MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_011529	GAC	2	6	1414967	1414972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224693
28002	NC_011529	CGC	2	6	1415080	1415085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224693
28003	NC_011529	TCA	2	6	1415091	1415096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224693
28004	NC_011529	GAA	2	6	1415108	1415113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224693
28005	NC_011529	CTTC	2	8	1415118	1415125	0 %	50 %	0 %	50 %	212224693
28006	NC_011529	ATG	2	6	1415169	1415174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224693
28007	NC_011529	ACC	2	6	1415238	1415243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224693
28008	NC_011529	AGG	2	6	1415328	1415333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224693
28009	NC_011529	TCG	2	6	1415349	1415354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224693
28010	NC_011529	GAT	2	6	1415475	1415480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224693
28011	NC_011529	CGG	2	6	1415500	1415505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224693
28012	NC_011529	CTC	2	6	1415537	1415542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224693
28013	NC_011529	AG	3	6	1415711	1415716	50 %	0 %	50 %	0 %	212224693
28014	NC_011529	GGT	2	6	1415777	1415782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224693
28015	NC_011529	GAGG	2	8	1415873	1415880	25 %	0 %	75 %	0 %	212224693
28016	NC_011529	ATG	2	6	1415907	1415912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224693
28017	NC_011529	CAC	2	6	1415948	1415953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224693
28018	NC_011529	CCG	2	6	1416012	1416017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224693
28019	NC_011529	ACC	2	6	1416054	1416059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224693
28020	NC_011529	CTC	2	6	1416067	1416072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224693
28021	NC_011529	CTC	2	6	1416077	1416082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224693
28022	NC_011529	CGA	2	6	1416175	1416180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224693
28023	NC_011529	CACGAG	2	12	1416230	1416241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224693
28024	NC_011529	AAC	2	6	1416341	1416346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224693
28025	NC_011529	CTT	2	6	1416409	1416414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224693
28026	NC_011529	GTA	2	6	1416449	1416454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224693
28027	NC_011529	CGAG	2	8	1416481	1416488	25 %	0 %	50 %	25 %	212224693
28028	NC_011529	GA	3	6	1416503	1416508	50 %	0 %	50 %	0 %	212224693
28029	NC_011529	TCC	2	6	1416564	1416569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224693
28030	NC_011529	ACA	2	6	1416609	1416614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224693
28031	NC_011529	CGCT	2	8	1416712	1416719	0 %	25 %	25 %	50 %	212224693
28032	NC_011529	TGG	2	6	1416784	1416789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224693
28033	NC_011529	TCAG	2	8	1416840	1416847	25 %	25 %	25 %	25 %	212224693
28034	NC_011529	CAT	2	6	1416916	1416921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224693
28035	NC_011529	ACG	2	6	1416945	1416950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224693
28036	NC_011529	CCT	2	6	1417144	1417149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224693
28037	NC_011529	GAA	2	6	1417200	1417205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224693
28038	NC_011529	GTT	2	6	1417265	1417270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224693
28039	NC_011529	TG	3	6	1417362	1417367	0 %	50 %	50 %	0 %	212224693
28040	NC_011529	GTAGGT	2	12	1417490	1417501	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	212224693
28041	NC_011529	ATC	2	6	1417569	1417574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224693
28042	NC_011529	TCC	2	6	1417575	1417580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224693
28043	NC_011529	CAT	2	6	1417621	1417626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224693
28044	NC_011529	C	6	6	1417652	1417657	0 %	0 %	0 %	100 %	212224693
28045	NC_011529	GAC	2	6	1417682	1417687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224693
28046	NC_011529	ACG	2	6	1417704	1417709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224693
28047	NC_011529	TCA	2	6	1417717	1417722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224693
28048	NC_011529	CAT	2	6	1417738	1417743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224693
28049	NC_011529	TTA	2	6	1417750	1417755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224693
28050	NC_011529	AGC	2	6	1417775	1417780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224693
28051	NC_011529	AAT	2	6	1417802	1417807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224693
28052	NC_011529	GA	3	6	1417837	1417842	50 %	0 %	50 %	0 %	212224693
28053	NC_011529	CTT	2	6	1417850	1417855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224693
28054	NC_011529	TTCCA	2	10	1417895	1417904	20 %	40 %	0 %	40 %	212224693
28055	NC_011529	TTTA	2	8	1417924	1417931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28056	NC_011529	TAC	2	6	1417943	1417948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28057	NC_011529	TG	3	6	1417999	1418004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28058	NC_011529	A	6	6	1418039	1418044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28059	NC_011529	CAA	2	6	1418054	1418059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28060	NC_011529	TCT	2	6	1418131	1418136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224694
28061	NC_011529	CTT	2	6	1418159	1418164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224694
28062	NC_011529	GAA	2	6	1418177	1418182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224694
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28064	NC_011529	TCC	2	6	1418340	1418345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224694
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28068	NC_011529	CCT	2	6	1418446	1418451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224694
28069	NC_011529	CT	3	6	1418599	1418604	0 %	50 %	0 %	50 %	212224694
28070	NC_011529	GAA	2	6	1418630	1418635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224694
28071	NC_011529	TCT	2	6	1418667	1418672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224694
28072	NC_011529	GTA	2	6	1418750	1418755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224694
28073	NC_011529	AGT	2	6	1418791	1418796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224694
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28076	NC_011529	TCGAGG	2	12	1418892	1418903	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212224694
28077	NC_011529	GCT	2	6	1418974	1418979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224694
28078	NC_011529	CGT	2	6	1418989	1418994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224694
28079	NC_011529	CGTCGA	2	12	1419052	1419063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212224694
28080	NC_011529	GCCTG	2	10	1419180	1419189	0 %	20 %	40 %	40 %	212224694
28081	NC_011529	CGT	2	6	1419229	1419234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224694
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28084	NC_011529	GGAA	2	8	1419322	1419329	50 %	0 %	50 %	0 %	212224694
28085	NC_011529	GAA	2	6	1419389	1419394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224694
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28088	NC_011529	CTC	2	6	1419482	1419487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224694
28089	NC_011529	GGT	2	6	1419524	1419529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224694
28090	NC_011529	GAA	2	6	1419542	1419547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224694
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28092	NC_011529	CA	3	6	1419564	1419569	50 %	0 %	0 %	50 %	212224694
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28099	NC_011529	TAG	2	6	1419999	1420004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28100	NC_011529	AG	3	6	1420003	1420008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28101	NC_011529	TA	3	6	1420018	1420023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28102	NC_011529	AAT	2	6	1420074	1420079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224695
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28104	NC_011529	TAG	2	6	1420247	1420252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224695
28105	NC_011529	GTG	2	6	1420309	1420314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224695
28106	NC_011529	CT	3	6	1420328	1420333	0 %	50 %	0 %	50 %	212224695
28107	NC_011529	AAG	2	6	1420357	1420362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224695
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28113	NC_011529	TGA	2	6	1420788	1420793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224696
28114	NC_011529	CT	4	8	1420801	1420808	0 %	50 %	0 %	50 %	212224696
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28233	NC_011529	TCAC	2	8	1426992	1426999	25 %	25 %	0 %	50 %	212224704
28234	NC_011529	ACC	2	6	1427029	1427034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224704
28235	NC_011529	GGT	2	6	1427123	1427128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224704
28236	NC_011529	TTC	2	6	1427193	1427198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224704
28237	NC_011529	AC	3	6	1427224	1427229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28238	NC_011529	CCA	2	6	1427263	1427268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28239	NC_011529	AAG	2	6	1427432	1427437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224705
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28247	NC_011529	G	7	7	1427734	1427740	0 %	0 %	100 %	0 %	212224706
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28252	NC_011529	GTAAT	2	10	1427936	1427945	40 %	40 %	20 %	0 %	212224706
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28268	NC_011529	AAAC	2	8	1428718	1428725	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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28270	NC_011529	A	6	6	1428813	1428818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28293	NC_011529	GGAAA	2	10	1430204	1430213	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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28297	NC_011529	A	6	6	1430544	1430549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28298	NC_011529	A	6	6	1430585	1430590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28299	NC_011529	GTGGA	2	10	1430672	1430681	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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28345	NC_011529	GA	3	6	1432942	1432947	50 %	0 %	50 %	0 %	212224712
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28348	NC_011529	GTCTG	2	10	1433149	1433158	0 %	40 %	40 %	20 %	212224712
28349	NC_011529	CGGC	2	8	1433191	1433198	0 %	0 %	50 %	50 %	212224712
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28352	NC_011529	ATG	2	6	1433370	1433375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224712
28353	NC_011529	GGT	2	6	1433424	1433429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28354	NC_011529	AAAG	2	8	1433439	1433446	75 %	0 %	25 %	0 %	212224713
28355	NC_011529	GAG	2	6	1433503	1433508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224713
28356	NC_011529	TCG	2	6	1433603	1433608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224713
28357	NC_011529	GGA	2	6	1433631	1433636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224713
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28371	NC_011529	TAT	2	6	1434458	1434463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28372	NC_011529	GTACA	2	10	1434479	1434488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28373	NC_011529	CGT	2	6	1434701	1434706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224714
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28452	NC_011529	CT	3	6	1439056	1439061	0 %	50 %	0 %	50 %	212224717
28453	NC_011529	GGCC	2	8	1439084	1439091	0 %	0 %	50 %	50 %	212224717
28454	NC_011529	TGA	2	6	1439155	1439160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224717
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28462	NC_011529	CGT	2	6	1439423	1439428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224717
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28465	NC_011529	GAG	2	6	1439495	1439500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224717
28466	NC_011529	GAA	2	6	1439504	1439509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224717
28467	NC_011529	ATG	2	6	1439520	1439525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224717
28468	NC_011529	ATG	2	6	1439553	1439558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224717
28469	NC_011529	GGT	2	6	1439842	1439847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224717
28470	NC_011529	AT	3	6	1440137	1440142	50 %	50 %	0 %	0 %	212224718
28471	NC_011529	AT	3	6	1440200	1440205	50 %	50 %	0 %	0 %	212224718
28472	NC_011529	CCT	2	6	1440298	1440303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224718
28473	NC_011529	TCGCCC	2	12	1440396	1440407	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	212224718
28474	NC_011529	ACC	2	6	1440879	1440884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224718
28475	NC_011529	TTC	2	6	1440899	1440904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224718
28476	NC_011529	GCA	2	6	1440951	1440956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224718
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28479	NC_011529	GCA	2	6	1441151	1441156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224718
28480	NC_011529	TTCA	2	8	1441165	1441172	25 %	50 %	0 %	25 %	212224718
28481	NC_011529	GGA	2	6	1441196	1441201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224718
28482	NC_011529	TCC	2	6	1441284	1441289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224718
28483	NC_011529	ACT	2	6	1441380	1441385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224718
28484	NC_011529	AG	3	6	1441426	1441431	50 %	0 %	50 %	0 %	212224718
28485	NC_011529	ACT	2	6	1441578	1441583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224718
28486	NC_011529	GAG	2	6	1441595	1441600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224718
28487	NC_011529	CAA	3	9	1441686	1441694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224718
28488	NC_011529	GAA	2	6	1441759	1441764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224718
28489	NC_011529	GGT	2	6	1441925	1441930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28490	NC_011529	A	6	6	1441945	1441950	100 %	0 %	0 %	0 %	212224719
28491	NC_011529	TGA	2	6	1441972	1441977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224719
28492	NC_011529	ATC	2	6	1441980	1441985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224719
28493	NC_011529	CTC	2	6	1441998	1442003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224719
28494	NC_011529	AG	3	6	1442039	1442044	50 %	0 %	50 %	0 %	212224719
28495	NC_011529	C	6	6	1442052	1442057	0 %	0 %	0 %	100 %	212224719
28496	NC_011529	CTA	2	6	1442069	1442074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224719
28497	NC_011529	CAG	2	6	1442161	1442166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224719
28498	NC_011529	GCC	2	6	1442172	1442177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224719
28499	NC_011529	CTC	2	6	1442181	1442186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224719
28500	NC_011529	GAT	3	9	1442267	1442275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224719

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