MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_011529	GGC	2	6	1592209	1592214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224875
31502	NC_011529	TGAT	2	8	1592216	1592223	25 %	50 %	25 %	0 %	212224875
31503	NC_011529	GAG	2	6	1592228	1592233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224875
31504	NC_011529	GAG	2	6	1592239	1592244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224875
31505	NC_011529	CAT	2	6	1592344	1592349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224875
31506	NC_011529	GTT	2	6	1592371	1592376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224875
31507	NC_011529	TAG	2	6	1592396	1592401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224875
31508	NC_011529	GAG	2	6	1592413	1592418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224875
31509	NC_011529	CTG	2	6	1592449	1592454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224875
31510	NC_011529	GAGCT	2	10	1592486	1592495	20 %	20 %	40 %	20 %	212224875
31511	NC_011529	TCCT	2	8	1592497	1592504	0 %	50 %	0 %	50 %	212224875
31512	NC_011529	GT	3	6	1592637	1592642	0 %	50 %	50 %	0 %	212224875
31513	NC_011529	GGT	2	6	1592662	1592667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224875
31514	NC_011529	CCA	2	6	1592684	1592689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224875
31515	NC_011529	ATG	2	6	1592714	1592719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224875
31516	NC_011529	TTC	2	6	1592738	1592743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224875
31517	NC_011529	ACC	2	6	1592750	1592755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224875
31518	NC_011529	ATA	2	6	1592841	1592846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31519	NC_011529	GTT	2	6	1592856	1592861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31520	NC_011529	ATT	2	6	1592869	1592874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31521	NC_011529	CAA	2	6	1593000	1593005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31522	NC_011529	ACA	2	6	1593051	1593056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224876
31523	NC_011529	ATC	2	6	1593107	1593112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224876
31524	NC_011529	CAC	2	6	1593127	1593132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224876
31525	NC_011529	ACTC	2	8	1593180	1593187	25 %	25 %	0 %	50 %	212224876
31526	NC_011529	CAC	2	6	1593193	1593198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224876
31527	NC_011529	CAA	2	6	1593214	1593219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224876
31528	NC_011529	A	6	6	1593238	1593243	100 %	0 %	0 %	0 %	212224876
31529	NC_011529	CAC	2	6	1593322	1593327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224877
31530	NC_011529	TTTTCC	2	12	1593339	1593350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224877
31531	NC_011529	CT	3	6	1593375	1593380	0 %	50 %	0 %	50 %	212224877
31532	NC_011529	AGG	2	6	1593389	1593394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224877
31533	NC_011529	AGG	2	6	1593440	1593445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224877
31534	NC_011529	AAT	2	6	1593458	1593463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224877
31535	NC_011529	CTT	2	6	1593488	1593493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224877
31536	NC_011529	TCC	2	6	1593501	1593506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224877
31537	NC_011529	TCC	2	6	1593529	1593534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224877
31538	NC_011529	CTC	2	6	1593620	1593625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224877
31539	NC_011529	AT	3	6	1593626	1593631	50 %	50 %	0 %	0 %	212224877
31540	NC_011529	CTC	2	6	1593632	1593637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224877
31541	NC_011529	AG	3	6	1593663	1593668	50 %	0 %	50 %	0 %	212224877
31542	NC_011529	ACC	2	6	1593707	1593712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224877
31543	NC_011529	CTT	2	6	1593748	1593753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224877
31544	NC_011529	CTT	2	6	1593892	1593897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224877
31545	NC_011529	TGCACT	2	12	1593971	1593982	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212224877
31546	NC_011529	GTA	2	6	1594010	1594015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224877
31547	NC_011529	ATA	2	6	1594082	1594087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224877
31548	NC_011529	AAAG	2	8	1594123	1594130	75 %	0 %	25 %	0 %	212224877
31549	NC_011529	CTT	2	6	1594168	1594173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224877
31550	NC_011529	GGAA	2	8	1594190	1594197	50 %	0 %	50 %	0 %	212224877
31551	NC_011529	ATT	2	6	1594208	1594213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224877
31552	NC_011529	TTA	2	6	1594317	1594322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224877
31553	NC_011529	ACCA	2	8	1594351	1594358	50 %	0 %	0 %	50 %	212224877
31554	NC_011529	TGA	2	6	1594390	1594395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224877
31555	NC_011529	TCC	2	6	1594407	1594412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224877
31556	NC_011529	TCA	2	6	1594413	1594418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224877
31557	NC_011529	CCA	2	6	1594558	1594563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224877
31558	NC_011529	GTA	2	6	1594592	1594597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224877
31559	NC_011529	AGG	2	6	1594643	1594648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224877
31560	NC_011529	CCA	2	6	1594680	1594685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224877
31561	NC_011529	TCA	2	6	1594689	1594694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224877
31562	NC_011529	ACT	2	6	1594743	1594748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224877
31563	NC_011529	CAT	2	6	1594798	1594803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224877
31564	NC_011529	CAG	2	6	1594816	1594821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224877
31565	NC_011529	CCT	2	6	1594905	1594910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31566	NC_011529	TTA	2	6	1594936	1594941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31567	NC_011529	AT	3	6	1594967	1594972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31568	NC_011529	TGCATC	2	12	1594978	1594989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31569	NC_011529	AAC	2	6	1595030	1595035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31570	NC_011529	CTT	2	6	1595098	1595103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224878
31571	NC_011529	AGA	2	6	1595157	1595162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224878
31572	NC_011529	TGG	2	6	1595220	1595225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224878
31573	NC_011529	GAT	2	6	1595226	1595231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224878
31574	NC_011529	GAG	2	6	1595255	1595260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224878
31575	NC_011529	GCTG	2	8	1595291	1595298	0 %	25 %	50 %	25 %	212224879
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31577	NC_011529	CAT	2	6	1595340	1595345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224879
31578	NC_011529	GGA	2	6	1595352	1595357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224879
31579	NC_011529	CGA	2	6	1595397	1595402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224879
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31581	NC_011529	TGA	2	6	1595520	1595525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224879
31582	NC_011529	TTC	2	6	1595711	1595716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224880
31583	NC_011529	AG	3	6	1595731	1595736	50 %	0 %	50 %	0 %	212224880
31584	NC_011529	TGA	2	6	1595761	1595766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224880
31585	NC_011529	AAG	2	6	1595798	1595803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224880
31586	NC_011529	CGA	2	6	1595812	1595817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224880
31587	NC_011529	CTT	2	6	1595839	1595844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224880
31588	NC_011529	GAC	2	6	1595900	1595905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224880
31589	NC_011529	TCC	2	6	1595968	1595973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224880
31590	NC_011529	GGCA	2	8	1596041	1596048	25 %	0 %	50 %	25 %	212224880
31591	NC_011529	GAT	2	6	1596064	1596069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224880
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31593	NC_011529	TGGA	2	8	1596110	1596117	25 %	25 %	50 %	0 %	212224880
31594	NC_011529	TTC	2	6	1596143	1596148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224880
31595	NC_011529	GA	3	6	1596491	1596496	50 %	0 %	50 %	0 %	212224880
31596	NC_011529	GAG	2	6	1596602	1596607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224880
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31598	NC_011529	GGA	2	6	1596850	1596855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224880
31599	NC_011529	CAT	2	6	1596868	1596873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224880
31600	NC_011529	AAG	3	9	1596950	1596958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224880
31601	NC_011529	AGG	2	6	1597047	1597052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224880
31602	NC_011529	TCG	2	6	1597089	1597094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224880
31603	NC_011529	AGG	2	6	1597098	1597103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224880
31604	NC_011529	GAAG	2	8	1597108	1597115	50 %	0 %	50 %	0 %	212224880
31605	NC_011529	AGG	2	6	1597122	1597127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224880
31606	NC_011529	CGT	2	6	1597138	1597143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224880
31607	NC_011529	CTA	2	6	1597186	1597191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224880
31608	NC_011529	GACCG	2	10	1597259	1597268	20 %	0 %	40 %	40 %	212224880
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31615	NC_011529	AG	3	6	1597600	1597605	50 %	0 %	50 %	0 %	212224880
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31852	NC_011529	AGGA	2	8	1609104	1609111	50 %	0 %	50 %	0 %	212224894
31853	NC_011529	CGG	2	6	1609138	1609143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224894
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31968	NC_011529	GGA	2	6	1614623	1614628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224900
31969	NC_011529	AGC	2	6	1614700	1614705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224900
31970	NC_011529	ATA	2	6	1614708	1614713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224900
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31972	NC_011529	AGG	2	6	1614757	1614762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224900
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31975	NC_011529	CGA	2	6	1614935	1614940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224900
31976	NC_011529	AAG	2	6	1614945	1614950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224900
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31980	NC_011529	TCG	2	6	1615024	1615029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224900
31981	NC_011529	AG	3	6	1615079	1615084	50 %	0 %	50 %	0 %	212224900
31982	NC_011529	GGC	2	6	1615103	1615108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224900
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31992	NC_011529	TCC	2	6	1615464	1615469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224901
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31995	NC_011529	CGT	2	6	1615576	1615581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224901
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31998	NC_011529	TAC	2	6	1615745	1615750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224901
31999	NC_011529	CT	3	6	1615770	1615775	0 %	50 %	0 %	50 %	212224901
32000	NC_011529	GAA	2	6	1615777	1615782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224901

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