MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_011529	ATC	2	6	1770607	1770612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225036
35002	NC_011529	AGTG	2	8	1770615	1770622	25 %	25 %	50 %	0 %	212225036
35003	NC_011529	ATG	2	6	1770628	1770633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225036
35004	NC_011529	GAA	2	6	1770636	1770641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225036
35005	NC_011529	GTTG	2	8	1770678	1770685	0 %	50 %	50 %	0 %	212225036
35006	NC_011529	CCG	2	6	1770686	1770691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212225036
35007	NC_011529	GA	3	6	1770712	1770717	50 %	0 %	50 %	0 %	212225036
35008	NC_011529	TGA	2	6	1770729	1770734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225036
35009	NC_011529	TCG	2	6	1770836	1770841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225036
35010	NC_011529	CAC	2	6	1770924	1770929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212225036
35011	NC_011529	GGA	2	6	1771024	1771029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225036
35012	NC_011529	AGG	2	6	1771127	1771132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225036
35013	NC_011529	GAT	2	6	1771188	1771193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225036
35014	NC_011529	AGGG	2	8	1771196	1771203	25 %	0 %	75 %	0 %	212225036
35015	NC_011529	GTC	2	6	1771270	1771275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225036
35016	NC_011529	TCG	2	6	1771313	1771318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225036
35017	NC_011529	CGGGG	2	10	1771347	1771356	0 %	0 %	80 %	20 %	212225036
35018	NC_011529	GAG	2	6	1771363	1771368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225036
35019	NC_011529	ATA	2	6	1771393	1771398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212225036
35020	NC_011529	TCA	2	6	1771439	1771444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225036
35021	NC_011529	T	6	6	1771482	1771487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35022	NC_011529	TTC	2	6	1771494	1771499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35023	NC_011529	ATC	2	6	1771573	1771578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225037
35024	NC_011529	AG	3	6	1771622	1771627	50 %	0 %	50 %	0 %	212225037
35025	NC_011529	AGT	2	6	1771779	1771784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225037
35026	NC_011529	G	6	6	1771866	1771871	0 %	0 %	100 %	0 %	212225037
35027	NC_011529	TGA	2	6	1771922	1771927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225037
35028	NC_011529	GA	3	6	1771947	1771952	50 %	0 %	50 %	0 %	212225037
35029	NC_011529	GCT	2	6	1772037	1772042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225037
35030	NC_011529	CCG	2	6	1772099	1772104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212225037
35031	NC_011529	GA	3	6	1772163	1772168	50 %	0 %	50 %	0 %	212225037
35032	NC_011529	AGG	2	6	1772210	1772215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225037
35033	NC_011529	TCA	2	6	1772225	1772230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225037
35034	NC_011529	AG	3	6	1772351	1772356	50 %	0 %	50 %	0 %	212225037
35035	NC_011529	AT	3	6	1772407	1772412	50 %	50 %	0 %	0 %	212225037
35036	NC_011529	TCA	2	6	1772420	1772425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225037
35037	NC_011529	CGG	2	6	1772487	1772492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225037
35038	NC_011529	CTG	2	6	1772599	1772604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225037
35039	NC_011529	GA	3	6	1772646	1772651	50 %	0 %	50 %	0 %	212225037
35040	NC_011529	CT	3	6	1772697	1772702	0 %	50 %	0 %	50 %	212225037
35041	NC_011529	GCT	2	6	1772823	1772828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225037
35042	NC_011529	GAG	2	6	1772863	1772868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225037
35043	NC_011529	AGGA	2	8	1772908	1772915	50 %	0 %	50 %	0 %	212225037
35044	NC_011529	CTT	2	6	1772931	1772936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225037
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35047	NC_011529	TCA	2	6	1773043	1773048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225038
35048	NC_011529	TCG	2	6	1773091	1773096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225038
35049	NC_011529	GTC	2	6	1773165	1773170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225038
35050	NC_011529	ATC	2	6	1773198	1773203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225038
35051	NC_011529	GCC	2	6	1773264	1773269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212225038
35052	NC_011529	GAAGA	2	10	1773408	1773417	60 %	0 %	40 %	0 %	212225038
35053	NC_011529	ACT	2	6	1773427	1773432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225038
35054	NC_011529	TCG	2	6	1773496	1773501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225038
35055	NC_011529	CAT	2	6	1773557	1773562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225038
35056	NC_011529	CTC	2	6	1773636	1773641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225038
35057	NC_011529	TCC	2	6	1773808	1773813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225038
35058	NC_011529	TGA	2	6	1773943	1773948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225038
35059	NC_011529	CTT	2	6	1773998	1774003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225038
35060	NC_011529	TAC	2	6	1774098	1774103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225038
35061	NC_011529	GCT	2	6	1774133	1774138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225038
35062	NC_011529	CTT	2	6	1774170	1774175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225038
35063	NC_011529	GGA	2	6	1774250	1774255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225039
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35100	NC_011529	CGT	2	6	1776148	1776153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225040
35101	NC_011529	TCGCT	2	10	1776179	1776188	0 %	40 %	20 %	40 %	212225040
35102	NC_011529	AGA	2	6	1776239	1776244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225040
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35104	NC_011529	GA	3	6	1776283	1776288	50 %	0 %	50 %	0 %	212225040
35105	NC_011529	GA	3	6	1776375	1776380	50 %	0 %	50 %	0 %	212225040
35106	NC_011529	ATA	2	6	1776431	1776436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212225040
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35236	NC_011529	AGT	3	9	1782629	1782637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225048
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35352	NC_011529	TA	3	6	1788826	1788831	50 %	50 %	0 %	0 %	212225050
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35467	NC_011529	CTGTG	2	10	1794434	1794443	0 %	40 %	40 %	20 %	212225056
35468	NC_011529	AGG	2	6	1794491	1794496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225056
35469	NC_011529	ATCGC	2	10	1794514	1794523	20 %	20 %	20 %	40 %	212225056
35470	NC_011529	TGT	2	6	1794536	1794541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212225056
35471	NC_011529	AGCC	2	8	1794548	1794555	25 %	0 %	25 %	50 %	212225056
35472	NC_011529	CA	3	6	1794568	1794573	50 %	0 %	0 %	50 %	212225056
35473	NC_011529	AGAGA	2	10	1794642	1794651	60 %	0 %	40 %	0 %	212225056
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35475	NC_011529	GA	3	6	1794811	1794816	50 %	0 %	50 %	0 %	212225056
35476	NC_011529	ATC	2	6	1795003	1795008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225056
35477	NC_011529	TCA	2	6	1795028	1795033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225056
35478	NC_011529	AATA	2	8	1795067	1795074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35479	NC_011529	GA	3	6	1795095	1795100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35480	NC_011529	CAT	2	6	1795137	1795142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225057
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35484	NC_011529	TGT	2	6	1795254	1795259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212225057
35485	NC_011529	CGA	2	6	1795287	1795292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225057
35486	NC_011529	CGA	2	6	1795311	1795316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225057
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35489	NC_011529	TC	3	6	1795567	1795572	0 %	50 %	0 %	50 %	212225057
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35495	NC_011529	CTT	2	6	1795714	1795719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225057
35496	NC_011529	CGA	2	6	1795749	1795754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225057
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35499	NC_011529	CAG	2	6	1795853	1795858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225057
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