MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011901	AACAGC	2	12	268565	268576	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220933432
6502	NC_011901	CGG	2	6	268599	268604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933432
6503	NC_011901	CCT	2	6	268608	268613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933432
6504	NC_011901	GCA	2	6	268650	268655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933432
6505	NC_011901	GCC	2	6	268664	268669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933432
6506	NC_011901	AGCC	2	8	268670	268677	25 %	0 %	25 %	50 %	220933432
6507	NC_011901	GCA	2	6	268716	268721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933432
6508	NC_011901	CCGA	2	8	268930	268937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6509	NC_011901	GCCG	2	8	269038	269045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_011901	CGGC	2	8	269081	269088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_011901	TGC	2	6	269104	269109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_011901	GCC	2	6	269266	269271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933433
6513	NC_011901	TCCG	2	8	269339	269346	0 %	25 %	25 %	50 %	220933433
6514	NC_011901	GGA	2	6	269409	269414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933433
6515	NC_011901	GC	3	6	269419	269424	0 %	0 %	50 %	50 %	220933433
6516	NC_011901	GAC	2	6	269521	269526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933433
6517	NC_011901	GGC	2	6	269527	269532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933433
6518	NC_011901	AGA	2	6	269597	269602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933433
6519	NC_011901	TGGG	2	8	269623	269630	0 %	25 %	75 %	0 %	220933433
6520	NC_011901	G	6	6	269628	269633	0 %	0 %	100 %	0 %	220933433
6521	NC_011901	CGA	2	6	269634	269639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933433
6522	NC_011901	C	6	6	269772	269777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6523	NC_011901	TCCG	2	8	269857	269864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6524	NC_011901	CCT	2	6	269900	269905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_011901	CCCGG	2	10	270036	270045	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6526	NC_011901	CGTGG	2	10	270073	270082	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6527	NC_011901	CGG	2	6	270145	270150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_011901	TGG	2	6	270187	270192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933434
6529	NC_011901	GGA	2	6	270230	270235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933434
6530	NC_011901	GTGC	2	8	270240	270247	0 %	25 %	50 %	25 %	220933434
6531	NC_011901	CAT	2	6	270281	270286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933434
6532	NC_011901	GTG	3	9	270297	270305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933434
6533	NC_011901	CAC	2	6	270324	270329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933434
6534	NC_011901	TGG	2	6	270382	270387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933434
6535	NC_011901	AGC	2	6	270490	270495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933434
6536	NC_011901	CGC	2	6	270520	270525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933434
6537	NC_011901	GTG	2	6	270618	270623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933434
6538	NC_011901	CGG	2	6	270694	270699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933434
6539	NC_011901	GAG	2	6	270767	270772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_011901	GTG	2	6	270809	270814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933435
6541	NC_011901	GCG	2	6	270822	270827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933435
6542	NC_011901	GGC	2	6	270841	270846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933435
6543	NC_011901	GC	4	8	270859	270866	0 %	0 %	50 %	50 %	220933435
6544	NC_011901	GTG	2	6	270881	270886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933435
6545	NC_011901	TGG	2	6	270888	270893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933435
6546	NC_011901	CAC	2	6	270910	270915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933435
6547	NC_011901	ACCG	2	8	270932	270939	25 %	0 %	25 %	50 %	220933435
6548	NC_011901	CGC	2	6	271011	271016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933435
6549	NC_011901	GGA	2	6	271030	271035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933435
6550	NC_011901	GC	3	6	271066	271071	0 %	0 %	50 %	50 %	220933435
6551	NC_011901	GCC	2	6	271083	271088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933435
6552	NC_011901	GGT	2	6	271093	271098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933435
6553	NC_011901	GC	3	6	271110	271115	0 %	0 %	50 %	50 %	220933435
6554	NC_011901	CGA	2	6	271135	271140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933435
6555	NC_011901	TGG	2	6	271143	271148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933435
6556	NC_011901	GGT	2	6	271183	271188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933435
6557	NC_011901	CGCA	2	8	271248	271255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6558	NC_011901	TCC	2	6	271309	271314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_011901	CCAG	2	8	271317	271324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_011901	C	6	6	271355	271360	0 %	0 %	0 %	100 %	220933436
6561	NC_011901	CTG	2	6	271393	271398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933436
6562	NC_011901	CCG	2	6	271451	271456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933436
6563	NC_011901	CCCG	2	8	271624	271631	0 %	0 %	25 %	75 %	220933436
6564	NC_011901	GC	3	6	271634	271639	0 %	0 %	50 %	50 %	220933436
6565	NC_011901	CG	3	6	271674	271679	0 %	0 %	50 %	50 %	220933436
6566	NC_011901	CTGG	2	8	271713	271720	0 %	25 %	50 %	25 %	220933436
6567	NC_011901	TGC	2	6	271781	271786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933436
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6570	NC_011901	TGC	2	6	271982	271987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933436
6571	NC_011901	GGT	2	6	272040	272045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933436
6572	NC_011901	CGG	2	6	272064	272069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933436
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6577	NC_011901	CGCC	2	8	272200	272207	0 %	0 %	25 %	75 %	220933436
6578	NC_011901	CGGG	2	8	272231	272238	0 %	0 %	75 %	25 %	220933436
6579	NC_011901	TGC	2	6	272240	272245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933436
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6587	NC_011901	TCG	2	6	272792	272797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933437
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6589	NC_011901	GCA	2	6	272955	272960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933437
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6596	NC_011901	TGC	2	6	273158	273163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933437
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6601	NC_011901	GCTGA	2	10	273397	273406	20 %	20 %	40 %	20 %	220933437
6602	NC_011901	CCA	2	6	273447	273452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933437
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6607	NC_011901	GTGAG	2	10	273672	273681	20 %	20 %	60 %	0 %	220933437
6608	NC_011901	GAG	2	6	273824	273829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933437
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6614	NC_011901	ACCC	2	8	274123	274130	25 %	0 %	0 %	75 %	220933437
6615	NC_011901	GTT	2	6	274140	274145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933437
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6617	NC_011901	CCAG	2	8	274177	274184	25 %	0 %	25 %	50 %	220933437
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6622	NC_011901	CCT	2	6	274422	274427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933437
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6749	NC_011901	CCA	2	6	280349	280354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933441
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6751	NC_011901	CGG	2	6	280385	280390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933441
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6809	NC_011901	TGA	2	6	282769	282774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933442
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6814	NC_011901	GCATT	2	10	283158	283167	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6815	NC_011901	GAAG	2	8	283213	283220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6816	NC_011901	A	6	6	283242	283247	100 %	0 %	0 %	0 %	220933444
6817	NC_011901	TCG	2	6	283264	283269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933444
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6822	NC_011901	GGT	2	6	283409	283414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933444
6823	NC_011901	GCTCAT	2	12	283417	283428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220933444
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6840	NC_011901	C	6	6	284102	284107	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6841	NC_011901	AAG	3	9	284188	284196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933446
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6866	NC_011901	AC	3	6	285219	285224	50 %	0 %	0 %	50 %	220933446
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6994	NC_011901	CAG	2	6	290080	290085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933450
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6996	NC_011901	GTG	2	6	290152	290157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933450
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7000	NC_011901	GGAAC	2	10	290296	290305	40 %	0 %	40 %	20 %	220933450

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