MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_011901	GTC	2	6	290437	290442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933450
7003	NC_011901	GTC	2	6	290449	290454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933450
7004	NC_011901	CTC	2	6	290545	290550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933450
7005	NC_011901	CGC	2	6	290556	290561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933450
7006	NC_011901	GCC	2	6	290600	290605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933450
7007	NC_011901	GGC	2	6	290644	290649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933450
7008	NC_011901	TGG	2	6	290682	290687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933450
7009	NC_011901	GCCG	2	8	290757	290764	0 %	0 %	50 %	50 %	220933450
7010	NC_011901	CGT	2	6	290766	290771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933450
7011	NC_011901	GTA	2	6	290776	290781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933450
7012	NC_011901	CAG	2	6	290812	290817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933450
7013	NC_011901	CCG	2	6	290826	290831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933450
7014	NC_011901	GGC	2	6	290839	290844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933450
7015	NC_011901	CTT	2	6	290908	290913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933450
7016	NC_011901	TGG	2	6	290961	290966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933450
7017	NC_011901	TGA	2	6	291006	291011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933450
7018	NC_011901	GC	3	6	291034	291039	0 %	0 %	50 %	50 %	220933450
7019	NC_011901	GGCG	2	8	291060	291067	0 %	0 %	75 %	25 %	220933450
7020	NC_011901	CTT	2	6	291094	291099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933450
7021	NC_011901	TGG	2	6	291132	291137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933450
7022	NC_011901	CGG	2	6	291186	291191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933450
7023	NC_011901	TTC	2	6	291396	291401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7025	NC_011901	GCC	2	6	291584	291589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933451
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7033	NC_011901	GTC	2	6	291908	291913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933451
7034	NC_011901	CGG	2	6	291980	291985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_011901	CTA	2	6	292014	292019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_011901	CAA	2	6	292061	292066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_011901	TC	3	6	292080	292085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7038	NC_011901	GTTC	2	8	292168	292175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7039	NC_011901	TC	3	6	292200	292205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7040	NC_011901	GAA	2	6	292224	292229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_011901	GA	3	6	292264	292269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_011901	GA	3	6	292324	292329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_011901	CAA	2	6	292395	292400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_011901	CCT	2	6	292529	292534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933452
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7046	NC_011901	CCAG	2	8	292553	292560	25 %	0 %	25 %	50 %	220933452
7047	NC_011901	GCC	3	9	292564	292572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933452
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7052	NC_011901	GCTC	2	8	292694	292701	0 %	25 %	25 %	50 %	220933452
7053	NC_011901	AGC	2	6	292717	292722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933452
7054	NC_011901	CCA	2	6	292787	292792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933452
7055	NC_011901	GGCCA	2	10	292795	292804	20 %	0 %	40 %	40 %	220933452
7056	NC_011901	ATGCGG	2	12	292906	292917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220933452
7057	NC_011901	GC	3	6	292941	292946	0 %	0 %	50 %	50 %	220933452
7058	NC_011901	AGG	2	6	292951	292956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933452
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7062	NC_011901	GCC	2	6	293043	293048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933452
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7064	NC_011901	GTC	2	6	293112	293117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933452
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7067	NC_011901	GTT	2	6	293321	293326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_011901	TC	3	6	293347	293352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_011901	TTTA	2	8	293383	293390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_011901	GA	3	6	293469	293474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_011901	CG	4	8	293510	293517	0 %	0 %	50 %	50 %	220933453
7072	NC_011901	CGG	3	9	293526	293534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933453
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7082	NC_011901	GTGGC	2	10	293903	293912	0 %	20 %	60 %	20 %	220933453
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7089	NC_011901	CGCT	2	8	294278	294285	0 %	25 %	25 %	50 %	220933453
7090	NC_011901	GCCG	2	8	294315	294322	0 %	0 %	50 %	50 %	220933453
7091	NC_011901	CAG	2	6	294328	294333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933453
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7098	NC_011901	GAAA	2	8	294718	294725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7101	NC_011901	GA	3	6	294973	294978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_011901	GGTC	2	8	294998	295005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7103	NC_011901	GCG	2	6	295018	295023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933454
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7105	NC_011901	GTT	2	6	295183	295188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933454
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7109	NC_011901	GAT	2	6	295393	295398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933454
7110	NC_011901	CCA	2	6	295410	295415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933454
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7113	NC_011901	GCC	2	6	295444	295449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933454
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7118	NC_011901	GCT	2	6	295616	295621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_011901	A	6	6	295697	295702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_011901	GCCGG	2	10	295712	295721	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7121	NC_011901	GAA	2	6	295749	295754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_011901	ATACC	2	10	295759	295768	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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7124	NC_011901	AGA	2	6	295806	295811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7246	NC_011901	CGT	2	6	300415	300420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933458
7247	NC_011901	TCA	2	6	300479	300484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933458
7248	NC_011901	GTAG	2	8	300574	300581	25 %	25 %	50 %	0 %	220933458
7249	NC_011901	GTC	2	6	300622	300627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933458
7250	NC_011901	GCC	2	6	300670	300675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933458
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7253	NC_011901	GCAT	2	8	300767	300774	25 %	25 %	25 %	25 %	220933458
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7264	NC_011901	TGC	2	6	301490	301495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933459
7265	NC_011901	GCT	2	6	301542	301547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933459
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7277	NC_011901	AAC	2	6	302157	302162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7278	NC_011901	TGG	2	6	302173	302178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7279	NC_011901	TCG	2	6	302236	302241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933460
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7289	NC_011901	ACC	2	6	302764	302769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7290	NC_011901	GGC	2	6	302787	302792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7349	NC_011901	CAA	2	6	304933	304938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933461
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7352	NC_011901	GGT	2	6	305066	305071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933461
7353	NC_011901	GCC	2	6	305090	305095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933461
7354	NC_011901	TGGAC	2	10	305097	305106	20 %	20 %	40 %	20 %	220933461
7355	NC_011901	CCTG	2	8	305107	305114	0 %	25 %	25 %	50 %	220933461
7356	NC_011901	GCG	2	6	305123	305128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933461
7357	NC_011901	CTG	2	6	305132	305137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933461
7358	NC_011901	T	7	7	305223	305229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7359	NC_011901	GGA	2	6	305289	305294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7360	NC_011901	TTTCA	2	10	305301	305310	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7361	NC_011901	CCAG	2	8	305353	305360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7362	NC_011901	ATA	2	6	305476	305481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7363	NC_011901	TC	3	6	305490	305495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7364	NC_011901	GGA	2	6	305540	305545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7365	NC_011901	GA	3	6	305596	305601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7366	NC_011901	TC	3	6	305757	305762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7494	NC_011901	ACCT	2	8	310996	311003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7495	NC_011901	GGA	2	6	311038	311043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7496	NC_011901	GA	3	6	311086	311091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7497	NC_011901	GA	3	6	311134	311139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7498	NC_011901	TCG	2	6	311216	311221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933464
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