MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_011529	TCT	2	6	1390826	1390831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224666
27503	NC_011529	ATC	2	6	1390834	1390839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224666
27504	NC_011529	TGT	2	6	1390847	1390852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224666
27505	NC_011529	TCC	2	6	1390856	1390861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224666
27506	NC_011529	GCC	2	6	1391009	1391014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224666
27507	NC_011529	GCC	2	6	1391086	1391091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224666
27508	NC_011529	GAG	2	6	1391106	1391111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224666
27509	NC_011529	CCT	2	6	1391114	1391119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224666
27510	NC_011529	CGC	2	6	1391127	1391132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224666
27511	NC_011529	CTTTGA	2	12	1391273	1391284	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212224666
27512	NC_011529	TCA	2	6	1391333	1391338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224666
27513	NC_011529	TCCTG	2	10	1391417	1391426	0 %	40 %	20 %	40 %	212224666
27514	NC_011529	GGCT	2	8	1391491	1391498	0 %	25 %	50 %	25 %	212224666
27515	NC_011529	GAA	2	6	1391499	1391504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224666
27516	NC_011529	CTT	2	6	1391514	1391519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224666
27517	NC_011529	GAG	2	6	1391625	1391630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224666
27518	NC_011529	CACCAA	2	12	1391636	1391647	50 %	0 %	0 %	50 %	212224666
27519	NC_011529	ACC	2	6	1391698	1391703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224666
27520	NC_011529	TTC	2	6	1391725	1391730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224666
27521	NC_011529	TCT	2	6	1391774	1391779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224666
27522	NC_011529	AG	3	6	1391799	1391804	50 %	0 %	50 %	0 %	212224666
27523	NC_011529	CAC	2	6	1391832	1391837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27524	NC_011529	AAG	2	6	1391839	1391844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27525	NC_011529	CGA	2	6	1391913	1391918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224667
27526	NC_011529	CTT	2	6	1391967	1391972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224667
27527	NC_011529	AGG	2	6	1391981	1391986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224667
27528	NC_011529	ATC	2	6	1392011	1392016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224667
27529	NC_011529	CT	3	6	1392046	1392051	0 %	50 %	0 %	50 %	212224667
27530	NC_011529	ATC	2	6	1392113	1392118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224667
27531	NC_011529	TGA	2	6	1392186	1392191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224667
27532	NC_011529	CCT	2	6	1392207	1392212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224667
27533	NC_011529	AG	3	6	1392217	1392222	50 %	0 %	50 %	0 %	212224667
27534	NC_011529	AAC	2	6	1392235	1392240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224667
27535	NC_011529	GAA	2	6	1392259	1392264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224667
27536	NC_011529	CCT	2	6	1392293	1392298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224667
27537	NC_011529	TTG	2	6	1392359	1392364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224667
27538	NC_011529	CAGAGC	2	12	1392427	1392438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224667
27539	NC_011529	CCG	2	6	1392452	1392457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224667
27540	NC_011529	AGCCGT	2	12	1392471	1392482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212224667
27541	NC_011529	CTT	2	6	1392577	1392582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224667
27542	NC_011529	AG	3	6	1392686	1392691	50 %	0 %	50 %	0 %	212224667
27543	NC_011529	ATC	2	6	1392706	1392711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224667
27544	NC_011529	CATCAC	2	12	1392769	1392780	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	212224667
27545	NC_011529	AAG	2	6	1392785	1392790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27546	NC_011529	CT	3	6	1392795	1392800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27547	NC_011529	AAGGA	2	10	1392820	1392829	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27548	NC_011529	CTC	2	6	1392848	1392853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224668
27549	NC_011529	CTT	2	6	1392893	1392898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224668
27550	NC_011529	CGA	2	6	1392931	1392936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224668
27551	NC_011529	AGG	2	6	1392993	1392998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224668
27552	NC_011529	ATG	2	6	1393092	1393097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224668
27553	NC_011529	TGG	2	6	1393159	1393164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224668
27554	NC_011529	AG	3	6	1393283	1393288	50 %	0 %	50 %	0 %	212224668
27555	NC_011529	TGA	2	6	1393345	1393350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224668
27556	NC_011529	GCG	2	6	1393377	1393382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224668
27557	NC_011529	CAAG	2	8	1393395	1393402	50 %	0 %	25 %	25 %	212224668
27558	NC_011529	ACT	2	6	1393446	1393451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224668
27559	NC_011529	CTC	2	6	1393463	1393468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224668
27560	NC_011529	TCC	2	6	1393480	1393485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224668
27561	NC_011529	ACG	2	6	1393509	1393514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224668
27562	NC_011529	CCA	2	6	1393625	1393630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224668
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27567	NC_011529	CGA	2	6	1394122	1394127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224668
27568	NC_011529	TGGTGT	2	12	1394131	1394142	0 %	50 %	50 %	0 %	212224668
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27572	NC_011529	CCT	2	6	1394210	1394215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224668
27573	NC_011529	GCC	2	6	1394226	1394231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224668
27574	NC_011529	GGT	2	6	1394354	1394359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224668
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27576	NC_011529	CCA	2	6	1394394	1394399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224668
27577	NC_011529	GCA	2	6	1394473	1394478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224668
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27580	NC_011529	GA	3	6	1394542	1394547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27581	NC_011529	TCCA	2	8	1394612	1394619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27582	NC_011529	A	8	8	1394723	1394730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27583	NC_011529	AAG	2	6	1394759	1394764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27585	NC_011529	CTTC	2	8	1394867	1394874	0 %	50 %	0 %	50 %	212224669
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27587	NC_011529	TCC	2	6	1395106	1395111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224669
27588	NC_011529	TCG	2	6	1395199	1395204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224669
27589	NC_011529	CAA	2	6	1395224	1395229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224669
27590	NC_011529	TCC	2	6	1395247	1395252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224669
27591	NC_011529	CGA	2	6	1395272	1395277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224669
27592	NC_011529	ATTTT	2	10	1395356	1395365	20 %	80 %	0 %	0 %	212224669
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27594	NC_011529	TCA	2	6	1395380	1395385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224669
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27597	NC_011529	TCG	2	6	1395493	1395498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224670
27598	NC_011529	TCG	2	6	1395658	1395663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224670
27599	NC_011529	TCT	2	6	1395674	1395679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224670
27600	NC_011529	GAG	2	6	1395723	1395728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224670
27601	NC_011529	CG	3	6	1395729	1395734	0 %	0 %	50 %	50 %	212224670
27602	NC_011529	TC	4	8	1395755	1395762	0 %	50 %	0 %	50 %	212224670
27603	NC_011529	ACC	2	6	1395774	1395779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27604	NC_011529	CTG	2	6	1395816	1395821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27605	NC_011529	TGA	2	6	1395946	1395951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224671
27606	NC_011529	GCG	2	6	1395960	1395965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224671
27607	NC_011529	GAG	2	6	1396031	1396036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224671
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27609	NC_011529	GTT	2	6	1396124	1396129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224671
27610	NC_011529	TAT	2	6	1396205	1396210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224671
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27613	NC_011529	ATG	2	6	1396454	1396459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224671
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27617	NC_011529	AC	3	6	1396662	1396667	50 %	0 %	0 %	50 %	212224671
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27971	NC_011529	GAA	2	6	1413544	1413549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224691
27972	NC_011529	CGC	3	9	1413553	1413561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224691
27973	NC_011529	AGTG	2	8	1413576	1413583	25 %	25 %	50 %	0 %	212224691
27974	NC_011529	GT	3	6	1413635	1413640	0 %	50 %	50 %	0 %	212224692
27975	NC_011529	GAA	2	6	1413663	1413668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224692
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27978	NC_011529	GAT	2	6	1413781	1413786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224692
27979	NC_011529	AG	3	6	1413811	1413816	50 %	0 %	50 %	0 %	212224692
27980	NC_011529	GTA	2	6	1413865	1413870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224692
27981	NC_011529	AGT	2	6	1413899	1413904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224692
27982	NC_011529	GCC	2	6	1413917	1413922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224692
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27991	NC_011529	AAG	2	6	1414379	1414384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224692
27992	NC_011529	CCTT	2	8	1414454	1414461	0 %	50 %	0 %	50 %	212224692
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27994	NC_011529	CGG	2	6	1414540	1414545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224692
27995	NC_011529	CAG	2	6	1414618	1414623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224692
27996	NC_011529	AGG	3	9	1414646	1414654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224692
27997	NC_011529	CTA	2	6	1414743	1414748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224692
27998	NC_011529	ATG	2	6	1414826	1414831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224692
27999	NC_011529	TCA	2	6	1414926	1414931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28000	NC_011529	CGA	2	6	1414939	1414944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224693

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