MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73501	NC_011901	CAG	2	6	3136174	3136179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936152
73502	NC_011901	GCC	2	6	3136258	3136263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936152
73503	NC_011901	TCG	2	6	3136271	3136276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936152
73504	NC_011901	CGG	2	6	3136359	3136364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936152
73505	NC_011901	CACCGG	2	12	3136417	3136428	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220936152
73506	NC_011901	GCA	2	6	3136467	3136472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936152
73507	NC_011901	GC	3	6	3136510	3136515	0 %	0 %	50 %	50 %	220936152
73508	NC_011901	GAA	2	6	3136546	3136551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936152
73509	NC_011901	TGG	2	6	3136599	3136604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936152
73510	NC_011901	AGGT	2	8	3136619	3136626	25 %	25 %	50 %	0 %	220936152
73511	NC_011901	GAA	2	6	3136699	3136704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936152
73512	NC_011901	GCT	2	6	3136705	3136710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936152
73513	NC_011901	CAC	2	6	3136723	3136728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936152
73514	NC_011901	CCA	2	6	3136737	3136742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936152
73515	NC_011901	CAT	2	6	3136768	3136773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220936152
73516	NC_011901	CCG	2	6	3136796	3136801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936152
73517	NC_011901	CAT	2	6	3136822	3136827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220936152
73518	NC_011901	CAT	2	6	3136834	3136839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220936152
73519	NC_011901	GCG	2	6	3136871	3136876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936152
73520	NC_011901	GTC	2	6	3136984	3136989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936152
73521	NC_011901	GC	3	6	3136999	3137004	0 %	0 %	50 %	50 %	220936152
73522	NC_011901	GGTG	2	8	3137007	3137014	0 %	25 %	75 %	0 %	220936152
73523	NC_011901	GGC	2	6	3137083	3137088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936152
73524	NC_011901	GCC	2	6	3137114	3137119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936152
73525	NC_011901	GCTGC	2	10	3137152	3137161	0 %	20 %	40 %	40 %	220936152
73526	NC_011901	TCG	2	6	3137189	3137194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936152
73527	NC_011901	GCG	2	6	3137201	3137206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936152
73528	NC_011901	CGG	2	6	3137217	3137222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936152
73529	NC_011901	CGG	2	6	3137226	3137231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936152
73530	NC_011901	CGGTG	2	10	3137238	3137247	0 %	20 %	60 %	20 %	220936152
73531	NC_011901	GTA	2	6	3137251	3137256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936152
73532	NC_011901	CGA	2	6	3137274	3137279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936152
73533	NC_011901	GCA	2	6	3137308	3137313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936152
73534	NC_011901	G	7	7	3137359	3137365	0 %	0 %	100 %	0 %	220936152
73535	NC_011901	GCG	2	6	3137447	3137452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936152
73536	NC_011901	GCT	2	6	3137492	3137497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936153
73537	NC_011901	CGC	2	6	3137510	3137515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936153
73538	NC_011901	CGT	2	6	3137660	3137665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936153
73539	NC_011901	TGACCT	2	12	3137690	3137701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220936153
73540	NC_011901	CAGC	2	8	3137736	3137743	25 %	0 %	25 %	50 %	220936153
73541	NC_011901	GCT	2	6	3137771	3137776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936153
73542	NC_011901	CTG	2	6	3137862	3137867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936153
73543	NC_011901	GCA	2	6	3137888	3137893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936153
73544	NC_011901	GTT	2	6	3137922	3137927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220936153
73545	NC_011901	GAT	2	6	3137937	3137942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936153
73546	NC_011901	GAA	3	9	3137967	3137975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936153
73547	NC_011901	TGG	2	6	3137984	3137989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936153
73548	NC_011901	TGA	2	6	3138056	3138061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936153
73549	NC_011901	AGA	2	6	3138128	3138133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936153
73550	NC_011901	CAC	2	6	3138174	3138179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936153
73551	NC_011901	GC	3	6	3138196	3138201	0 %	0 %	50 %	50 %	220936153
73552	NC_011901	CAG	2	6	3138270	3138275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936153
73553	NC_011901	CCT	2	6	3138292	3138297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73554	NC_011901	CAC	2	6	3138477	3138482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936154
73555	NC_011901	CTG	2	6	3138549	3138554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936154
73556	NC_011901	TTG	3	9	3138559	3138567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220936154
73557	NC_011901	GCTGGG	2	12	3138653	3138664	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220936154
73558	NC_011901	CAG	2	6	3138681	3138686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936154
73559	NC_011901	ATG	2	6	3138694	3138699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936154
73560	NC_011901	TTC	2	6	3138724	3138729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220936154
73561	NC_011901	ATG	2	6	3138814	3138819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936154
73562	NC_011901	CTGGC	2	10	3138943	3138952	0 %	20 %	40 %	40 %	220936154
73563	NC_011901	CGGC	2	8	3138991	3138998	0 %	0 %	50 %	50 %	220936154
73564	NC_011901	GTC	2	6	3139017	3139022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936154
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73566	NC_011901	GAA	2	6	3139185	3139190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936154
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73568	NC_011901	GTG	2	6	3139276	3139281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936154
73569	NC_011901	TCT	2	6	3139295	3139300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220936154
73570	NC_011901	GCT	2	6	3139313	3139318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936154
73571	NC_011901	GC	3	6	3139332	3139337	0 %	0 %	50 %	50 %	220936154
73572	NC_011901	CAG	2	6	3139449	3139454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936154
73573	NC_011901	GGC	2	6	3139458	3139463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936154
73574	NC_011901	ATC	2	6	3139465	3139470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220936154
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73577	NC_011901	GCG	2	6	3139564	3139569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936154
73578	NC_011901	ACCG	2	8	3139666	3139673	25 %	0 %	25 %	50 %	220936154
73579	NC_011901	GGCC	2	8	3139765	3139772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73580	NC_011901	CAT	2	6	3139794	3139799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73581	NC_011901	CCG	2	6	3139822	3139827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936155
73582	NC_011901	GA	3	6	3139873	3139878	50 %	0 %	50 %	0 %	220936155
73583	NC_011901	GCA	2	6	3139919	3139924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936155
73584	NC_011901	GAT	2	6	3139977	3139982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220936155
73585	NC_011901	TGT	2	6	3139991	3139996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220936155
73586	NC_011901	CAC	2	6	3140033	3140038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936155
73587	NC_011901	AGC	2	6	3140057	3140062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936155
73588	NC_011901	GGCATC	2	12	3140103	3140114	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220936155
73589	NC_011901	CGT	2	6	3140156	3140161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936155
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73591	NC_011901	GGC	2	6	3140210	3140215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936155
73592	NC_011901	GCC	2	6	3140250	3140255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220936155
73593	NC_011901	GTC	2	6	3140265	3140270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936155
73594	NC_011901	CCAC	2	8	3140308	3140315	25 %	0 %	0 %	75 %	220936155
73595	NC_011901	TGG	2	6	3140317	3140322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220936155
73596	NC_011901	GGC	2	6	3140325	3140330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936155
73597	NC_011901	GGC	2	6	3140412	3140417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936155
73598	NC_011901	CGG	2	6	3140450	3140455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220936155
73599	NC_011901	GGACT	2	10	3140458	3140467	20 %	20 %	40 %	20 %	220936155
73600	NC_011901	CAG	2	6	3140481	3140486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936155
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73602	NC_011901	CCA	2	6	3140640	3140645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936155
73603	NC_011901	TTG	2	6	3140659	3140664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220936155
73604	NC_011901	TCT	2	6	3140717	3140722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220936155
73605	NC_011901	TCG	2	6	3140769	3140774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220936156
73606	NC_011901	CTT	2	6	3140822	3140827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220936156
73607	NC_011901	GAA	2	6	3140867	3140872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220936156
73608	NC_011901	CAG	3	9	3140873	3140881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220936156
73609	NC_011901	ACC	2	6	3140886	3140891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936156
73610	NC_011901	GC	3	6	3140961	3140966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73611	NC_011901	CG	3	6	3140974	3140979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73612	NC_011901	CCA	2	6	3141032	3141037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936157
73613	NC_011901	CCA	2	6	3141062	3141067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220936157
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