MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 36505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_011529	GAGCAC	2	12	934025	934036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224160
18503	NC_011529	CGT	2	6	934040	934045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224160
18504	NC_011529	CGA	2	6	934100	934105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224160
18505	NC_011529	AACG	2	8	934110	934117	50 %	0 %	25 %	25 %	212224160
18506	NC_011529	ACA	2	6	934183	934188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224160
18507	NC_011529	ATC	2	6	934299	934304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224160
18508	NC_011529	GGA	2	6	934313	934318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224160
18509	NC_011529	TC	3	6	934356	934361	0 %	50 %	0 %	50 %	212224160
18510	NC_011529	TGGC	2	8	934362	934369	0 %	25 %	50 %	25 %	212224160
18511	NC_011529	CTC	2	6	934539	934544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224161
18512	NC_011529	ACA	2	6	934579	934584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224161
18513	NC_011529	GA	3	6	934615	934620	50 %	0 %	50 %	0 %	212224161
18514	NC_011529	GAG	2	6	934661	934666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224161
18515	NC_011529	GGA	2	6	934673	934678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224161
18516	NC_011529	GA	3	6	934818	934823	50 %	0 %	50 %	0 %	212224161
18517	NC_011529	G	6	6	934826	934831	0 %	0 %	100 %	0 %	212224161
18518	NC_011529	ATA	2	6	934842	934847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224161
18519	NC_011529	TGTT	2	8	934924	934931	0 %	75 %	25 %	0 %	212224161
18520	NC_011529	TTG	2	6	934957	934962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224161
18521	NC_011529	CG	3	6	934990	934995	0 %	0 %	50 %	50 %	212224161
18522	NC_011529	CG	3	6	935046	935051	0 %	0 %	50 %	50 %	212224161
18523	NC_011529	GAC	2	6	935054	935059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224161
18524	NC_011529	ACT	2	6	935257	935262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224161
18525	NC_011529	AAG	2	6	935268	935273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224161
18526	NC_011529	GAA	2	6	935303	935308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224161
18527	NC_011529	GAA	2	6	935360	935365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224161
18528	NC_011529	TCG	2	6	935389	935394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224161
18529	NC_011529	GGA	2	6	935505	935510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224161
18530	NC_011529	CAT	2	6	935567	935572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224161
18531	NC_011529	GAG	3	9	935604	935612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224161
18532	NC_011529	CTG	2	6	935886	935891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224161
18533	NC_011529	ATT	2	6	935912	935917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224161
18534	NC_011529	GTT	2	6	935998	936003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224162
18535	NC_011529	T	6	6	936129	936134	0 %	100 %	0 %	0 %	212224162
18536	NC_011529	AGG	2	6	936136	936141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224162
18537	NC_011529	GA	3	6	936158	936163	50 %	0 %	50 %	0 %	212224162
18538	NC_011529	TCCT	2	8	936169	936176	0 %	50 %	0 %	50 %	212224162
18539	NC_011529	GTC	2	6	936210	936215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224162
18540	NC_011529	CAG	2	6	936249	936254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224162
18541	NC_011529	CCG	2	6	936295	936300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212224162
18542	NC_011529	CTT	2	6	936339	936344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224162
18543	NC_011529	AGG	2	6	936385	936390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224162
18544	NC_011529	CTT	2	6	936411	936416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224162
18545	NC_011529	CGG	2	6	936420	936425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224162
18546	NC_011529	GA	3	6	936433	936438	50 %	0 %	50 %	0 %	212224162
18547	NC_011529	CCT	2	6	936449	936454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224162
18548	NC_011529	GGC	2	6	936493	936498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224162
18549	NC_011529	TCA	2	6	936517	936522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224162
18550	NC_011529	GAC	2	6	936558	936563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224162
18551	NC_011529	TTG	2	6	936577	936582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224162
18552	NC_011529	GTA	2	6	936669	936674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224162
18553	NC_011529	CTC	2	6	936732	936737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224162
18554	NC_011529	GTC	2	6	936790	936795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224163
18555	NC_011529	GGC	2	6	936854	936859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224163
18556	NC_011529	TCCT	2	8	936860	936867	0 %	50 %	0 %	50 %	212224163
18557	NC_011529	TGG	2	6	936877	936882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224163
18558	NC_011529	CTC	2	6	936892	936897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224163
18559	NC_011529	GA	3	6	936905	936910	50 %	0 %	50 %	0 %	212224163
18560	NC_011529	GAG	2	6	936928	936933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224163
18561	NC_011529	TCA	2	6	936935	936940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224163
18562	NC_011529	CTC	2	6	937033	937038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224163
18563	NC_011529	GGGT	2	8	937041	937048	0 %	25 %	75 %	0 %	212224163
18564	NC_011529	TTC	2	6	937064	937069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224163
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18568	NC_011529	CTT	2	6	937174	937179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224163
18569	NC_011529	GCA	2	6	937284	937289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224163
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18571	NC_011529	TTCC	2	8	937333	937340	0 %	50 %	0 %	50 %	212224163
18572	NC_011529	GCTCA	2	10	937417	937426	20 %	20 %	20 %	40 %	212224163
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18577	NC_011529	TCGC	2	8	937613	937620	0 %	25 %	25 %	50 %	212224163
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18584	NC_011529	CCAAG	2	10	938137	938146	40 %	0 %	20 %	40 %	212224164
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18587	NC_011529	TCC	2	6	938275	938280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224164
18588	NC_011529	TCTT	2	8	938330	938337	0 %	75 %	0 %	25 %	212224164
18589	NC_011529	CTA	2	6	938350	938355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224164
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18593	NC_011529	ATATTT	2	12	938427	938438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224164
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18595	NC_011529	C	6	6	938590	938595	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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18597	NC_011529	T	7	7	938621	938627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_011529	ATG	2	6	938688	938693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_011529	CT	3	6	938705	938710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18600	NC_011529	AAG	2	6	938711	938716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18601	NC_011529	ACCT	2	8	938791	938798	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18602	NC_011529	CTT	2	6	938826	938831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18603	NC_011529	AGA	2	6	938957	938962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_011529	TAG	2	6	938965	938970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18605	NC_011529	AG	3	6	938985	938990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18606	NC_011529	GTA	2	6	939033	939038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18607	NC_011529	GA	3	6	939115	939120	50 %	0 %	50 %	0 %	212224165
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18609	NC_011529	CT	3	6	939169	939174	0 %	50 %	0 %	50 %	212224165
18610	NC_011529	TTC	2	6	939225	939230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224165
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18612	NC_011529	TGCT	2	8	939333	939340	0 %	50 %	25 %	25 %	212224165
18613	NC_011529	GATA	2	8	939376	939383	50 %	25 %	25 %	0 %	212224165
18614	NC_011529	CCCT	2	8	939536	939543	0 %	25 %	0 %	75 %	212224165
18615	NC_011529	GGAA	2	8	939620	939627	50 %	0 %	50 %	0 %	212224165
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18618	NC_011529	TAT	2	6	939901	939906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224165
18619	NC_011529	GATT	2	8	940026	940033	25 %	50 %	25 %	0 %	212224165
18620	NC_011529	A	7	7	940054	940060	100 %	0 %	0 %	0 %	212224165
18621	NC_011529	GA	4	8	940119	940126	50 %	0 %	50 %	0 %	212224165
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18986	NC_011529	AGA	2	6	959269	959274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224188
18987	NC_011529	AGG	2	6	959301	959306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224188
18988	NC_011529	AGA	2	6	959368	959373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224188
18989	NC_011529	TTC	2	6	959438	959443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224188
18990	NC_011529	TCC	2	6	959447	959452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224188
18991	NC_011529	CCA	2	6	959531	959536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212224189
18992	NC_011529	AGGA	2	8	959775	959782	50 %	0 %	50 %	0 %	212224189
18993	NC_011529	GAA	3	9	959891	959899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224189
18994	NC_011529	CGA	2	6	959912	959917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224189
18995	NC_011529	GAGCC	2	10	959940	959949	20 %	0 %	40 %	40 %	212224189
18996	NC_011529	CTACCT	2	12	960047	960058	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	212224189
18997	NC_011529	ATT	2	6	960106	960111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224189
18998	NC_011529	GTC	2	6	960123	960128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224189
18999	NC_011529	AGG	2	6	960214	960219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224189
19000	NC_011529	CGA	2	6	960221	960226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224189

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