MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011901	GCG	2	6	569297	569302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933722
13502	NC_011901	CGG	2	6	569307	569312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933722
13503	NC_011901	CTCC	2	8	569330	569337	0 %	25 %	0 %	75 %	220933723
13504	NC_011901	ACC	2	6	569413	569418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933723
13505	NC_011901	GCA	2	6	569421	569426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933723
13506	NC_011901	CAG	2	6	569470	569475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933723
13507	NC_011901	CAG	2	6	569518	569523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933723
13508	NC_011901	CGG	3	9	569588	569596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933723
13509	NC_011901	CGG	2	6	569647	569652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933723
13510	NC_011901	GCTC	2	8	569658	569665	0 %	25 %	25 %	50 %	220933723
13511	NC_011901	CAT	2	6	569722	569727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933723
13512	NC_011901	CAG	2	6	569728	569733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933723
13513	NC_011901	GCACCA	2	12	569739	569750	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220933723
13514	NC_011901	TCGCCG	2	12	569834	569845	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933724
13515	NC_011901	GGC	2	6	569847	569852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933724
13516	NC_011901	GAT	2	6	569874	569879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933724
13517	NC_011901	GAT	2	6	569916	569921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933724
13518	NC_011901	ATC	2	6	569953	569958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933724
13519	NC_011901	CCA	2	6	569972	569977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933724
13520	NC_011901	GGT	2	6	569991	569996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933724
13521	NC_011901	CGG	2	6	570041	570046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933724
13522	NC_011901	CGG	2	6	570062	570067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933724
13523	NC_011901	GAT	2	6	570087	570092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933724
13524	NC_011901	CAC	2	6	570168	570173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933724
13525	NC_011901	TCC	2	6	570187	570192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933724
13526	NC_011901	GCA	2	6	570320	570325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933724
13527	NC_011901	GCT	2	6	570335	570340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933724
13528	NC_011901	CGATGG	2	12	570392	570403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220933724
13529	NC_011901	CAC	3	9	570420	570428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933724
13530	NC_011901	CTG	2	6	570453	570458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933724
13531	NC_011901	GAA	2	6	570459	570464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933724
13532	NC_011901	TC	3	6	570498	570503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13533	NC_011901	GTA	2	6	570546	570551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933725
13534	NC_011901	CAG	2	6	570603	570608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933725
13535	NC_011901	GCGGG	2	10	570623	570632	0 %	0 %	80 %	20 %	220933725
13536	NC_011901	CGG	2	6	570737	570742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933725
13537	NC_011901	GCAGGA	2	12	570749	570760	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220933725
13538	NC_011901	GCA	2	6	570761	570766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933725
13539	NC_011901	GCG	2	6	570769	570774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933725
13540	NC_011901	GCG	2	6	570881	570886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933726
13541	NC_011901	GCG	2	6	570975	570980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933726
13542	NC_011901	AG	3	6	570994	570999	50 %	0 %	50 %	0 %	220933726
13543	NC_011901	CAG	2	6	571043	571048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933726
13544	NC_011901	GCG	2	6	571056	571061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933726
13545	NC_011901	GCC	2	6	571104	571109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933726
13546	NC_011901	CAG	2	6	571196	571201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933726
13547	NC_011901	GCC	3	9	571203	571211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933726
13548	NC_011901	GC	3	6	571227	571232	0 %	0 %	50 %	50 %	220933726
13549	NC_011901	GCC	2	6	571263	571268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933726
13550	NC_011901	GC	3	6	571297	571302	0 %	0 %	50 %	50 %	220933726
13551	NC_011901	CAG	2	6	571322	571327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933726
13552	NC_011901	CTCC	2	8	571371	571378	0 %	25 %	0 %	75 %	220933727
13553	NC_011901	GCA	3	9	571403	571411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933727
13554	NC_011901	GC	3	6	571467	571472	0 %	0 %	50 %	50 %	220933727
13555	NC_011901	TCC	2	6	571525	571530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933727
13556	NC_011901	TCC	2	6	571546	571551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933727
13557	NC_011901	TCG	2	6	571561	571566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933727
13558	NC_011901	CGG	2	6	571622	571627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933727
13559	NC_011901	GGC	2	6	571638	571643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933727
13560	NC_011901	GGT	2	6	571644	571649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933727
13561	NC_011901	CCA	2	6	571745	571750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933727
13562	NC_011901	GC	4	8	571833	571840	0 %	0 %	50 %	50 %	220933727
13563	NC_011901	TGCC	2	8	571841	571848	0 %	25 %	25 %	50 %	220933727
13564	NC_011901	GAT	2	6	571863	571868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933727
13565	NC_011901	CAG	2	6	571923	571928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933727
13566	NC_011901	GGCG	2	8	571934	571941	0 %	0 %	75 %	25 %	220933727
13567	NC_011901	GCC	2	6	572038	572043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933727
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13570	NC_011901	TCG	2	6	572074	572079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933727
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13574	NC_011901	CAG	3	9	572247	572255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933727
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13578	NC_011901	CTG	2	6	572439	572444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933727
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13589	NC_011901	TCC	2	6	572974	572979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933727
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13595	NC_011901	GTGGG	2	10	573199	573208	0 %	20 %	80 %	0 %	220933727
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13599	NC_011901	GC	3	6	573379	573384	0 %	0 %	50 %	50 %	220933727
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13603	NC_011901	GCT	2	6	573500	573505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933727
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13605	NC_011901	GTC	2	6	573558	573563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933727
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13737	NC_011901	GGT	2	6	578828	578833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933733
13738	NC_011901	CGCA	2	8	578838	578845	25 %	0 %	25 %	50 %	220933733
13739	NC_011901	CGA	2	6	578891	578896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933733
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13742	NC_011901	TCG	2	6	579153	579158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933734
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13976	NC_011901	CAC	3	9	588695	588703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933743
13977	NC_011901	CGT	2	6	588715	588720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933743
13978	NC_011901	GCCGGT	2	12	588731	588742	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933743
13979	NC_011901	CTG	2	6	588747	588752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933743
13980	NC_011901	CAG	2	6	588767	588772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933743
13981	NC_011901	TGC	2	6	588778	588783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933743
13982	NC_011901	CTA	2	6	588830	588835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933743
13983	NC_011901	CGC	2	6	588869	588874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933743
13984	NC_011901	GGC	2	6	588995	589000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933743
13985	NC_011901	GGC	2	6	589007	589012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933743
13986	NC_011901	CGG	2	6	589045	589050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933743
13987	NC_011901	GAGCT	2	10	589074	589083	20 %	20 %	40 %	20 %	220933743
13988	NC_011901	CCA	2	6	589097	589102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933743
13989	NC_011901	CAT	2	6	589130	589135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933743
13990	NC_011901	CTGG	2	8	589142	589149	0 %	25 %	50 %	25 %	220933743
13991	NC_011901	CCGA	2	8	589175	589182	25 %	0 %	25 %	50 %	220933743
13992	NC_011901	TCCC	2	8	589249	589256	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13993	NC_011901	GGT	2	6	589282	589287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13994	NC_011901	CCG	2	6	589357	589362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933744
13995	NC_011901	TC	3	6	589373	589378	0 %	50 %	0 %	50 %	220933744
13996	NC_011901	CAC	2	6	589406	589411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933744
13997	NC_011901	GCG	2	6	589448	589453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933744
13998	NC_011901	TGG	2	6	589470	589475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933744
13999	NC_011901	CCT	2	6	589498	589503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933744
14000	NC_011901	GCC	3	9	589535	589543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933744

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