MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_011529	CGT	2	6	1340350	1340355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224613
26502	NC_011529	GAG	2	6	1340375	1340380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224613
26503	NC_011529	CTT	2	6	1340437	1340442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224613
26504	NC_011529	CTT	2	6	1340471	1340476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224613
26505	NC_011529	GAG	2	6	1340477	1340482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224613
26506	NC_011529	T	6	6	1340635	1340640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26507	NC_011529	ATT	2	6	1340718	1340723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26508	NC_011529	GTTT	2	8	1340827	1340834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26509	NC_011529	T	6	6	1340832	1340837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26510	NC_011529	CGGG	2	8	1340845	1340852	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26511	NC_011529	GCG	2	6	1340883	1340888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26512	NC_011529	CTT	2	6	1341025	1341030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224614
26513	NC_011529	CAGG	2	8	1341150	1341157	25 %	0 %	50 %	25 %	212224614
26514	NC_011529	CTC	3	9	1341160	1341168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224614
26515	NC_011529	TCA	2	6	1341279	1341284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224614
26516	NC_011529	CTC	2	6	1341295	1341300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224614
26517	NC_011529	AAC	2	6	1341346	1341351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224614
26518	NC_011529	CTC	2	6	1341370	1341375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224614
26519	NC_011529	TCC	2	6	1341391	1341396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224614
26520	NC_011529	CTT	2	6	1341399	1341404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224614
26521	NC_011529	AGG	2	6	1341437	1341442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224614
26522	NC_011529	CTT	2	6	1341547	1341552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224614
26523	NC_011529	CGA	2	6	1341621	1341626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224614
26524	NC_011529	GGC	2	6	1341691	1341696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224614
26525	NC_011529	TGT	2	6	1341708	1341713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224614
26526	NC_011529	GCC	2	6	1341755	1341760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224614
26527	NC_011529	CTC	2	6	1341853	1341858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224614
26528	NC_011529	TTC	2	6	1341881	1341886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224614
26529	NC_011529	CTC	2	6	1341949	1341954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224615
26530	NC_011529	AGGA	2	8	1342362	1342369	50 %	0 %	50 %	0 %	212224615
26531	NC_011529	CTC	2	6	1342399	1342404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224615
26532	NC_011529	TCCA	2	8	1342473	1342480	25 %	25 %	0 %	50 %	212224615
26533	NC_011529	CTTT	2	8	1342564	1342571	0 %	75 %	0 %	25 %	212224615
26534	NC_011529	TGG	2	6	1342616	1342621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26535	NC_011529	CTC	2	6	1342636	1342641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224616
26536	NC_011529	CTC	2	6	1342697	1342702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224616
26537	NC_011529	TCT	2	6	1342750	1342755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224616
26538	NC_011529	GTGG	2	8	1342824	1342831	0 %	25 %	75 %	0 %	212224616
26539	NC_011529	CG	3	6	1342875	1342880	0 %	0 %	50 %	50 %	212224616
26540	NC_011529	ATC	2	6	1342912	1342917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224616
26541	NC_011529	TGA	2	6	1342962	1342967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224616
26542	NC_011529	TG	3	6	1343017	1343022	0 %	50 %	50 %	0 %	212224616
26543	NC_011529	CCCA	2	8	1343136	1343143	25 %	0 %	0 %	75 %	212224616
26544	NC_011529	GTT	2	6	1343162	1343167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224616
26545	NC_011529	C	6	6	1343171	1343176	0 %	0 %	0 %	100 %	212224616
26546	NC_011529	CTC	2	6	1343206	1343211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224616
26547	NC_011529	G	6	6	1343326	1343331	0 %	0 %	100 %	0 %	212224616
26548	NC_011529	CTC	2	6	1343374	1343379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224616
26549	NC_011529	TCC	2	6	1343426	1343431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224616
26550	NC_011529	CAC	2	6	1343526	1343531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26551	NC_011529	GAA	2	6	1343637	1343642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224617
26552	NC_011529	GAG	2	6	1343686	1343691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224617
26553	NC_011529	CG	3	6	1343712	1343717	0 %	0 %	50 %	50 %	212224617
26554	NC_011529	AG	3	6	1343727	1343732	50 %	0 %	50 %	0 %	212224617
26555	NC_011529	GCC	2	6	1343734	1343739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224617
26556	NC_011529	TCG	2	6	1343741	1343746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224617
26557	NC_011529	ATG	2	6	1343836	1343841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224617
26558	NC_011529	TCT	2	6	1343891	1343896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224617
26559	NC_011529	GAA	2	6	1343919	1343924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224617
26560	NC_011529	GAG	2	6	1343926	1343931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224617
26561	NC_011529	GGAT	2	8	1343939	1343946	25 %	25 %	50 %	0 %	212224617
26562	NC_011529	CTCG	2	8	1344057	1344064	0 %	25 %	25 %	50 %	212224617
26563	NC_011529	GAG	2	6	1344079	1344084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224617
26564	NC_011529	AGG	2	6	1344086	1344091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224617
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26566	NC_011529	GAGAG	2	10	1344148	1344157	40 %	0 %	60 %	0 %	212224617
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26568	NC_011529	GGA	2	6	1344261	1344266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224617
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26571	NC_011529	GGGA	2	8	1344372	1344379	25 %	0 %	75 %	0 %	212224618
26572	NC_011529	GA	3	6	1344389	1344394	50 %	0 %	50 %	0 %	212224618
26573	NC_011529	TTC	2	6	1344410	1344415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224618
26574	NC_011529	GAG	2	6	1344509	1344514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224618
26575	NC_011529	GGAC	2	8	1344718	1344725	25 %	0 %	50 %	25 %	212224618
26576	NC_011529	CTG	2	6	1344764	1344769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224618
26577	NC_011529	GAA	2	6	1344785	1344790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224618
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26579	NC_011529	GCT	2	6	1344876	1344881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224619
26580	NC_011529	GGT	2	6	1344888	1344893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224619
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26582	NC_011529	TCT	2	6	1344932	1344937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224619
26583	NC_011529	TCA	2	6	1345001	1345006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224619
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26589	NC_011529	GCC	2	6	1345240	1345245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224619
26590	NC_011529	TGGA	2	8	1345267	1345274	25 %	25 %	50 %	0 %	212224619
26591	NC_011529	AAG	2	6	1345303	1345308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224619
26592	NC_011529	GAGAAG	2	12	1345345	1345356	50 %	0 %	50 %	0 %	212224619
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26599	NC_011529	TAC	2	6	1345540	1345545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224619
26600	NC_011529	AGG	2	6	1345559	1345564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224619
26601	NC_011529	TCT	2	6	1345571	1345576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224619
26602	NC_011529	GGA	2	6	1345578	1345583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224619
26603	NC_011529	GGA	2	6	1345614	1345619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224619
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26605	NC_011529	AGG	2	6	1345664	1345669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224619
26606	NC_011529	GAA	2	6	1345672	1345677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224619
26607	NC_011529	TGG	2	6	1345687	1345692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224619
26608	NC_011529	GAGAAG	2	12	1345726	1345737	50 %	0 %	50 %	0 %	212224619
26609	NC_011529	AGA	2	6	1345751	1345756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224619
26610	NC_011529	GAG	2	6	1345762	1345767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224619
26611	NC_011529	ATA	2	6	1345780	1345785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224619
26612	NC_011529	GAG	2	6	1345795	1345800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224619
26613	NC_011529	CTTT	2	8	1345837	1345844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26614	NC_011529	CT	3	6	1345960	1345965	0 %	50 %	0 %	50 %	212224620
26615	NC_011529	GAT	2	6	1345969	1345974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224620
26616	NC_011529	GTC	2	6	1346020	1346025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224620
26617	NC_011529	TGA	2	6	1346028	1346033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224620
26618	NC_011529	CTT	2	6	1346044	1346049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224620
26619	NC_011529	TCGA	2	8	1346059	1346066	25 %	25 %	25 %	25 %	212224620
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26624	NC_011529	ATG	2	6	1346227	1346232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224620
26625	NC_011529	GTT	2	6	1346260	1346265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224620
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26632	NC_011529	TGA	2	6	1346693	1346698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224621
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26715	NC_011529	TA	3	6	1351490	1351495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26716	NC_011529	A	6	6	1351517	1351522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26717	NC_011529	T	6	6	1351545	1351550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26722	NC_011529	AGG	2	6	1351686	1351691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26735	NC_011529	AGAA	2	8	1352318	1352325	75 %	0 %	25 %	0 %	212224628
26736	NC_011529	CCA	2	6	1352330	1352335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224628
26737	NC_011529	TCA	2	6	1352396	1352401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224628
26738	NC_011529	GGA	2	6	1352417	1352422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224628
26739	NC_011529	TGA	2	6	1352439	1352444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224628
26740	NC_011529	CTG	2	6	1352469	1352474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224628
26741	NC_011529	ACT	2	6	1352537	1352542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224628
26742	NC_011529	CGAA	2	8	1352564	1352571	50 %	0 %	25 %	25 %	212224628
26743	NC_011529	CCAA	2	8	1352575	1352582	50 %	0 %	0 %	50 %	212224628
26744	NC_011529	AGA	2	6	1352601	1352606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224628
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26747	NC_011529	CAT	2	6	1352737	1352742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224629
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26749	NC_011529	GCG	2	6	1352922	1352927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224629
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26753	NC_011529	TCG	2	6	1353186	1353191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224629
26754	NC_011529	TCC	2	6	1353198	1353203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224629
26755	NC_011529	ACT	2	6	1353279	1353284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224629
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26758	NC_011529	CATGGG	2	12	1353430	1353441	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212224629
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26767	NC_011529	AAG	2	6	1353838	1353843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224630
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26795	NC_011529	TGA	2	6	1355135	1355140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26796	NC_011529	GCT	2	6	1355177	1355182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224632
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26803	NC_011529	CT	3	6	1355472	1355477	0 %	50 %	0 %	50 %	212224632
26804	NC_011529	AGCG	2	8	1355519	1355526	25 %	0 %	50 %	25 %	212224632
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26836	NC_011529	GTCCAG	2	12	1356984	1356995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212224633
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26839	NC_011529	GAG	2	6	1357132	1357137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224633
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26842	NC_011529	TCC	2	6	1357312	1357317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224633
26843	NC_011529	GGA	2	6	1357325	1357330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224633
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26845	NC_011529	TCT	3	9	1357345	1357353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26848	NC_011529	C	6	6	1357480	1357485	0 %	0 %	0 %	100 %	212224634
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26968	NC_011529	GAC	2	6	1364029	1364034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224643
26969	NC_011529	TTC	2	6	1364049	1364054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224643
26970	NC_011529	AG	3	6	1364061	1364066	50 %	0 %	50 %	0 %	212224643
26971	NC_011529	AGG	2	6	1364108	1364113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224643
26972	NC_011529	TC	3	6	1364124	1364129	0 %	50 %	0 %	50 %	212224643
26973	NC_011529	AACG	2	8	1364160	1364167	50 %	0 %	25 %	25 %	212224643
26974	NC_011529	TCA	2	6	1364213	1364218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224643
26975	NC_011529	GTC	2	6	1364302	1364307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224643
26976	NC_011529	GAA	2	6	1364310	1364315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224643
26977	NC_011529	CTA	2	6	1364383	1364388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224643
26978	NC_011529	TGG	2	6	1364405	1364410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224643
26979	NC_011529	GCT	2	6	1364464	1364469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224643
26980	NC_011529	TGA	2	6	1364546	1364551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224643
26981	NC_011529	AGGAAA	2	12	1364589	1364600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26982	NC_011529	GAT	2	6	1364609	1364614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26983	NC_011529	CCG	2	6	1364721	1364726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224644
26984	NC_011529	CCTTC	2	10	1364758	1364767	0 %	40 %	0 %	60 %	212224644
26985	NC_011529	TAT	2	6	1364812	1364817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224644
26986	NC_011529	TTC	2	6	1364891	1364896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224644
26987	NC_011529	TGT	2	6	1364910	1364915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224644
26988	NC_011529	TAT	2	6	1365001	1365006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224644
26989	NC_011529	TCG	2	6	1365089	1365094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224644
26990	NC_011529	AGG	2	6	1365110	1365115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224644
26991	NC_011529	TGG	2	6	1365129	1365134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224644
26992	NC_011529	TGC	2	6	1365156	1365161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224644
26993	NC_011529	CT	3	6	1365307	1365312	0 %	50 %	0 %	50 %	212224644
26994	NC_011529	AGC	2	6	1365425	1365430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224644
26995	NC_011529	TCT	2	6	1365492	1365497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224644
26996	NC_011529	TCA	2	6	1365530	1365535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26997	NC_011529	TTA	2	6	1365540	1365545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26998	NC_011529	AG	3	6	1365614	1365619	50 %	0 %	50 %	0 %	212224645
26999	NC_011529	AAG	2	6	1365652	1365657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224645
27000	NC_011529	TCC	2	6	1365800	1365805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224645

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