 %	0 %	60 %	20 %	220933765
14500	NC_011901	TCG	2	6	612415	612420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933765

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