MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 53059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011653	ATGT	2	8	611793	611800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_011653	TCT	2	6	611808	611813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_011653	AAAT	2	8	611867	611874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_011653	CTT	2	6	611966	611971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_011653	T	6	6	611992	611997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_011653	GAA	2	6	612008	612013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_011653	TAC	2	6	612025	612030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_011653	TCA	2	6	612104	612109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_011653	T	7	7	612122	612128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_011653	TGT	2	6	612135	612140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_011653	AAT	2	6	612152	612157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_011653	TGC	2	6	612185	612190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_011653	TTA	2	6	612191	612196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_011653	T	6	6	612235	612240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_011653	TGA	2	6	612253	612258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_011653	T	7	7	612274	612280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_011653	T	7	7	612326	612332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_011653	T	6	6	612369	612374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_011653	AT	3	6	612400	612405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_011653	CCA	2	6	612421	612426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16021	NC_011653	CCT	2	6	612467	612472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16022	NC_011653	TAT	2	6	612483	612488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_011653	AATT	2	8	612554	612561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_011653	TAATT	2	10	612571	612580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_011653	ATG	2	6	612588	612593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_011653	A	7	7	612596	612602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_011653	AAAT	2	8	612623	612630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_011653	TTA	2	6	612658	612663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_011653	AAT	2	6	612721	612726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_011653	TAT	2	6	612764	612769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_011653	TA	3	6	612793	612798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_011653	TAT	2	6	612805	612810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_011653	A	6	6	612871	612876	100 %	0 %	0 %	0 %	217076714
16034	NC_011653	A	6	6	612904	612909	100 %	0 %	0 %	0 %	217076714
16035	NC_011653	GAT	2	6	612915	612920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076714
16036	NC_011653	TAA	2	6	612933	612938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076714
16037	NC_011653	A	7	7	612937	612943	100 %	0 %	0 %	0 %	217076714
16038	NC_011653	ATT	2	6	612987	612992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076714
16039	NC_011653	AT	3	6	612994	612999	50 %	50 %	0 %	0 %	217076714
16040	NC_011653	A	9	9	613044	613052	100 %	0 %	0 %	0 %	217076714
16041	NC_011653	AAG	2	6	613130	613135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076714
16042	NC_011653	TTG	2	6	613151	613156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076714
16043	NC_011653	ATT	2	6	613166	613171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076714
16044	NC_011653	AAC	2	6	613174	613179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076714
16045	NC_011653	A	7	7	613222	613228	100 %	0 %	0 %	0 %	217076714
16046	NC_011653	TAG	3	9	613242	613250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076714
16047	NC_011653	ATT	2	6	613252	613257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076714
16048	NC_011653	AAGGA	2	10	613260	613269	60 %	0 %	40 %	0 %	217076714
16049	NC_011653	AAG	2	6	613284	613289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076714
16050	NC_011653	TTA	2	6	613312	613317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076714
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16052	NC_011653	A	7	7	613350	613356	100 %	0 %	0 %	0 %	217076714
16053	NC_011653	TAA	2	6	613359	613364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076714
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16057	NC_011653	TAT	2	6	613590	613595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076714
16058	NC_011653	ATTTA	2	10	613601	613610	40 %	60 %	0 %	0 %	217076714
16059	NC_011653	A	6	6	613729	613734	100 %	0 %	0 %	0 %	217076714
16060	NC_011653	TTTC	2	8	613771	613778	0 %	75 %	0 %	25 %	217076714
16061	NC_011653	CAT	2	6	613784	613789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076714
16062	NC_011653	GAAA	2	8	613851	613858	75 %	0 %	25 %	0 %	217076714
16063	NC_011653	TGG	2	6	613929	613934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217076714
16064	NC_011653	TAAAAA	2	12	613935	613946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	217076714
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16067	NC_011653	TTTAA	2	10	614048	614057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_011653	TCT	2	6	614133	614138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_011653	TA	3	6	614188	614193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_011653	TAA	2	6	614210	614215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_011653	TAA	2	6	614271	614276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_011653	ATTTT	2	10	614281	614290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_011653	ATTTT	2	10	614306	614315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_011653	ATTT	2	8	614323	614330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_011653	A	6	6	614339	614344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_011653	AT	3	6	614398	614403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16079	NC_011653	ATT	2	6	614492	614497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076715
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16082	NC_011653	CAAAA	2	10	614616	614625	80 %	0 %	0 %	20 %	217076715
16083	NC_011653	TGA	2	6	614668	614673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076715
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16085	NC_011653	A	6	6	614771	614776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_011653	GA	3	6	614829	614834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_011653	TAA	2	6	614847	614852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_011653	AG	3	6	614921	614926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_011653	ATC	2	6	615049	615054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076716
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16091	NC_011653	TAAAA	2	10	615094	615103	80 %	20 %	0 %	0 %	217076716
16092	NC_011653	CAG	2	6	615192	615197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076716
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16094	NC_011653	CTT	2	6	615210	615215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076716
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16096	NC_011653	AATTA	2	10	615271	615280	60 %	40 %	0 %	0 %	217076716
16097	NC_011653	CTTT	2	8	615392	615399	0 %	75 %	0 %	25 %	217076716
16098	NC_011653	AT	3	6	615410	615415	50 %	50 %	0 %	0 %	217076716
16099	NC_011653	T	6	6	615461	615466	0 %	100 %	0 %	0 %	217076716
16100	NC_011653	T	6	6	615479	615484	0 %	100 %	0 %	0 %	217076716
16101	NC_011653	ATG	2	6	615576	615581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076716
16102	NC_011653	CTT	2	6	615681	615686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076716
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16104	NC_011653	AT	3	6	615732	615737	50 %	50 %	0 %	0 %	217076716
16105	NC_011653	TCCAT	2	10	615745	615754	20 %	40 %	0 %	40 %	217076716
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16109	NC_011653	TTC	2	6	615882	615887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076716
16110	NC_011653	TTCC	2	8	615915	615922	0 %	50 %	0 %	50 %	217076716
16111	NC_011653	ATC	2	6	615967	615972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076716
16112	NC_011653	GAA	2	6	615993	615998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076716
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16114	NC_011653	ATG	2	6	616049	616054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076716
16115	NC_011653	A	7	7	616136	616142	100 %	0 %	0 %	0 %	217076716
16116	NC_011653	T	6	6	616220	616225	0 %	100 %	0 %	0 %	217076716
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16120	NC_011653	T	6	6	616288	616293	0 %	100 %	0 %	0 %	217076716
16121	NC_011653	TTTCT	2	10	616321	616330	0 %	80 %	0 %	20 %	217076716
16122	NC_011653	ATA	2	6	616349	616354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076716
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16125	NC_011653	TAT	2	6	616419	616424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_011653	TAA	2	6	616438	616443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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