MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_011529	ACG	2	6	1114198	1114203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224367
22003	NC_011529	CTC	2	6	1114222	1114227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224367
22004	NC_011529	TAT	2	6	1114260	1114265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224367
22005	NC_011529	TC	3	6	1114272	1114277	0 %	50 %	0 %	50 %	212224367
22006	NC_011529	CAC	2	6	1114314	1114319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224368
22007	NC_011529	TTC	2	6	1114327	1114332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224368
22008	NC_011529	TCC	2	6	1114351	1114356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224368
22009	NC_011529	CAT	2	6	1114511	1114516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224368
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22011	NC_011529	CGG	2	6	1114693	1114698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224369
22012	NC_011529	GAT	2	6	1114735	1114740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224369
22013	NC_011529	GTA	2	6	1114832	1114837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224369
22014	NC_011529	CTT	2	6	1114858	1114863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224369
22015	NC_011529	TCA	2	6	1114936	1114941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224369
22016	NC_011529	TTCA	2	8	1114970	1114977	25 %	50 %	0 %	25 %	212224369
22017	NC_011529	AGGA	2	8	1114994	1115001	50 %	0 %	50 %	0 %	212224369
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22032	NC_011529	GA	3	6	1115673	1115678	50 %	0 %	50 %	0 %	212224369
22033	NC_011529	TCG	2	6	1115703	1115708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224369
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22062	NC_011529	GTC	2	6	1117459	1117464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22101	NC_011529	GA	3	6	1119678	1119683	50 %	0 %	50 %	0 %	212224375
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22118	NC_011529	CAG	2	6	1120495	1120500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22119	NC_011529	TCT	2	6	1120512	1120517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224377
22120	NC_011529	CGTT	2	8	1120548	1120555	0 %	50 %	25 %	25 %	212224377
22121	NC_011529	GAG	2	6	1120573	1120578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224377
22122	NC_011529	CGT	2	6	1120608	1120613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224377
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22235	NC_011529	CCT	2	6	1126469	1126474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224383
22236	NC_011529	CTC	3	9	1126569	1126577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224383
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22352	NC_011529	ATC	2	6	1132682	1132687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224392
22353	NC_011529	GTGG	2	8	1132705	1132712	0 %	25 %	75 %	0 %	212224392
22354	NC_011529	TCA	2	6	1132802	1132807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224392
22355	NC_011529	GGA	2	6	1132830	1132835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224392
22356	NC_011529	GAA	2	6	1132990	1132995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224392
22357	NC_011529	TCG	2	6	1133145	1133150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224392
22358	NC_011529	AAG	2	6	1133176	1133181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224392
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22360	NC_011529	ACC	2	6	1133278	1133283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22361	NC_011529	CACC	2	8	1133297	1133304	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22362	NC_011529	TAA	2	6	1133307	1133312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22363	NC_011529	TGAC	2	8	1133324	1133331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22364	NC_011529	CTCC	2	8	1133332	1133339	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22365	NC_011529	G	6	6	1133388	1133393	0 %	0 %	100 %	0 %	212224393
22366	NC_011529	TTCA	2	8	1133395	1133402	25 %	50 %	0 %	25 %	212224393
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22374	NC_011529	TCT	2	6	1133757	1133762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224393
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22390	NC_011529	TTTC	2	8	1134778	1134785	0 %	75 %	0 %	25 %	212224394
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22395	NC_011529	A	6	6	1134994	1134999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22396	NC_011529	TTTGGA	2	12	1135046	1135057	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22397	NC_011529	GA	4	8	1135069	1135076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22398	NC_011529	TTA	2	6	1135109	1135114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22409	NC_011529	GAA	2	6	1135532	1135537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22441	NC_011529	AGG	2	6	1137634	1137639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22468	NC_011529	CACT	2	8	1139046	1139053	25 %	25 %	0 %	50 %	212224399
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