MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20003	NC_011529	CTC	2	6	1013150	1013155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224241
20004	NC_011529	CTT	3	9	1013159	1013167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224241
20005	NC_011529	T	6	6	1013226	1013231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20008	NC_011529	CTC	2	6	1013523	1013528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224242
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20011	NC_011529	GA	3	6	1013586	1013591	50 %	0 %	50 %	0 %	212224242
20012	NC_011529	CAC	2	6	1013634	1013639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224242
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20117	NC_011529	CCG	2	6	1018263	1018268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224246
20118	NC_011529	CTCTGG	2	12	1018295	1018306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224246
20119	NC_011529	CGC	2	6	1018366	1018371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224246
20120	NC_011529	GGC	2	6	1018382	1018387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224246
20121	NC_011529	GCGA	2	8	1018410	1018417	25 %	0 %	50 %	25 %	212224246
20122	NC_011529	TGATAA	2	12	1018468	1018479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212224246
20123	NC_011529	GTC	2	6	1018571	1018576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224246
20124	NC_011529	GAA	2	6	1018583	1018588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224246
20125	NC_011529	CGT	2	6	1018603	1018608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224246
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20128	NC_011529	TTG	2	6	1018821	1018826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224246
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20130	NC_011529	TCT	2	6	1018852	1018857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224246
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20132	NC_011529	ATG	2	6	1018893	1018898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224246
20133	NC_011529	CTT	2	6	1018916	1018921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224246
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20139	NC_011529	TGA	2	6	1019207	1019212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20140	NC_011529	TCT	2	6	1019254	1019259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20141	NC_011529	TGA	3	9	1019358	1019366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20142	NC_011529	TGA	2	6	1019388	1019393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20143	NC_011529	TGA	2	6	1019407	1019412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224247
20144	NC_011529	A	6	6	1019434	1019439	100 %	0 %	0 %	0 %	212224247
20145	NC_011529	ATC	2	6	1019622	1019627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224247
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20148	NC_011529	GGTG	2	8	1019819	1019826	0 %	25 %	75 %	0 %	212224247
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20152	NC_011529	GGA	2	6	1019988	1019993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224248
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20230	NC_011529	CTT	2	6	1022993	1022998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224253
20231	NC_011529	TCC	2	6	1023004	1023009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224253
20232	NC_011529	CT	3	6	1023113	1023118	0 %	50 %	0 %	50 %	212224253
20233	NC_011529	CTT	2	6	1023201	1023206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224253
20234	NC_011529	TGA	2	6	1023220	1023225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224253
20235	NC_011529	CT	3	6	1023310	1023315	0 %	50 %	0 %	50 %	212224253
20236	NC_011529	TC	4	8	1023397	1023404	0 %	50 %	0 %	50 %	212224253
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20351	NC_011529	GGT	2	6	1029038	1029043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224262
20352	NC_011529	GGA	2	6	1029046	1029051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224262
20353	NC_011529	GA	4	8	1029086	1029093	50 %	0 %	50 %	0 %	212224262
20354	NC_011529	AGG	2	6	1029097	1029102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224262
20355	NC_011529	GGAG	2	8	1029196	1029203	25 %	0 %	75 %	0 %	212224262
20356	NC_011529	TCA	2	6	1029241	1029246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224262
20357	NC_011529	AGG	2	6	1029271	1029276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224262
20358	NC_011529	CTA	2	6	1029374	1029379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224262
20359	NC_011529	ATC	2	6	1029396	1029401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224262
20360	NC_011529	AGA	2	6	1029427	1029432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224262
20361	NC_011529	ACA	2	6	1029445	1029450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224262
20362	NC_011529	GAA	2	6	1029476	1029481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224262
20363	NC_011529	AAG	2	6	1029492	1029497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224262
20364	NC_011529	T	7	7	1029539	1029545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20365	NC_011529	ATC	2	6	1029589	1029594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20366	NC_011529	GGT	2	6	1029613	1029618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20367	NC_011529	AAT	2	6	1029620	1029625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224263
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20369	NC_011529	ATC	2	6	1029753	1029758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224263
20370	NC_011529	CCG	2	6	1029772	1029777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224263
20371	NC_011529	CAT	2	6	1029818	1029823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224263
20372	NC_011529	ATGG	2	8	1029828	1029835	25 %	25 %	50 %	0 %	212224263
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20374	NC_011529	CGA	2	6	1029869	1029874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224263
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20380	NC_011529	ACT	2	6	1030062	1030067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224263
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20382	NC_011529	GCA	2	6	1030146	1030151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224263
20383	NC_011529	GGC	2	6	1030176	1030181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224263
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20385	NC_011529	GCC	2	6	1030265	1030270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224263
20386	NC_011529	CTGGAA	2	12	1030297	1030308	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212224263
20387	NC_011529	CTC	2	6	1030314	1030319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224263
20388	NC_011529	TAC	2	6	1030389	1030394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224263
20389	NC_011529	AG	3	6	1030406	1030411	50 %	0 %	50 %	0 %	212224263
20390	NC_011529	AG	3	6	1030416	1030421	50 %	0 %	50 %	0 %	212224263
20391	NC_011529	AGG	2	6	1030429	1030434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224263
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20393	NC_011529	AG	3	6	1030522	1030527	50 %	0 %	50 %	0 %	212224263
20394	NC_011529	CAGC	2	8	1030532	1030539	25 %	0 %	25 %	50 %	212224263
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20399	NC_011529	AAG	2	6	1030755	1030760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224263
20400	NC_011529	CGA	2	6	1030781	1030786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224263
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20403	NC_011529	CGA	2	6	1030913	1030918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224263
20404	NC_011529	CTG	2	6	1030920	1030925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224263
20405	NC_011529	GAG	2	6	1030926	1030931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224263
20406	NC_011529	AG	3	6	1030983	1030988	50 %	0 %	50 %	0 %	212224263
20407	NC_011529	GAG	2	6	1031006	1031011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224263
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20432	NC_011529	CTGG	2	8	1032319	1032326	0 %	25 %	50 %	25 %	212224264
20433	NC_011529	TTCCTG	2	12	1032393	1032404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212224264
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20439	NC_011529	ATC	2	6	1032832	1032837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224266
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20446	NC_011529	GTGA	2	8	1032998	1033005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20447	NC_011529	AATG	2	8	1033055	1033062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20448	NC_011529	TTAC	2	8	1033097	1033104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20449	NC_011529	CAT	2	6	1033123	1033128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20451	NC_011529	GAAA	2	8	1033148	1033155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20452	NC_011529	CCG	2	6	1033289	1033294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224267
20453	NC_011529	CATTT	2	10	1033310	1033319	20 %	60 %	0 %	20 %	212224267
20454	NC_011529	ACC	2	6	1033321	1033326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224267
20455	NC_011529	GGC	2	6	1033426	1033431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224267
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20459	NC_011529	A	6	6	1033590	1033595	100 %	0 %	0 %	0 %	212224267
20460	NC_011529	GTG	2	6	1033688	1033693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224268
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20463	NC_011529	A	6	6	1033810	1033815	100 %	0 %	0 %	0 %	212224268
20464	NC_011529	ATC	2	6	1033874	1033879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224269
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20467	NC_011529	TCT	2	6	1033948	1033953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224269
20468	NC_011529	CGA	2	6	1033954	1033959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224269
20469	NC_011529	GAA	2	6	1033984	1033989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224269
20470	NC_011529	CA	3	6	1034036	1034041	50 %	0 %	0 %	50 %	212224269
20471	NC_011529	ATC	2	6	1034070	1034075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224269
20472	NC_011529	CA	3	6	1034101	1034106	50 %	0 %	0 %	50 %	212224269
20473	NC_011529	GCA	2	6	1034125	1034130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224269
20474	NC_011529	GC	3	6	1034136	1034141	0 %	0 %	50 %	50 %	212224269
20475	NC_011529	GTT	2	6	1034258	1034263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224269
20476	NC_011529	TC	3	6	1034286	1034291	0 %	50 %	0 %	50 %	212224269
20477	NC_011529	CAG	2	6	1034336	1034341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224269
20478	NC_011529	TC	3	6	1034470	1034475	0 %	50 %	0 %	50 %	212224269
20479	NC_011529	TGCA	2	8	1034486	1034493	25 %	25 %	25 %	25 %	212224269
20480	NC_011529	ATC	2	6	1034606	1034611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20481	NC_011529	GCCTTG	2	12	1034661	1034672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224270
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20484	NC_011529	ATT	2	6	1034730	1034735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224270
20485	NC_011529	GCT	2	6	1034753	1034758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224270
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20488	NC_011529	AG	3	6	1034948	1034953	50 %	0 %	50 %	0 %	212224271
20489	NC_011529	TCT	2	6	1035009	1035014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224271
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20496	NC_011529	GAG	2	6	1035541	1035546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224271
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20500	NC_011529	T	6	6	1035729	1035734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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