MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_011901	CAG	2	6	3155409	3155414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936172
74002	NC_011901	CAC	2	6	3155433	3155438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936172
74003	NC_011901	CG	3	6	3155446	3155451	0 %	0 %	50 %	50 %	220936172
74004	NC_011901	CGG	2	6	3155459	3155464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936172
74005	NC_011901	GCC	2	6	3155490	3155495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936172
74006	NC_011901	CAGG	2	8	3155528	3155535	25 %	0 %	50 %	25 %	220936172
74007	NC_011901	CGG	2	6	3155631	3155636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936172
74008	NC_011901	GCC	2	6	3155669	3155674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74009	NC_011901	TGT	2	6	3155704	3155709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74010	NC_011901	CAT	2	6	3155726	3155731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74011	NC_011901	CTG	2	6	3155793	3155798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936173
74012	NC_011901	GCC	2	6	3155827	3155832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936173
74013	NC_011901	GGCC	2	8	3155834	3155841	0 %	0 %	50 %	50 %	220936173
74014	NC_011901	CCA	2	6	3155881	3155886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936173
74015	NC_011901	TGC	2	6	3155890	3155895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936173
74016	NC_011901	CAT	2	6	3155918	3155923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220936173
74017	NC_011901	CTG	2	6	3155928	3155933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936173
74018	NC_011901	TCG	2	6	3155965	3155970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936173
74019	NC_011901	CGC	2	6	3156002	3156007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936173
74020	NC_011901	GCC	2	6	3156018	3156023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936173
74021	NC_011901	CGC	2	6	3156125	3156130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936173
74022	NC_011901	GCC	2	6	3156153	3156158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936173
74023	NC_011901	CCG	2	6	3156190	3156195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936173
74024	NC_011901	GCC	2	6	3156249	3156254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936173
74025	NC_011901	TGC	2	6	3156259	3156264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936173
74026	NC_011901	CGC	2	6	3156266	3156271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936173
74027	NC_011901	CCG	2	6	3156302	3156307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936173
74028	NC_011901	CTG	2	6	3156309	3156314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936173
74029	NC_011901	CAA	2	6	3156338	3156343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220936173
74030	NC_011901	GC	4	8	3156440	3156447	0 %	0 %	50 %	50 %	220936174
74031	NC_011901	GGC	2	6	3156597	3156602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936174
74032	NC_011901	CCA	3	9	3156624	3156632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936174
74033	NC_011901	CCGC	2	8	3156657	3156664	0 %	0 %	25 %	75 %	220936174
74034	NC_011901	CCA	2	6	3156687	3156692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936174
74035	NC_011901	CCT	2	6	3156696	3156701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220936174
74036	NC_011901	GGT	2	6	3156754	3156759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936174
74037	NC_011901	CGGT	2	8	3156806	3156813	0 %	25 %	50 %	25 %	220936174
74038	NC_011901	GCC	2	6	3156863	3156868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936174
74039	NC_011901	GGGCC	2	10	3156870	3156879	0 %	0 %	60 %	40 %	220936174
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74042	NC_011901	CGT	2	6	3156936	3156941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936174
74043	NC_011901	CCA	2	6	3156987	3156992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936174
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74046	NC_011901	CAG	2	6	3157054	3157059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936174
74047	NC_011901	CGG	2	6	3157098	3157103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936174
74048	NC_011901	CCCAGG	2	12	3157110	3157121	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220936174
74049	NC_011901	GC	3	6	3157129	3157134	0 %	0 %	50 %	50 %	220936174
74050	NC_011901	CACC	2	8	3157143	3157150	25 %	0 %	0 %	75 %	220936174
74051	NC_011901	AGC	2	6	3157151	3157156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936174
74052	NC_011901	CAG	2	6	3157162	3157167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936174
74053	NC_011901	GGC	2	6	3157207	3157212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936174
74054	NC_011901	GCA	2	6	3157248	3157253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936174
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74057	NC_011901	CAG	2	6	3157342	3157347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936174
74058	NC_011901	TCA	2	6	3157382	3157387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220936174
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74061	NC_011901	CGC	2	6	3157511	3157516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74062	NC_011901	ACG	2	6	3157576	3157581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74063	NC_011901	GAT	2	6	3157690	3157695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74064	NC_011901	CGT	2	6	3157795	3157800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936175
74065	NC_011901	CGCAAG	2	12	3157831	3157842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936175
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74068	NC_011901	CGAC	2	8	3157919	3157926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74069	NC_011901	GC	3	6	3158031	3158036	0 %	0 %	50 %	50 %	220936176
74070	NC_011901	CGC	2	6	3158076	3158081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936176
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74087	NC_011901	TCCC	2	8	3159123	3159130	0 %	25 %	0 %	75 %	220936177
74088	NC_011901	CGC	2	6	3159161	3159166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936177
74089	NC_011901	GGA	2	6	3159175	3159180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220936177
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74094	NC_011901	GCCCT	2	10	3159335	3159344	0 %	20 %	20 %	60 %	220936177
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74104	NC_011901	GC	3	6	3159657	3159662	0 %	0 %	50 %	50 %	220936177
74105	NC_011901	GCC	3	9	3159675	3159683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936177
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74115	NC_011901	CCCGGG	2	12	3160202	3160213	0 %	0 %	50 %	50 %	220936178
74116	NC_011901	TGGGCC	2	12	3160340	3160351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220936178
74117	NC_011901	CGC	3	9	3160401	3160409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936178
74118	NC_011901	CCG	2	6	3160479	3160484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936178
74119	NC_011901	GGAC	2	8	3160491	3160498	25 %	0 %	50 %	25 %	220936178
74120	NC_011901	TGG	2	6	3160550	3160555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936178
74121	NC_011901	TTC	2	6	3160563	3160568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220936178
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74124	NC_011901	CTG	2	6	3160627	3160632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936178
74125	NC_011901	CGC	2	6	3160677	3160682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936178
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74128	NC_011901	CTGG	2	8	3160848	3160855	0 %	25 %	50 %	25 %	220936178
74129	NC_011901	GACTG	2	10	3160889	3160898	20 %	20 %	40 %	20 %	220936178
74130	NC_011901	GC	3	6	3160918	3160923	0 %	0 %	50 %	50 %	220936178
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74134	NC_011901	GCC	2	6	3161005	3161010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936178
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74136	NC_011901	TGG	2	6	3161108	3161113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936178
74137	NC_011901	AAG	2	6	3161155	3161160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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74151	NC_011901	CCT	2	6	3161766	3161771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220936179
74152	NC_011901	ATG	2	6	3161774	3161779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936179
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74154	NC_011901	CGG	2	6	3161861	3161866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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74186	NC_011901	GGC	2	6	3163480	3163485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936180
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74202	NC_011901	CCG	2	6	3164047	3164052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936180
74203	NC_011901	GCA	2	6	3164056	3164061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936180
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74212	NC_011901	ATG	2	6	3164408	3164413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74213	NC_011901	A	6	6	3164512	3164517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74214	NC_011901	TC	3	6	3164565	3164570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74215	NC_011901	ACG	2	6	3164603	3164608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74216	NC_011901	AGA	2	6	3164684	3164689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74217	NC_011901	AAG	2	6	3164721	3164726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936181
74218	NC_011901	TGG	2	6	3164770	3164775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936181
74219	NC_011901	CGG	2	6	3164789	3164794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936181
74220	NC_011901	GTG	2	6	3164844	3164849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936181
74221	NC_011901	AAG	2	6	3164892	3164897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936181
74222	NC_011901	CTC	2	6	3164948	3164953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220936181
74223	NC_011901	AGG	2	6	3164995	3165000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220936181
74224	NC_011901	CCAGAT	2	12	3165014	3165025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220936181
74225	NC_011901	GCC	2	6	3165168	3165173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936181
74226	NC_011901	GGCC	2	8	3165179	3165186	0 %	0 %	50 %	50 %	220936181
74227	NC_011901	CTG	2	6	3165240	3165245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936181
74228	NC_011901	GGA	2	6	3165257	3165262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220936181
74229	NC_011901	CCA	2	6	3165304	3165309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936181
74230	NC_011901	AGC	2	6	3165376	3165381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936181
74231	NC_011901	GAG	2	6	3165387	3165392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220936181
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74233	NC_011901	AAG	2	6	3165438	3165443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936181
74234	NC_011901	GGC	2	6	3165447	3165452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936181
74235	NC_011901	GCA	2	6	3165506	3165511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936181
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74238	NC_011901	CAGC	2	8	3165545	3165552	25 %	0 %	25 %	50 %	220936181
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74303	NC_011901	GCCC	2	8	3168246	3168253	0 %	0 %	25 %	75 %	220936185
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74333	NC_011901	GAA	2	6	3169843	3169848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936186
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