MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_011529	AAC	2	6	1442292	1442297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224719
28502	NC_011529	GAT	2	6	1442327	1442332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224719
28503	NC_011529	TCG	2	6	1442548	1442553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224719
28504	NC_011529	GCT	2	6	1442567	1442572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224719
28505	NC_011529	TCG	2	6	1442662	1442667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224719
28506	NC_011529	ACG	2	6	1442673	1442678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224719
28507	NC_011529	GGT	2	6	1442685	1442690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224719
28508	NC_011529	TGG	2	6	1442722	1442727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224719
28509	NC_011529	TCT	2	6	1442728	1442733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224719
28510	NC_011529	CAT	2	6	1442747	1442752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224719
28511	NC_011529	ACG	2	6	1442760	1442765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224719
28512	NC_011529	GGT	2	6	1442859	1442864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28513	NC_011529	AAG	2	6	1442905	1442910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224720
28514	NC_011529	ACC	2	6	1443077	1443082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224720
28515	NC_011529	TGG	2	6	1443113	1443118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224720
28516	NC_011529	CGA	2	6	1443123	1443128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224720
28517	NC_011529	GGA	2	6	1443222	1443227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224720
28518	NC_011529	GGC	2	6	1443335	1443340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224720
28519	NC_011529	GAC	2	6	1443352	1443357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224720
28520	NC_011529	AGGA	2	8	1443382	1443389	50 %	0 %	50 %	0 %	212224720
28521	NC_011529	ACT	2	6	1443395	1443400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224720
28522	NC_011529	CCG	2	6	1443409	1443414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224720
28523	NC_011529	GAA	2	6	1443444	1443449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224720
28524	NC_011529	GTC	2	6	1443460	1443465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224720
28525	NC_011529	GCA	2	6	1443499	1443504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224720
28526	NC_011529	AGA	2	6	1443581	1443586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224720
28527	NC_011529	GA	3	6	1443631	1443636	50 %	0 %	50 %	0 %	212224720
28528	NC_011529	CA	3	6	1443657	1443662	50 %	0 %	0 %	50 %	212224720
28529	NC_011529	GA	3	6	1443715	1443720	50 %	0 %	50 %	0 %	212224720
28530	NC_011529	AG	3	6	1443753	1443758	50 %	0 %	50 %	0 %	212224720
28531	NC_011529	GGA	2	6	1443833	1443838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224720
28532	NC_011529	CGG	2	6	1443909	1443914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224720
28533	NC_011529	GA	3	6	1443921	1443926	50 %	0 %	50 %	0 %	212224720
28534	NC_011529	AGA	2	6	1443954	1443959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224720
28535	NC_011529	AAG	2	6	1443967	1443972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224720
28536	NC_011529	TCG	2	6	1443995	1444000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224720
28537	NC_011529	ACC	2	6	1444136	1444141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224720
28538	NC_011529	AGG	2	6	1444187	1444192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224720
28539	NC_011529	ATA	2	6	1444249	1444254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224720
28540	NC_011529	GGA	2	6	1444279	1444284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224720
28541	NC_011529	AAC	2	6	1444387	1444392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224720
28542	NC_011529	TACAGG	2	12	1444399	1444410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212224720
28543	NC_011529	GGC	2	6	1444416	1444421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224720
28544	NC_011529	ACA	2	6	1444427	1444432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224720
28545	NC_011529	ATG	2	6	1444453	1444458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224720
28546	NC_011529	GA	3	6	1444525	1444530	50 %	0 %	50 %	0 %	212224720
28547	NC_011529	CAA	2	6	1444587	1444592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224720
28548	NC_011529	AGG	2	6	1444612	1444617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224720
28549	NC_011529	CTC	2	6	1444754	1444759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224721
28550	NC_011529	GAC	2	6	1444766	1444771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224721
28551	NC_011529	ACA	2	6	1444773	1444778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224721
28552	NC_011529	GAG	2	6	1444779	1444784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224721
28553	NC_011529	GAG	2	6	1444835	1444840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224721
28554	NC_011529	GTT	2	6	1444916	1444921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224721
28555	NC_011529	AGGCTC	2	12	1444922	1444933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212224721
28556	NC_011529	GAG	2	6	1445009	1445014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224721
28557	NC_011529	ATC	2	6	1445015	1445020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224721
28558	NC_011529	AGG	2	6	1445066	1445071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224721
28559	NC_011529	AGG	2	6	1445106	1445111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224721
28560	NC_011529	GCTCC	2	10	1445136	1445145	0 %	20 %	20 %	60 %	212224722
28561	NC_011529	ACG	2	6	1445222	1445227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224722
28562	NC_011529	CTC	2	6	1445278	1445283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224722
28563	NC_011529	CTA	2	6	1445310	1445315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224722
28564	NC_011529	AGGG	2	8	1445443	1445450	25 %	0 %	75 %	0 %	212224722
28565	NC_011529	GGAGG	2	10	1445465	1445474	20 %	0 %	80 %	0 %	212224722
28566	NC_011529	GGTC	2	8	1445517	1445524	0 %	25 %	50 %	25 %	212224722
28567	NC_011529	GGA	2	6	1445559	1445564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224722
28568	NC_011529	TCG	2	6	1445597	1445602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224722
28569	NC_011529	AGA	2	6	1445603	1445608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224722
28570	NC_011529	CGA	2	6	1445631	1445636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224722
28571	NC_011529	GGA	2	6	1445670	1445675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224722
28572	NC_011529	GAG	2	6	1445797	1445802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224722
28573	NC_011529	CGC	2	6	1445826	1445831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224722
28574	NC_011529	ATG	2	6	1445863	1445868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224722
28575	NC_011529	AG	3	6	1445878	1445883	50 %	0 %	50 %	0 %	212224722
28576	NC_011529	ACCT	2	8	1445942	1445949	25 %	25 %	0 %	50 %	212224723
28577	NC_011529	CT	3	6	1445958	1445963	0 %	50 %	0 %	50 %	212224723
28578	NC_011529	GGAG	2	8	1445971	1445978	25 %	0 %	75 %	0 %	212224723
28579	NC_011529	GAA	2	6	1445990	1445995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224723
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28581	NC_011529	GAA	2	6	1446092	1446097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224723
28582	NC_011529	GGC	2	6	1446114	1446119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224723
28583	NC_011529	AG	3	6	1446169	1446174	50 %	0 %	50 %	0 %	212224723
28584	NC_011529	A	6	6	1446203	1446208	100 %	0 %	0 %	0 %	212224724
28585	NC_011529	AAG	2	6	1446247	1446252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224724
28586	NC_011529	GCT	2	6	1446285	1446290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224724
28587	NC_011529	TCC	2	6	1446332	1446337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224724
28588	NC_011529	GGT	2	6	1446342	1446347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224724
28589	NC_011529	GGCT	2	8	1446354	1446361	0 %	25 %	50 %	25 %	212224724
28590	NC_011529	CTC	2	6	1446412	1446417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224724
28591	NC_011529	TTC	2	6	1446709	1446714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224724
28592	NC_011529	CTC	2	6	1446880	1446885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224724
28593	NC_011529	TTC	2	6	1446913	1446918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224724
28594	NC_011529	CTA	2	6	1446978	1446983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224724
28595	NC_011529	TCA	2	6	1447022	1447027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224724
28596	NC_011529	CTA	2	6	1447164	1447169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224724
28597	NC_011529	TCG	2	6	1447172	1447177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224724
28598	NC_011529	AAG	2	6	1447195	1447200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224724
28599	NC_011529	GGCC	2	8	1447205	1447212	0 %	0 %	50 %	50 %	212224724
28600	NC_011529	T	6	6	1447227	1447232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28601	NC_011529	CCAT	2	8	1447233	1447240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28602	NC_011529	TCA	2	6	1447292	1447297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224725
28603	NC_011529	ATA	2	6	1447462	1447467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224725
28604	NC_011529	CTG	2	6	1447486	1447491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224725
28605	NC_011529	ATC	2	6	1447575	1447580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224726
28606	NC_011529	GGC	2	6	1447581	1447586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224726
28607	NC_011529	TGG	2	6	1447670	1447675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224726
28608	NC_011529	GGT	2	6	1447679	1447684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224726
28609	NC_011529	TCA	2	6	1447762	1447767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224726
28610	NC_011529	TCC	2	6	1447780	1447785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224726
28611	NC_011529	CGC	2	6	1447820	1447825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224726
28612	NC_011529	GTGGA	2	10	1447842	1447851	20 %	20 %	60 %	0 %	212224726
28613	NC_011529	ACC	2	6	1447864	1447869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224726
28614	NC_011529	GAT	2	6	1447887	1447892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224726
28615	NC_011529	TCT	2	6	1447940	1447945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224727
28616	NC_011529	CCG	2	6	1447994	1447999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224727
28617	NC_011529	GGT	2	6	1448133	1448138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224727
28618	NC_011529	TGAA	2	8	1448140	1448147	50 %	25 %	25 %	0 %	212224727
28619	NC_011529	TCC	2	6	1448165	1448170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224728
28620	NC_011529	TCA	2	6	1448183	1448188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224728
28621	NC_011529	CCAG	2	8	1448214	1448221	25 %	0 %	25 %	50 %	212224728
28622	NC_011529	TTC	2	6	1448356	1448361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224728
28623	NC_011529	AAT	2	6	1448367	1448372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224728
28624	NC_011529	AGG	2	6	1448414	1448419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224728
28625	NC_011529	GAT	2	6	1448490	1448495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224728
28626	NC_011529	GGT	2	6	1448542	1448547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224728
28627	NC_011529	GGT	2	6	1448557	1448562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224728
28628	NC_011529	CTC	2	6	1448704	1448709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224728
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28630	NC_011529	GGC	2	6	1448773	1448778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224728
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28634	NC_011529	TCC	3	9	1448840	1448848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224728
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28643	NC_011529	GAA	2	6	1449433	1449438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224730
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28645	NC_011529	AGA	2	6	1449718	1449723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224730
28646	NC_011529	CCG	2	6	1449741	1449746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224730
28647	NC_011529	GAA	2	6	1449763	1449768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224730
28648	NC_011529	TGA	2	6	1449784	1449789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28649	NC_011529	AAT	2	6	1449858	1449863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224731
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28652	NC_011529	AAT	2	6	1450011	1450016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224731
28653	NC_011529	CT	3	6	1450040	1450045	0 %	50 %	0 %	50 %	212224731
28654	NC_011529	GCTACC	2	12	1450091	1450102	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212224731
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28681	NC_011529	AGGGA	2	10	1451403	1451412	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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28690	NC_011529	TA	3	6	1451719	1451724	50 %	50 %	0 %	0 %	212224732
28691	NC_011529	TGCA	2	8	1451795	1451802	25 %	25 %	25 %	25 %	212224732
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28694	NC_011529	AG	3	6	1451867	1451872	50 %	0 %	50 %	0 %	212224732
28695	NC_011529	GA	3	6	1451928	1451933	50 %	0 %	50 %	0 %	212224732
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28703	NC_011529	CGG	2	6	1452250	1452255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224733
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28713	NC_011529	G	6	6	1452889	1452894	0 %	0 %	100 %	0 %	212224734
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28715	NC_011529	GCATT	2	10	1452968	1452977	20 %	40 %	20 %	20 %	212224735
28716	NC_011529	CAA	2	6	1453016	1453021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224735
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28719	NC_011529	GTT	2	6	1453470	1453475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224736
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28721	NC_011529	CTTTC	2	10	1453548	1453557	0 %	60 %	0 %	40 %	212224737
28722	NC_011529	GCT	2	6	1453558	1453563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224737
28723	NC_011529	GCT	2	6	1453579	1453584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224737
28724	NC_011529	TGGG	2	8	1453623	1453630	0 %	25 %	75 %	0 %	212224737
28725	NC_011529	GAC	2	6	1453658	1453663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224737
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28728	NC_011529	GGA	2	6	1453809	1453814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224737
28729	NC_011529	GAT	2	6	1453831	1453836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224738
28730	NC_011529	GGT	2	6	1453930	1453935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224738
28731	NC_011529	CCA	2	6	1453952	1453957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224738
28732	NC_011529	AGCGGG	2	12	1453959	1453970	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	212224738
28733	NC_011529	GAA	2	6	1454007	1454012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224738
28734	NC_011529	ACA	2	6	1454018	1454023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224738
28735	NC_011529	CGG	2	6	1454052	1454057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224738
28736	NC_011529	GCA	2	6	1454074	1454079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224738
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28739	NC_011529	AAC	2	6	1454122	1454127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224738
28740	NC_011529	CTT	2	6	1454158	1454163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224738
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28744	NC_011529	TCA	2	6	1454284	1454289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224739
28745	NC_011529	TCA	2	6	1454344	1454349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224739
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28750	NC_011529	GA	3	6	1454716	1454721	50 %	0 %	50 %	0 %	212224740
28751	NC_011529	AAT	2	6	1454893	1454898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224740
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28753	NC_011529	TAC	2	6	1454981	1454986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224740
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28832	NC_011529	CTT	2	6	1459299	1459304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224745
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28835	NC_011529	AG	3	6	1459384	1459389	50 %	0 %	50 %	0 %	212224745
28836	NC_011529	ATG	2	6	1459396	1459401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224745
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