MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_011529	AAGC	2	8	1365828	1365835	50 %	0 %	25 %	25 %	212224645
27003	NC_011529	C	6	6	1365835	1365840	0 %	0 %	0 %	100 %	212224645
27004	NC_011529	ATG	2	6	1365931	1365936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224645
27005	NC_011529	TTGAGA	2	12	1366022	1366033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224645
27006	NC_011529	TCGACA	2	12	1366103	1366114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212224645
27007	NC_011529	TGG	2	6	1366126	1366131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224645
27008	NC_011529	CTC	2	6	1366171	1366176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224645
27009	NC_011529	ACC	2	6	1366238	1366243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224645
27010	NC_011529	AG	3	6	1366251	1366256	50 %	0 %	50 %	0 %	212224645
27011	NC_011529	GGCT	2	8	1366368	1366375	0 %	25 %	50 %	25 %	212224645
27012	NC_011529	AC	3	6	1366376	1366381	50 %	0 %	0 %	50 %	212224645
27013	NC_011529	CTC	2	6	1366411	1366416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224645
27014	NC_011529	CGA	2	6	1366428	1366433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224645
27015	NC_011529	AGG	2	6	1366496	1366501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224645
27016	NC_011529	GAT	2	6	1366554	1366559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224645
27017	NC_011529	AGGG	2	8	1366576	1366583	25 %	0 %	75 %	0 %	212224645
27018	NC_011529	CTC	2	6	1366645	1366650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224645
27019	NC_011529	AAG	2	6	1366774	1366779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224645
27020	NC_011529	GAG	2	6	1366795	1366800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224645
27021	NC_011529	CTCG	2	8	1366901	1366908	0 %	25 %	25 %	50 %	212224646
27022	NC_011529	TCT	2	6	1366933	1366938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224646
27023	NC_011529	GAG	2	6	1366997	1367002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224646
27024	NC_011529	TTCG	2	8	1367011	1367018	0 %	50 %	25 %	25 %	212224646
27025	NC_011529	TAC	2	6	1367049	1367054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224646
27026	NC_011529	AGG	2	6	1367092	1367097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224646
27027	NC_011529	CT	3	6	1367139	1367144	0 %	50 %	0 %	50 %	212224646
27028	NC_011529	TCG	2	6	1367215	1367220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224646
27029	NC_011529	GAACT	2	10	1367244	1367253	40 %	20 %	20 %	20 %	212224646
27030	NC_011529	CGA	2	6	1367330	1367335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224646
27031	NC_011529	CTGG	2	8	1367442	1367449	0 %	25 %	50 %	25 %	212224646
27032	NC_011529	GGT	2	6	1367579	1367584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224646
27033	NC_011529	GAT	2	6	1367627	1367632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224646
27034	NC_011529	GTG	2	6	1367712	1367717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27035	NC_011529	CAT	2	6	1367728	1367733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27036	NC_011529	CCA	2	6	1367841	1367846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27037	NC_011529	CTT	2	6	1367858	1367863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27038	NC_011529	AGC	2	6	1367969	1367974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27039	NC_011529	AGCT	2	8	1367988	1367995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27040	NC_011529	TTA	2	6	1368012	1368017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27041	NC_011529	GGA	2	6	1368055	1368060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224647
27042	NC_011529	GA	3	6	1368115	1368120	50 %	0 %	50 %	0 %	212224647
27043	NC_011529	GTT	2	6	1368128	1368133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224647
27044	NC_011529	ACG	2	6	1368141	1368146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224647
27045	NC_011529	ATCCAG	2	12	1368152	1368163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212224647
27046	NC_011529	CAT	2	6	1368178	1368183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224647
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27050	NC_011529	T	6	6	1368299	1368304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27051	NC_011529	ATC	2	6	1368332	1368337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27052	NC_011529	GGT	2	6	1368387	1368392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27053	NC_011529	GA	3	6	1368407	1368412	50 %	0 %	50 %	0 %	212224648
27054	NC_011529	GAA	2	6	1368496	1368501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224648
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27057	NC_011529	TCA	2	6	1368575	1368580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224648
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27059	NC_011529	GAG	2	6	1368640	1368645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224648
27060	NC_011529	TCA	2	6	1369007	1369012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224648
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27071	NC_011529	TCT	2	6	1369542	1369547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27072	NC_011529	TAC	2	6	1369553	1369558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27073	NC_011529	GAG	2	6	1369732	1369737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224649
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27083	NC_011529	GTC	2	6	1370197	1370202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224649
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27107	NC_011529	GA	3	6	1371386	1371391	50 %	0 %	50 %	0 %	212224649
27108	NC_011529	GGA	2	6	1371402	1371407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224649
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27112	NC_011529	AGAT	2	8	1371554	1371561	50 %	25 %	25 %	0 %	212224649
27113	NC_011529	GTGGA	2	10	1371625	1371634	20 %	20 %	60 %	0 %	212224649
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27115	NC_011529	GAA	2	6	1371665	1371670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27116	NC_011529	AAAAAC	2	12	1371725	1371736	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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27472	NC_011529	CAT	2	6	1389612	1389617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224665
27473	NC_011529	TTC	2	6	1389633	1389638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224665
27474	NC_011529	GCTG	2	8	1389648	1389655	0 %	25 %	50 %	25 %	212224665
27475	NC_011529	CAG	2	6	1389669	1389674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224665
27476	NC_011529	TCG	2	6	1389678	1389683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224665
27477	NC_011529	CTC	2	6	1389698	1389703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224665
27478	NC_011529	TTC	2	6	1389713	1389718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224665
27479	NC_011529	GAG	2	6	1389821	1389826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224665
27480	NC_011529	CTG	2	6	1389902	1389907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224665
27481	NC_011529	GGC	2	6	1389952	1389957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224665
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27483	NC_011529	GTC	2	6	1389989	1389994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224665
27484	NC_011529	AG	3	6	1390074	1390079	50 %	0 %	50 %	0 %	212224665
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27486	NC_011529	GAG	2	6	1390121	1390126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224665
27487	NC_011529	CT	3	6	1390224	1390229	0 %	50 %	0 %	50 %	212224666
27488	NC_011529	ACC	2	6	1390315	1390320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224666
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27491	NC_011529	AGGA	2	8	1390471	1390478	50 %	0 %	50 %	0 %	212224666
27492	NC_011529	CCT	2	6	1390494	1390499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224666
27493	NC_011529	TGG	2	6	1390547	1390552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224666
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27498	NC_011529	CTT	2	6	1390677	1390682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224666
27499	NC_011529	CTC	2	6	1390719	1390724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224666
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