MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_011529	GAC	2	6	1692083	1692088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224967
33502	NC_011529	TCA	2	6	1692205	1692210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224967
33503	NC_011529	GTT	2	6	1692247	1692252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33504	NC_011529	TAG	2	6	1692268	1692273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33505	NC_011529	AAG	2	6	1692374	1692379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33506	NC_011529	AGCCTG	2	12	1692435	1692446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212224968
33507	NC_011529	CTC	2	6	1692461	1692466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224968
33508	NC_011529	CAT	2	6	1692473	1692478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224968
33509	NC_011529	GA	3	6	1692494	1692499	50 %	0 %	50 %	0 %	212224968
33510	NC_011529	CTC	2	6	1692575	1692580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224968
33511	NC_011529	TCG	2	6	1692603	1692608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224968
33512	NC_011529	C	6	6	1692671	1692676	0 %	0 %	0 %	100 %	212224968
33513	NC_011529	CTC	3	9	1692713	1692721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224968
33514	NC_011529	ATG	2	6	1692726	1692731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224968
33515	NC_011529	AGC	2	6	1692831	1692836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224968
33516	NC_011529	AGC	2	6	1692884	1692889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224969
33517	NC_011529	GGA	2	6	1692903	1692908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224969
33518	NC_011529	ATT	2	6	1692971	1692976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224969
33519	NC_011529	CCAT	2	8	1693032	1693039	25 %	25 %	0 %	50 %	212224969
33520	NC_011529	TCG	2	6	1693043	1693048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224969
33521	NC_011529	GAC	2	6	1693069	1693074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224969
33522	NC_011529	TAT	2	6	1693102	1693107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224969
33523	NC_011529	ACG	2	6	1693289	1693294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224969
33524	NC_011529	ACT	2	6	1693358	1693363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224969
33525	NC_011529	CCTT	2	8	1693403	1693410	0 %	50 %	0 %	50 %	212224969
33526	NC_011529	TGA	2	6	1693452	1693457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224969
33527	NC_011529	CTT	2	6	1693464	1693469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224969
33528	NC_011529	GAG	2	6	1693489	1693494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224969
33529	NC_011529	TGG	2	6	1693521	1693526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224969
33530	NC_011529	GTT	2	6	1693528	1693533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224969
33531	NC_011529	CTTT	2	8	1693559	1693566	0 %	75 %	0 %	25 %	212224969
33532	NC_011529	TAC	2	6	1693576	1693581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224969
33533	NC_011529	A	6	6	1693706	1693711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33534	NC_011529	TA	3	6	1693714	1693719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33535	NC_011529	AGG	2	6	1693781	1693786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224970
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33537	NC_011529	TCC	2	6	1694024	1694029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224970
33538	NC_011529	TCA	2	6	1694032	1694037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224970
33539	NC_011529	TAT	2	6	1694107	1694112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224970
33540	NC_011529	TAT	2	6	1694217	1694222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224970
33541	NC_011529	ATT	2	6	1694242	1694247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224970
33542	NC_011529	GGCA	2	8	1694365	1694372	25 %	0 %	50 %	25 %	212224970
33543	NC_011529	ATC	2	6	1694376	1694381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224970
33544	NC_011529	GGAATT	2	12	1694388	1694399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224970
33545	NC_011529	TC	3	6	1694408	1694413	0 %	50 %	0 %	50 %	212224970
33546	NC_011529	GTA	2	6	1694442	1694447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224970
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33551	NC_011529	T	7	7	1694743	1694749	0 %	100 %	0 %	0 %	212224970
33552	NC_011529	GGTG	2	8	1694881	1694888	0 %	25 %	75 %	0 %	212224970
33553	NC_011529	TC	4	8	1694909	1694916	0 %	50 %	0 %	50 %	212224970
33554	NC_011529	TGT	2	6	1695008	1695013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224970
33555	NC_011529	GTT	2	6	1695024	1695029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224970
33556	NC_011529	TG	3	6	1695032	1695037	0 %	50 %	50 %	0 %	212224970
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33558	NC_011529	TA	3	6	1695140	1695145	50 %	50 %	0 %	0 %	212224970
33559	NC_011529	AT	3	6	1695174	1695179	50 %	50 %	0 %	0 %	212224970
33560	NC_011529	TGA	2	6	1695226	1695231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224970
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33562	NC_011529	TCT	2	6	1695264	1695269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224970
33563	NC_011529	TGA	2	6	1695413	1695418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224970
33564	NC_011529	TG	3	6	1695494	1695499	0 %	50 %	50 %	0 %	212224970
33565	NC_011529	TGA	2	6	1695506	1695511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224970
33566	NC_011529	AGATAC	2	12	1695540	1695551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212224970
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33568	NC_011529	CAG	2	6	1695864	1695869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224970
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33585	NC_011529	CCG	2	6	1697130	1697135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224971
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33589	NC_011529	GTA	2	6	1697399	1697404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224971
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33605	NC_011529	AGGG	2	8	1698365	1698372	25 %	0 %	75 %	0 %	212224971
33606	NC_011529	GAAT	2	8	1698409	1698416	50 %	25 %	25 %	0 %	212224971
33607	NC_011529	A	6	6	1698516	1698521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33608	NC_011529	CAT	2	6	1698528	1698533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33969	NC_011529	TACTG	2	10	1717718	1717727	20 %	40 %	20 %	20 %	212224983
33970	NC_011529	TGA	2	6	1717766	1717771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224983
33971	NC_011529	CT	3	6	1717821	1717826	0 %	50 %	0 %	50 %	212224984
33972	NC_011529	AGC	2	6	1717835	1717840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224984
33973	NC_011529	CTC	2	6	1717870	1717875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224984
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33976	NC_011529	TCT	2	6	1718118	1718123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224984
33977	NC_011529	GTT	2	6	1718138	1718143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224984
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33980	NC_011529	GCA	2	6	1718217	1718222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224984
33981	NC_011529	CGG	2	6	1718230	1718235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224984
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33983	NC_011529	GAG	2	6	1718245	1718250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224984
33984	NC_011529	TC	3	6	1718467	1718472	0 %	50 %	0 %	50 %	212224984
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33987	NC_011529	GTA	2	6	1718686	1718691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224984
33988	NC_011529	CCCT	2	8	1718809	1718816	0 %	25 %	0 %	75 %	212224984
33989	NC_011529	TGG	2	6	1718862	1718867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224984
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33991	NC_011529	AGGA	2	8	1718897	1718904	50 %	0 %	50 %	0 %	212224984
33992	NC_011529	TGA	2	6	1718922	1718927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224984
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33997	NC_011529	AG	3	6	1719125	1719130	50 %	0 %	50 %	0 %	212224984
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33999	NC_011529	ATC	2	6	1719236	1719241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224984
34000	NC_011529	CT	3	6	1719244	1719249	0 %	50 %	0 %	50 %	212224984

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