MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_011529	GAT	2	6	1140631	1140636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224401
22502	NC_011529	A	6	6	1140641	1140646	100 %	0 %	0 %	0 %	212224402
22503	NC_011529	GA	3	6	1140649	1140654	50 %	0 %	50 %	0 %	212224402
22504	NC_011529	AAG	2	6	1140655	1140660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224402
22505	NC_011529	CGG	2	6	1140675	1140680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224402
22506	NC_011529	CCT	2	6	1140690	1140695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224402
22507	NC_011529	TGG	2	6	1140749	1140754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224402
22508	NC_011529	TGG	2	6	1140851	1140856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224402
22509	NC_011529	AAAT	2	8	1140908	1140915	75 %	25 %	0 %	0 %	212224402
22510	NC_011529	TTG	2	6	1140923	1140928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224402
22511	NC_011529	AGG	2	6	1140968	1140973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224402
22512	NC_011529	AAT	2	6	1141053	1141058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224402
22513	NC_011529	TCA	2	6	1141116	1141121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22514	NC_011529	TAG	3	9	1141292	1141300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224403
22515	NC_011529	TCC	2	6	1141313	1141318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224403
22516	NC_011529	CCT	2	6	1141333	1141338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224403
22517	NC_011529	TCT	2	6	1141398	1141403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224403
22518	NC_011529	CTT	2	6	1141405	1141410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224403
22519	NC_011529	CTT	2	6	1141414	1141419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224403
22520	NC_011529	TCC	2	6	1141448	1141453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224403
22521	NC_011529	CTT	2	6	1141456	1141461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224403
22522	NC_011529	ACC	2	6	1141536	1141541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224404
22523	NC_011529	CGTC	2	8	1141575	1141582	0 %	25 %	25 %	50 %	212224404
22524	NC_011529	TCG	2	6	1141648	1141653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224404
22525	NC_011529	TTG	2	6	1141731	1141736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224404
22526	NC_011529	AGC	2	6	1141749	1141754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224404
22527	NC_011529	GTGA	2	8	1141869	1141876	25 %	25 %	50 %	0 %	212224404
22528	NC_011529	AAG	2	6	1141884	1141889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224404
22529	NC_011529	CGG	2	6	1141901	1141906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224404
22530	NC_011529	CGTAGT	2	12	1141921	1141932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	212224404
22531	NC_011529	CGA	2	6	1142056	1142061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224404
22532	NC_011529	TTC	2	6	1142066	1142071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224404
22533	NC_011529	CT	4	8	1142079	1142086	0 %	50 %	0 %	50 %	212224404
22534	NC_011529	TCA	2	6	1142089	1142094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224404
22535	NC_011529	GTT	2	6	1142105	1142110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224404
22536	NC_011529	GAA	2	6	1142182	1142187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224404
22537	NC_011529	TCG	2	6	1142233	1142238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224404
22538	NC_011529	TTGG	2	8	1142258	1142265	0 %	50 %	50 %	0 %	212224404
22539	NC_011529	CAC	2	6	1142276	1142281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224404
22540	NC_011529	GAA	2	6	1142314	1142319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22541	NC_011529	GTC	2	6	1142339	1142344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224405
22542	NC_011529	G	6	6	1142363	1142368	0 %	0 %	100 %	0 %	212224405
22543	NC_011529	TTC	2	6	1142382	1142387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224405
22544	NC_011529	ATG	2	6	1142482	1142487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224405
22545	NC_011529	ACGA	2	8	1142558	1142565	50 %	0 %	25 %	25 %	212224405
22546	NC_011529	GCG	2	6	1142646	1142651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224405
22547	NC_011529	GTGAA	2	10	1142685	1142694	40 %	20 %	40 %	0 %	212224405
22548	NC_011529	TAT	2	6	1142909	1142914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224405
22549	NC_011529	GGC	2	6	1142933	1142938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224405
22550	NC_011529	GAG	2	6	1142966	1142971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224405
22551	NC_011529	AGT	2	6	1143004	1143009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224405
22552	NC_011529	AAC	2	6	1143089	1143094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224405
22553	NC_011529	GC	3	6	1143126	1143131	0 %	0 %	50 %	50 %	212224405
22554	NC_011529	CGA	2	6	1143148	1143153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224405
22555	NC_011529	GCG	2	6	1143159	1143164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224405
22556	NC_011529	CTG	2	6	1143190	1143195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224405
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22558	NC_011529	TC	3	6	1143307	1143312	0 %	50 %	0 %	50 %	212224405
22559	NC_011529	CTT	2	6	1143326	1143331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224405
22560	NC_011529	TCAGC	2	10	1143379	1143388	20 %	20 %	20 %	40 %	212224405
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22563	NC_011529	GTC	2	6	1143470	1143475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224405
22564	NC_011529	TCG	2	6	1143519	1143524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224405
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22567	NC_011529	TGA	2	6	1143807	1143812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224406
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22569	NC_011529	AGT	2	6	1143864	1143869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22570	NC_011529	GCTT	2	8	1143894	1143901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22571	NC_011529	A	6	6	1143928	1143933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22572	NC_011529	T	6	6	1143934	1143939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22573	NC_011529	A	6	6	1143941	1143946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22574	NC_011529	A	6	6	1143950	1143955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22575	NC_011529	A	6	6	1143957	1143962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22576	NC_011529	GAG	2	6	1144092	1144097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224407
22577	NC_011529	TGGG	2	8	1144111	1144118	0 %	25 %	75 %	0 %	212224407
22578	NC_011529	GCA	2	6	1144155	1144160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224407
22579	NC_011529	GCA	2	6	1144164	1144169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224407
22580	NC_011529	GCG	2	6	1144222	1144227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224407
22581	NC_011529	GCT	2	6	1144229	1144234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224407
22582	NC_011529	GA	3	6	1144297	1144302	50 %	0 %	50 %	0 %	212224407
22583	NC_011529	T	7	7	1144409	1144415	0 %	100 %	0 %	0 %	212224407
22584	NC_011529	GGA	2	6	1144626	1144631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224408
22585	NC_011529	TGC	2	6	1144689	1144694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224408
22586	NC_011529	AG	3	6	1144697	1144702	50 %	0 %	50 %	0 %	212224408
22587	NC_011529	AC	3	6	1144727	1144732	50 %	0 %	0 %	50 %	212224408
22588	NC_011529	TAC	2	6	1144774	1144779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224408
22589	NC_011529	CGA	2	6	1144809	1144814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224408
22590	NC_011529	GAC	2	6	1144882	1144887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224408
22591	NC_011529	ATA	2	6	1144951	1144956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224408
22592	NC_011529	GAG	2	6	1144972	1144977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224408
22593	NC_011529	TGA	2	6	1144998	1145003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224408
22594	NC_011529	GTTA	2	8	1145037	1145044	25 %	50 %	25 %	0 %	212224408
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22601	NC_011529	CAA	2	6	1145457	1145462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224408
22602	NC_011529	AGC	2	6	1145539	1145544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224408
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22605	NC_011529	AAG	2	6	1145650	1145655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224408
22606	NC_011529	GAAT	2	8	1145681	1145688	50 %	25 %	25 %	0 %	212224408
22607	NC_011529	ATGG	2	8	1145723	1145730	25 %	25 %	50 %	0 %	212224409
22608	NC_011529	GGC	2	6	1145854	1145859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224409
22609	NC_011529	GTT	2	6	1145918	1145923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224409
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22612	NC_011529	GAG	2	6	1145988	1145993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22613	NC_011529	ATG	2	6	1146068	1146073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224410
22614	NC_011529	GCC	2	6	1146119	1146124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224410
22615	NC_011529	GCA	2	6	1146133	1146138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224410
22616	NC_011529	CCTT	2	8	1146168	1146175	0 %	50 %	0 %	50 %	212224410
22617	NC_011529	GCT	2	6	1146239	1146244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224410
22618	NC_011529	ATTC	2	8	1146301	1146308	25 %	50 %	0 %	25 %	212224410
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22620	NC_011529	CTT	2	6	1146358	1146363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224410
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22622	NC_011529	GCG	2	6	1146417	1146422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224410
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22637	NC_011529	GGA	2	6	1147577	1147582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22638	NC_011529	CTGG	2	8	1147614	1147621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22639	NC_011529	GAA	2	6	1147709	1147714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22681	NC_011529	GCTC	2	8	1150080	1150087	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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22724	NC_011529	GA	3	6	1151895	1151900	50 %	0 %	50 %	0 %	212224414
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22731	NC_011529	GAG	2	6	1152243	1152248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224415
22732	NC_011529	GA	3	6	1152315	1152320	50 %	0 %	50 %	0 %	212224415
22733	NC_011529	GGT	2	6	1152392	1152397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224415
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22854	NC_011529	GCG	2	6	1159083	1159088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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22970	NC_011529	AGG	2	6	1164592	1164597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224429
22971	NC_011529	GAA	2	6	1164673	1164678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224429
22972	NC_011529	GCC	2	6	1164726	1164731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224429
22973	NC_011529	CTT	2	6	1164743	1164748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224429
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22977	NC_011529	AAAG	2	8	1165038	1165045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22978	NC_011529	CAC	2	6	1165082	1165087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224430
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22983	NC_011529	GTA	2	6	1165275	1165280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224430
22984	NC_011529	GCCC	2	8	1165281	1165288	0 %	0 %	25 %	75 %	212224430
22985	NC_011529	AAG	2	6	1165302	1165307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224430
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22990	NC_011529	TGA	2	6	1165574	1165579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224430
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22992	NC_011529	ACG	2	6	1165606	1165611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224430
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22999	NC_011529	CTG	2	6	1166037	1166042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224430
23000	NC_011529	GAGCCT	2	12	1166071	1166082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212224430

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