MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011901	TCCG	2	8	461670	461677	0 %	25 %	25 %	50 %	220933624
11002	NC_011901	ATC	2	6	461693	461698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933624
11003	NC_011901	GGA	2	6	461707	461712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933624
11004	NC_011901	CAC	2	6	461719	461724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933624
11005	NC_011901	GGT	2	6	461729	461734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933624
11006	NC_011901	GGCAAG	2	12	461792	461803	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220933624
11007	NC_011901	GAA	2	6	461921	461926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933624
11008	NC_011901	CAT	2	6	461929	461934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933624
11009	NC_011901	AGA	2	6	462020	462025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_011901	AAG	2	6	462047	462052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933625
11011	NC_011901	TGA	2	6	462063	462068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933625
11012	NC_011901	GAAG	2	8	462258	462265	50 %	0 %	50 %	0 %	220933625
11013	NC_011901	TCC	2	6	462268	462273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933625
11014	NC_011901	CAC	3	9	462300	462308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933625
11015	NC_011901	CCG	2	6	462359	462364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933625
11016	NC_011901	CGC	2	6	462411	462416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933625
11017	NC_011901	GAA	2	6	462429	462434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933625
11018	NC_011901	CGA	2	6	462498	462503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933625
11019	NC_011901	ATC	2	6	462517	462522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933625
11020	NC_011901	AAGG	2	8	462547	462554	50 %	0 %	50 %	0 %	220933625
11021	NC_011901	GGA	2	6	462567	462572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933625
11022	NC_011901	TCC	2	6	462577	462582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933625
11023	NC_011901	GTG	2	6	462601	462606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933625
11024	NC_011901	CAA	2	6	462651	462656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933625
11025	NC_011901	CAG	2	6	462658	462663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933625
11026	NC_011901	TGC	2	6	462695	462700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933625
11027	NC_011901	AAG	2	6	462709	462714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933625
11028	NC_011901	CTG	2	6	462733	462738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933625
11029	NC_011901	CTG	2	6	462775	462780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933625
11030	NC_011901	ATC	2	6	462781	462786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933625
11031	NC_011901	TGG	2	6	462821	462826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933625
11032	NC_011901	GCC	2	6	462856	462861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933625
11033	NC_011901	TGC	2	6	462899	462904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933625
11034	NC_011901	CGG	2	6	462924	462929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933625
11035	NC_011901	CGA	2	6	462978	462983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933625
11036	NC_011901	GGCCA	2	10	462988	462997	20 %	0 %	40 %	40 %	220933625
11037	NC_011901	GTG	2	6	463006	463011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933625
11038	NC_011901	CAT	2	6	463029	463034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933625
11039	NC_011901	CGA	2	6	463053	463058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933625
11040	NC_011901	CGG	2	6	463155	463160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933625
11041	NC_011901	GCC	2	6	463183	463188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933625
11042	NC_011901	GAA	2	6	463209	463214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933625
11043	NC_011901	GAA	2	6	463258	463263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933625
11044	NC_011901	GTG	2	6	463267	463272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933625
11045	NC_011901	CGG	3	9	463275	463283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933625
11046	NC_011901	GTGC	2	8	463294	463301	0 %	25 %	50 %	25 %	220933625
11047	NC_011901	CATCGC	2	12	463353	463364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220933625
11048	NC_011901	GCG	2	6	463409	463414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933625
11049	NC_011901	GTG	2	6	463426	463431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933625
11050	NC_011901	AAC	2	6	463435	463440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933625
11051	NC_011901	GTG	2	6	463441	463446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933625
11052	NC_011901	CGC	2	6	463473	463478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933625
11053	NC_011901	CCA	2	6	463523	463528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933625
11054	NC_011901	CGC	2	6	463554	463559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933625
11055	NC_011901	ATC	2	6	463576	463581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933625
11056	NC_011901	ACC	2	6	463582	463587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933625
11057	NC_011901	GAA	2	6	463611	463616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933625
11058	NC_011901	CGG	3	9	463635	463643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933625
11059	NC_011901	GGCATG	2	12	463660	463671	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220933625
11060	NC_011901	T	7	7	463737	463743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_011901	T	6	6	463792	463797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_011901	CT	3	6	463833	463838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_011901	GT	3	6	463886	463891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_011901	GTCA	2	8	463914	463921	25 %	25 %	25 %	25 %	220933626
11065	NC_011901	GC	3	6	464033	464038	0 %	0 %	50 %	50 %	220933626
11066	NC_011901	GGA	2	6	464088	464093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933626
11067	NC_011901	CGC	2	6	464135	464140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933626
11068	NC_011901	ATC	2	6	464191	464196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933626
11069	NC_011901	CGC	2	6	464268	464273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933626
11070	NC_011901	CGCC	2	8	464334	464341	0 %	0 %	25 %	75 %	220933626
11071	NC_011901	CAT	2	6	464356	464361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933626
11072	NC_011901	CGG	2	6	464362	464367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933626
11073	NC_011901	GCC	2	6	464372	464377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11074	NC_011901	CAA	2	6	464384	464389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_011901	ATG	2	6	464521	464526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_011901	CCT	2	6	464647	464652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933627
11077	NC_011901	GGA	2	6	464666	464671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933627
11078	NC_011901	CCGG	2	8	464722	464729	0 %	0 %	50 %	50 %	220933627
11079	NC_011901	GGT	2	6	464765	464770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933627
11080	NC_011901	GGC	2	6	464783	464788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933627
11081	NC_011901	GAG	2	6	464808	464813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933627
11082	NC_011901	ACC	2	6	464814	464819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933627
11083	NC_011901	CCT	2	6	464845	464850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933627
11084	NC_011901	CGGG	2	8	464855	464862	0 %	0 %	75 %	25 %	220933627
11085	NC_011901	GC	3	6	464975	464980	0 %	0 %	50 %	50 %	220933627
11086	NC_011901	GCC	3	9	465096	465104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933627
11087	NC_011901	GGGC	2	8	465134	465141	0 %	0 %	75 %	25 %	220933627
11088	NC_011901	CCA	2	6	465158	465163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933627
11089	NC_011901	TTC	2	6	465207	465212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933627
11090	NC_011901	CGGGC	2	10	465236	465245	0 %	0 %	60 %	40 %	220933627
11091	NC_011901	GCGCG	2	10	465281	465290	0 %	0 %	60 %	40 %	220933627
11092	NC_011901	CCG	2	6	465325	465330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933627
11093	NC_011901	GGT	2	6	465344	465349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933627
11094	NC_011901	CCTG	2	8	465359	465366	0 %	25 %	25 %	50 %	220933627
11095	NC_011901	GCCG	2	8	465374	465381	0 %	0 %	50 %	50 %	220933627
11096	NC_011901	ATC	2	6	465417	465422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933627
11097	NC_011901	CTG	2	6	465432	465437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11098	NC_011901	TGC	2	6	465523	465528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11099	NC_011901	GGT	2	6	465623	465628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933627
11100	NC_011901	CCGGTG	2	12	465672	465683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933627
11101	NC_011901	GC	3	6	465699	465704	0 %	0 %	50 %	50 %	220933627
11102	NC_011901	GTG	2	6	465705	465710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933627
11103	NC_011901	GGT	2	6	465711	465716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933627
11104	NC_011901	GC	3	6	465746	465751	0 %	0 %	50 %	50 %	220933627
11105	NC_011901	ATC	2	6	465786	465791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933627
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11107	NC_011901	GGC	2	6	465803	465808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933627
11108	NC_011901	TGG	2	6	465838	465843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933627
11109	NC_011901	GGT	2	6	465869	465874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933627
11110	NC_011901	GCT	2	6	465887	465892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11111	NC_011901	GCGGTG	2	12	465954	465965	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220933627
11112	NC_011901	ATC	2	6	465969	465974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933627
11113	NC_011901	CAT	2	6	466013	466018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933627
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11115	NC_011901	GTG	2	6	466098	466103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933627
11116	NC_011901	TCG	2	6	466156	466161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11117	NC_011901	GGA	2	6	466178	466183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933627
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11119	NC_011901	TCG	2	6	466351	466356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11120	NC_011901	GCT	2	6	466478	466483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11121	NC_011901	AGG	2	6	466504	466509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933627
11122	NC_011901	CCG	2	6	466585	466590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933627
11123	NC_011901	GGT	2	6	466622	466627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933627
11124	NC_011901	TGC	2	6	466636	466641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11125	NC_011901	GCA	2	6	466673	466678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11126	NC_011901	GGC	2	6	466680	466685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933627
11127	NC_011901	ACG	2	6	466717	466722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11128	NC_011901	CGCC	2	8	466723	466730	0 %	0 %	25 %	75 %	220933627
11129	NC_011901	CAA	2	6	466820	466825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933627
11130	NC_011901	CTG	2	6	466911	466916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11131	NC_011901	GGC	2	6	466922	466927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933627
11132	NC_011901	TCG	2	6	466945	466950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11133	NC_011901	CTG	3	9	466953	466961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11134	NC_011901	CAGCGT	2	12	466997	467008	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933627
11135	NC_011901	GATA	2	8	467109	467116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11136	NC_011901	TTGA	2	8	467217	467224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11137	NC_011901	GAT	2	6	467328	467333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933628
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11139	NC_011901	TGC	2	6	467420	467425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933628
11140	NC_011901	CCG	2	6	467433	467438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933628
11141	NC_011901	TGG	2	6	467480	467485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933628
11142	NC_011901	GAAGA	2	10	467557	467566	60 %	0 %	40 %	0 %	220933628
11143	NC_011901	GCA	2	6	467598	467603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933628
11144	NC_011901	GCGG	2	8	467631	467638	0 %	0 %	75 %	25 %	220933628
11145	NC_011901	AGGT	2	8	467677	467684	25 %	25 %	50 %	0 %	220933628
11146	NC_011901	TC	3	6	467695	467700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11147	NC_011901	TGGCT	2	10	467808	467817	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11148	NC_011901	CTG	2	6	467887	467892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11149	NC_011901	CTG	2	6	467928	467933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933629
11150	NC_011901	GCCA	2	8	468041	468048	25 %	0 %	25 %	50 %	220933629
11151	NC_011901	TCC	2	6	468078	468083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933629
11152	NC_011901	CCGAAC	20	120	468085	468204	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220933629
11153	NC_011901	CCCGAA	4	24	468222	468245	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220933629
11154	NC_011901	GGA	2	6	468329	468334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933629
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11156	NC_011901	AGCGCC	2	12	468394	468405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220933629
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11159	NC_011901	TGG	2	6	468574	468579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933629
11160	NC_011901	CTG	2	6	468645	468650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933629
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11163	NC_011901	CGG	2	6	468703	468708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933629
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11211	NC_011901	GC	3	6	470571	470576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11212	NC_011901	TGCGC	2	10	470732	470741	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11213	NC_011901	GGCC	2	8	470857	470864	0 %	0 %	50 %	50 %	220933631
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11230	NC_011901	GC	3	6	471436	471441	0 %	0 %	50 %	50 %	220933631
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11480	NC_011901	GC	4	8	482192	482199	0 %	0 %	50 %	50 %	220933638
11481	NC_011901	GTC	2	6	482319	482324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11482	NC_011901	ATG	2	6	482327	482332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11483	NC_011901	GGT	2	6	482397	482402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933639
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