MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_011529	CGA	2	6	1666517	1666522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224947
33002	NC_011529	CGT	2	6	1666541	1666546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224947
33003	NC_011529	ATA	2	6	1666587	1666592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224947
33004	NC_011529	TC	3	6	1666637	1666642	0 %	50 %	0 %	50 %	212224947
33005	NC_011529	CACG	2	8	1666643	1666650	25 %	0 %	25 %	50 %	212224947
33006	NC_011529	CGT	2	6	1666724	1666729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224947
33007	NC_011529	GCCA	2	8	1666823	1666830	25 %	0 %	25 %	50 %	212224947
33008	NC_011529	CTT	2	6	1666838	1666843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224947
33009	NC_011529	GAA	2	6	1666926	1666931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224947
33010	NC_011529	CGG	2	6	1666980	1666985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224947
33011	NC_011529	TTCG	2	8	1666986	1666993	0 %	50 %	25 %	25 %	212224947
33012	NC_011529	GAAG	2	8	1667006	1667013	50 %	0 %	50 %	0 %	212224947
33013	NC_011529	ACC	2	6	1667023	1667028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224947
33014	NC_011529	CT	3	6	1667065	1667070	0 %	50 %	0 %	50 %	212224947
33015	NC_011529	CTT	2	6	1667076	1667081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224947
33016	NC_011529	ACG	2	6	1667083	1667088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224947
33017	NC_011529	GTG	2	6	1667118	1667123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224947
33018	NC_011529	CCT	2	6	1667154	1667159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224947
33019	NC_011529	GTG	2	6	1667346	1667351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224947
33020	NC_011529	TCCT	2	8	1667372	1667379	0 %	50 %	0 %	50 %	212224947
33021	NC_011529	CT	3	6	1667466	1667471	0 %	50 %	0 %	50 %	212224947
33022	NC_011529	CGG	2	6	1667477	1667482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224947
33023	NC_011529	AGCTC	2	10	1667534	1667543	20 %	20 %	20 %	40 %	212224947
33024	NC_011529	GAA	2	6	1667555	1667560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224947
33025	NC_011529	AGT	2	6	1667570	1667575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224947
33026	NC_011529	TCG	2	6	1667584	1667589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224947
33027	NC_011529	CTT	2	6	1667595	1667600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224947
33028	NC_011529	TGA	2	6	1667624	1667629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224947
33029	NC_011529	CAG	2	6	1667664	1667669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224947
33030	NC_011529	AGCG	2	8	1667703	1667710	25 %	0 %	50 %	25 %	212224947
33031	NC_011529	GTC	2	6	1667727	1667732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224947
33032	NC_011529	CGG	2	6	1667735	1667740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224947
33033	NC_011529	CGA	2	6	1667948	1667953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224947
33034	NC_011529	CCA	2	6	1668053	1668058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33035	NC_011529	TGA	2	6	1668070	1668075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33036	NC_011529	GAAG	2	8	1668120	1668127	50 %	0 %	50 %	0 %	212224948
33037	NC_011529	AGCTT	2	10	1668175	1668184	20 %	40 %	20 %	20 %	212224948
33038	NC_011529	CTC	2	6	1668193	1668198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224948
33039	NC_011529	AGG	2	6	1668368	1668373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224948
33040	NC_011529	CCTT	2	8	1668407	1668414	0 %	50 %	0 %	50 %	212224948
33041	NC_011529	GA	3	6	1668487	1668492	50 %	0 %	50 %	0 %	212224948
33042	NC_011529	TCA	2	6	1668503	1668508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224948
33043	NC_011529	ATA	2	6	1668592	1668597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224948
33044	NC_011529	GAG	2	6	1668619	1668624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224948
33045	NC_011529	ACA	2	6	1668647	1668652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224948
33046	NC_011529	CGG	2	6	1668669	1668674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224948
33047	NC_011529	CTT	2	6	1668726	1668731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224948
33048	NC_011529	GA	3	6	1668744	1668749	50 %	0 %	50 %	0 %	212224948
33049	NC_011529	ATC	2	6	1668796	1668801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224948
33050	NC_011529	ACA	2	6	1668839	1668844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224948
33051	NC_011529	AGG	2	6	1668946	1668951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224948
33052	NC_011529	TCG	2	6	1668971	1668976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224948
33053	NC_011529	GAGTAC	2	12	1669015	1669026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212224948
33054	NC_011529	CGC	2	6	1669028	1669033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224948
33055	NC_011529	GA	3	6	1669360	1669365	50 %	0 %	50 %	0 %	212224949
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33058	NC_011529	GGT	2	6	1669423	1669428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224949
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33066	NC_011529	GAG	2	6	1669858	1669863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224949
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33068	NC_011529	CTG	2	6	1669993	1669998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224949
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33078	NC_011529	CGA	2	6	1670394	1670399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224949
33079	NC_011529	GA	3	6	1670410	1670415	50 %	0 %	50 %	0 %	212224949
33080	NC_011529	AG	3	6	1670419	1670424	50 %	0 %	50 %	0 %	212224949
33081	NC_011529	GGA	2	6	1670445	1670450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224949
33082	NC_011529	GCGA	2	8	1670471	1670478	25 %	0 %	50 %	25 %	212224949
33083	NC_011529	GAGGG	2	10	1670494	1670503	20 %	0 %	80 %	0 %	212224949
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33086	NC_011529	CGG	2	6	1670868	1670873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224950
33087	NC_011529	CTC	2	6	1670942	1670947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33088	NC_011529	GA	3	6	1671012	1671017	50 %	0 %	50 %	0 %	212224951
33089	NC_011529	GA	3	6	1671050	1671055	50 %	0 %	50 %	0 %	212224951
33090	NC_011529	CAC	2	6	1671069	1671074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224951
33091	NC_011529	GGA	2	6	1671119	1671124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224951
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33096	NC_011529	AT	3	6	1671261	1671266	50 %	50 %	0 %	0 %	212224951
33097	NC_011529	ACG	2	6	1671359	1671364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224951
33098	NC_011529	TTCGAC	2	12	1671454	1671465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212224951
33099	NC_011529	GGA	2	6	1671475	1671480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224951
33100	NC_011529	CCG	2	6	1671488	1671493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224951
33101	NC_011529	GGAC	2	8	1671537	1671544	25 %	0 %	50 %	25 %	212224951
33102	NC_011529	CCT	2	6	1671603	1671608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224951
33103	NC_011529	CGA	2	6	1671633	1671638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224951
33104	NC_011529	TCC	2	6	1671680	1671685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224951
33105	NC_011529	GAG	2	6	1671694	1671699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224951
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33108	NC_011529	CTC	2	6	1671874	1671879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224951
33109	NC_011529	GGA	2	6	1671882	1671887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224951
33110	NC_011529	GAG	2	6	1671949	1671954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224951
33111	NC_011529	TTC	2	6	1671997	1672002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224951
33112	NC_011529	TCG	2	6	1672004	1672009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224951
33113	NC_011529	GTAA	2	8	1672110	1672117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33114	NC_011529	CTG	2	6	1672163	1672168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33115	NC_011529	TCA	2	6	1672192	1672197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224952
33116	NC_011529	CCT	2	6	1672205	1672210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224952
33117	NC_011529	TCT	2	6	1672231	1672236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224952
33118	NC_011529	AAT	2	6	1672406	1672411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224952
33119	NC_011529	TTC	2	6	1672572	1672577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224952
33120	NC_011529	GTG	2	6	1672605	1672610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224952
33121	NC_011529	GTC	2	6	1672677	1672682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224952
33122	NC_011529	CAT	2	6	1672766	1672771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224952
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33124	NC_011529	CT	3	6	1672813	1672818	0 %	50 %	0 %	50 %	212224952
33125	NC_011529	CTG	2	6	1672944	1672949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224952
33126	NC_011529	AG	3	6	1673024	1673029	50 %	0 %	50 %	0 %	212224953
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33133	NC_011529	GTCGAG	2	12	1673381	1673392	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212224954
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33148	NC_011529	ACC	2	6	1674142	1674147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224954
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33192	NC_011529	CGAC	2	8	1676642	1676649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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33200	NC_011529	TCT	2	6	1676956	1676961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224955
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33223	NC_011529	CCT	2	6	1677909	1677914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224956
33224	NC_011529	GAT	2	6	1677949	1677954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224956
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33226	NC_011529	GT	3	6	1678100	1678105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33227	NC_011529	TA	3	6	1678169	1678174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33228	NC_011529	AG	3	6	1678229	1678234	50 %	0 %	50 %	0 %	212224957
33229	NC_011529	ATA	2	6	1678314	1678319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224957
33230	NC_011529	GA	3	6	1678446	1678451	50 %	0 %	50 %	0 %	212224957
33231	NC_011529	GCG	2	6	1678492	1678497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224957
33232	NC_011529	TGCC	2	8	1678508	1678515	0 %	25 %	25 %	50 %	212224957
33233	NC_011529	ACG	2	6	1678618	1678623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224957
33234	NC_011529	GTT	2	6	1678724	1678729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224957
33235	NC_011529	CGA	2	6	1678809	1678814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224958
33236	NC_011529	TGC	2	6	1678820	1678825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224958
33237	NC_011529	CCT	2	6	1678857	1678862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224958
33238	NC_011529	GA	4	8	1678877	1678884	50 %	0 %	50 %	0 %	212224958
33239	NC_011529	GAG	2	6	1678909	1678914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224958
33240	NC_011529	CTA	2	6	1678950	1678955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224958
33241	NC_011529	AGC	2	6	1679023	1679028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224958
33242	NC_011529	AAT	3	9	1679067	1679075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224958
33243	NC_011529	GTG	2	6	1679162	1679167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224958
33244	NC_011529	AGCC	2	8	1679246	1679253	25 %	0 %	25 %	50 %	212224958
33245	NC_011529	ATG	2	6	1679254	1679259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224958
33246	NC_011529	GAT	2	6	1679313	1679318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224958
33247	NC_011529	CGC	2	6	1679322	1679327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224958
33248	NC_011529	GCA	2	6	1679357	1679362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224958
33249	NC_011529	AGCC	2	8	1679533	1679540	25 %	0 %	25 %	50 %	212224958
33250	NC_011529	AGG	2	6	1679555	1679560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224958
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33252	NC_011529	AAG	2	6	1679617	1679622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224958
33253	NC_011529	AACC	2	8	1679739	1679746	50 %	0 %	0 %	50 %	212224958
33254	NC_011529	TGC	2	6	1679841	1679846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224958
33255	NC_011529	GGA	3	9	1679874	1679882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224958
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33263	NC_011529	AAT	2	6	1680327	1680332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224958
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33265	NC_011529	GA	3	6	1680390	1680395	50 %	0 %	50 %	0 %	212224958
33266	NC_011529	CGA	2	6	1680396	1680401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224958
33267	NC_011529	AAGGC	2	10	1680446	1680455	40 %	0 %	40 %	20 %	212224958
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33269	NC_011529	TAC	2	6	1680493	1680498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224958
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33272	NC_011529	GAAGC	2	10	1680565	1680574	40 %	0 %	40 %	20 %	212224958
33273	NC_011529	GGT	2	6	1680628	1680633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33274	NC_011529	GAGCTT	2	12	1680694	1680705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212224959
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33280	NC_011529	CT	3	6	1680977	1680982	0 %	50 %	0 %	50 %	212224960
33281	NC_011529	CCAA	2	8	1680983	1680990	50 %	0 %	0 %	50 %	212224960
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33288	NC_011529	TTA	2	6	1681704	1681709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33289	NC_011529	AT	3	6	1681721	1681726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33290	NC_011529	ATG	2	6	1681764	1681769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33305	NC_011529	CCT	2	6	1682541	1682546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224962
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33308	NC_011529	TGA	2	6	1682652	1682657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224962
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33326	NC_011529	GCAA	2	8	1683556	1683563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33327	NC_011529	GGT	2	6	1683618	1683623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33328	NC_011529	TGAA	2	8	1683626	1683633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33329	NC_011529	GAG	2	6	1683698	1683703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33330	NC_011529	CT	4	8	1683814	1683821	0 %	50 %	0 %	50 %	212224963
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33333	NC_011529	TTC	2	6	1683902	1683907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224963
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33337	NC_011529	CCGGG	2	10	1684035	1684044	0 %	0 %	60 %	40 %	212224963
33338	NC_011529	TCT	2	6	1684056	1684061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224963
33339	NC_011529	TCCAGC	2	12	1684076	1684087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212224963
33340	NC_011529	ATG	2	6	1684088	1684093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224963
33341	NC_011529	TCC	2	6	1684100	1684105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224963
33342	NC_011529	CTC	2	6	1684178	1684183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224963
33343	NC_011529	GGA	2	6	1684194	1684199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224963
33344	NC_011529	TCA	2	6	1684205	1684210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224963
33345	NC_011529	GT	3	6	1684246	1684251	0 %	50 %	50 %	0 %	212224963
33346	NC_011529	TCTT	2	8	1684254	1684261	0 %	75 %	0 %	25 %	212224963
33347	NC_011529	TC	3	6	1684281	1684286	0 %	50 %	0 %	50 %	212224963
33348	NC_011529	GAA	3	9	1684303	1684311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224963
33349	NC_011529	CCCAG	2	10	1684371	1684380	20 %	0 %	20 %	60 %	212224963
33350	NC_011529	GCG	2	6	1684385	1684390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224963
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33352	NC_011529	AGCC	2	8	1684490	1684497	25 %	0 %	25 %	50 %	212224963
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33354	NC_011529	TCG	2	6	1684670	1684675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224963
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33442	NC_011529	GACAG	2	10	1689524	1689533	40 %	0 %	40 %	20 %	212224967
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33470	NC_011529	CTT	2	6	1690762	1690767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224967
33471	NC_011529	CG	3	6	1690856	1690861	0 %	0 %	50 %	50 %	212224967
33472	NC_011529	TCC	2	6	1690894	1690899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224967
33473	NC_011529	TGA	2	6	1690903	1690908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224967
33474	NC_011529	GAA	2	6	1690913	1690918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224967
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33476	NC_011529	TGA	2	6	1691017	1691022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224967
33477	NC_011529	TC	3	6	1691040	1691045	0 %	50 %	0 %	50 %	212224967
33478	NC_011529	CGTT	2	8	1691101	1691108	0 %	50 %	25 %	25 %	212224967
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33493	NC_011529	TCG	2	6	1691898	1691903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224967
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33497	NC_011529	CTT	3	9	1691951	1691959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224967
33498	NC_011529	TCA	2	6	1692004	1692009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224967
33499	NC_011529	GCTCGA	2	12	1692010	1692021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212224967
33500	NC_011529	CGT	2	6	1692058	1692063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224967

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