MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_011529	TCC	2	6	1190440	1190445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224462
23503	NC_011529	CGA	2	6	1190447	1190452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224462
23504	NC_011529	CTT	2	6	1190454	1190459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224462
23505	NC_011529	CGG	2	6	1190508	1190513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224462
23506	NC_011529	CTT	2	6	1190547	1190552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224462
23507	NC_011529	GGC	2	6	1190733	1190738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224462
23508	NC_011529	AAG	2	6	1190745	1190750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224462
23509	NC_011529	GGC	2	6	1190754	1190759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224462
23510	NC_011529	GCC	2	6	1190775	1190780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224462
23511	NC_011529	TGT	2	6	1190798	1190803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224462
23512	NC_011529	CTCC	2	8	1190818	1190825	0 %	25 %	0 %	75 %	212224463
23513	NC_011529	ACG	2	6	1191069	1191074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224463
23514	NC_011529	CTT	2	6	1191098	1191103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224463
23515	NC_011529	GGT	2	6	1191113	1191118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224463
23516	NC_011529	CAA	2	6	1191148	1191153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224463
23517	NC_011529	GAC	2	6	1191284	1191289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224463
23518	NC_011529	GAA	2	6	1191338	1191343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224463
23519	NC_011529	CTT	2	6	1191374	1191379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224463
23520	NC_011529	CCT	2	6	1191388	1191393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224463
23521	NC_011529	GCG	2	6	1191493	1191498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224463
23522	NC_011529	CTT	2	6	1191560	1191565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224463
23523	NC_011529	CAGG	2	8	1191594	1191601	25 %	0 %	50 %	25 %	212224463
23524	NC_011529	CGG	2	6	1191611	1191616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224463
23525	NC_011529	CGG	2	6	1191620	1191625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224463
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23533	NC_011529	TCT	2	6	1192069	1192074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224463
23534	NC_011529	CGA	2	6	1192117	1192122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224463
23535	NC_011529	CTT	2	6	1192136	1192141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224463
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23550	NC_011529	GTT	2	6	1192939	1192944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224464
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23553	NC_011529	GTA	2	6	1193074	1193079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224464
23554	NC_011529	CGCT	2	8	1193094	1193101	0 %	25 %	25 %	50 %	212224464
23555	NC_011529	TTC	2	6	1193117	1193122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224464
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23558	NC_011529	TCT	2	6	1193166	1193171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224464
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23569	NC_011529	CGA	2	6	1193802	1193807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224464
23570	NC_011529	CTC	2	6	1193815	1193820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224464
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23572	NC_011529	GAC	3	9	1193929	1193937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224464
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23574	NC_011529	TCA	2	6	1194144	1194149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224464
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23576	NC_011529	TA	3	6	1194178	1194183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23577	NC_011529	AATA	2	8	1194229	1194236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23578	NC_011529	CAT	2	6	1194260	1194265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23580	NC_011529	TTA	2	6	1194308	1194313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23581	NC_011529	TGA	2	6	1194327	1194332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23585	NC_011529	CCCACG	2	12	1194473	1194484	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	212224465
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23587	NC_011529	AAC	2	6	1194588	1194593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224465
23588	NC_011529	CCGA	2	8	1194613	1194620	25 %	0 %	25 %	50 %	212224465
23589	NC_011529	CAG	2	6	1194663	1194668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224465
23590	NC_011529	AT	3	6	1194730	1194735	50 %	50 %	0 %	0 %	212224465
23591	NC_011529	CTC	2	6	1194772	1194777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224465
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23598	NC_011529	TCG	2	6	1194950	1194955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224465
23599	NC_011529	TCA	2	6	1194971	1194976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224465
23600	NC_011529	T	6	6	1195037	1195042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23601	NC_011529	CCG	2	6	1195121	1195126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224466
23602	NC_011529	ATG	2	6	1195169	1195174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224466
23603	NC_011529	CGTGG	2	10	1195191	1195200	0 %	20 %	60 %	20 %	212224466
23604	NC_011529	CTG	2	6	1195360	1195365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224466
23605	NC_011529	CCG	2	6	1195415	1195420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224466
23606	NC_011529	GTT	2	6	1195462	1195467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224466
23607	NC_011529	GGC	2	6	1195500	1195505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224466
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23612	NC_011529	AACT	2	8	1195728	1195735	50 %	25 %	0 %	25 %	212224466
23613	NC_011529	GGTCAT	2	12	1195737	1195748	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212224466
23614	NC_011529	TGT	2	6	1195760	1195765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224466
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23616	NC_011529	AAG	2	6	1195804	1195809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224466
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23733	NC_011529	CGA	2	6	1201190	1201195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224473
23734	NC_011529	CCGTC	2	10	1201202	1201211	0 %	20 %	20 %	60 %	212224473
23735	NC_011529	GAA	2	6	1201388	1201393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23736	NC_011529	CTC	2	6	1201533	1201538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224474
23737	NC_011529	ATGCCA	2	12	1201627	1201638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212224474
23738	NC_011529	GCG	2	6	1201642	1201647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224474
23739	NC_011529	TCG	2	6	1201666	1201671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224474
23740	NC_011529	CGT	2	6	1201718	1201723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224474
23741	NC_011529	GAG	2	6	1201803	1201808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224474
23742	NC_011529	GGC	2	6	1201851	1201856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224474
23743	NC_011529	GTC	2	6	1201879	1201884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224474
23744	NC_011529	TCC	2	6	1201900	1201905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224474
23745	NC_011529	A	6	6	1202010	1202015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23767	NC_011529	ATG	2	6	1203217	1203222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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