MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thauera sp. MZ1T plasmid pTha01

Total Repeats: 1740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011667	AGGC	2	8	15	22	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011667	AAG	2	6	30	35	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217980116
3	NC_011667	TCG	2	6	144	149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980116
4	NC_011667	GC	4	8	206	213	0 %	0 %	50 %	50 %	217980116
5	NC_011667	CGC	2	6	265	270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980116
6	NC_011667	GCGTGC	2	12	274	285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	217980116
7	NC_011667	TCG	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980117
8	NC_011667	TGC	3	9	375	383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980117
9	NC_011667	GGC	2	6	408	413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980117
10	NC_011667	TCC	2	6	424	429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217980117
11	NC_011667	CG	3	6	467	472	0 %	0 %	50 %	50 %	217980117
12	NC_011667	GTG	2	6	541	546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980117
13	NC_011667	GC	3	6	553	558	0 %	0 %	50 %	50 %	217980117
14	NC_011667	GCC	2	6	564	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980117
15	NC_011667	TGC	2	6	570	575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980117
16	NC_011667	TGA	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980117
17	NC_011667	GTC	2	6	681	686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980118
18	NC_011667	C	6	6	706	711	0 %	0 %	0 %	100 %	217980118
19	NC_011667	GCG	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980118
20	NC_011667	GCG	2	6	803	808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980118
21	NC_011667	TCC	2	6	880	885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217980118
22	NC_011667	GCT	2	6	953	958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980118
23	NC_011667	CTT	2	6	996	1001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980118
24	NC_011667	TCA	2	6	1065	1070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011667	ACC	2	6	1198	1203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980119
26	NC_011667	CGC	2	6	1223	1228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980119
27	NC_011667	CT	3	6	1239	1244	0 %	50 %	0 %	50 %	217980119
28	NC_011667	ACA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217980119
29	NC_011667	GCAC	2	8	1383	1390	25 %	0 %	25 %	50 %	217980119
30	NC_011667	GTCG	2	8	1489	1496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011667	TGCT	2	8	1512	1519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011667	C	6	6	1578	1583	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_011667	CCAC	2	8	1607	1614	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_011667	ACA	2	6	1641	1646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011667	GCA	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011667	TGC	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011667	TGT	2	6	1661	1666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011667	TGC	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011667	GCA	2	6	1695	1700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011667	CAG	2	6	1734	1739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011667	CGGGG	2	10	1764	1773	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011667	GGC	2	6	1820	1825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011667	TGG	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011667	G	6	6	1877	1882	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011667	GCCCC	2	10	1950	1959	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
46	NC_011667	GAG	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011667	G	6	6	2032	2037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011667	GCCC	2	8	2076	2083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_011667	AGGG	2	8	2086	2093	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011667	GGC	2	6	2094	2099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011667	GCG	2	6	2105	2110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011667	AGG	2	6	2155	2160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011667	GGC	2	6	2169	2174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011667	AAG	2	6	2198	2203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011667	GGC	2	6	2213	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011667	AGG	2	6	2289	2294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011667	GGC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011667	GAA	2	6	2452	2457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011667	GAAT	2	8	2482	2489	50 %	25 %	25 %	0 %	217980120
60	NC_011667	TGGC	2	8	2546	2553	0 %	25 %	50 %	25 %	217980120
61	NC_011667	GCT	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980120
62	NC_011667	CA	4	8	2592	2599	50 %	0 %	0 %	50 %	217980120
63	NC_011667	GA	3	6	2614	2619	50 %	0 %	50 %	0 %	217980120
64	NC_011667	GGC	2	6	2636	2641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980120
65	NC_011667	CCCG	2	8	2659	2666	0 %	0 %	25 %	75 %	217980120
66	NC_011667	GTG	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980120
67	NC_011667	TTGCT	2	10	2836	2845	0 %	60 %	20 %	20 %	217980120
68	NC_011667	CCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980120
69	NC_011667	TCT	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980120
70	NC_011667	GAT	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980120
71	NC_011667	CGGA	2	8	3088	3095	25 %	0 %	50 %	25 %	217980120
72	NC_011667	CGA	2	6	3101	3106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980120
73	NC_011667	ATC	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980120
74	NC_011667	GT	3	6	3180	3185	0 %	50 %	50 %	0 %	217980120
75	NC_011667	GTC	2	6	3237	3242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980120
76	NC_011667	CG	3	6	3250	3255	0 %	0 %	50 %	50 %	217980120
77	NC_011667	AGC	2	6	3265	3270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980120
78	NC_011667	GGC	2	6	3321	3326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980120
79	NC_011667	A	7	7	3367	3373	100 %	0 %	0 %	0 %	217980120
80	NC_011667	AC	4	8	3403	3410	50 %	0 %	0 %	50 %	217980120
81	NC_011667	CTG	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980120
82	NC_011667	GGA	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217980120
83	NC_011667	GGC	2	6	3488	3493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980120
84	NC_011667	G	6	6	3505	3510	0 %	0 %	100 %	0 %	217980120
85	NC_011667	C	7	7	3555	3561	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_011667	CCGC	2	8	3592	3599	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_011667	GGC	2	6	3687	3692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011667	AAC	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011667	TGGG	2	8	3909	3916	0 %	25 %	75 %	0 %	217980121
90	NC_011667	CAG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980121
91	NC_011667	CAT	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980121
92	NC_011667	ACCG	2	8	4155	4162	25 %	0 %	25 %	50 %	217980121
93	NC_011667	GC	3	6	4169	4174	0 %	0 %	50 %	50 %	217980121
94	NC_011667	ACC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980121
95	NC_011667	CG	3	6	4462	4467	0 %	0 %	50 %	50 %	217980122
96	NC_011667	GCA	2	6	4491	4496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980122
97	NC_011667	GCTC	2	8	4524	4531	0 %	25 %	25 %	50 %	217980122
98	NC_011667	ACC	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980122
99	NC_011667	CATGC	2	10	4591	4600	20 %	20 %	20 %	40 %	217980122
100	NC_011667	GAG	2	6	4631	4636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217980122
101	NC_011667	TCA	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980123
102	NC_011667	GC	3	6	4725	4730	0 %	0 %	50 %	50 %	217980123
103	NC_011667	TCA	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980123
104	NC_011667	CTG	3	9	4793	4801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980123
105	NC_011667	CGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980123
106	NC_011667	GCG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980123
107	NC_011667	GCG	2	6	4946	4951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980123
108	NC_011667	CG	3	6	4950	4955	0 %	0 %	50 %	50 %	217980123
109	NC_011667	GGC	2	6	5005	5010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980123
110	NC_011667	GC	3	6	5056	5061	0 %	0 %	50 %	50 %	217980123
111	NC_011667	CGG	2	6	5095	5100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980123
112	NC_011667	AGC	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980123
113	NC_011667	CGA	2	6	5179	5184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980123
114	NC_011667	CGT	2	6	5191	5196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980123
115	NC_011667	CCG	2	6	5299	5304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
116	NC_011667	CG	3	6	5374	5379	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
117	NC_011667	CG	3	6	5389	5394	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
118	NC_011667	GCG	3	9	5392	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980124
119	NC_011667	CTTC	2	8	5402	5409	0 %	50 %	0 %	50 %	217980124
120	NC_011667	CTT	2	6	5477	5482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980124
121	NC_011667	CCTTCG	2	12	5519	5530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	217980124
122	NC_011667	GCC	2	6	5566	5571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
123	NC_011667	CGC	2	6	5585	5590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
124	NC_011667	GC	3	6	5589	5594	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
125	NC_011667	GGT	2	6	5733	5738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980124
126	NC_011667	GC	3	6	5755	5760	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
127	NC_011667	TCG	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980124
128	NC_011667	CGC	2	6	5808	5813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
129	NC_011667	CG	3	6	5819	5824	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
130	NC_011667	CGG	2	6	5870	5875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980124
131	NC_011667	TTGGCC	2	12	6019	6030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980124
132	NC_011667	ACC	2	6	6031	6036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980124
133	NC_011667	GCC	2	6	6061	6066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
134	NC_011667	GCC	3	9	6080	6088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
135	NC_011667	CGC	2	6	6099	6104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
136	NC_011667	CGC	2	6	6108	6113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
137	NC_011667	GGC	2	6	6134	6139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980124
138	NC_011667	GCCG	2	8	6167	6174	0 %	0 %	50 %	50 %	217980124
139	NC_011667	TTC	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980124
140	NC_011667	CGC	2	6	6195	6200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980124
141	NC_011667	ATA	2	6	6269	6274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011667	ATA	3	9	6278	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011667	ATT	2	6	6289	6294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011667	ATT	2	6	6310	6315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011667	GCT	2	6	6321	6326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011667	CGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_011667	CGC	2	6	6492	6497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980125
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168	NC_011667	GTC	2	6	7216	7221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_011667	GCT	2	6	7300	7305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980126
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240	NC_011667	GTA	2	6	10412	10417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_011667	CATTT	2	10	11177	11186	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
253	NC_011667	AGCG	2	8	11294	11301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
254	NC_011667	AGT	2	6	11390	11395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_011667	CCT	2	6	11438	11443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_011667	GGA	2	6	11513	11518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_011667	GAA	2	6	11549	11554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217980128
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259	NC_011667	TA	3	6	11674	11679	50 %	50 %	0 %	0 %	217980128
260	NC_011667	GA	3	6	11757	11762	50 %	0 %	50 %	0 %	217980128
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262	NC_011667	TCGT	2	8	11796	11803	0 %	50 %	25 %	25 %	217980128
263	NC_011667	CAA	2	6	11871	11876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217980128
264	NC_011667	CTCCA	2	10	11893	11902	20 %	20 %	0 %	60 %	217980128
265	NC_011667	CTT	2	6	11948	11953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980128
266	NC_011667	AAT	2	6	11960	11965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217980128
267	NC_011667	GGT	2	6	12062	12067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980128
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269	NC_011667	GGTA	2	8	12145	12152	25 %	25 %	50 %	0 %	217980128
270	NC_011667	GATG	2	8	12184	12191	25 %	25 %	50 %	0 %	217980128
271	NC_011667	CAG	2	6	12323	12328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_011667	TGC	2	6	12347	12352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_011667	GTC	2	6	12595	12600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_011667	ACG	2	6	12773	12778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_011667	TGC	2	6	12788	12793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_011667	GCT	2	6	12849	12854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_011667	GCTT	2	8	12898	12905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
278	NC_011667	TCG	2	6	12945	12950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_011667	GGT	2	6	13037	13042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011667	TGC	2	6	13132	13137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_011667	GAG	2	6	13345	13350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_011667	CCG	2	6	19360	19365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980134
405	NC_011667	GC	3	6	19404	19409	0 %	0 %	50 %	50 %	217980134
406	NC_011667	CGCTG	2	10	19456	19465	0 %	20 %	40 %	40 %	217980134
407	NC_011667	CTT	2	6	19475	19480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980134
408	NC_011667	TGC	2	6	19557	19562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980134
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413	NC_011667	CCGT	2	8	19731	19738	0 %	25 %	25 %	50 %	217980134
414	NC_011667	GC	3	6	19739	19744	0 %	0 %	50 %	50 %	217980134
415	NC_011667	GCA	2	6	19834	19839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980134
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417	NC_011667	TAA	2	6	19941	19946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_011667	GGC	2	6	19954	19959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_011667	GGC	2	6	19961	19966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_011667	AAG	2	6	20074	20079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_011667	CCT	2	6	20173	20178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_011667	AAT	2	6	20189	20194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_011667	GC	3	6	20267	20272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
425	NC_011667	C	8	8	20337	20344	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
426	NC_011667	C	8	8	20360	20367	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
427	NC_011667	GC	3	6	20380	20385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
428	NC_011667	C	8	8	20393	20400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
429	NC_011667	C	9	9	20416	20424	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
430	NC_011667	T	6	6	20450	20455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_011667	CGCA	2	8	20482	20489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
432	NC_011667	C	7	7	20558	20564	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
433	NC_011667	C	7	7	20580	20586	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
434	NC_011667	G	6	6	20588	20593	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
435	NC_011667	C	7	7	20605	20611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
436	NC_011667	ACC	2	6	20647	20652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
437	NC_011667	CCG	2	6	20659	20664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_011667	AAGCA	2	10	20684	20693	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
439	NC_011667	AGC	2	6	20705	20710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_011667	GCA	2	6	20717	20722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_011667	GCG	2	6	20748	20753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_011667	CG	3	6	20752	20757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
443	NC_011667	TCC	2	6	20783	20788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_011667	ACC	2	6	20802	20807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980135
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499	NC_011667	TCC	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
500	NC_011667	CCA	2	6	23320	23325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980138

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