MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011901	CCG	2	6	549182	549187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933703
13002	NC_011901	GTG	2	6	549188	549193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933703
13003	NC_011901	CTG	2	6	549200	549205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933703
13004	NC_011901	GGC	2	6	549217	549222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933703
13005	NC_011901	CTG	2	6	549230	549235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933703
13006	NC_011901	CCA	2	6	549240	549245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933703
13007	NC_011901	CT	3	6	549259	549264	0 %	50 %	0 %	50 %	220933703
13008	NC_011901	TGG	2	6	549303	549308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933703
13009	NC_011901	GC	3	6	549344	549349	0 %	0 %	50 %	50 %	220933703
13010	NC_011901	CGG	2	6	549366	549371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933703
13011	NC_011901	CCG	2	6	549480	549485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933703
13012	NC_011901	TGGC	2	8	549533	549540	0 %	25 %	50 %	25 %	220933703
13013	NC_011901	GC	3	6	549553	549558	0 %	0 %	50 %	50 %	220933703
13014	NC_011901	CTG	3	9	549566	549574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933703
13015	NC_011901	GCT	2	6	549655	549660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933703
13016	NC_011901	CTG	2	6	549680	549685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933703
13017	NC_011901	GAG	2	6	549701	549706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933703
13018	NC_011901	CTG	2	6	549716	549721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933703
13019	NC_011901	GGGT	2	8	549765	549772	0 %	25 %	75 %	0 %	220933703
13020	NC_011901	TGC	2	6	549777	549782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933703
13021	NC_011901	GGCC	2	8	549791	549798	0 %	0 %	50 %	50 %	220933703
13022	NC_011901	AAC	2	6	549891	549896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933703
13023	NC_011901	GCC	3	9	549913	549921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933703
13024	NC_011901	TGG	2	6	549945	549950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_011901	AG	3	6	549962	549967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_011901	A	7	7	549999	550005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_011901	T	6	6	550020	550025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_011901	CTT	2	6	550036	550041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_011901	ACG	2	6	550101	550106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933704
13030	NC_011901	TGC	2	6	550125	550130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933704
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13032	NC_011901	GAT	2	6	550189	550194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933704
13033	NC_011901	CGG	2	6	550329	550334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933704
13034	NC_011901	CCG	2	6	550371	550376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933704
13035	NC_011901	CGCA	2	8	550400	550407	25 %	0 %	25 %	50 %	220933704
13036	NC_011901	GGC	2	6	550408	550413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933704
13037	NC_011901	GTG	2	6	550430	550435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933704
13038	NC_011901	GCC	2	6	550505	550510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933704
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13040	NC_011901	CGG	3	9	550557	550565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933704
13041	NC_011901	ACC	2	6	550568	550573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933704
13042	NC_011901	GGC	2	6	550578	550583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933704
13043	NC_011901	CGG	2	6	550590	550595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933704
13044	NC_011901	GAT	2	6	550603	550608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933704
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13047	NC_011901	GAT	2	6	550720	550725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933704
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13052	NC_011901	GGT	2	6	550960	550965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933705
13053	NC_011901	CGTGCT	2	12	550975	550986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933705
13054	NC_011901	TGAT	2	8	550995	551002	25 %	50 %	25 %	0 %	220933705
13055	NC_011901	CTGG	2	8	551033	551040	0 %	25 %	50 %	25 %	220933705
13056	NC_011901	AGT	2	6	551074	551079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933705
13057	NC_011901	TTGATC	2	12	551094	551105	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220933705
13058	NC_011901	TGT	2	6	551113	551118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933705
13059	NC_011901	ACC	2	6	551190	551195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933705
13060	NC_011901	CCT	2	6	551221	551226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933705
13061	NC_011901	CAG	3	9	551246	551254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933705
13062	NC_011901	GC	4	8	551262	551269	0 %	0 %	50 %	50 %	220933705
13063	NC_011901	TTC	2	6	551324	551329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933705
13064	NC_011901	TAG	2	6	551350	551355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_011901	CAG	3	9	551577	551585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933706
13066	NC_011901	GCC	2	6	551589	551594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933706
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13068	NC_011901	TGA	2	6	551621	551626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933706
13069	NC_011901	GTC	2	6	551637	551642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933706
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13091	NC_011901	GGCGCG	2	12	552642	552653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933707
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13093	NC_011901	GGTG	2	8	552707	552714	0 %	25 %	75 %	0 %	220933707
13094	NC_011901	GCC	2	6	552750	552755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933707
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13099	NC_011901	CGC	2	6	553077	553082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933707
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13101	NC_011901	CCG	2	6	553090	553095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933707
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13103	NC_011901	CGG	2	6	553196	553201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933707
13104	NC_011901	GC	3	6	553225	553230	0 %	0 %	50 %	50 %	220933707
13105	NC_011901	GGTCCG	2	12	553232	553243	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933707
13106	NC_011901	GCG	2	6	553264	553269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933707
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13120	NC_011901	GC	3	6	553731	553736	0 %	0 %	50 %	50 %	220933708
13121	NC_011901	AGCC	2	8	553737	553744	25 %	0 %	25 %	50 %	220933708
13122	NC_011901	GAT	2	6	553769	553774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933708
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13148	NC_011901	GCG	2	6	554912	554917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13149	NC_011901	GCC	2	6	554929	554934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13150	NC_011901	GCCG	2	8	554954	554961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13151	NC_011901	GAT	2	6	554964	554969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13210	NC_011901	CGCCTG	2	12	557441	557452	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933710
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13225	NC_011901	CG	3	6	557929	557934	0 %	0 %	50 %	50 %	220933711
13226	NC_011901	ACCGGT	2	12	558199	558210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933711
13227	NC_011901	CGC	2	6	558222	558227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933711
13228	NC_011901	CTG	2	6	558256	558261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933711
13229	NC_011901	TCG	2	6	558290	558295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933711
13230	NC_011901	CGC	2	6	558314	558319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933711
13231	NC_011901	TCGCC	2	10	558327	558336	0 %	20 %	20 %	60 %	220933711
13232	NC_011901	CCG	2	6	558352	558357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13233	NC_011901	CGG	2	6	558358	558363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13234	NC_011901	AGG	2	6	558586	558591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13235	NC_011901	CGC	2	6	558754	558759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13236	NC_011901	GAT	3	9	558796	558804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933712
13237	NC_011901	GGT	2	6	558877	558882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933712
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13239	NC_011901	CCA	2	6	558972	558977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933712
13240	NC_011901	TCA	2	6	558999	559004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933712
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13242	NC_011901	CGG	2	6	559029	559034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933712
13243	NC_011901	CAC	2	6	559042	559047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933712
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13270	NC_011901	GTT	2	6	559844	559849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13358	NC_011901	A	6	6	563346	563351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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