MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_011529	CGT	2	6	1241318	1241323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224523
24503	NC_011529	GAGT	2	8	1241485	1241492	25 %	25 %	50 %	0 %	212224523
24504	NC_011529	CCA	2	6	1241498	1241503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224523
24505	NC_011529	TC	3	6	1241562	1241567	0 %	50 %	0 %	50 %	212224523
24506	NC_011529	CTG	2	6	1241590	1241595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224523
24507	NC_011529	CCT	2	6	1241598	1241603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224523
24508	NC_011529	CTC	2	6	1241622	1241627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224523
24509	NC_011529	CGT	2	6	1241640	1241645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224523
24510	NC_011529	TCG	2	6	1241731	1241736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224523
24511	NC_011529	CCCAA	2	10	1241743	1241752	40 %	0 %	0 %	60 %	212224523
24512	NC_011529	ACCG	2	8	1241776	1241783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24513	NC_011529	AGG	2	6	1241789	1241794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24514	NC_011529	G	7	7	1241793	1241799	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24515	NC_011529	TC	3	6	1241847	1241852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24516	NC_011529	ACG	2	6	1241926	1241931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24517	NC_011529	GA	3	6	1241940	1241945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24518	NC_011529	TGAA	2	8	1241970	1241977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24519	NC_011529	CAA	2	6	1241983	1241988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24520	NC_011529	AAG	2	6	1242000	1242005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24521	NC_011529	ATC	2	6	1242116	1242121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24522	NC_011529	AAG	2	6	1242142	1242147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224524
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24524	NC_011529	GGAG	2	8	1242214	1242221	25 %	0 %	75 %	0 %	212224524
24525	NC_011529	TCT	3	9	1242267	1242275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224524
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24527	NC_011529	GAG	2	6	1242370	1242375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224524
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24532	NC_011529	AAG	2	6	1242723	1242728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224524
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24539	NC_011529	CGAG	2	8	1243019	1243026	25 %	0 %	50 %	25 %	212224525
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24552	NC_011529	TAG	2	6	1243607	1243612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224525
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24554	NC_011529	CAG	2	6	1243701	1243706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24555	NC_011529	TAA	2	6	1243729	1243734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24558	NC_011529	A	6	6	1243875	1243880	100 %	0 %	0 %	0 %	212224526
24559	NC_011529	CTT	2	6	1243902	1243907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224526
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24561	NC_011529	TGTC	2	8	1244000	1244007	0 %	50 %	25 %	25 %	212224526
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24575	NC_011529	GGA	2	6	1244766	1244771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224527
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24583	NC_011529	CTG	2	6	1245209	1245214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224527
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24589	NC_011529	GGAAG	2	10	1245694	1245703	40 %	0 %	60 %	0 %	212224527
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24602	NC_011529	CT	3	6	1246283	1246288	0 %	50 %	0 %	50 %	212224528
24603	NC_011529	TCG	2	6	1246319	1246324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224528
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24612	NC_011529	TCA	2	6	1246691	1246696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24617	NC_011529	ATGT	2	8	1246841	1246848	25 %	50 %	25 %	0 %	212224529
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24619	NC_011529	GAT	2	6	1246955	1246960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224529
24620	NC_011529	AG	3	6	1246976	1246981	50 %	0 %	50 %	0 %	212224529
24621	NC_011529	CTT	2	6	1247116	1247121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224529
24622	NC_011529	GCG	2	6	1247129	1247134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224529
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24637	NC_011529	AGGA	2	8	1248051	1248058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24638	NC_011529	CCG	2	6	1248059	1248064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24641	NC_011529	A	6	6	1248164	1248169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24642	NC_011529	AG	3	6	1248176	1248181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24643	NC_011529	TGA	2	6	1248230	1248235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224530
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24650	NC_011529	A	6	6	1248547	1248552	100 %	0 %	0 %	0 %	212224530
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24714	NC_011529	GA	3	6	1251665	1251670	50 %	0 %	50 %	0 %	212224531
24715	NC_011529	ATG	2	6	1251732	1251737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224531
24716	NC_011529	AT	4	8	1251738	1251745	50 %	50 %	0 %	0 %	212224531
24717	NC_011529	CAA	2	6	1251766	1251771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224531
24718	NC_011529	GAGG	2	8	1251778	1251785	25 %	0 %	75 %	0 %	212224531
24719	NC_011529	TCC	2	6	1251852	1251857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224531
24720	NC_011529	ACT	2	6	1251872	1251877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224531
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24722	NC_011529	TAC	2	6	1252121	1252126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224531
24723	NC_011529	TTTTC	2	10	1252206	1252215	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24724	NC_011529	G	6	6	1252278	1252283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24725	NC_011529	GTG	2	6	1252368	1252373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24726	NC_011529	TA	3	6	1252436	1252441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24727	NC_011529	GTAC	2	8	1252463	1252470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24728	NC_011529	GGT	2	6	1252548	1252553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24729	NC_011529	TA	3	6	1252562	1252567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24730	NC_011529	GTG	2	6	1252569	1252574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24731	NC_011529	CCG	2	6	1252622	1252627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24732	NC_011529	TGA	3	9	1252631	1252639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24733	NC_011529	ACT	2	6	1252746	1252751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24734	NC_011529	ATT	2	6	1252794	1252799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24735	NC_011529	TA	3	6	1252803	1252808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24737	NC_011529	CA	4	8	1252891	1252898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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24862	NC_011529	A	6	6	1258169	1258174	100 %	0 %	0 %	0 %	212224534
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24980	NC_011529	GGT	2	6	1264563	1264568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224541
24981	NC_011529	ATG	2	6	1264716	1264721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224542
24982	NC_011529	CAT	2	6	1264868	1264873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224542
24983	NC_011529	GGC	2	6	1264916	1264921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224542
24984	NC_011529	CCT	2	6	1265018	1265023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224542
24985	NC_011529	CCT	2	6	1265029	1265034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224542
24986	NC_011529	AGA	2	6	1265055	1265060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224542
24987	NC_011529	GGAA	2	8	1265133	1265140	50 %	0 %	50 %	0 %	212224542
24988	NC_011529	A	6	6	1265171	1265176	100 %	0 %	0 %	0 %	212224542
24989	NC_011529	GCGA	2	8	1265181	1265188	25 %	0 %	50 %	25 %	212224542
24990	NC_011529	GAA	2	6	1265198	1265203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224542
24991	NC_011529	GCC	2	6	1265340	1265345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224542
24992	NC_011529	CAT	2	6	1265411	1265416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224542
24993	NC_011529	TC	3	6	1265434	1265439	0 %	50 %	0 %	50 %	212224542
24994	NC_011529	GGA	2	6	1265471	1265476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224542
24995	NC_011529	GA	4	8	1265475	1265482	50 %	0 %	50 %	0 %	212224542
24996	NC_011529	CTGCC	2	10	1265518	1265527	0 %	20 %	20 %	60 %	212224542
24997	NC_011529	ATC	2	6	1265538	1265543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224542
24998	NC_011529	ACC	2	6	1265576	1265581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224542
24999	NC_011529	GAA	2	6	1265594	1265599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224542
25000	NC_011529	CAT	2	6	1265612	1265617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224542

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