MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_011529	GAT	2	6	1540534	1540539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224826
30502	NC_011529	GAAAA	2	10	1540564	1540573	80 %	0 %	20 %	0 %	212224826
30503	NC_011529	A	6	6	1540570	1540575	100 %	0 %	0 %	0 %	212224826
30504	NC_011529	CTT	2	6	1540646	1540651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224826
30505	NC_011529	A	6	6	1540726	1540731	100 %	0 %	0 %	0 %	212224826
30506	NC_011529	CCT	2	6	1540762	1540767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224826
30507	NC_011529	AT	3	6	1540894	1540899	50 %	50 %	0 %	0 %	212224826
30508	NC_011529	GAG	3	9	1540930	1540938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224826
30509	NC_011529	AGG	2	6	1540945	1540950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224826
30510	NC_011529	GATC	2	8	1540980	1540987	25 %	25 %	25 %	25 %	212224826
30511	NC_011529	CGG	2	6	1541017	1541022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224826
30512	NC_011529	GAT	2	6	1541046	1541051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224826
30513	NC_011529	AGG	2	6	1541054	1541059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224826
30514	NC_011529	CAC	2	6	1541063	1541068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224826
30515	NC_011529	GAT	2	6	1541103	1541108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224826
30516	NC_011529	CGA	2	6	1541154	1541159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224826
30517	NC_011529	GAG	2	6	1541167	1541172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224826
30518	NC_011529	AG	3	6	1541293	1541298	50 %	0 %	50 %	0 %	212224826
30519	NC_011529	AGG	2	6	1541305	1541310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224826
30520	NC_011529	CCA	2	6	1541399	1541404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224826
30521	NC_011529	AAGA	2	8	1541422	1541429	75 %	0 %	25 %	0 %	212224826
30522	NC_011529	TCA	2	6	1541450	1541455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224826
30523	NC_011529	CTG	2	6	1541488	1541493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224826
30524	NC_011529	TCG	2	6	1541537	1541542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224826
30525	NC_011529	C	6	6	1541598	1541603	0 %	0 %	0 %	100 %	212224826
30526	NC_011529	GAGC	2	8	1541604	1541611	25 %	0 %	50 %	25 %	212224826
30527	NC_011529	TCA	2	6	1541615	1541620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224826
30528	NC_011529	GAT	2	6	1541719	1541724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224826
30529	NC_011529	ATC	2	6	1541761	1541766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224826
30530	NC_011529	CAGGT	2	10	1541944	1541953	20 %	20 %	40 %	20 %	212224826
30531	NC_011529	CAG	2	6	1541958	1541963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224826
30532	NC_011529	GAA	2	6	1541964	1541969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224826
30533	NC_011529	CAC	2	6	1542118	1542123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224826
30534	NC_011529	AAAAG	2	10	1542156	1542165	80 %	0 %	20 %	0 %	212224826
30535	NC_011529	AAT	2	6	1542171	1542176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224826
30536	NC_011529	TAC	2	6	1542226	1542231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224826
30537	NC_011529	TGA	2	6	1542249	1542254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224826
30538	NC_011529	AAG	2	6	1542268	1542273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224826
30539	NC_011529	CAG	2	6	1542300	1542305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224826
30540	NC_011529	AGA	2	6	1542417	1542422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224827
30541	NC_011529	AAAGG	2	10	1542488	1542497	60 %	0 %	40 %	0 %	212224827
30542	NC_011529	AGA	2	6	1542527	1542532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224827
30543	NC_011529	CTT	2	6	1542635	1542640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224827
30544	NC_011529	GATA	2	8	1542773	1542780	50 %	25 %	25 %	0 %	212224827
30545	NC_011529	TGG	2	6	1542812	1542817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224827
30546	NC_011529	ATG	2	6	1542846	1542851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224827
30547	NC_011529	GTC	2	6	1542864	1542869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224827
30548	NC_011529	GA	3	6	1542876	1542881	50 %	0 %	50 %	0 %	212224827
30549	NC_011529	GAG	2	6	1542987	1542992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224827
30550	NC_011529	TCC	2	6	1543026	1543031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224827
30551	NC_011529	CGA	2	6	1543055	1543060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224827
30552	NC_011529	GTT	2	6	1543089	1543094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224827
30553	NC_011529	TGG	2	6	1543121	1543126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224827
30554	NC_011529	AGA	2	6	1543157	1543162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224827
30555	NC_011529	TCG	3	9	1543264	1543272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224827
30556	NC_011529	GCC	2	6	1543313	1543318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224827
30557	NC_011529	TCA	2	6	1543366	1543371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224827
30558	NC_011529	AAG	2	6	1543386	1543391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224827
30559	NC_011529	TCA	2	6	1543427	1543432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224828
30560	NC_011529	CGC	2	6	1543609	1543614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224828
30561	NC_011529	AAG	2	6	1543829	1543834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224828
30562	NC_011529	ATG	2	6	1543907	1543912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224828
30563	NC_011529	ACG	2	6	1543974	1543979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224828
30564	NC_011529	TC	3	6	1544088	1544093	0 %	50 %	0 %	50 %	212224828
30565	NC_011529	CTT	2	6	1544156	1544161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224828
30566	NC_011529	CAG	2	6	1544229	1544234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224828
30567	NC_011529	CTG	2	6	1544249	1544254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224828
30568	NC_011529	GGT	2	6	1544380	1544385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224829
30569	NC_011529	GGT	2	6	1544550	1544555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224829
30570	NC_011529	TCT	3	9	1544566	1544574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224829
30571	NC_011529	TAT	2	6	1544615	1544620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224829
30572	NC_011529	CCAACG	2	12	1544625	1544636	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	212224829
30573	NC_011529	CTC	2	6	1544663	1544668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224829
30574	NC_011529	ACGC	2	8	1544818	1544825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30575	NC_011529	AT	3	6	1544859	1544864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30576	NC_011529	AGA	2	6	1544865	1544870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30577	NC_011529	GAG	2	6	1544932	1544937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224830
30578	NC_011529	AGG	2	6	1544957	1544962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224830
30579	NC_011529	CTC	2	6	1545052	1545057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224830
30580	NC_011529	TC	3	6	1545079	1545084	0 %	50 %	0 %	50 %	212224830
30581	NC_011529	ATA	2	6	1545085	1545090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224830
30582	NC_011529	ACT	2	6	1545237	1545242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224831
30583	NC_011529	GAA	2	6	1545249	1545254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224831
30584	NC_011529	GTA	2	6	1545256	1545261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224831
30585	NC_011529	CTT	2	6	1545343	1545348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224831
30586	NC_011529	GAGAAG	2	12	1545433	1545444	50 %	0 %	50 %	0 %	212224831
30587	NC_011529	TCG	2	6	1545446	1545451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224831
30588	NC_011529	TCC	2	6	1545474	1545479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224831
30589	NC_011529	CTT	2	6	1545558	1545563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224831
30590	NC_011529	GTT	2	6	1545637	1545642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224831
30591	NC_011529	ATG	2	6	1545647	1545652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224831
30592	NC_011529	TTG	2	6	1545671	1545676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224831
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30594	NC_011529	CATA	2	8	1545730	1545737	50 %	25 %	0 %	25 %	212224831
30595	NC_011529	TAC	2	6	1545785	1545790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30596	NC_011529	TGA	2	6	1545851	1545856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224832
30597	NC_011529	A	7	7	1545895	1545901	100 %	0 %	0 %	0 %	212224832
30598	NC_011529	GCCCC	2	10	1545902	1545911	0 %	0 %	20 %	80 %	212224832
30599	NC_011529	GCC	2	6	1545934	1545939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224832
30600	NC_011529	CGG	2	6	1545950	1545955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224832
30601	NC_011529	CTTC	2	8	1545963	1545970	0 %	50 %	0 %	50 %	212224832
30602	NC_011529	GA	3	6	1546002	1546007	50 %	0 %	50 %	0 %	212224832
30603	NC_011529	A	6	6	1546094	1546099	100 %	0 %	0 %	0 %	212224832
30604	NC_011529	CAA	2	6	1546140	1546145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224832
30605	NC_011529	TAC	2	6	1546186	1546191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224832
30606	NC_011529	AAC	2	6	1546192	1546197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224832
30607	NC_011529	ACTA	2	8	1546234	1546241	50 %	25 %	0 %	25 %	212224832
30608	NC_011529	TCG	2	6	1546256	1546261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224832
30609	NC_011529	CTA	2	6	1546299	1546304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224832
30610	NC_011529	GAA	2	6	1546332	1546337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224832
30611	NC_011529	AGG	2	6	1546409	1546414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224832
30612	NC_011529	TGT	2	6	1546416	1546421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224832
30613	NC_011529	TA	3	6	1546425	1546430	50 %	50 %	0 %	0 %	212224832
30614	NC_011529	GAACGT	2	12	1546506	1546517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212224832
30615	NC_011529	CGTT	2	8	1546535	1546542	0 %	50 %	25 %	25 %	212224832
30616	NC_011529	TCG	2	6	1546674	1546679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224833
30617	NC_011529	TTCT	2	8	1546766	1546773	0 %	75 %	0 %	25 %	212224833
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30692	NC_011529	GGT	2	6	1550739	1550744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30716	NC_011529	CTTT	2	8	1552257	1552264	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30717	NC_011529	CTC	2	6	1552306	1552311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30731	NC_011529	GTC	2	6	1552845	1552850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224840
30732	NC_011529	GAAGC	2	10	1552878	1552887	40 %	0 %	40 %	20 %	212224840
30733	NC_011529	GCCT	2	8	1552940	1552947	0 %	25 %	25 %	50 %	212224840
30734	NC_011529	ATC	2	6	1552981	1552986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224840
30735	NC_011529	TCC	2	6	1552998	1553003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224840
30736	NC_011529	CGT	2	6	1553007	1553012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224840
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30740	NC_011529	TGC	2	6	1553351	1553356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224840
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30744	NC_011529	TC	3	6	1553550	1553555	0 %	50 %	0 %	50 %	212224840
30745	NC_011529	AGA	2	6	1553582	1553587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224840
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30752	NC_011529	GT	3	6	1553808	1553813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30753	NC_011529	GGT	2	6	1553841	1553846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30754	NC_011529	CAT	2	6	1553847	1553852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224841
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30760	NC_011529	AC	3	6	1554134	1554139	50 %	0 %	0 %	50 %	212224841
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30764	NC_011529	ATA	2	6	1554531	1554536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30765	NC_011529	CGT	2	6	1554560	1554565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224842
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30826	NC_011529	TAA	3	9	1557869	1557877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224844
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30834	NC_011529	TGGC	2	8	1558294	1558301	0 %	25 %	50 %	25 %	212224844
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30839	NC_011529	GGCC	2	8	1558461	1558468	0 %	0 %	50 %	50 %	212224845
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30845	NC_011529	CTG	2	6	1558869	1558874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224845
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30847	NC_011529	CTG	2	6	1558902	1558907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224845
30848	NC_011529	GCGA	2	8	1559029	1559036	25 %	0 %	50 %	25 %	212224845
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30850	NC_011529	CAA	2	6	1559102	1559107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224845
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