MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 81351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011901	C	7	7	248396	248402	0 %	0 %	0 %	100 %	220933416
6002	NC_011901	ACT	2	6	248443	248448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933416
6003	NC_011901	GGT	2	6	248457	248462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933416
6004	NC_011901	TCA	2	6	248540	248545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933416
6005	NC_011901	ATG	2	6	248579	248584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933416
6006	NC_011901	AGG	3	9	248633	248641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933416
6007	NC_011901	CATGG	2	10	248675	248684	20 %	20 %	40 %	20 %	220933416
6008	NC_011901	TTG	2	6	248702	248707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933416
6009	NC_011901	GCT	2	6	248830	248835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933416
6010	NC_011901	ATG	2	6	248867	248872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933416
6011	NC_011901	AAT	2	6	248880	248885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220933416
6012	NC_011901	TTG	2	6	248969	248974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933416
6013	NC_011901	CGG	2	6	248988	248993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933416
6014	NC_011901	TGT	2	6	249021	249026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933416
6015	NC_011901	CG	3	6	249082	249087	0 %	0 %	50 %	50 %	220933416
6016	NC_011901	GATT	2	8	249111	249118	25 %	50 %	25 %	0 %	220933416
6017	NC_011901	AAC	2	6	249162	249167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933416
6018	NC_011901	GGC	2	6	249240	249245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933416
6019	NC_011901	ACG	2	6	249260	249265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933416
6020	NC_011901	TTG	2	6	249295	249300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933416
6021	NC_011901	GGC	2	6	249346	249351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933416
6022	NC_011901	GTC	2	6	249413	249418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933416
6023	NC_011901	CGC	2	6	249422	249427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933416
6024	NC_011901	TGG	2	6	249444	249449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933416
6025	NC_011901	G	10	10	249448	249457	0 %	0 %	100 %	0 %	220933416
6026	NC_011901	T	7	7	249492	249498	0 %	100 %	0 %	0 %	220933417
6027	NC_011901	AGA	2	6	249525	249530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933417
6028	NC_011901	AC	3	6	249539	249544	50 %	0 %	0 %	50 %	220933417
6029	NC_011901	CGC	2	6	249589	249594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933417
6030	NC_011901	CAG	2	6	249662	249667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933417
6031	NC_011901	GGCTG	2	10	249679	249688	0 %	20 %	60 %	20 %	220933417
6032	NC_011901	GGCC	2	8	249697	249704	0 %	0 %	50 %	50 %	220933417
6033	NC_011901	GCCG	2	8	249710	249717	0 %	0 %	50 %	50 %	220933417
6034	NC_011901	CAG	2	6	249779	249784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933417
6035	NC_011901	CCA	2	6	249824	249829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933417
6036	NC_011901	GAT	2	6	249866	249871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933417
6037	NC_011901	GCCCA	2	10	249903	249912	20 %	0 %	20 %	60 %	220933417
6038	NC_011901	GCCA	2	8	249951	249958	25 %	0 %	25 %	50 %	220933417
6039	NC_011901	GCC	2	6	249989	249994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933417
6040	NC_011901	CAG	2	6	250007	250012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933417
6041	NC_011901	GGC	2	6	250013	250018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933417
6042	NC_011901	GTT	2	6	250070	250075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933417
6043	NC_011901	GCC	2	6	250082	250087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_011901	GAAC	2	8	250116	250123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_011901	CA	3	6	250157	250162	50 %	0 %	0 %	50 %	220933418
6046	NC_011901	CGC	2	6	250168	250173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933418
6047	NC_011901	GGC	2	6	250177	250182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933418
6048	NC_011901	TGG	4	12	250202	250213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933418
6049	NC_011901	GCC	2	6	250231	250236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933418
6050	NC_011901	GTG	2	6	250240	250245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933418
6051	NC_011901	CAT	2	6	250251	250256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933418
6052	NC_011901	CGA	2	6	250266	250271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933418
6053	NC_011901	GC	3	6	250288	250293	0 %	0 %	50 %	50 %	220933418
6054	NC_011901	CAC	2	6	250356	250361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933418
6055	NC_011901	GC	3	6	250374	250379	0 %	0 %	50 %	50 %	220933418
6056	NC_011901	TGG	2	6	250382	250387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933418
6057	NC_011901	CAC	2	6	250395	250400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933418
6058	NC_011901	CGACAT	2	12	250503	250514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220933418
6059	NC_011901	GGT	2	6	250543	250548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933418
6060	NC_011901	GTG	3	9	250666	250674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933419
6061	NC_011901	CAT	2	6	250686	250691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933419
6062	NC_011901	GCG	3	9	250718	250726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933419
6063	NC_011901	GTG	2	6	250738	250743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933419
6064	NC_011901	AGG	2	6	250748	250753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933419
6065	NC_011901	CCG	2	6	250755	250760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933419
6066	NC_011901	GCT	2	6	250770	250775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933419
6067	NC_011901	CGA	2	6	250788	250793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933419
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6069	NC_011901	CGG	2	6	250921	250926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933419
6070	NC_011901	ATC	2	6	251062	251067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933419
6071	NC_011901	GTGG	2	8	251091	251098	0 %	25 %	75 %	0 %	220933419
6072	NC_011901	CGG	2	6	251112	251117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933419
6073	NC_011901	CTG	2	6	251199	251204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933420
6074	NC_011901	TGG	2	6	251212	251217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933420
6075	NC_011901	GGT	2	6	251219	251224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933420
6076	NC_011901	GC	3	6	251245	251250	0 %	0 %	50 %	50 %	220933420
6077	NC_011901	TCA	2	6	251251	251256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933420
6078	NC_011901	GCC	2	6	251274	251279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933420
6079	NC_011901	GCC	2	6	251283	251288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933420
6080	NC_011901	TGGG	2	8	251316	251323	0 %	25 %	75 %	0 %	220933420
6081	NC_011901	CGAG	2	8	251389	251396	25 %	0 %	50 %	25 %	220933420
6082	NC_011901	CGTGGA	2	12	251444	251455	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220933420
6083	NC_011901	GGC	2	6	251469	251474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933420
6084	NC_011901	GTGGAG	2	12	251484	251495	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	220933420
6085	NC_011901	GAC	2	6	251508	251513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933420
6086	NC_011901	GGT	2	6	251537	251542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933420
6087	NC_011901	TGGC	2	8	251564	251571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6088	NC_011901	C	6	6	251584	251589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6089	NC_011901	GCC	2	6	251600	251605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_011901	CGCT	2	8	251610	251617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_011901	GCTC	2	8	251630	251637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_011901	CGGC	2	8	251638	251645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_011901	CG	3	6	251685	251690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_011901	GCG	2	6	251701	251706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_011901	GCT	2	6	251806	251811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_011901	CTG	2	6	251816	251821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_011901	GGT	2	6	251842	251847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933421
6098	NC_011901	ATG	2	6	251852	251857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933421
6099	NC_011901	G	6	6	251864	251869	0 %	0 %	100 %	0 %	220933421
6100	NC_011901	GAAC	2	8	251923	251930	50 %	0 %	25 %	25 %	220933421
6101	NC_011901	CTG	2	6	251948	251953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933421
6102	NC_011901	GGT	2	6	251971	251976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933421
6103	NC_011901	CCGG	2	8	251980	251987	0 %	0 %	50 %	50 %	220933421
6104	NC_011901	GC	3	6	252064	252069	0 %	0 %	50 %	50 %	220933421
6105	NC_011901	CCG	2	6	252162	252167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933421
6106	NC_011901	GCGT	2	8	252231	252238	0 %	25 %	50 %	25 %	220933421
6107	NC_011901	CAG	2	6	252377	252382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933421
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6109	NC_011901	GTG	3	9	252460	252468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933422
6110	NC_011901	GGC	2	6	252480	252485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933422
6111	NC_011901	TGG	2	6	252494	252499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933422
6112	NC_011901	CG	3	6	252523	252528	0 %	0 %	50 %	50 %	220933422
6113	NC_011901	GCC	2	6	252571	252576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933422
6114	NC_011901	CTG	2	6	252595	252600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933422
6115	NC_011901	C	9	9	252641	252649	0 %	0 %	0 %	100 %	220933422
6116	NC_011901	CAA	2	6	252717	252722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933422
6117	NC_011901	GGC	2	6	252726	252731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933422
6118	NC_011901	GCG	2	6	252742	252747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933422
6119	NC_011901	CTG	2	6	252766	252771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933422
6120	NC_011901	GC	3	6	252780	252785	0 %	0 %	50 %	50 %	220933422
6121	NC_011901	TAC	2	6	252868	252873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933422
6122	NC_011901	CGC	2	6	252884	252889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933422
6123	NC_011901	GAT	2	6	252912	252917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933422
6124	NC_011901	CAC	2	6	253008	253013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933422
6125	NC_011901	TGC	2	6	253040	253045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933422
6126	NC_011901	GGT	2	6	253071	253076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933422
6127	NC_011901	TTC	2	6	253087	253092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933422
6128	NC_011901	CTG	2	6	253132	253137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933422
6129	NC_011901	CTG	2	6	253144	253149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933422
6130	NC_011901	GTG	2	6	253168	253173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933422
6131	NC_011901	TG	3	6	253190	253195	0 %	50 %	50 %	0 %	220933422
6132	NC_011901	ATG	2	6	253437	253442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_011901	GA	3	6	253472	253477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_011901	ATC	2	6	253526	253531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_011901	CTG	3	9	253579	253587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933423
6136	NC_011901	AGGGG	2	10	253599	253608	20 %	0 %	80 %	0 %	220933423
6137	NC_011901	TGC	2	6	253622	253627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933423
6138	NC_011901	CGC	2	6	253671	253676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933423
6139	NC_011901	GTG	2	6	253705	253710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933423
6140	NC_011901	GC	3	6	253759	253764	0 %	0 %	50 %	50 %	220933423
6141	NC_011901	GAC	2	6	253864	253869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933423
6142	NC_011901	GTG	2	6	253885	253890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933423
6143	NC_011901	CCCA	2	8	253978	253985	25 %	0 %	0 %	75 %	220933423
6144	NC_011901	GCTG	2	8	253994	254001	0 %	25 %	50 %	25 %	220933423
6145	NC_011901	CGC	2	6	254073	254078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933423
6146	NC_011901	CTG	2	6	254080	254085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933423
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6149	NC_011901	GTG	2	6	254140	254145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933423
6150	NC_011901	GGCCC	2	10	254152	254161	0 %	0 %	40 %	60 %	220933423
6151	NC_011901	GAG	2	6	254236	254241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933423
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6154	NC_011901	GCC	2	6	254341	254346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933423
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6161	NC_011901	GGGC	2	8	254549	254556	0 %	0 %	75 %	25 %	220933423
6162	NC_011901	TGA	2	6	254754	254759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933423
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6180	NC_011901	AGCGC	2	10	255330	255339	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6181	NC_011901	CAG	2	6	255359	255364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6182	NC_011901	CT	3	6	255431	255436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6183	NC_011901	AAC	2	6	255521	255526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6184	NC_011901	AC	3	6	255551	255556	50 %	0 %	0 %	50 %	220933425
6185	NC_011901	GCTG	2	8	255568	255575	0 %	25 %	50 %	25 %	220933425
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6203	NC_011901	GCTGG	2	10	256034	256043	0 %	20 %	60 %	20 %	220933425
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6205	NC_011901	GC	3	6	256091	256096	0 %	0 %	50 %	50 %	220933425
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6209	NC_011901	ACA	2	6	256406	256411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6211	NC_011901	ACC	2	6	256543	256548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6230	NC_011901	CTG	2	6	257039	257044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933426
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6233	NC_011901	CGT	2	6	257150	257155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933426
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6242	NC_011901	GAC	2	6	257762	257767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933426
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6489	NC_011901	GCCT	2	8	268091	268098	0 %	25 %	25 %	50 %	220933432
6490	NC_011901	GAGC	2	8	268142	268149	25 %	0 %	50 %	25 %	220933432
6491	NC_011901	TGGG	2	8	268190	268197	0 %	25 %	75 %	0 %	220933432
6492	NC_011901	G	6	6	268204	268209	0 %	0 %	100 %	0 %	220933432
6493	NC_011901	CAGG	2	8	268286	268293	25 %	0 %	50 %	25 %	220933432
6494	NC_011901	CAGGGC	2	12	268354	268365	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220933432
6495	NC_011901	GC	4	8	268399	268406	0 %	0 %	50 %	50 %	220933432
6496	NC_011901	TG	3	6	268430	268435	0 %	50 %	50 %	0 %	220933432
6497	NC_011901	ACA	2	6	268437	268442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933432
6498	NC_011901	CCAG	2	8	268494	268501	25 %	0 %	25 %	50 %	220933432
6499	NC_011901	GCCG	2	8	268530	268537	0 %	0 %	50 %	50 %	220933432
6500	NC_011901	CAG	2	6	268543	268548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933432

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