MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_011529	CAG	2	6	1744853	1744858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225015
34502	NC_011529	A	7	7	1744892	1744898	100 %	0 %	0 %	0 %	212225015
34503	NC_011529	GAA	2	6	1744916	1744921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225015
34504	NC_011529	A	6	6	1744964	1744969	100 %	0 %	0 %	0 %	212225015
34505	NC_011529	GA	3	6	1745094	1745099	50 %	0 %	50 %	0 %	212225015
34506	NC_011529	CTC	2	6	1745358	1745363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225015
34507	NC_011529	TCCC	2	8	1745453	1745460	0 %	25 %	0 %	75 %	212225015
34508	NC_011529	CTGGG	2	10	1745567	1745576	0 %	20 %	60 %	20 %	212225016
34509	NC_011529	AGG	2	6	1745594	1745599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225016
34510	NC_011529	TCCT	2	8	1745608	1745615	0 %	50 %	0 %	50 %	212225016
34511	NC_011529	GGC	2	6	1745662	1745667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225016
34512	NC_011529	GGCAG	2	10	1745755	1745764	20 %	0 %	60 %	20 %	212225016
34513	NC_011529	GAG	2	6	1745767	1745772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225016
34514	NC_011529	A	6	6	1745775	1745780	100 %	0 %	0 %	0 %	212225016
34515	NC_011529	TCG	2	6	1745792	1745797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225016
34516	NC_011529	ATAGGG	2	12	1745876	1745887	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	212225016
34517	NC_011529	CAG	2	6	1745907	1745912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225016
34518	NC_011529	GCC	2	6	1745913	1745918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212225016
34519	NC_011529	TGA	2	6	1746090	1746095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225016
34520	NC_011529	TTGA	2	8	1746166	1746173	25 %	50 %	25 %	0 %	212225016
34521	NC_011529	CCA	2	6	1746218	1746223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212225016
34522	NC_011529	GAT	2	6	1746264	1746269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225016
34523	NC_011529	GAA	2	6	1746292	1746297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225016
34524	NC_011529	CCA	2	6	1746370	1746375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34525	NC_011529	ACC	2	6	1746386	1746391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34526	NC_011529	CAT	2	6	1746442	1746447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225017
34527	NC_011529	CACT	2	8	1746479	1746486	25 %	25 %	0 %	50 %	212225017
34528	NC_011529	GAG	2	6	1746507	1746512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225017
34529	NC_011529	ATC	2	6	1746513	1746518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225017
34530	NC_011529	AGG	2	6	1746596	1746601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34531	NC_011529	TTG	2	6	1746626	1746631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212225018
34532	NC_011529	CCGA	2	8	1746649	1746656	25 %	0 %	25 %	50 %	212225018
34533	NC_011529	CGA	2	6	1746672	1746677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225018
34534	NC_011529	GAG	2	6	1746682	1746687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225018
34535	NC_011529	GAG	2	6	1746793	1746798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225018
34536	NC_011529	ACG	2	6	1746809	1746814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225018
34537	NC_011529	CAGG	2	8	1746831	1746838	25 %	0 %	50 %	25 %	212225018
34538	NC_011529	CTCTT	2	10	1746889	1746898	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34539	NC_011529	CGC	2	6	1746966	1746971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34540	NC_011529	GAT	2	6	1747046	1747051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225019
34541	NC_011529	TC	3	6	1747082	1747087	0 %	50 %	0 %	50 %	212225019
34542	NC_011529	CT	3	6	1747119	1747124	0 %	50 %	0 %	50 %	212225019
34543	NC_011529	TTCC	2	8	1747228	1747235	0 %	50 %	0 %	50 %	212225019
34544	NC_011529	TC	4	8	1747297	1747304	0 %	50 %	0 %	50 %	212225019
34545	NC_011529	GAG	2	6	1747347	1747352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225019
34546	NC_011529	TCG	2	6	1747441	1747446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225019
34547	NC_011529	CGA	2	6	1747505	1747510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225019
34548	NC_011529	GCG	2	6	1747576	1747581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225019
34549	NC_011529	TTCC	2	8	1747631	1747638	0 %	50 %	0 %	50 %	212225019
34550	NC_011529	GAG	2	6	1747690	1747695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225019
34551	NC_011529	GAG	2	6	1747734	1747739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225019
34552	NC_011529	CTC	2	6	1747782	1747787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212225019
34553	NC_011529	CGT	2	6	1747790	1747795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225019
34554	NC_011529	GAG	2	6	1747941	1747946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212225019
34555	NC_011529	CTG	2	6	1748014	1748019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225020
34556	NC_011529	GGT	2	6	1748086	1748091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212225020
34557	NC_011529	TGG	2	6	1748141	1748146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212225020
34558	NC_011529	TGA	2	6	1748175	1748180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225020
34559	NC_011529	GAA	2	6	1748241	1748246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225020
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34561	NC_011529	TGA	2	6	1748502	1748507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212225020
34562	NC_011529	TTGA	2	8	1748518	1748525	25 %	50 %	25 %	0 %	212225020
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34589	NC_011529	CTTC	2	8	1749499	1749506	0 %	50 %	0 %	50 %	212225021
34590	NC_011529	CGT	2	6	1749550	1749555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225021
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34596	NC_011529	TA	3	6	1749810	1749815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34597	NC_011529	TGA	2	6	1749819	1749824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34598	NC_011529	CCA	2	6	1749906	1749911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34599	NC_011529	GGT	2	6	1750055	1750060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34600	NC_011529	AGGA	2	8	1750078	1750085	50 %	0 %	50 %	0 %	212225022
34601	NC_011529	CTT	2	6	1750161	1750166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225022
34602	NC_011529	GAA	2	6	1750180	1750185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212225022
34603	NC_011529	CGG	2	6	1750214	1750219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212225022
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34606	NC_011529	GGCC	2	8	1750355	1750362	0 %	0 %	50 %	50 %	212225022
34607	NC_011529	GCA	2	6	1750413	1750418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225022
34608	NC_011529	GA	4	8	1750672	1750679	50 %	0 %	50 %	0 %	212225022
34609	NC_011529	TTC	2	6	1750690	1750695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225022
34610	NC_011529	CTGA	2	8	1750702	1750709	25 %	25 %	25 %	25 %	212225022
34611	NC_011529	AG	3	6	1750717	1750722	50 %	0 %	50 %	0 %	212225022
34612	NC_011529	CTG	2	6	1750826	1750831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225022
34613	NC_011529	CGT	2	6	1750866	1750871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225022
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34615	NC_011529	TGAA	2	8	1750976	1750983	50 %	25 %	25 %	0 %	212225022
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34617	NC_011529	ACG	2	6	1751047	1751052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212225022
34618	NC_011529	GTC	2	6	1751131	1751136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225022
34619	NC_011529	ACC	2	6	1751143	1751148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212225022
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34633	NC_011529	CTA	2	6	1751835	1751840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212225022
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34850	NC_011529	CGT	2	6	1762486	1762491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225029
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34966	NC_011529	ACC	2	6	1768924	1768929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212225034
34967	NC_011529	TTC	2	6	1768998	1769003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212225034
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