MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_011529	TCA	2	6	1719279	1719284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224984
34002	NC_011529	GTA	2	6	1719310	1719315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224984
34003	NC_011529	GTG	2	6	1719353	1719358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224984
34004	NC_011529	GGA	2	6	1719420	1719425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224984
34005	NC_011529	CTC	2	6	1719472	1719477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224984
34006	NC_011529	CGA	2	6	1719510	1719515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224984
34007	NC_011529	TTA	3	9	1719528	1719536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224984
34008	NC_011529	CTC	2	6	1719548	1719553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224984
34009	NC_011529	TTA	2	6	1719585	1719590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34010	NC_011529	GGA	2	6	1719618	1719623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224985
34011	NC_011529	GCT	2	6	1719740	1719745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224985
34012	NC_011529	TCC	2	6	1719897	1719902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224985
34013	NC_011529	CGA	2	6	1719940	1719945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224985
34014	NC_011529	GAG	3	9	1719971	1719979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224985
34015	NC_011529	GCG	2	6	1719981	1719986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224985
34016	NC_011529	TCC	2	6	1719997	1720002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224985
34017	NC_011529	GAG	2	6	1720031	1720036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224985
34018	NC_011529	TCC	2	6	1720088	1720093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224985
34019	NC_011529	CGG	2	6	1720119	1720124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224985
34020	NC_011529	CGC	2	6	1720228	1720233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224985
34021	NC_011529	GAA	2	6	1720241	1720246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224985
34022	NC_011529	GA	3	6	1720319	1720324	50 %	0 %	50 %	0 %	212224985
34023	NC_011529	CGT	2	6	1720341	1720346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224986
34024	NC_011529	CT	3	6	1720482	1720487	0 %	50 %	0 %	50 %	212224986
34025	NC_011529	TCGCCT	2	12	1720514	1720525	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212224986
34026	NC_011529	GA	3	6	1720575	1720580	50 %	0 %	50 %	0 %	212224987
34027	NC_011529	TCC	2	6	1720594	1720599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224987
34028	NC_011529	TTC	2	6	1720641	1720646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224987
34029	NC_011529	GTC	2	6	1720787	1720792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224987
34030	NC_011529	CGT	2	6	1720810	1720815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224987
34031	NC_011529	CCTT	2	8	1720824	1720831	0 %	50 %	0 %	50 %	212224987
34032	NC_011529	TTC	2	6	1720935	1720940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224987
34033	NC_011529	TTG	2	6	1720947	1720952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224987
34034	NC_011529	TAT	2	6	1720991	1720996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224987
34035	NC_011529	CCG	2	6	1721079	1721084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224987
34036	NC_011529	AGG	2	6	1721208	1721213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224987
34037	NC_011529	ACG	2	6	1721226	1721231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224987
34038	NC_011529	AGC	2	6	1721244	1721249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224987
34039	NC_011529	GGC	2	6	1721285	1721290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224987
34040	NC_011529	ACC	2	6	1721301	1721306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224987
34041	NC_011529	TTCA	2	8	1721514	1721521	25 %	50 %	0 %	25 %	212224987
34042	NC_011529	ACC	3	9	1721523	1721531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34043	NC_011529	ATG	2	6	1721533	1721538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34044	NC_011529	ATT	2	6	1721546	1721551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34045	NC_011529	CGG	2	6	1721626	1721631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224988
34046	NC_011529	CGA	2	6	1721637	1721642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224988
34047	NC_011529	CGA	2	6	1721728	1721733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224988
34048	NC_011529	GAG	3	9	1721840	1721848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224988
34049	NC_011529	GGA	2	6	1721884	1721889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224988
34050	NC_011529	TCA	2	6	1721910	1721915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224988
34051	NC_011529	TGG	2	6	1721946	1721951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224988
34052	NC_011529	ACG	2	6	1721967	1721972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224988
34053	NC_011529	GGA	2	6	1721973	1721978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224988
34054	NC_011529	ACG	2	6	1721994	1721999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224988
34055	NC_011529	GCCG	2	8	1722076	1722083	0 %	0 %	50 %	50 %	212224988
34056	NC_011529	CTC	2	6	1722299	1722304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224988
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34058	NC_011529	GAG	2	6	1722320	1722325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224988
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34060	NC_011529	AAG	2	6	1722371	1722376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224988
34061	NC_011529	ATA	2	6	1722401	1722406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224988
34062	NC_011529	GAG	2	6	1722428	1722433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224988
34063	NC_011529	CGA	2	6	1722498	1722503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224988
34064	NC_011529	CAT	2	6	1722514	1722519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224988
34065	NC_011529	TCG	2	6	1722564	1722569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224988
34066	NC_011529	TTA	3	9	1722629	1722637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34067	NC_011529	TTTTTC	2	12	1722714	1722725	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34068	NC_011529	CCTG	2	8	1722797	1722804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34069	NC_011529	GGAA	2	8	1722871	1722878	50 %	0 %	50 %	0 %	212224989
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34076	NC_011529	A	7	7	1723067	1723073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34077	NC_011529	AAG	2	6	1723139	1723144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34078	NC_011529	CAA	2	6	1723183	1723188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224990
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34084	NC_011529	CTCC	2	8	1723413	1723420	0 %	25 %	0 %	75 %	212224990
34085	NC_011529	GA	3	6	1723439	1723444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34086	NC_011529	CTGG	2	8	1723518	1723525	0 %	25 %	50 %	25 %	212224991
34087	NC_011529	TTCG	2	8	1723611	1723618	0 %	50 %	25 %	25 %	212224991
34088	NC_011529	GAA	2	6	1723625	1723630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224991
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34091	NC_011529	CTA	2	6	1723888	1723893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34092	NC_011529	GAA	2	6	1723915	1723920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34093	NC_011529	GAG	2	6	1723923	1723928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34094	NC_011529	CTC	2	6	1724078	1724083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34095	NC_011529	TA	3	6	1724106	1724111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34096	NC_011529	TTTA	2	8	1724122	1724129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34097	NC_011529	T	6	6	1724138	1724143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34098	NC_011529	AAT	2	6	1724157	1724162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34099	NC_011529	GAG	2	6	1724243	1724248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34100	NC_011529	CATC	2	8	1724345	1724352	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34101	NC_011529	CTC	2	6	1724391	1724396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34102	NC_011529	TA	3	6	1724419	1724424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34103	NC_011529	TTTA	2	8	1724435	1724442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34104	NC_011529	T	6	6	1724451	1724456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34105	NC_011529	TAG	2	6	1724514	1724519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34106	NC_011529	AATCG	2	10	1724534	1724543	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34107	NC_011529	AACCC	2	10	1724585	1724594	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
34108	NC_011529	TTC	2	6	1724600	1724605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34109	NC_011529	ATG	2	6	1724621	1724626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34110	NC_011529	ATTA	2	8	1724649	1724656	50 %	50 %	0 %	0 %	212224992
34111	NC_011529	GTT	2	6	1724677	1724682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224992
34112	NC_011529	GGA	2	6	1724742	1724747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224992
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34114	NC_011529	ACC	3	9	1724977	1724985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224992
34115	NC_011529	ACG	2	6	1725055	1725060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224992
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34118	NC_011529	AGACG	2	10	1725153	1725162	40 %	0 %	40 %	20 %	212224992
34119	NC_011529	GAC	2	6	1725198	1725203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224992
34120	NC_011529	GGA	2	6	1725207	1725212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224992
34121	NC_011529	TGAT	2	8	1725230	1725237	25 %	50 %	25 %	0 %	212224992
34122	NC_011529	GTT	2	6	1725241	1725246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224992
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34125	NC_011529	CGG	2	6	1725390	1725395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34126	NC_011529	GAT	2	6	1725398	1725403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34130	NC_011529	ATC	2	6	1725558	1725563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224993
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34217	NC_011529	GGA	2	6	1730936	1730941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34222	NC_011529	GA	3	6	1731365	1731370	50 %	0 %	50 %	0 %	212225003
34223	NC_011529	CTTT	2	8	1731410	1731417	0 %	75 %	0 %	25 %	212225003
34224	NC_011529	ATTT	2	8	1731473	1731480	25 %	75 %	0 %	0 %	212225003
34225	NC_011529	ATT	2	6	1731494	1731499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212225003
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34228	NC_011529	AG	3	6	1731584	1731589	50 %	0 %	50 %	0 %	212225003
34229	NC_011529	TTTA	2	8	1731627	1731634	25 %	75 %	0 %	0 %	212225003
34230	NC_011529	GATT	2	8	1731637	1731644	25 %	50 %	25 %	0 %	212225003
34231	NC_011529	TGC	2	6	1731694	1731699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212225003
34232	NC_011529	T	7	7	1731717	1731723	0 %	100 %	0 %	0 %	212225003
34233	NC_011529	CCA	2	6	1731732	1731737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212225003
34234	NC_011529	TA	3	6	1731774	1731779	50 %	50 %	0 %	0 %	212225003
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34477	NC_011529	AAT	2	6	1743760	1743765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34478	NC_011529	ATC	2	6	1743807	1743812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34479	NC_011529	ATTT	2	8	1743837	1743844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34480	NC_011529	TC	3	6	1743848	1743853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34481	NC_011529	GTA	2	6	1743859	1743864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34482	NC_011529	TCCC	2	8	1743927	1743934	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34483	NC_011529	GGT	2	6	1743953	1743958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34484	NC_011529	CCGG	2	8	1744011	1744018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34485	NC_011529	CGCC	2	8	1744065	1744072	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34486	NC_011529	CCA	2	6	1744111	1744116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34490	NC_011529	CCT	2	6	1744320	1744325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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