MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_011529	TGT	2	6	1516442	1516447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224803
30002	NC_011529	GAC	2	6	1516464	1516469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224803
30003	NC_011529	TC	3	6	1516585	1516590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30004	NC_011529	TCT	2	6	1516614	1516619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30005	NC_011529	A	6	6	1516634	1516639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30006	NC_011529	GGT	2	6	1516643	1516648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30007	NC_011529	TAA	2	6	1516733	1516738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224804
30008	NC_011529	CAA	2	6	1516763	1516768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224804
30009	NC_011529	GTT	2	6	1516803	1516808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224804
30010	NC_011529	CGA	2	6	1516868	1516873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224804
30011	NC_011529	GC	3	6	1516963	1516968	0 %	0 %	50 %	50 %	212224804
30012	NC_011529	GAT	2	6	1516973	1516978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224804
30013	NC_011529	AAC	2	6	1516988	1516993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224804
30014	NC_011529	CTT	2	6	1517012	1517017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224804
30015	NC_011529	AGG	2	6	1517113	1517118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224804
30016	NC_011529	CCT	2	6	1517219	1517224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224804
30017	NC_011529	GGT	2	6	1517333	1517338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224804
30018	NC_011529	GAC	2	6	1517346	1517351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224804
30019	NC_011529	ATA	2	6	1517376	1517381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224804
30020	NC_011529	CAG	2	6	1517402	1517407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224804
30021	NC_011529	GCG	2	6	1517479	1517484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224804
30022	NC_011529	CTT	2	6	1517502	1517507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224804
30023	NC_011529	CAA	3	9	1517552	1517560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224804
30024	NC_011529	CTC	2	6	1517595	1517600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224804
30025	NC_011529	AGGC	2	8	1517692	1517699	25 %	0 %	50 %	25 %	212224804
30026	NC_011529	AGG	2	6	1517707	1517712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224804
30027	NC_011529	CAA	2	6	1517744	1517749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224804
30028	NC_011529	TAA	2	6	1517768	1517773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224804
30029	NC_011529	TCA	2	6	1517776	1517781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224804
30030	NC_011529	ATT	2	6	1517861	1517866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224804
30031	NC_011529	GAG	2	6	1517877	1517882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224804
30032	NC_011529	ATG	2	6	1517893	1517898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224804
30033	NC_011529	ATG	2	6	1517924	1517929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224804
30034	NC_011529	TAC	2	6	1518014	1518019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224805
30035	NC_011529	CTT	2	6	1518049	1518054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224805
30036	NC_011529	T	6	6	1518092	1518097	0 %	100 %	0 %	0 %	212224805
30037	NC_011529	CTC	2	6	1518140	1518145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224805
30038	NC_011529	CTG	2	6	1518183	1518188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224805
30039	NC_011529	GTT	2	6	1518242	1518247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224805
30040	NC_011529	CCT	3	9	1518280	1518288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224805
30041	NC_011529	TC	3	6	1518302	1518307	0 %	50 %	0 %	50 %	212224805
30042	NC_011529	GCC	2	6	1518338	1518343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224805
30043	NC_011529	CTA	2	6	1518361	1518366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224805
30044	NC_011529	TA	3	6	1518380	1518385	50 %	50 %	0 %	0 %	212224805
30045	NC_011529	TGT	2	6	1518409	1518414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224805
30046	NC_011529	CT	3	6	1518473	1518478	0 %	50 %	0 %	50 %	212224805
30047	NC_011529	ATG	2	6	1518512	1518517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224805
30048	NC_011529	AGA	2	6	1518610	1518615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224805
30049	NC_011529	ATCTG	2	10	1518682	1518691	20 %	40 %	20 %	20 %	212224805
30050	NC_011529	TGA	2	6	1518759	1518764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224805
30051	NC_011529	ATTG	2	8	1518817	1518824	25 %	50 %	25 %	0 %	212224805
30052	NC_011529	GAC	2	6	1518827	1518832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224805
30053	NC_011529	GA	3	6	1518851	1518856	50 %	0 %	50 %	0 %	212224805
30054	NC_011529	G	6	6	1518887	1518892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30055	NC_011529	GTT	2	6	1518909	1518914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224806
30056	NC_011529	CTG	2	6	1518937	1518942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224806
30057	NC_011529	GGC	2	6	1518984	1518989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224806
30058	NC_011529	GCC	2	6	1519014	1519019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224806
30059	NC_011529	TA	3	6	1519035	1519040	50 %	50 %	0 %	0 %	212224806
30060	NC_011529	TAAG	2	8	1519045	1519052	50 %	25 %	25 %	0 %	212224806
30061	NC_011529	GCG	2	6	1519174	1519179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224806
30062	NC_011529	AGG	2	6	1519485	1519490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30063	NC_011529	G	6	6	1519561	1519566	0 %	0 %	100 %	0 %	212224807
30064	NC_011529	CGA	2	6	1519711	1519716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224807
30065	NC_011529	CTC	2	6	1519850	1519855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224807
30066	NC_011529	GAA	2	6	1519921	1519926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224807
30067	NC_011529	GGT	2	6	1519927	1519932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224807
30068	NC_011529	GC	3	6	1519972	1519977	0 %	0 %	50 %	50 %	212224807
30069	NC_011529	GCGA	2	8	1520003	1520010	25 %	0 %	50 %	25 %	212224807
30070	NC_011529	GGA	2	6	1520068	1520073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224807
30071	NC_011529	TCT	2	6	1520091	1520096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224807
30072	NC_011529	TAC	2	6	1520130	1520135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224808
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30074	NC_011529	TC	3	6	1520163	1520168	0 %	50 %	0 %	50 %	212224808
30075	NC_011529	TCA	2	6	1520215	1520220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224808
30076	NC_011529	TACCT	2	10	1520416	1520425	20 %	40 %	0 %	40 %	212224808
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30078	NC_011529	CTC	2	6	1520487	1520492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224808
30079	NC_011529	TTA	2	6	1520569	1520574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224808
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30081	NC_011529	TAC	2	6	1520668	1520673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224808
30082	NC_011529	CGC	2	6	1520747	1520752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224808
30083	NC_011529	CT	3	6	1520772	1520777	0 %	50 %	0 %	50 %	212224808
30084	NC_011529	ATG	2	6	1520781	1520786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224808
30085	NC_011529	GAG	2	6	1520811	1520816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224808
30086	NC_011529	TGGAAT	2	12	1520832	1520843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30087	NC_011529	AAG	2	6	1520860	1520865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30088	NC_011529	T	6	6	1520948	1520953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30089	NC_011529	ATT	2	6	1521017	1521022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224809
30090	NC_011529	TGG	2	6	1521088	1521093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224809
30091	NC_011529	GATA	2	8	1521119	1521126	50 %	25 %	25 %	0 %	212224809
30092	NC_011529	AT	4	8	1521210	1521217	50 %	50 %	0 %	0 %	212224809
30093	NC_011529	CTT	2	6	1521238	1521243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224809
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30101	NC_011529	TCC	2	6	1521657	1521662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224809
30102	NC_011529	TA	3	6	1521761	1521766	50 %	50 %	0 %	0 %	212224809
30103	NC_011529	ATTG	2	8	1521821	1521828	25 %	50 %	25 %	0 %	212224809
30104	NC_011529	GTTC	2	8	1521858	1521865	0 %	50 %	25 %	25 %	212224809
30105	NC_011529	TGGA	2	8	1522072	1522079	25 %	25 %	50 %	0 %	212224809
30106	NC_011529	GTT	2	6	1522085	1522090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224809
30107	NC_011529	ATCC	2	8	1522092	1522099	25 %	25 %	0 %	50 %	212224809
30108	NC_011529	GTG	2	6	1522101	1522106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224809
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30110	NC_011529	ATA	2	6	1522212	1522217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224809
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30113	NC_011529	TAC	2	6	1522382	1522387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224809
30114	NC_011529	T	6	6	1522626	1522631	0 %	100 %	0 %	0 %	212224809
30115	NC_011529	GAC	2	6	1522639	1522644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224809
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30118	NC_011529	CAC	2	6	1522698	1522703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224809
30119	NC_011529	TA	3	6	1522776	1522781	50 %	50 %	0 %	0 %	212224809
30120	NC_011529	AG	3	6	1522841	1522846	50 %	0 %	50 %	0 %	212224809
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30162	NC_011529	GAAAA	2	10	1524531	1524540	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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30225	NC_011529	TAT	2	6	1527498	1527503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224814
30226	NC_011529	CCCA	2	8	1527541	1527548	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30227	NC_011529	CGG	2	6	1527603	1527608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30228	NC_011529	TA	3	6	1527615	1527620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30229	NC_011529	CGG	2	6	1527718	1527723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224815
30230	NC_011529	TC	3	6	1527743	1527748	0 %	50 %	0 %	50 %	212224815
30231	NC_011529	TC	3	6	1527774	1527779	0 %	50 %	0 %	50 %	212224815
30232	NC_011529	TGTTC	2	10	1527800	1527809	0 %	60 %	20 %	20 %	212224815
30233	NC_011529	CCG	2	6	1527838	1527843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224815
30234	NC_011529	GTG	2	6	1527855	1527860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224815
30235	NC_011529	TTCATG	2	12	1527936	1527947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212224815
30236	NC_011529	A	6	6	1527982	1527987	100 %	0 %	0 %	0 %	212224815
30237	NC_011529	GTC	2	6	1527999	1528004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224815
30238	NC_011529	ACC	2	6	1528092	1528097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224815
30239	NC_011529	TGC	2	6	1528121	1528126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224815
30240	NC_011529	CTCG	2	8	1528129	1528136	0 %	25 %	25 %	50 %	212224815
30241	NC_011529	CTT	2	6	1528161	1528166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224815
30242	NC_011529	GCT	2	6	1528179	1528184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224815
30243	NC_011529	ACC	2	6	1528217	1528222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224815
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30245	NC_011529	CTT	2	6	1528274	1528279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224815
30246	NC_011529	AGG	2	6	1528344	1528349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224815
30247	NC_011529	TGGC	2	8	1528425	1528432	0 %	25 %	50 %	25 %	212224815
30248	NC_011529	ATG	2	6	1528464	1528469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224815
30249	NC_011529	GCA	2	6	1528497	1528502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224815
30250	NC_011529	TGG	2	6	1528519	1528524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224815
30251	NC_011529	CTG	2	6	1528689	1528694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224815
30252	NC_011529	CCTT	2	8	1528711	1528718	0 %	50 %	0 %	50 %	212224815
30253	NC_011529	ACA	2	6	1528746	1528751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224815
30254	NC_011529	CTG	2	6	1528789	1528794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224815
30255	NC_011529	TCA	2	6	1528836	1528841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224815
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30258	NC_011529	CCT	2	6	1528967	1528972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224815
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30260	NC_011529	AGGG	2	8	1529003	1529010	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30261	NC_011529	A	6	6	1529033	1529038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30262	NC_011529	AAG	2	6	1529227	1529232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224816
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30264	NC_011529	CTG	2	6	1529366	1529371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224816
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30267	NC_011529	TTGG	2	8	1529443	1529450	0 %	50 %	50 %	0 %	212224816
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30286	NC_011529	TTC	2	6	1530483	1530488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30287	NC_011529	GTTTC	2	10	1530553	1530562	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30288	NC_011529	TGG	2	6	1530626	1530631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224817
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30339	NC_011529	AT	3	6	1532778	1532783	50 %	50 %	0 %	0 %	212224819
30340	NC_011529	TAA	2	6	1532797	1532802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30341	NC_011529	TCT	2	6	1532832	1532837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30342	NC_011529	TTCTC	2	10	1532851	1532860	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30343	NC_011529	TCGT	2	8	1532871	1532878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30344	NC_011529	TTC	2	6	1532902	1532907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30345	NC_011529	TAA	2	6	1532915	1532920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30346	NC_011529	TGC	2	6	1532950	1532955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30347	NC_011529	TGA	2	6	1532956	1532961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30348	NC_011529	A	7	7	1533070	1533076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30349	NC_011529	AGG	2	6	1533136	1533141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30350	NC_011529	ATA	2	6	1533194	1533199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224820
30351	NC_011529	CGG	2	6	1533271	1533276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224820
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30354	NC_011529	TA	3	6	1533422	1533427	50 %	50 %	0 %	0 %	212224820
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30470	NC_011529	CCA	2	6	1538964	1538969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224824
30471	NC_011529	TCC	2	6	1539015	1539020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224824
30472	NC_011529	AGC	2	6	1539080	1539085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224824
30473	NC_011529	CTACAC	2	12	1539217	1539228	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	212224824
30474	NC_011529	AGC	2	6	1539259	1539264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224824
30475	NC_011529	AGC	2	6	1539297	1539302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224824
30476	NC_011529	ATGG	2	8	1539312	1539319	25 %	25 %	50 %	0 %	212224824
30477	NC_011529	TGCTCG	2	12	1539351	1539362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224824
30478	NC_011529	CAG	2	6	1539431	1539436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224824
30479	NC_011529	TC	3	6	1539496	1539501	0 %	50 %	0 %	50 %	212224825
30480	NC_011529	TAGT	2	8	1539527	1539534	25 %	50 %	25 %	0 %	212224825
30481	NC_011529	ACA	3	9	1539566	1539574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224825
30482	NC_011529	ACA	2	6	1539689	1539694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224825
30483	NC_011529	GAC	2	6	1539759	1539764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224825
30484	NC_011529	GTT	2	6	1539808	1539813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224825
30485	NC_011529	ACT	2	6	1539836	1539841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224825
30486	NC_011529	CTGT	2	8	1539872	1539879	0 %	50 %	25 %	25 %	212224825
30487	NC_011529	TGA	2	6	1539948	1539953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224825
30488	NC_011529	TAA	2	6	1539962	1539967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224825
30489	NC_011529	TA	3	6	1539978	1539983	50 %	50 %	0 %	0 %	212224825
30490	NC_011529	ACG	2	6	1540067	1540072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224825
30491	NC_011529	TTC	2	6	1540129	1540134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224825
30492	NC_011529	GCA	2	6	1540135	1540140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224825
30493	NC_011529	GGA	2	6	1540218	1540223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224825
30494	NC_011529	TCACC	2	10	1540247	1540256	20 %	20 %	0 %	60 %	212224825
30495	NC_011529	AGA	2	6	1540259	1540264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224825
30496	NC_011529	CTC	2	6	1540265	1540270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224825
30497	NC_011529	TCCC	2	8	1540288	1540295	0 %	25 %	0 %	75 %	212224825
30498	NC_011529	C	7	7	1540360	1540366	0 %	0 %	0 %	100 %	212224825
30499	NC_011529	GAA	2	6	1540479	1540484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224826
30500	NC_011529	AGA	2	6	1540487	1540492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224826

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