MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011529	TCG	3	9	72122	72130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223232
1502	NC_011529	CGA	2	6	72143	72148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223232
1503	NC_011529	GTGAG	2	10	72162	72171	20 %	20 %	60 %	0 %	212223232
1504	NC_011529	AG	3	6	72170	72175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011529	TCA	2	6	72193	72198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223233
1506	NC_011529	ACC	2	6	72271	72276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223233
1507	NC_011529	CGA	2	6	72287	72292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223233
1508	NC_011529	TCA	2	6	72376	72381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223233
1509	NC_011529	CAA	2	6	72404	72409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223233
1510	NC_011529	GAC	2	6	72420	72425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223233
1511	NC_011529	GAG	2	6	72456	72461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223233
1512	NC_011529	GTC	2	6	72474	72479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223233
1513	NC_011529	GA	3	6	72484	72489	50 %	0 %	50 %	0 %	212223233
1514	NC_011529	CCG	2	6	72537	72542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223233
1515	NC_011529	GGC	2	6	72546	72551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223233
1516	NC_011529	AAG	2	6	72564	72569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223233
1517	NC_011529	AGG	2	6	72580	72585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223233
1518	NC_011529	GA	3	6	72630	72635	50 %	0 %	50 %	0 %	212223233
1519	NC_011529	GA	3	6	72651	72656	50 %	0 %	50 %	0 %	212223234
1520	NC_011529	AGG	2	6	72662	72667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223234
1521	NC_011529	AAG	3	9	72668	72676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223234
1522	NC_011529	ATGG	2	8	72705	72712	25 %	25 %	50 %	0 %	212223234
1523	NC_011529	AAG	3	9	72719	72727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223234
1524	NC_011529	GGA	2	6	72737	72742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223234
1525	NC_011529	GGCA	2	8	72763	72770	25 %	0 %	50 %	25 %	212223234
1526	NC_011529	GAA	2	6	72781	72786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223234
1527	NC_011529	CGA	2	6	72898	72903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223234
1528	NC_011529	GAG	3	9	72941	72949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223234
1529	NC_011529	ATC	2	6	72956	72961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223234
1530	NC_011529	ACC	2	6	72968	72973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223234
1531	NC_011529	TCA	2	6	73026	73031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223234
1532	NC_011529	CTA	2	6	73036	73041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223234
1533	NC_011529	GGC	2	6	73079	73084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223234
1534	NC_011529	ATTTA	2	10	73108	73117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011529	CTG	3	9	73246	73254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223235
1536	NC_011529	GCA	2	6	73293	73298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223235
1537	NC_011529	ACT	2	6	73307	73312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223235
1538	NC_011529	TCG	2	6	73409	73414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223235
1539	NC_011529	TC	3	6	73437	73442	0 %	50 %	0 %	50 %	212223235
1540	NC_011529	AGG	2	6	73456	73461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223235
1541	NC_011529	CTT	2	6	73503	73508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223235
1542	NC_011529	TCC	2	6	73667	73672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223235
1543	NC_011529	CGC	2	6	73725	73730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223235
1544	NC_011529	ACT	2	6	73774	73779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223235
1545	NC_011529	GGCC	2	8	73808	73815	0 %	0 %	50 %	50 %	212223235
1546	NC_011529	ATG	2	6	73900	73905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223235
1547	NC_011529	CTG	2	6	73909	73914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223235
1548	NC_011529	GTC	3	9	73936	73944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223235
1549	NC_011529	AG	3	6	73950	73955	50 %	0 %	50 %	0 %	212223235
1550	NC_011529	CT	3	6	74060	74065	0 %	50 %	0 %	50 %	212223235
1551	NC_011529	CTC	2	6	74092	74097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223235
1552	NC_011529	AAC	2	6	74098	74103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223235
1553	NC_011529	CTTGG	2	10	74114	74123	0 %	40 %	40 %	20 %	212223235
1554	NC_011529	CCA	2	6	74176	74181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223235
1555	NC_011529	CTT	2	6	74406	74411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223235
1556	NC_011529	TTCA	2	8	74415	74422	25 %	50 %	0 %	25 %	212223235
1557	NC_011529	TCC	2	6	74483	74488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223235
1558	NC_011529	GAG	2	6	74518	74523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223235
1559	NC_011529	AG	3	6	74530	74535	50 %	0 %	50 %	0 %	212223235
1560	NC_011529	CTTTC	2	10	74587	74596	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1561	NC_011529	CTT	2	6	74628	74633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_011529	CCT	2	6	74641	74646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_011529	ATG	2	6	74656	74661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223236
1564	NC_011529	GGCT	2	8	74717	74724	0 %	25 %	50 %	25 %	212223236
1565	NC_011529	GAG	2	6	74779	74784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223236
1566	NC_011529	TGG	2	6	74801	74806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223236
1567	NC_011529	CCA	2	6	74924	74929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223236
1568	NC_011529	AGG	2	6	74966	74971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223236
1569	NC_011529	CGG	2	6	75119	75124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223236
1570	NC_011529	GAG	2	6	75190	75195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223236
1571	NC_011529	TTG	2	6	75209	75214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223236
1572	NC_011529	AT	3	6	75254	75259	50 %	50 %	0 %	0 %	212223237
1573	NC_011529	ACC	2	6	75300	75305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223237
1574	NC_011529	AAT	2	6	75331	75336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223237
1575	NC_011529	TTC	2	6	75347	75352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223237
1576	NC_011529	AGA	3	9	75402	75410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223237
1577	NC_011529	AGA	2	6	75423	75428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223237
1578	NC_011529	GAA	2	6	75460	75465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223237
1579	NC_011529	AAG	2	6	75470	75475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223237
1580	NC_011529	CAG	2	6	75479	75484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223237
1581	NC_011529	CTG	2	6	75548	75553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223237
1582	NC_011529	TTC	2	6	75575	75580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223237
1583	NC_011529	TCC	2	6	75679	75684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223237
1584	NC_011529	GA	3	6	75805	75810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011529	AGGTCA	2	12	75827	75838	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212223238
1586	NC_011529	GAAG	2	8	75843	75850	50 %	0 %	50 %	0 %	212223238
1587	NC_011529	GAA	2	6	75895	75900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223238
1588	NC_011529	CG	3	6	75951	75956	0 %	0 %	50 %	50 %	212223238
1589	NC_011529	CGAG	2	8	75963	75970	25 %	0 %	50 %	25 %	212223238
1590	NC_011529	AAG	2	6	75992	75997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223238
1591	NC_011529	AGG	2	6	76301	76306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223239
1592	NC_011529	ATT	2	6	76337	76342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223239
1593	NC_011529	GCC	2	6	76347	76352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223239
1594	NC_011529	GC	3	6	76414	76419	0 %	0 %	50 %	50 %	212223239
1595	NC_011529	AGGG	2	8	76436	76443	25 %	0 %	75 %	0 %	212223239
1596	NC_011529	AGG	2	6	76455	76460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223239
1597	NC_011529	CGA	2	6	76531	76536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223239
1598	NC_011529	GCC	2	6	76607	76612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223239
1599	NC_011529	ACC	2	6	76617	76622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223239
1600	NC_011529	CAA	2	6	76663	76668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223239
1601	NC_011529	AGG	2	6	76674	76679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223239
1602	NC_011529	GCCA	2	8	76690	76697	25 %	0 %	25 %	50 %	212223240
1603	NC_011529	GAA	2	6	76707	76712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223240
1604	NC_011529	GAG	2	6	76732	76737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223240
1605	NC_011529	GTC	3	9	76751	76759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223240
1606	NC_011529	AGG	2	6	76823	76828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223240
1607	NC_011529	AG	3	6	76858	76863	50 %	0 %	50 %	0 %	212223240
1608	NC_011529	GAC	2	6	76886	76891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223240
1609	NC_011529	GCC	2	6	76904	76909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223240
1610	NC_011529	CGG	2	6	77049	77054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223241
1611	NC_011529	TGG	2	6	77069	77074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223241
1612	NC_011529	GGGA	2	8	77086	77093	25 %	0 %	75 %	0 %	212223241
1613	NC_011529	GAG	2	6	77122	77127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223241
1614	NC_011529	GA	3	6	77185	77190	50 %	0 %	50 %	0 %	212223241
1615	NC_011529	TTA	2	6	77204	77209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223241
1616	NC_011529	AAC	2	6	77257	77262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212223241
1617	NC_011529	AGAGC	2	10	77292	77301	40 %	0 %	40 %	20 %	212223241
1618	NC_011529	CCT	2	6	77444	77449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223241
1619	NC_011529	GGC	2	6	77463	77468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223241
1620	NC_011529	TC	3	6	77478	77483	0 %	50 %	0 %	50 %	212223241
1621	NC_011529	GAA	2	6	77508	77513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223241
1622	NC_011529	GTC	2	6	77605	77610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223241
1623	NC_011529	GAG	2	6	77805	77810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223242
1624	NC_011529	AAG	2	6	77986	77991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223242
1625	NC_011529	GCG	2	6	78044	78049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212223242
1626	NC_011529	TTC	2	6	78050	78055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223242
1627	NC_011529	GA	3	6	78067	78072	50 %	0 %	50 %	0 %	212223242
1628	NC_011529	GGT	2	6	78081	78086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223242
1629	NC_011529	GCT	2	6	78093	78098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223242
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1647	NC_011529	TCT	2	6	78866	78871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1648	NC_011529	CT	3	6	78880	78885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1649	NC_011529	T	6	6	78895	78900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1650	NC_011529	TCT	2	6	78911	78916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1748	NC_011529	CT	3	6	83187	83192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1753	NC_011529	AAG	2	6	83662	83667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223248
1754	NC_011529	GGT	2	6	83671	83676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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