MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_011529	TGC	2	6	1796024	1796029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225057
35502	NC_011529	TTGGA	2	10	1796064	1796073	20 %	40 %	40 %	0 %	212225057
35503	NC_011529	TCG	2	6	1796162	1796167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35504	NC_011529	AGG	2	6	1796261	1796266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35505	NC_011529	GAA	2	6	1796287	1796292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35506	NC_011529	AGA	2	6	1796396	1796401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225058
35507	NC_011529	CTT	2	6	1796438	1796443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225058
35508	NC_011529	CTTCC	2	10	1796552	1796561	0 %	40 %	0 %	60 %	212225058
35509	NC_011529	C	6	6	1796569	1796574	0 %	0 %	0 %	100 %	212225058
35510	NC_011529	CTC	2	6	1796595	1796600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225058
35511	NC_011529	TGA	2	6	1796633	1796638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225058
35512	NC_011529	TAT	2	6	1796796	1796801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212225058
35513	NC_011529	TCC	2	6	1796875	1796880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225058
35514	NC_011529	AT	3	6	1796928	1796933	50 %	50 %	0 %	0 %	212225058
35515	NC_011529	CAT	2	6	1796934	1796939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225058
35516	NC_011529	TGA	2	6	1797106	1797111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35517	NC_011529	TG	3	6	1797148	1797153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35518	NC_011529	GTT	2	6	1797189	1797194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35519	NC_011529	GCA	2	6	1797245	1797250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225059
35520	NC_011529	CA	3	6	1797303	1797308	50 %	0 %	0 %	50 %	212225059
35521	NC_011529	CCG	2	6	1797491	1797496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212225059
35522	NC_011529	TCA	2	6	1797501	1797506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225059
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35525	NC_011529	TGG	2	6	1797688	1797693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212225059
35526	NC_011529	TGT	2	6	1797694	1797699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212225059
35527	NC_011529	CTG	2	6	1797711	1797716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225059
35528	NC_011529	ACG	2	6	1797723	1797728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225059
35529	NC_011529	AAC	2	6	1797773	1797778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212225059
35530	NC_011529	GTC	2	6	1797788	1797793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225059
35531	NC_011529	TGA	2	6	1797835	1797840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225059
35532	NC_011529	CGGA	2	8	1797900	1797907	25 %	0 %	50 %	25 %	212225059
35533	NC_011529	GAC	2	6	1797953	1797958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225059
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35535	NC_011529	TGC	2	6	1798057	1798062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225059
35536	NC_011529	GAC	2	6	1798220	1798225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225059
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35538	NC_011529	CTA	2	6	1798300	1798305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225059
35539	NC_011529	CAA	2	6	1798306	1798311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212225059
35540	NC_011529	AACACC	2	12	1798352	1798363	50 %	0 %	0 %	50 %	212225059
35541	NC_011529	TCC	2	6	1798374	1798379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225059
35542	NC_011529	TAC	2	6	1798421	1798426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225059
35543	NC_011529	GGC	2	6	1798462	1798467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225059
35544	NC_011529	ACT	2	6	1798492	1798497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35545	NC_011529	TCG	2	6	1798656	1798661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35546	NC_011529	GCG	2	6	1798690	1798695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35547	NC_011529	TTA	2	6	1798735	1798740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35548	NC_011529	GTG	2	6	1798768	1798773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35549	NC_011529	GCT	2	6	1798804	1798809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225060
35550	NC_011529	CTG	2	6	1798817	1798822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225060
35551	NC_011529	GCT	2	6	1798831	1798836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225060
35552	NC_011529	GAT	2	6	1798867	1798872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225060
35553	NC_011529	GGT	2	6	1798876	1798881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212225060
35554	NC_011529	CGAA	2	8	1798911	1798918	50 %	0 %	25 %	25 %	212225060
35555	NC_011529	TGG	2	6	1798930	1798935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212225060
35556	NC_011529	GTT	2	6	1798973	1798978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212225060
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35558	NC_011529	GA	3	6	1799293	1799298	50 %	0 %	50 %	0 %	212225060
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35562	NC_011529	AT	3	6	1799396	1799401	50 %	50 %	0 %	0 %	212225060
35563	NC_011529	CTC	2	6	1799471	1799476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225060
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35574	NC_011529	GGC	2	6	1800043	1800048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225060
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35593	NC_011529	TCCT	2	8	1801109	1801116	0 %	50 %	0 %	50 %	212225063
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35601	NC_011529	TCG	2	6	1801530	1801535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225065
35602	NC_011529	CAA	2	6	1801639	1801644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212225065
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35605	NC_011529	G	7	7	1801849	1801855	0 %	0 %	100 %	0 %	212225065
35606	NC_011529	ACA	2	6	1801863	1801868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212225065
35607	NC_011529	CCT	2	6	1801902	1801907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35608	NC_011529	GAAA	2	8	1801926	1801933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35609	NC_011529	CTT	2	6	1801940	1801945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225066
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35611	NC_011529	CGG	2	6	1802002	1802007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225066
35612	NC_011529	GGT	2	6	1802024	1802029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212225066
35613	NC_011529	GAA	2	6	1802060	1802065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225066
35614	NC_011529	AAGG	2	8	1802081	1802088	50 %	0 %	50 %	0 %	212225066
35615	NC_011529	CGT	2	6	1802098	1802103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225066
35616	NC_011529	TCC	2	6	1802178	1802183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225066
35617	NC_011529	ATG	2	6	1802190	1802195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225066
35618	NC_011529	GGCCT	2	10	1802202	1802211	0 %	20 %	40 %	40 %	212225066
35619	NC_011529	CGA	2	6	1802212	1802217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225066
35620	NC_011529	ATG	2	6	1802244	1802249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225066
35621	NC_011529	CGT	3	9	1802272	1802280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225066
35622	NC_011529	GAT	2	6	1802294	1802299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225066
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35629	NC_011529	CTT	2	6	1802591	1802596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225067
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35637	NC_011529	ATC	2	6	1802937	1802942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225067
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35645	NC_011529	TC	3	6	1803364	1803369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35646	NC_011529	TAT	2	6	1803395	1803400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35648	NC_011529	TCTT	2	8	1803475	1803482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35649	NC_011529	GTT	2	6	1803483	1803488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35855	NC_011529	CCT	2	6	1815436	1815441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225085
35856	NC_011529	CAT	2	6	1815455	1815460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225085
35857	NC_011529	TCC	2	6	1815482	1815487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225085
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35859	NC_011529	GGTG	2	8	1815526	1815533	0 %	25 %	75 %	0 %	212225085
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35863	NC_011529	TCC	2	6	1815686	1815691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35864	NC_011529	GAA	2	6	1815701	1815706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35865	NC_011529	CCT	2	6	1815715	1815720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35866	NC_011529	GA	3	6	1815763	1815768	50 %	0 %	50 %	0 %	212225086
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35891	NC_011529	TGG	2	6	1817453	1817458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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