MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011529	AGGC	2	8	169445	169452	25 %	0 %	50 %	25 %	212223337
3502	NC_011529	ACC	2	6	169499	169504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223337
3503	NC_011529	GTTG	2	8	169580	169587	0 %	50 %	50 %	0 %	212223337
3504	NC_011529	GTC	3	9	169658	169666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223337
3505	NC_011529	CTC	2	6	169676	169681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223337
3506	NC_011529	CTC	2	6	169688	169693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223337
3507	NC_011529	CCT	2	6	169775	169780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223337
3508	NC_011529	CCA	2	6	169790	169795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223337
3509	NC_011529	GATGG	2	10	169826	169835	20 %	20 %	60 %	0 %	212223337
3510	NC_011529	GTGG	2	8	169859	169866	0 %	25 %	75 %	0 %	212223337
3511	NC_011529	ACC	2	6	169890	169895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_011529	AGA	2	6	169983	169988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_011529	AGC	2	6	170054	170059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223338
3514	NC_011529	TCCTC	2	10	170064	170073	0 %	40 %	0 %	60 %	212223338
3515	NC_011529	CTC	2	6	170092	170097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223338
3516	NC_011529	TCT	2	6	170127	170132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223338
3517	NC_011529	TCC	2	6	170192	170197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223338
3518	NC_011529	CTG	2	6	170198	170203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223338
3519	NC_011529	TTG	2	6	170210	170215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223338
3520	NC_011529	TCCA	2	8	170309	170316	25 %	25 %	0 %	50 %	212223338
3521	NC_011529	GGA	2	6	170373	170378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223338
3522	NC_011529	AGT	2	6	170379	170384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223338
3523	NC_011529	CTT	2	6	170416	170421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223338
3524	NC_011529	TCCT	2	8	170506	170513	0 %	50 %	0 %	50 %	212223338
3525	NC_011529	GCG	2	6	170525	170530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223338
3526	NC_011529	AGC	2	6	170548	170553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223338
3527	NC_011529	GGC	2	6	170600	170605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223338
3528	NC_011529	CCA	2	6	170639	170644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223338
3529	NC_011529	CGC	2	6	170652	170657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223338
3530	NC_011529	AGCG	2	8	170715	170722	25 %	0 %	50 %	25 %	212223338
3531	NC_011529	CGG	2	6	170734	170739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223338
3532	NC_011529	TCTT	2	8	170759	170766	0 %	75 %	0 %	25 %	212223338
3533	NC_011529	CCA	2	6	170773	170778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223338
3534	NC_011529	ATC	2	6	171007	171012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223338
3535	NC_011529	CGA	2	6	171015	171020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223338
3536	NC_011529	AGCC	2	8	171140	171147	25 %	0 %	25 %	50 %	212223338
3537	NC_011529	CT	3	6	171148	171153	0 %	50 %	0 %	50 %	212223338
3538	NC_011529	GC	3	6	171158	171163	0 %	0 %	50 %	50 %	212223338
3539	NC_011529	CTT	2	6	171187	171192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223338
3540	NC_011529	CCG	2	6	171209	171214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223338
3541	NC_011529	TCA	2	6	171242	171247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223338
3542	NC_011529	TCG	2	6	171299	171304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223338
3543	NC_011529	GAA	2	6	171331	171336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223338
3544	NC_011529	CTT	2	6	171344	171349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223338
3545	NC_011529	TTC	2	6	171455	171460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223338
3546	NC_011529	GAA	2	6	171472	171477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223338
3547	NC_011529	TCA	2	6	171513	171518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223338
3548	NC_011529	TCT	2	6	171573	171578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223338
3549	NC_011529	CCA	2	6	171581	171586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223338
3550	NC_011529	GAG	2	6	171592	171597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223338
3551	NC_011529	GTA	2	6	171628	171633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223338
3552	NC_011529	GTA	2	6	171685	171690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223338
3553	NC_011529	CTTG	2	8	171748	171755	0 %	50 %	25 %	25 %	212223338
3554	NC_011529	TCCAC	2	10	171771	171780	20 %	20 %	0 %	60 %	212223338
3555	NC_011529	TCT	2	6	171819	171824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223338
3556	NC_011529	GAG	2	6	171841	171846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223338
3557	NC_011529	TCA	2	6	171933	171938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_011529	ACT	2	6	172047	172052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223339
3559	NC_011529	TTC	2	6	172090	172095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223339
3560	NC_011529	GCT	2	6	172101	172106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223339
3561	NC_011529	TCA	2	6	172130	172135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223339
3562	NC_011529	GAG	2	6	172147	172152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223339
3563	NC_011529	AAG	2	6	172177	172182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223339
3564	NC_011529	CAT	2	6	172185	172190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223339
3565	NC_011529	GAG	2	6	172217	172222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223339
3566	NC_011529	GGT	2	6	172283	172288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_011529	TCG	2	6	172312	172317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_011529	TAC	2	6	172365	172370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_011529	CGA	2	6	172389	172394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_011529	ATA	2	6	172439	172444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_011529	GAT	2	6	172503	172508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_011529	ATA	2	6	172597	172602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223340
3573	NC_011529	TAT	2	6	172740	172745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223340
3574	NC_011529	CTGA	2	8	172751	172758	25 %	25 %	25 %	25 %	212223340
3575	NC_011529	GGT	2	6	172759	172764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_011529	GAG	2	6	172802	172807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223341
3577	NC_011529	CTT	2	6	172814	172819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223341
3578	NC_011529	TCG	2	6	172857	172862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223341
3579	NC_011529	TGG	2	6	172905	172910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223341
3580	NC_011529	CA	3	6	172983	172988	50 %	0 %	0 %	50 %	212223341
3581	NC_011529	CTA	3	9	173014	173022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223341
3582	NC_011529	CGG	2	6	173023	173028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223341
3583	NC_011529	TAT	2	6	173132	173137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223341
3584	NC_011529	CGA	2	6	173149	173154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223341
3585	NC_011529	CTT	2	6	173239	173244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223341
3586	NC_011529	ATG	2	6	173294	173299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223341
3587	NC_011529	CCG	2	6	173312	173317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223341
3588	NC_011529	AGG	2	6	173325	173330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223341
3589	NC_011529	CTTC	2	8	173332	173339	0 %	50 %	0 %	50 %	212223341
3590	NC_011529	GTC	2	6	173393	173398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223341
3591	NC_011529	AGC	2	6	173432	173437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223341
3592	NC_011529	CTC	2	6	173447	173452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223341
3593	NC_011529	GAA	3	9	173461	173469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223341
3594	NC_011529	T	6	6	173479	173484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_011529	CT	4	8	173486	173493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_011529	A	6	6	173506	173511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011529	TCATTG	2	12	173589	173600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212223342
3598	NC_011529	ACG	2	6	173670	173675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223342
3599	NC_011529	CCGA	2	8	173693	173700	25 %	0 %	25 %	50 %	212223342
3600	NC_011529	TCA	2	6	173718	173723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223342
3601	NC_011529	AAGG	2	8	173747	173754	50 %	0 %	50 %	0 %	212223342
3602	NC_011529	CTC	2	6	173795	173800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223342
3603	NC_011529	CCCT	2	8	173843	173850	0 %	25 %	0 %	75 %	212223342
3604	NC_011529	CTC	2	6	173890	173895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223342
3605	NC_011529	TCTCGA	2	12	173920	173931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212223342
3606	NC_011529	AGA	2	6	174066	174071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223342
3607	NC_011529	CTC	2	6	174188	174193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223342
3608	NC_011529	TCA	2	6	174223	174228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_011529	CTC	2	6	174265	174270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_011529	CGG	2	6	174287	174292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_011529	TGGA	2	8	174475	174482	25 %	25 %	50 %	0 %	212223343
3612	NC_011529	CCA	2	6	174576	174581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223343
3613	NC_011529	GCC	2	6	174664	174669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223343
3614	NC_011529	GCA	2	6	174790	174795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223343
3615	NC_011529	CTT	2	6	174798	174803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223343
3616	NC_011529	AGCG	2	8	174815	174822	25 %	0 %	50 %	25 %	212223343
3617	NC_011529	CGA	2	6	174852	174857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223343
3618	NC_011529	GGC	2	6	174907	174912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223343
3619	NC_011529	CTT	2	6	174962	174967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223343
3620	NC_011529	GAG	2	6	175012	175017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223343
3621	NC_011529	CGT	2	6	175044	175049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223343
3622	NC_011529	CCA	2	6	175111	175116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223343
3623	NC_011529	G	7	7	175206	175212	0 %	0 %	100 %	0 %	212223343
3624	NC_011529	CGA	2	6	175230	175235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223343
3625	NC_011529	CGA	2	6	175239	175244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223343
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3644	NC_011529	AATG	2	8	176368	176375	50 %	25 %	25 %	0 %	212223344
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3731	NC_011529	CG	3	6	180791	180796	0 %	0 %	50 %	50 %	212223348
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3742	NC_011529	TGGGC	2	10	181103	181112	0 %	20 %	60 %	20 %	212223348
3743	NC_011529	T	6	6	181147	181152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3744	NC_011529	AT	3	6	181187	181192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3745	NC_011529	C	7	7	181221	181227	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3746	NC_011529	TCC	2	6	181249	181254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3747	NC_011529	AAAG	2	8	181277	181284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3748	NC_011529	GGAG	2	8	181321	181328	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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3752	NC_011529	CGA	2	6	181636	181641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223349
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3994	NC_011529	CAT	2	6	195476	195481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223363
3995	NC_011529	ACA	2	6	195484	195489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223363
3996	NC_011529	CCT	2	6	195491	195496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223363
3997	NC_011529	GAG	2	6	195513	195518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223363
3998	NC_011529	GC	3	6	195527	195532	0 %	0 %	50 %	50 %	212223363
3999	NC_011529	TAC	2	6	195540	195545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223363
4000	NC_011529	ATG	2	6	195552	195557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223363

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