MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_011529	ACCT	2	8	1315300	1315307	25 %	25 %	0 %	50 %	212224590
26003	NC_011529	CGA	2	6	1315356	1315361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224590
26004	NC_011529	GCG	2	6	1315370	1315375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224590
26005	NC_011529	ACC	2	6	1315396	1315401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224590
26006	NC_011529	CG	3	6	1315440	1315445	0 %	0 %	50 %	50 %	212224590
26007	NC_011529	CAA	2	6	1315473	1315478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224590
26008	NC_011529	GGAA	2	8	1315508	1315515	50 %	0 %	50 %	0 %	212224590
26009	NC_011529	ATT	2	6	1315649	1315654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224590
26010	NC_011529	GAGC	2	8	1315668	1315675	25 %	0 %	50 %	25 %	212224590
26011	NC_011529	GGAA	2	8	1315678	1315685	50 %	0 %	50 %	0 %	212224590
26012	NC_011529	TTC	2	6	1315702	1315707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224590
26013	NC_011529	CTA	2	6	1315719	1315724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224590
26014	NC_011529	CTA	2	6	1315776	1315781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224590
26015	NC_011529	TAC	2	6	1315837	1315842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224590
26016	NC_011529	AG	3	6	1315844	1315849	50 %	0 %	50 %	0 %	212224590
26017	NC_011529	CTT	2	6	1315885	1315890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224590
26018	NC_011529	GGC	2	6	1316001	1316006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224590
26019	NC_011529	GAAAC	2	10	1316039	1316048	60 %	0 %	20 %	20 %	212224590
26020	NC_011529	ACC	2	6	1316156	1316161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224590
26021	NC_011529	ATA	2	6	1316188	1316193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224590
26022	NC_011529	ACT	2	6	1316213	1316218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224590
26023	NC_011529	CGA	2	6	1316232	1316237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224590
26024	NC_011529	TCT	2	6	1316252	1316257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224590
26025	NC_011529	A	6	6	1316278	1316283	100 %	0 %	0 %	0 %	212224590
26026	NC_011529	CCTG	2	8	1316286	1316293	0 %	25 %	25 %	50 %	212224590
26027	NC_011529	CTC	2	6	1316337	1316342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224590
26028	NC_011529	CTC	2	6	1316374	1316379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224590
26029	NC_011529	CGA	2	6	1316403	1316408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224590
26030	NC_011529	GAA	2	6	1316427	1316432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224590
26031	NC_011529	AAAG	2	8	1316449	1316456	75 %	0 %	25 %	0 %	212224590
26032	NC_011529	GCC	2	6	1316528	1316533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224591
26033	NC_011529	CTC	2	6	1316611	1316616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224591
26034	NC_011529	CCTC	2	8	1316634	1316641	0 %	25 %	0 %	75 %	212224591
26035	NC_011529	GTA	3	9	1316668	1316676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224591
26036	NC_011529	CCA	2	6	1316685	1316690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224591
26037	NC_011529	CGA	2	6	1316727	1316732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224591
26038	NC_011529	CT	3	6	1316787	1316792	0 %	50 %	0 %	50 %	212224591
26039	NC_011529	TCC	2	6	1316911	1316916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224591
26040	NC_011529	GAG	2	6	1316929	1316934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224591
26041	NC_011529	TGG	2	6	1316985	1316990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224591
26042	NC_011529	CTC	2	6	1317071	1317076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224591
26043	NC_011529	TCA	2	6	1317081	1317086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26044	NC_011529	CCGG	2	8	1317175	1317182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26045	NC_011529	GGT	2	6	1317203	1317208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26046	NC_011529	GAT	2	6	1317211	1317216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224592
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26049	NC_011529	GGA	2	6	1317459	1317464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224592
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26051	NC_011529	CCG	2	6	1317545	1317550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224592
26052	NC_011529	AG	3	6	1317631	1317636	50 %	0 %	50 %	0 %	212224592
26053	NC_011529	TACGC	2	10	1317666	1317675	20 %	20 %	20 %	40 %	212224592
26054	NC_011529	GA	3	6	1317764	1317769	50 %	0 %	50 %	0 %	212224592
26055	NC_011529	AAAGC	2	10	1317770	1317779	60 %	0 %	20 %	20 %	212224592
26056	NC_011529	CTC	2	6	1317830	1317835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224592
26057	NC_011529	CTT	2	6	1317862	1317867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224592
26058	NC_011529	GTG	2	6	1317902	1317907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224592
26059	NC_011529	ACGG	2	8	1317971	1317978	25 %	0 %	50 %	25 %	212224592
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26104	NC_011529	ATTT	2	8	1319670	1319677	25 %	75 %	0 %	0 %	212224594
26105	NC_011529	A	7	7	1319724	1319730	100 %	0 %	0 %	0 %	212224594
26106	NC_011529	A	6	6	1319740	1319745	100 %	0 %	0 %	0 %	212224594
26107	NC_011529	ACTC	2	8	1319747	1319754	25 %	25 %	0 %	50 %	212224594
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26113	NC_011529	AAG	2	6	1319971	1319976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224594
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26118	NC_011529	AAT	2	6	1320264	1320269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224594
26119	NC_011529	TGA	2	6	1320302	1320307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224594
26120	NC_011529	A	7	7	1320317	1320323	100 %	0 %	0 %	0 %	212224594
26121	NC_011529	AGGA	2	8	1320482	1320489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26122	NC_011529	TTA	2	6	1320623	1320628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26123	NC_011529	A	6	6	1320639	1320644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26124	NC_011529	CAT	2	6	1320648	1320653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26125	NC_011529	T	6	6	1320662	1320667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26126	NC_011529	CTT	2	6	1320685	1320690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26127	NC_011529	TTA	2	6	1320700	1320705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26128	NC_011529	TAA	2	6	1320719	1320724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26130	NC_011529	GA	3	6	1320775	1320780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26131	NC_011529	TAGAAG	2	12	1320809	1320820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26148	NC_011529	CG	3	6	1321937	1321942	0 %	0 %	50 %	50 %	212224596
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26223	NC_011529	GAAAA	2	10	1325633	1325642	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26224	NC_011529	C	6	6	1325740	1325745	0 %	0 %	0 %	100 %	212224600
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26236	NC_011529	GA	3	6	1326471	1326476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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26238	NC_011529	GA	3	6	1326558	1326563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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26354	NC_011529	ATA	2	6	1332807	1332812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224605
26355	NC_011529	CTC	2	6	1332837	1332842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224605
26356	NC_011529	TCA	2	6	1332851	1332856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224605
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26469	NC_011529	CTT	2	6	1338056	1338061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224612
26470	NC_011529	CAT	2	6	1338179	1338184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224612
26471	NC_011529	TTC	2	6	1338237	1338242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224612
26472	NC_011529	CCT	3	9	1338266	1338274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224612
26473	NC_011529	CGC	2	6	1338329	1338334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224612
26474	NC_011529	AGC	2	6	1338480	1338485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224612
26475	NC_011529	ATG	2	6	1338588	1338593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224612
26476	NC_011529	CCACT	2	10	1338945	1338954	20 %	20 %	0 %	60 %	212224612
26477	NC_011529	TCC	2	6	1338984	1338989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224612
26478	NC_011529	TCCTTC	2	12	1339104	1339115	0 %	50 %	0 %	50 %	212224612
26479	NC_011529	CCG	3	9	1339194	1339202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224612
26480	NC_011529	TA	3	6	1339244	1339249	50 %	50 %	0 %	0 %	212224612
26481	NC_011529	GCC	2	6	1339331	1339336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26482	NC_011529	TGA	2	6	1339365	1339370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26483	NC_011529	CTT	2	6	1339421	1339426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224613
26484	NC_011529	CTC	2	6	1339431	1339436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224613
26485	NC_011529	CGG	2	6	1339462	1339467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224613
26486	NC_011529	TTG	2	6	1339501	1339506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224613
26487	NC_011529	AGT	2	6	1339528	1339533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224613
26488	NC_011529	GCA	2	6	1339645	1339650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224613
26489	NC_011529	CT	3	6	1339674	1339679	0 %	50 %	0 %	50 %	212224613
26490	NC_011529	TAT	2	6	1339775	1339780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224613
26491	NC_011529	CGG	2	6	1339813	1339818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224613
26492	NC_011529	CTC	2	6	1339913	1339918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224613
26493	NC_011529	CCGG	2	8	1339939	1339946	0 %	0 %	50 %	50 %	212224613
26494	NC_011529	TTC	2	6	1339960	1339965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224613
26495	NC_011529	CT	3	6	1340070	1340075	0 %	50 %	0 %	50 %	212224613
26496	NC_011529	CTC	2	6	1340105	1340110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224613
26497	NC_011529	ATG	2	6	1340130	1340135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224613
26498	NC_011529	CT	3	6	1340144	1340149	0 %	50 %	0 %	50 %	212224613
26499	NC_011529	GA	3	6	1340280	1340285	50 %	0 %	50 %	0 %	212224613
26500	NC_011529	AAC	2	6	1340312	1340317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224613

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