MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_011529	TCC	2	6	1087893	1087898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224340
21502	NC_011529	C	6	6	1087901	1087906	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21503	NC_011529	AC	3	6	1087970	1087975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21504	NC_011529	AT	3	6	1088007	1088012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21505	NC_011529	TCA	2	6	1088042	1088047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21506	NC_011529	TTCA	2	8	1088072	1088079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21507	NC_011529	ATC	2	6	1088109	1088114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21508	NC_011529	AT	3	6	1088160	1088165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21509	NC_011529	AGA	2	6	1088180	1088185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21510	NC_011529	CGC	2	6	1088208	1088213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21511	NC_011529	GGT	2	6	1088234	1088239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21512	NC_011529	TAC	2	6	1088294	1088299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224341
21513	NC_011529	TTC	2	6	1088431	1088436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224341
21514	NC_011529	AGA	2	6	1088485	1088490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224341
21515	NC_011529	GACAA	2	10	1088582	1088591	60 %	0 %	20 %	20 %	212224341
21516	NC_011529	TC	3	6	1088606	1088611	0 %	50 %	0 %	50 %	212224341
21517	NC_011529	AGA	2	6	1088625	1088630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224341
21518	NC_011529	GAA	2	6	1088648	1088653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224341
21519	NC_011529	AGG	2	6	1088717	1088722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224341
21520	NC_011529	CAGA	2	8	1088726	1088733	50 %	0 %	25 %	25 %	212224341
21521	NC_011529	GAG	2	6	1088738	1088743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224341
21522	NC_011529	TCA	2	6	1088754	1088759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224341
21523	NC_011529	CGGACA	2	12	1088863	1088874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224341
21524	NC_011529	AG	3	6	1088885	1088890	50 %	0 %	50 %	0 %	212224341
21525	NC_011529	GAA	2	6	1088917	1088922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224341
21526	NC_011529	GAAAGA	2	12	1089037	1089048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224341
21527	NC_011529	GAA	2	6	1089197	1089202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224341
21528	NC_011529	AAG	2	6	1089205	1089210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224341
21529	NC_011529	GGA	2	6	1089269	1089274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224341
21530	NC_011529	GGA	2	6	1089292	1089297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224341
21531	NC_011529	AG	3	6	1089305	1089310	50 %	0 %	50 %	0 %	212224341
21532	NC_011529	CTC	2	6	1089328	1089333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224342
21533	NC_011529	GAG	2	6	1089337	1089342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224342
21534	NC_011529	GAG	2	6	1089364	1089369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224342
21535	NC_011529	GTT	2	6	1089379	1089384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224342
21536	NC_011529	CGG	2	6	1089439	1089444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224342
21537	NC_011529	TCG	2	6	1089458	1089463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224342
21538	NC_011529	TAT	2	6	1089505	1089510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224342
21539	NC_011529	ATT	2	6	1089533	1089538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224342
21540	NC_011529	TTC	2	6	1089539	1089544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224342
21541	NC_011529	CTT	2	6	1089583	1089588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224342
21542	NC_011529	GAC	2	6	1089595	1089600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224342
21543	NC_011529	CAT	2	6	1089673	1089678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224342
21544	NC_011529	CTC	2	6	1089718	1089723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224342
21545	NC_011529	CCATC	2	10	1089759	1089768	20 %	20 %	0 %	60 %	212224342
21546	NC_011529	AAG	2	6	1089794	1089799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224343
21547	NC_011529	CAT	2	6	1089869	1089874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224343
21548	NC_011529	CAA	2	6	1089886	1089891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224343
21549	NC_011529	GTC	2	6	1090040	1090045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224343
21550	NC_011529	ACG	2	6	1090119	1090124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224343
21551	NC_011529	T	6	6	1090179	1090184	0 %	100 %	0 %	0 %	212224343
21552	NC_011529	CAC	2	6	1090243	1090248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224343
21553	NC_011529	AGC	2	6	1090253	1090258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224343
21554	NC_011529	CTG	2	6	1090305	1090310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224343
21555	NC_011529	GTGCCT	2	12	1090480	1090491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224343
21556	NC_011529	AGG	2	6	1090626	1090631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224343
21557	NC_011529	TC	4	8	1090642	1090649	0 %	50 %	0 %	50 %	212224343
21558	NC_011529	GAA	2	6	1090666	1090671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224343
21559	NC_011529	CAA	2	6	1090811	1090816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224343
21560	NC_011529	ATC	2	6	1090847	1090852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224343
21561	NC_011529	ACGGCA	2	12	1090878	1090889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224343
21562	NC_011529	AAG	2	6	1090946	1090951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224343
21563	NC_011529	GCT	2	6	1090968	1090973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224343
21564	NC_011529	ATA	2	6	1091060	1091065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21565	NC_011529	AAT	2	6	1091087	1091092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21566	NC_011529	CCTA	2	8	1091110	1091117	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21567	NC_011529	T	6	6	1091148	1091153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21568	NC_011529	AACC	2	8	1091191	1091198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21569	NC_011529	ATG	2	6	1091237	1091242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224344
21570	NC_011529	TAG	2	6	1091302	1091307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224344
21571	NC_011529	AAC	2	6	1091372	1091377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224344
21572	NC_011529	TAC	2	6	1091387	1091392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224344
21573	NC_011529	ACAA	2	8	1091405	1091412	75 %	0 %	0 %	25 %	212224344
21574	NC_011529	CTA	2	6	1091429	1091434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224344
21575	NC_011529	TTC	2	6	1091462	1091467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224344
21576	NC_011529	GTTA	2	8	1091519	1091526	25 %	50 %	25 %	0 %	212224344
21577	NC_011529	AAG	2	6	1091528	1091533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224344
21578	NC_011529	CAC	2	6	1091537	1091542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224344
21579	NC_011529	CAGGA	2	10	1091580	1091589	40 %	0 %	40 %	20 %	212224344
21580	NC_011529	AG	3	6	1091678	1091683	50 %	0 %	50 %	0 %	212224344
21581	NC_011529	GAG	2	6	1091780	1091785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224344
21582	NC_011529	CAG	2	6	1091828	1091833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224344
21583	NC_011529	AGG	2	6	1091919	1091924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224344
21584	NC_011529	TCG	2	6	1092033	1092038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224344
21585	NC_011529	AT	3	6	1092044	1092049	50 %	50 %	0 %	0 %	212224344
21586	NC_011529	TGC	2	6	1092118	1092123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224345
21587	NC_011529	GAA	2	6	1092125	1092130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224345
21588	NC_011529	CCA	2	6	1092149	1092154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224345
21589	NC_011529	AGG	2	6	1092181	1092186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224345
21590	NC_011529	ATGG	2	8	1092249	1092256	25 %	25 %	50 %	0 %	212224345
21591	NC_011529	A	6	6	1092278	1092283	100 %	0 %	0 %	0 %	212224345
21592	NC_011529	CCG	2	6	1092316	1092321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224345
21593	NC_011529	AGGA	2	8	1092328	1092335	50 %	0 %	50 %	0 %	212224345
21594	NC_011529	AGGC	2	8	1092355	1092362	25 %	0 %	50 %	25 %	212224345
21595	NC_011529	AAAT	2	8	1092412	1092419	75 %	25 %	0 %	0 %	212224345
21596	NC_011529	TGT	2	6	1092424	1092429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224345
21597	NC_011529	GGGT	2	8	1092438	1092445	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21598	NC_011529	GAT	2	6	1092494	1092499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224346
21599	NC_011529	CTG	2	6	1092559	1092564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224346
21600	NC_011529	TAA	2	6	1092675	1092680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224346
21601	NC_011529	AGG	2	6	1092726	1092731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224346
21602	NC_011529	CTC	2	6	1092793	1092798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224346
21603	NC_011529	ATC	2	6	1092833	1092838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224346
21604	NC_011529	AAG	2	6	1092849	1092854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224346
21605	NC_011529	AGG	2	6	1092869	1092874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224346
21606	NC_011529	AGG	2	6	1092887	1092892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224346
21607	NC_011529	GTG	2	6	1092953	1092958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224346
21608	NC_011529	TCA	2	6	1092968	1092973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224346
21609	NC_011529	GGT	2	6	1092977	1092982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224346
21610	NC_011529	CTC	2	6	1092992	1092997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224346
21611	NC_011529	AGAT	2	8	1093107	1093114	50 %	25 %	25 %	0 %	212224346
21612	NC_011529	GAG	2	6	1093145	1093150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224346
21613	NC_011529	GAG	2	6	1093200	1093205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224346
21614	NC_011529	AAG	2	6	1093229	1093234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224346
21615	NC_011529	CTG	2	6	1093257	1093262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224346
21616	NC_011529	GAT	2	6	1093270	1093275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224346
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21967	NC_011529	TTTG	2	8	1112430	1112437	0 %	75 %	25 %	0 %	212224364
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21969	NC_011529	TCG	2	6	1112522	1112527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224364
21970	NC_011529	TCT	2	6	1112700	1112705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224364
21971	NC_011529	GTA	2	6	1112725	1112730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224364
21972	NC_011529	ATCT	2	8	1112809	1112816	25 %	50 %	0 %	25 %	212224364
21973	NC_011529	AGCC	2	8	1112918	1112925	25 %	0 %	25 %	50 %	212224364
21974	NC_011529	CTT	2	6	1112938	1112943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224364
21975	NC_011529	A	6	6	1112959	1112964	100 %	0 %	0 %	0 %	212224364
21976	NC_011529	CTC	2	6	1112982	1112987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224365
21977	NC_011529	TGA	2	6	1112990	1112995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224365
21978	NC_011529	TCAA	2	8	1113166	1113173	50 %	25 %	0 %	25 %	212224365
21979	NC_011529	TCA	2	6	1113238	1113243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224365
21980	NC_011529	TAA	3	9	1113256	1113264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224365
21981	NC_011529	TGA	2	6	1113265	1113270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224365
21982	NC_011529	TCA	2	6	1113297	1113302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21983	NC_011529	GGC	2	6	1113466	1113471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224366
21984	NC_011529	GAA	2	6	1113503	1113508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224366
21985	NC_011529	ATA	2	6	1113627	1113632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224366
21986	NC_011529	CCA	2	6	1113698	1113703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224366
21987	NC_011529	AAT	2	6	1113731	1113736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224366
21988	NC_011529	TCA	2	6	1113742	1113747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224366
21989	NC_011529	AGAC	2	8	1113751	1113758	50 %	0 %	25 %	25 %	212224366
21990	NC_011529	GAG	2	6	1113780	1113785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224366
21991	NC_011529	ATA	2	6	1113795	1113800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224366
21992	NC_011529	AAG	2	6	1113801	1113806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224366
21993	NC_011529	AGG	2	6	1113817	1113822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224366
21994	NC_011529	CT	3	6	1113829	1113834	0 %	50 %	0 %	50 %	212224366
21995	NC_011529	CTG	2	6	1113864	1113869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224366
21996	NC_011529	CGA	2	6	1113956	1113961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224367
21997	NC_011529	ACG	2	6	1114012	1114017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224367
21998	NC_011529	GGA	2	6	1114136	1114141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224367
21999	NC_011529	CTC	2	6	1114146	1114151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224367
22000	NC_011529	TTA	2	6	1114160	1114165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224367

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