MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_011901	CAG	2	6	3323647	3323652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936332
78002	NC_011901	CACC	2	8	3323691	3323698	25 %	0 %	0 %	75 %	220936332
78003	NC_011901	CCGG	2	8	3323701	3323708	0 %	0 %	50 %	50 %	220936332
78004	NC_011901	CCA	2	6	3323718	3323723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936332
78005	NC_011901	CTC	2	6	3323752	3323757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220936332
78006	NC_011901	GCC	2	6	3323842	3323847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936332
78007	NC_011901	TCT	2	6	3323850	3323855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220936332
78008	NC_011901	CAG	2	6	3323887	3323892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936332
78009	NC_011901	TCG	2	6	3323909	3323914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936332
78010	NC_011901	GCC	2	6	3323965	3323970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936332
78011	NC_011901	CCA	2	6	3324048	3324053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936332
78012	NC_011901	CAC	2	6	3324055	3324060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936332
78013	NC_011901	GC	3	6	3324079	3324084	0 %	0 %	50 %	50 %	220936332
78014	NC_011901	CAC	2	6	3324103	3324108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936332
78015	NC_011901	GCA	2	6	3324135	3324140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936332
78016	NC_011901	CCG	2	6	3324210	3324215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936332
78017	NC_011901	TGC	2	6	3324273	3324278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936332
78018	NC_011901	CAGGCG	2	12	3324334	3324345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220936332
78019	NC_011901	TGCCG	2	10	3324352	3324361	0 %	20 %	40 %	40 %	220936332
78020	NC_011901	CCA	2	6	3324381	3324386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936332
78021	NC_011901	GC	3	6	3324417	3324422	0 %	0 %	50 %	50 %	220936332
78022	NC_011901	CACC	2	8	3324450	3324457	25 %	0 %	0 %	75 %	220936332
78023	NC_011901	CAC	2	6	3324481	3324486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936332
78024	NC_011901	GGC	2	6	3324538	3324543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936332
78025	NC_011901	CCGG	2	8	3324561	3324568	0 %	0 %	50 %	50 %	220936332
78026	NC_011901	GGC	2	6	3324644	3324649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936332
78027	NC_011901	GAA	2	6	3324658	3324663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936332
78028	NC_011901	GCG	2	6	3324704	3324709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936332
78029	NC_011901	CAG	2	6	3324721	3324726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936332
78030	NC_011901	CCG	3	9	3324729	3324737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936332
78031	NC_011901	GCG	2	6	3324743	3324748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936332
78032	NC_011901	GAA	2	6	3324754	3324759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936332
78033	NC_011901	CGA	2	6	3324801	3324806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936332
78034	NC_011901	ATG	2	6	3324875	3324880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936332
78035	NC_011901	GGC	2	6	3325054	3325059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936333
78036	NC_011901	GTCC	2	8	3325063	3325070	0 %	25 %	25 %	50 %	220936333
78037	NC_011901	GGT	2	6	3325082	3325087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936333
78038	NC_011901	TCG	2	6	3325155	3325160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936333
78039	NC_011901	GCG	2	6	3325174	3325179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936333
78040	NC_011901	AAC	2	6	3325203	3325208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220936333
78041	NC_011901	GACGC	2	10	3325239	3325248	20 %	0 %	40 %	40 %	220936333
78042	NC_011901	CAG	2	6	3325256	3325261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936333
78043	NC_011901	CCA	2	6	3325267	3325272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936333
78044	NC_011901	CCCGGG	2	12	3325297	3325308	0 %	0 %	50 %	50 %	220936333
78045	NC_011901	GCC	2	6	3325317	3325322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936333
78046	NC_011901	CGG	2	6	3325390	3325395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936333
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78048	NC_011901	CGT	2	6	3325438	3325443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936333
78049	NC_011901	GGCG	2	8	3325468	3325475	0 %	0 %	75 %	25 %	220936333
78050	NC_011901	C	7	7	3325515	3325521	0 %	0 %	0 %	100 %	220936333
78051	NC_011901	GCA	2	6	3325540	3325545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936333
78052	NC_011901	GCC	2	6	3325553	3325558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936333
78053	NC_011901	CTC	2	6	3325559	3325564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220936333
78054	NC_011901	CAG	2	6	3325580	3325585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936333
78055	NC_011901	CGG	2	6	3325597	3325602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936333
78056	NC_011901	G	6	6	3325630	3325635	0 %	0 %	100 %	0 %	220936333
78057	NC_011901	GCG	2	6	3325639	3325644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936333
78058	NC_011901	GGCAT	2	10	3325734	3325743	20 %	20 %	40 %	20 %	220936333
78059	NC_011901	CGG	3	9	3325753	3325761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78060	NC_011901	TGCGC	2	10	3325839	3325848	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78061	NC_011901	CCA	2	6	3325943	3325948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936334
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78069	NC_011901	GCAGGC	2	12	3326135	3326146	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220936334
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78071	NC_011901	CCT	2	6	3326183	3326188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220936334
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78083	NC_011901	GGC	2	6	3326573	3326578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936334
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78096	NC_011901	ATG	2	6	3326988	3326993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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78099	NC_011901	GCCG	2	8	3327078	3327085	0 %	0 %	50 %	50 %	220936335
78100	NC_011901	TCT	2	6	3327086	3327091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220936335
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78103	NC_011901	CGC	2	6	3327178	3327183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936335
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78112	NC_011901	GGCACC	2	12	3327680	3327691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220936335
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78466	NC_011901	CCA	2	6	3343166	3343171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936346
78467	NC_011901	CAG	2	6	3343179	3343184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936346
78468	NC_011901	GCG	2	6	3343228	3343233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936346
78469	NC_011901	TGA	2	6	3343259	3343264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936346
78470	NC_011901	CAC	2	6	3343268	3343273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936346
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78472	NC_011901	CAG	2	6	3343305	3343310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936346
78473	NC_011901	CCT	2	6	3343355	3343360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220936346
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78475	NC_011901	CTG	2	6	3343447	3343452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936346
78476	NC_011901	CCT	2	6	3343466	3343471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220936346
78477	NC_011901	ATC	2	6	3343512	3343517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220936346
78478	NC_011901	GCC	2	6	3343585	3343590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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78481	NC_011901	TCG	2	6	3343640	3343645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936347
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78489	NC_011901	CGG	2	6	3344015	3344020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936347
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78492	NC_011901	GC	3	6	3344059	3344064	0 %	0 %	50 %	50 %	220936347
78493	NC_011901	ACC	2	6	3344069	3344074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936347
78494	NC_011901	GGCG	2	8	3344100	3344107	0 %	0 %	75 %	25 %	220936347
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78497	NC_011901	TTG	2	6	3344219	3344224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220936347
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78499	NC_011901	GCC	2	6	3344309	3344314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936347
78500	NC_011901	GTA	2	6	3344347	3344352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936347

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