MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_011529	C	6	6	1265649	1265654	0 %	0 %	0 %	100 %	212224542
25002	NC_011529	CGC	2	6	1265690	1265695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224542
25003	NC_011529	CGA	3	9	1265704	1265712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224542
25004	NC_011529	G	6	6	1265740	1265745	0 %	0 %	100 %	0 %	212224542
25005	NC_011529	GAA	3	9	1265777	1265785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224542
25006	NC_011529	GGA	2	6	1265800	1265805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224542
25007	NC_011529	TTC	2	6	1265846	1265851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224543
25008	NC_011529	CTT	2	6	1265857	1265862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224543
25009	NC_011529	ATG	2	6	1265931	1265936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224543
25010	NC_011529	GTCG	2	8	1266023	1266030	0 %	25 %	50 %	25 %	212224543
25011	NC_011529	CGC	2	6	1266163	1266168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224543
25012	NC_011529	CCT	2	6	1266190	1266195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224543
25013	NC_011529	CTC	2	6	1266225	1266230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224543
25014	NC_011529	ACTC	2	8	1266256	1266263	25 %	25 %	0 %	50 %	212224543
25015	NC_011529	CTT	2	6	1266266	1266271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224543
25016	NC_011529	CTT	2	6	1266302	1266307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224543
25017	NC_011529	TC	3	6	1266332	1266337	0 %	50 %	0 %	50 %	212224543
25018	NC_011529	TCT	2	6	1266421	1266426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224543
25019	NC_011529	ATT	2	6	1266510	1266515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224543
25020	NC_011529	CATC	2	8	1266520	1266527	25 %	25 %	0 %	50 %	212224543
25021	NC_011529	CCT	2	6	1266604	1266609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224543
25022	NC_011529	CT	3	6	1266665	1266670	0 %	50 %	0 %	50 %	212224543
25023	NC_011529	TCC	2	6	1266699	1266704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224543
25024	NC_011529	CAC	2	6	1266721	1266726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224543
25025	NC_011529	TAT	2	6	1266734	1266739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224543
25026	NC_011529	TCAGC	2	10	1266815	1266824	20 %	20 %	20 %	40 %	212224544
25027	NC_011529	TCC	2	6	1266924	1266929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224544
25028	NC_011529	CTC	2	6	1266971	1266976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224544
25029	NC_011529	CAT	2	6	1266986	1266991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224544
25030	NC_011529	CTGA	2	8	1266992	1266999	25 %	25 %	25 %	25 %	212224544
25031	NC_011529	AAG	2	6	1267103	1267108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224544
25032	NC_011529	TCC	2	6	1267117	1267122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224544
25033	NC_011529	CTC	2	6	1267136	1267141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224544
25034	NC_011529	GAG	2	6	1267160	1267165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224544
25035	NC_011529	TCC	2	6	1267245	1267250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224544
25036	NC_011529	CCT	3	9	1267336	1267344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224544
25037	NC_011529	AAG	2	6	1267349	1267354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224544
25038	NC_011529	TCG	2	6	1267380	1267385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224544
25039	NC_011529	TA	3	6	1267438	1267443	50 %	50 %	0 %	0 %	212224544
25040	NC_011529	TC	3	6	1267559	1267564	0 %	50 %	0 %	50 %	212224544
25041	NC_011529	CCTC	2	8	1267570	1267577	0 %	25 %	0 %	75 %	212224544
25042	NC_011529	ACG	2	6	1267629	1267634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224544
25043	NC_011529	TA	3	6	1267745	1267750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25044	NC_011529	TCC	2	6	1267883	1267888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224545
25045	NC_011529	TCG	2	6	1267976	1267981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224545
25046	NC_011529	CTT	2	6	1267989	1267994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224545
25047	NC_011529	CT	3	6	1268054	1268059	0 %	50 %	0 %	50 %	212224545
25048	NC_011529	GACT	2	8	1268063	1268070	25 %	25 %	25 %	25 %	212224545
25049	NC_011529	CTT	2	6	1268121	1268126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224545
25050	NC_011529	TGG	2	6	1268129	1268134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224545
25051	NC_011529	CTC	2	6	1268173	1268178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224545
25052	NC_011529	GAG	2	6	1268182	1268187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224545
25053	NC_011529	AGG	2	6	1268192	1268197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224545
25054	NC_011529	TTC	2	6	1268287	1268292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224545
25055	NC_011529	AGCCT	2	10	1268314	1268323	20 %	20 %	20 %	40 %	212224545
25056	NC_011529	TCGC	2	8	1268338	1268345	0 %	25 %	25 %	50 %	212224545
25057	NC_011529	CTC	2	6	1268377	1268382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224545
25058	NC_011529	CGC	2	6	1268547	1268552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224545
25059	NC_011529	TCT	3	9	1268564	1268572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224545
25060	NC_011529	CAG	2	6	1268575	1268580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224545
25061	NC_011529	GGC	3	9	1268715	1268723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224545
25062	NC_011529	ATG	2	6	1268782	1268787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224545
25063	NC_011529	CTT	2	6	1268790	1268795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224545
25064	NC_011529	GAG	2	6	1268803	1268808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224545
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25066	NC_011529	TA	3	6	1268869	1268874	50 %	50 %	0 %	0 %	212224545
25067	NC_011529	GGT	2	6	1268875	1268880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224545
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25069	NC_011529	TAG	2	6	1268936	1268941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224545
25070	NC_011529	CTT	2	6	1269085	1269090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224546
25071	NC_011529	TCC	2	6	1269167	1269172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224546
25072	NC_011529	CAA	2	6	1269252	1269257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224546
25073	NC_011529	GTT	2	6	1269260	1269265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224546
25074	NC_011529	ATT	2	6	1269290	1269295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224546
25075	NC_011529	CTC	2	6	1269376	1269381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224546
25076	NC_011529	CTT	2	6	1269399	1269404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224546
25077	NC_011529	CGAAG	2	10	1269408	1269417	40 %	0 %	40 %	20 %	212224546
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25079	NC_011529	GA	3	6	1269515	1269520	50 %	0 %	50 %	0 %	212224546
25080	NC_011529	ACC	2	6	1269526	1269531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224546
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25082	NC_011529	CAC	2	6	1269574	1269579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25083	NC_011529	A	6	6	1269605	1269610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25084	NC_011529	GAAA	2	8	1269650	1269657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25085	NC_011529	AAT	2	6	1269686	1269691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25086	NC_011529	AT	4	8	1269749	1269756	50 %	50 %	0 %	0 %	212224547
25087	NC_011529	GCT	2	6	1269795	1269800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224547
25088	NC_011529	TTTC	2	8	1269860	1269867	0 %	75 %	0 %	25 %	212224547
25089	NC_011529	TGT	2	6	1269891	1269896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224547
25090	NC_011529	TCC	2	6	1270121	1270126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224547
25091	NC_011529	TTC	2	6	1270205	1270210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224547
25092	NC_011529	CGT	2	6	1270230	1270235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224547
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25096	NC_011529	TGA	2	6	1270421	1270426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224548
25097	NC_011529	GAG	2	6	1270449	1270454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224548
25098	NC_011529	TGC	2	6	1270529	1270534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224548
25099	NC_011529	CTT	2	6	1270536	1270541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224548
25100	NC_011529	ATA	2	6	1270555	1270560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224548
25101	NC_011529	TTG	2	6	1270561	1270566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224548
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25103	NC_011529	CGG	2	6	1270656	1270661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224548
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25105	NC_011529	TCC	2	6	1270753	1270758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224548
25106	NC_011529	TCG	2	6	1270816	1270821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224548
25107	NC_011529	TC	3	6	1270878	1270883	0 %	50 %	0 %	50 %	212224548
25108	NC_011529	CTC	2	6	1270923	1270928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224548
25109	NC_011529	TCC	2	6	1270930	1270935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224548
25110	NC_011529	TCA	2	6	1270990	1270995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224548
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25113	NC_011529	GAA	2	6	1271108	1271113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224548
25114	NC_011529	TC	3	6	1271147	1271152	0 %	50 %	0 %	50 %	212224548
25115	NC_011529	AGCGG	2	10	1271185	1271194	20 %	0 %	60 %	20 %	212224548
25116	NC_011529	CGG	2	6	1271246	1271251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224548
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25118	NC_011529	GGC	2	6	1271485	1271490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224548
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25122	NC_011529	CTCG	2	8	1271736	1271743	0 %	25 %	25 %	50 %	212224548
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25233	NC_011529	GTG	2	6	1277979	1277984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25234	NC_011529	CCGG	2	8	1277987	1277994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25235	NC_011529	C	6	6	1278085	1278090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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25237	NC_011529	C	6	6	1278160	1278165	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25238	NC_011529	CGACC	2	10	1278182	1278191	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25239	NC_011529	GT	3	6	1278247	1278252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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25241	NC_011529	GAT	2	6	1278281	1278286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25242	NC_011529	TTCCC	2	10	1278366	1278375	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
25243	NC_011529	GC	3	6	1278412	1278417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25244	NC_011529	TCCT	2	8	1278463	1278470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25245	NC_011529	CGG	2	6	1278483	1278488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25247	NC_011529	CCT	2	6	1278502	1278507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25250	NC_011529	CCT	2	6	1278603	1278608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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25257	NC_011529	CTG	2	6	1279253	1279258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25273	NC_011529	A	6	6	1279950	1279955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25283	NC_011529	AAGC	2	8	1280498	1280505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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25349	NC_011529	CAAT	2	8	1283968	1283975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25350	NC_011529	AGAAA	2	10	1283995	1284004	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25351	NC_011529	TGA	2	6	1284068	1284073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224559
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25359	NC_011529	CTT	2	6	1284465	1284470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224559
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25361	NC_011529	AAC	2	6	1284624	1284629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224559
25362	NC_011529	TCG	2	6	1284643	1284648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224559
25363	NC_011529	CTT	3	9	1284651	1284659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224559
25364	NC_011529	CTT	2	6	1284735	1284740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224559
25365	NC_011529	TAT	2	6	1284768	1284773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224559
25366	NC_011529	TCC	2	6	1284815	1284820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224559
25367	NC_011529	CCTCTC	2	12	1284870	1284881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224559
25368	NC_011529	AGG	2	6	1284994	1284999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224559
25369	NC_011529	CTT	2	6	1285005	1285010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224559
25370	NC_011529	TCG	2	6	1285027	1285032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224559
25371	NC_011529	TCG	2	6	1285054	1285059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224559
25372	NC_011529	TC	3	6	1285111	1285116	0 %	50 %	0 %	50 %	212224559
25373	NC_011529	CCT	2	6	1285208	1285213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224559
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25382	NC_011529	CCTCG	2	10	1285522	1285531	0 %	20 %	20 %	60 %	212224560
25383	NC_011529	CCT	2	6	1285569	1285574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224560
25384	NC_011529	CAG	2	6	1285858	1285863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224560
25385	NC_011529	CCA	2	6	1285940	1285945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224560
25386	NC_011529	TC	3	6	1285989	1285994	0 %	50 %	0 %	50 %	212224560
25387	NC_011529	AAG	2	6	1286026	1286031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224560
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25389	NC_011529	T	7	7	1286225	1286231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25390	NC_011529	ATC	2	6	1286246	1286251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25391	NC_011529	TCT	2	6	1286343	1286348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224561
25392	NC_011529	ACTC	2	8	1286386	1286393	25 %	25 %	0 %	50 %	212224561
25393	NC_011529	CAG	2	6	1286394	1286399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224561
25394	NC_011529	AAG	2	6	1286441	1286446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224561
25395	NC_011529	CGG	2	6	1286458	1286463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224561
25396	NC_011529	CCTA	2	8	1286514	1286521	25 %	25 %	0 %	50 %	212224561
25397	NC_011529	GAC	2	6	1286536	1286541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224561
25398	NC_011529	GAG	2	6	1286687	1286692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224561
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25401	NC_011529	GA	4	8	1286827	1286834	50 %	0 %	50 %	0 %	212224561
25402	NC_011529	GA	3	6	1286921	1286926	50 %	0 %	50 %	0 %	212224561
25403	NC_011529	AAG	2	6	1286942	1286947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224561
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25405	NC_011529	CTG	2	6	1287071	1287076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224561
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25410	NC_011529	TAC	2	6	1287196	1287201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25414	NC_011529	TAT	2	6	1287342	1287347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224562
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25421	NC_011529	TCG	2	6	1287572	1287577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224562
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25423	NC_011529	GA	3	6	1287694	1287699	50 %	0 %	50 %	0 %	212224562
25424	NC_011529	CAG	2	6	1287744	1287749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224562
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25431	NC_011529	AAT	2	6	1288402	1288407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224563
25432	NC_011529	CCCG	2	8	1288414	1288421	0 %	0 %	25 %	75 %	212224563
25433	NC_011529	ATC	2	6	1288445	1288450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224563
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25466	NC_011529	GCCA	2	8	1289679	1289686	25 %	0 %	25 %	50 %	212224564
25467	NC_011529	CGG	2	6	1289696	1289701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224564
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25473	NC_011529	ACA	2	6	1290007	1290012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224564
25474	NC_011529	TGC	2	6	1290030	1290035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224564
25475	NC_011529	GC	3	6	1290052	1290057	0 %	0 %	50 %	50 %	212224564
25476	NC_011529	GGA	2	6	1290071	1290076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224564
25477	NC_011529	AGT	2	6	1290203	1290208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224564
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25479	NC_011529	TGT	2	6	1290284	1290289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224564
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25481	NC_011529	TCT	2	6	1290368	1290373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224564
25482	NC_011529	TCG	2	6	1290385	1290390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224564
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