MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_011529	TAAT	2	8	1568087	1568094	50 %	50 %	0 %	0 %	212224853
31002	NC_011529	CTG	2	6	1568110	1568115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224853
31003	NC_011529	T	7	7	1568132	1568138	0 %	100 %	0 %	0 %	212224853
31004	NC_011529	GTCCA	2	10	1568205	1568214	20 %	20 %	20 %	40 %	212224853
31005	NC_011529	ATG	2	6	1568230	1568235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224853
31006	NC_011529	AT	3	6	1568264	1568269	50 %	50 %	0 %	0 %	212224853
31007	NC_011529	GCT	2	6	1568377	1568382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224853
31008	NC_011529	TTA	2	6	1568411	1568416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224853
31009	NC_011529	TTA	2	6	1568459	1568464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224853
31010	NC_011529	TCT	2	6	1568496	1568501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224853
31011	NC_011529	TA	3	6	1568549	1568554	50 %	50 %	0 %	0 %	212224853
31012	NC_011529	TGG	2	6	1568561	1568566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224853
31013	NC_011529	GGC	2	6	1568604	1568609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224853
31014	NC_011529	TA	3	6	1568612	1568617	50 %	50 %	0 %	0 %	212224853
31015	NC_011529	GTA	2	6	1568640	1568645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224853
31016	NC_011529	TTA	2	6	1568747	1568752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224853
31017	NC_011529	CTGT	2	8	1568813	1568820	0 %	50 %	25 %	25 %	212224853
31018	NC_011529	GAA	2	6	1568835	1568840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224853
31019	NC_011529	TGT	2	6	1568970	1568975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224853
31020	NC_011529	ACA	2	6	1569091	1569096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224853
31021	NC_011529	CTTT	2	8	1569153	1569160	0 %	75 %	0 %	25 %	212224853
31022	NC_011529	T	7	7	1569158	1569164	0 %	100 %	0 %	0 %	212224853
31023	NC_011529	TC	4	8	1569176	1569183	0 %	50 %	0 %	50 %	212224853
31024	NC_011529	ACA	2	6	1569223	1569228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224853
31025	NC_011529	A	6	6	1569312	1569317	100 %	0 %	0 %	0 %	212224853
31026	NC_011529	CCA	2	6	1569407	1569412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31027	NC_011529	CAG	2	6	1569431	1569436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224854
31028	NC_011529	CAG	2	6	1569452	1569457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224854
31029	NC_011529	ATG	2	6	1569462	1569467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224854
31030	NC_011529	CTT	2	6	1569652	1569657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224854
31031	NC_011529	TCA	2	6	1569679	1569684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224854
31032	NC_011529	GAG	2	6	1569752	1569757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224854
31033	NC_011529	GAG	2	6	1569806	1569811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224854
31034	NC_011529	TGA	2	6	1569826	1569831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224854
31035	NC_011529	GAG	2	6	1569845	1569850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224854
31036	NC_011529	CCA	2	6	1569903	1569908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224854
31037	NC_011529	TGG	2	6	1569978	1569983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224854
31038	NC_011529	AAG	2	6	1569984	1569989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224854
31039	NC_011529	AGGG	2	8	1570068	1570075	25 %	0 %	75 %	0 %	212224854
31040	NC_011529	CTC	2	6	1570087	1570092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224854
31041	NC_011529	CGA	2	6	1570111	1570116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224854
31042	NC_011529	GAG	2	6	1570127	1570132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224854
31043	NC_011529	CGA	2	6	1570141	1570146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224854
31044	NC_011529	CTC	2	6	1570157	1570162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224854
31045	NC_011529	CTT	2	6	1570231	1570236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224855
31046	NC_011529	TTC	2	6	1570286	1570291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224855
31047	NC_011529	CAT	2	6	1570300	1570305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224855
31048	NC_011529	CGC	2	6	1570327	1570332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224855
31049	NC_011529	CGTAGA	2	12	1570390	1570401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212224855
31050	NC_011529	CT	3	6	1570436	1570441	0 %	50 %	0 %	50 %	212224855
31051	NC_011529	GA	3	6	1570456	1570461	50 %	0 %	50 %	0 %	212224855
31052	NC_011529	GAG	2	6	1570496	1570501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224855
31053	NC_011529	TGT	2	6	1570525	1570530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224855
31054	NC_011529	AGT	2	6	1570655	1570660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224855
31055	NC_011529	C	6	6	1570737	1570742	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31056	NC_011529	CTC	2	6	1570779	1570784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224856
31057	NC_011529	CCA	2	6	1570795	1570800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224856
31058	NC_011529	CTC	2	6	1570805	1570810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224856
31059	NC_011529	CAT	2	6	1570927	1570932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224856
31060	NC_011529	CTG	2	6	1570984	1570989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224856
31061	NC_011529	ATG	2	6	1571019	1571024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224856
31062	NC_011529	GCTT	2	8	1571029	1571036	0 %	50 %	25 %	25 %	212224856
31063	NC_011529	AGA	2	6	1571068	1571073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224856
31064	NC_011529	ATC	2	6	1571118	1571123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224856
31065	NC_011529	CCT	2	6	1571173	1571178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224856
31066	NC_011529	TAG	2	6	1571214	1571219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224856
31067	NC_011529	GCT	2	6	1571263	1571268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224856
31068	NC_011529	TTACC	2	10	1571278	1571287	20 %	40 %	0 %	40 %	212224856
31069	NC_011529	CAG	2	6	1571318	1571323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224856
31070	NC_011529	CGTCT	2	10	1571405	1571414	0 %	40 %	20 %	40 %	212224856
31071	NC_011529	GTA	2	6	1571462	1571467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224856
31072	NC_011529	TTCCC	2	10	1571494	1571503	0 %	40 %	0 %	60 %	212224856
31073	NC_011529	GGT	3	9	1571512	1571520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224856
31074	NC_011529	TCG	2	6	1571523	1571528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224856
31075	NC_011529	GTG	2	6	1571546	1571551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224856
31076	NC_011529	CGA	2	6	1571572	1571577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224856
31077	NC_011529	AGT	2	6	1571584	1571589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224856
31078	NC_011529	AGG	2	6	1571607	1571612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224856
31079	NC_011529	CGA	2	6	1571713	1571718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224856
31080	NC_011529	CT	3	6	1571721	1571726	0 %	50 %	0 %	50 %	212224856
31081	NC_011529	AGC	2	6	1571785	1571790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224856
31082	NC_011529	TAT	2	6	1571843	1571848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224856
31083	NC_011529	AGT	2	6	1571920	1571925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224856
31084	NC_011529	TGACCA	2	12	1571992	1572003	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212224856
31085	NC_011529	CCT	2	6	1572071	1572076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224856
31086	NC_011529	GTC	2	6	1572089	1572094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224856
31087	NC_011529	CGG	2	6	1572119	1572124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224856
31088	NC_011529	CCCT	2	8	1572171	1572178	0 %	25 %	0 %	75 %	212224856
31089	NC_011529	CTT	2	6	1572182	1572187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224856
31090	NC_011529	GCC	2	6	1572286	1572291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224857
31091	NC_011529	TCC	2	6	1572353	1572358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224857
31092	NC_011529	ACG	2	6	1572410	1572415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224857
31093	NC_011529	CTC	2	6	1572639	1572644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224857
31094	NC_011529	CGA	2	6	1572678	1572683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224857
31095	NC_011529	TCC	2	6	1572695	1572700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224857
31096	NC_011529	GAG	2	6	1572721	1572726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224857
31097	NC_011529	ATA	2	6	1572841	1572846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224857
31098	NC_011529	TCT	2	6	1573061	1573066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224857
31099	NC_011529	TCCG	2	8	1573105	1573112	0 %	25 %	25 %	50 %	212224857
31100	NC_011529	TGA	2	6	1573121	1573126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224857
31101	NC_011529	TCA	2	6	1573223	1573228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224858
31102	NC_011529	GGC	2	6	1573237	1573242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224858
31103	NC_011529	ATC	2	6	1573258	1573263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224858
31104	NC_011529	GCC	2	6	1573335	1573340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224858
31105	NC_011529	CT	3	6	1573362	1573367	0 %	50 %	0 %	50 %	212224858
31106	NC_011529	GTA	2	6	1573434	1573439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224858
31107	NC_011529	TTC	2	6	1573492	1573497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224858
31108	NC_011529	ATG	2	6	1573501	1573506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224858
31109	NC_011529	GTG	2	6	1573509	1573514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224858
31110	NC_011529	GTA	2	6	1573584	1573589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224858
31111	NC_011529	CTT	3	9	1573644	1573652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224858
31112	NC_011529	TGA	2	6	1573670	1573675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224858
31113	NC_011529	GCC	2	6	1573699	1573704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224858
31114	NC_011529	G	6	6	1573730	1573735	0 %	0 %	100 %	0 %	212224858
31115	NC_011529	TCC	2	6	1573763	1573768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224858
31116	NC_011529	GAG	2	6	1573845	1573850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224858
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31233	NC_011529	GAC	2	6	1579058	1579063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224864
31234	NC_011529	CTG	2	6	1579169	1579174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224864
31235	NC_011529	GA	3	6	1579277	1579282	50 %	0 %	50 %	0 %	212224865
31236	NC_011529	CTT	2	6	1579310	1579315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224865
31237	NC_011529	GCA	2	6	1579500	1579505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224865
31238	NC_011529	GTG	2	6	1579512	1579517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224865
31239	NC_011529	CTT	2	6	1579520	1579525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224865
31240	NC_011529	CTG	2	6	1579668	1579673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224865
31241	NC_011529	AAG	2	6	1579842	1579847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31245	NC_011529	CTG	2	6	1579971	1579976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224866
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31309	NC_011529	ATA	2	6	1583368	1583373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31322	NC_011529	GGCT	2	8	1584078	1584085	0 %	25 %	50 %	25 %	212224867
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31335	NC_011529	AGCTC	2	10	1584649	1584658	20 %	20 %	20 %	40 %	212224867
31336	NC_011529	ACG	2	6	1584682	1584687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224867
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31340	NC_011529	GAG	2	6	1584798	1584803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224867
31341	NC_011529	TCC	2	6	1584844	1584849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224867
31342	NC_011529	CGA	2	6	1584881	1584886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224867
31343	NC_011529	CG	3	6	1584896	1584901	0 %	0 %	50 %	50 %	212224867
31344	NC_011529	GAG	2	6	1584906	1584911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224867
31345	NC_011529	GGC	2	6	1584957	1584962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224867
31346	NC_011529	GC	3	6	1585002	1585007	0 %	0 %	50 %	50 %	212224867
31347	NC_011529	CTGA	2	8	1585026	1585033	25 %	25 %	25 %	25 %	212224867
31348	NC_011529	GCTGA	2	10	1585089	1585098	20 %	20 %	40 %	20 %	212224867
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31452	NC_011529	AG	3	6	1589764	1589769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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31466	NC_011529	GAT	2	6	1590396	1590401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224872
31467	NC_011529	GTT	2	6	1590412	1590417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224872
31468	NC_011529	ATCT	2	8	1590421	1590428	25 %	50 %	0 %	25 %	212224872
31469	NC_011529	T	6	6	1590461	1590466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31470	NC_011529	GA	3	6	1590594	1590599	50 %	0 %	50 %	0 %	212224873
31471	NC_011529	GAG	2	6	1590677	1590682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224873
31472	NC_011529	GAG	2	6	1590687	1590692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224873
31473	NC_011529	AGC	2	6	1590700	1590705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224873
31474	NC_011529	GGA	2	6	1590730	1590735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224873
31475	NC_011529	TAC	2	6	1590822	1590827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224873
31476	NC_011529	GAA	2	6	1590849	1590854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224873
31477	NC_011529	AG	3	6	1590873	1590878	50 %	0 %	50 %	0 %	212224873
31478	NC_011529	CTC	2	6	1590945	1590950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224873
31479	NC_011529	TGA	2	6	1591046	1591051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224873
31480	NC_011529	TGA	2	6	1591060	1591065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224873
31481	NC_011529	AAG	2	6	1591077	1591082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224873
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31483	NC_011529	GGA	2	6	1591208	1591213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224873
31484	NC_011529	GGA	2	6	1591238	1591243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224873
31485	NC_011529	CTC	2	6	1591272	1591277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224873
31486	NC_011529	ACT	2	6	1591336	1591341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224873
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31489	NC_011529	GAA	2	6	1591613	1591618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224873
31490	NC_011529	AAG	2	6	1591659	1591664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224873
31491	NC_011529	AAG	2	6	1591716	1591721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224873
31492	NC_011529	CTC	2	6	1591830	1591835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224874
31493	NC_011529	TCT	2	6	1591837	1591842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224874
31494	NC_011529	CTTT	2	8	1591864	1591871	0 %	75 %	0 %	25 %	212224874
31495	NC_011529	TCC	2	6	1591875	1591880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224874
31496	NC_011529	TCT	2	6	1591932	1591937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224874
31497	NC_011529	A	6	6	1591965	1591970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31498	NC_011529	AGT	2	6	1592010	1592015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224875
31499	NC_011529	CAC	3	9	1592131	1592139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224875
31500	NC_011529	CGT	2	6	1592152	1592157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224875

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